Shewanella frigidimarina: Sfri_3457
Help
Entry
Sfri_3457 CDS
T00395
Name
(GenBank) heavy metal efflux pump, CzcA family protein
KO
K15726
heavy metal efflux system protein
Organism
sfr
Shewanella frigidimarina
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sfr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sfr02000
]
Sfri_3457
Transporters [BR:
sfr02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
Sfri_3457
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
PFF1_TM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABI73288
UniProt:
Q07XH6
LinkDB
All DBs
Position
4110210..4113326
Genome browser
AA seq
1038 aa
AA seq
DB search
MIDKLIQFSITRRWLVMFFVLLTGALGVWNYQHLPIDAVPDITNVQVQINTEAPGYSPLE
VEQRVTYLVEMSIAGLPYVESTRSLSRYALSQVTVVFEKGTDIYFARNLINERLQQAKSE
MPSGIEPVMGPVATGLGEIFHYSVHAAPGALQADGQPYDATALRTLQDWVIRPQLRLVEG
VTEVNTIGGYEKEFHITPEPSKLLAYQISFDDLVAALQKNNSNVGAGYIEKNGEQYLIRA
PGQVTDISSIKQIIVARRDGIPITVGDVAEIGFGKQLRTGAATRDGEETVLGTAVMLLGG
NSRTVSQAVSAKLLEINKTLPEGVIAEPVYDRTVLVDKTIATVQTNLAEGAVLVIVVLLV
MLGNVRAALLTAMVIPLSMLMLMTGMVETKVSANLMSLGALDFGLIVDGAVIIVENCILR
LAGRQHHLGRILTLDERFQTVFTATREVFTPSLISVLVVIMVNLPILALTGVEGKMFTPM
AMAVIMALLSALVLSLTFVPAAVALFMTGHIEEKDNFIVSQSKRLYLPILSIVLRFRVLV
ISIALIFVILVGFVATKMGTEFVPNLDEGDIAIQALRIPGTSLTQSLDMQFKLEKAILEI
PEVKTYFSRVGTAEVASDPMGPNISDGYVMLKDHSEWPNPEKTKAQLLEEISEKLALLPG
NAFEISQPIQLRFNELISGVRSDLGIKIFGDDLSKLLSSGAEIAKVLSSIEGAEGVKVEQ
VSGLPILSIDADRAAMYRLGLNVSDVQDVVAAATGGESAGLIFDGDQRLSIVVRVDERVR
GNLEALERLPIPLPEGGYVPLREVAKLTLAPGPNQISRENGKRRLVVSANVRGRDLGGFV
AEVQSKVAEQVKLSPGYWLEYGGTFEQLQSASDRLTILVPITLIMIFALLMMTFGSAKDA
ALVFSGVPLALTGGVIALWLRDIPLSITAGVGFITLCGVSVLTGVMMVSAFKDELDRGSP
IDQAIQTGAMLRLRPIMMVALVAALGFLPMALNTSTGAEVQRPLATVVIGGIISSTLLTL
LVLPGLYRLTWRKTKQLK
NT seq
3117 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgataaactcattcaattttccataacccgccggtggttggttatgttttttgtt
ttgctaacgggtgcactaggcgtttggaattatcaacatcttcctattgatgctgtacct
gatattaccaatgttcaagttcaaattaacacagaagcacctgggtattcaccactagaa
gttgagcagcgagtcacctatttggttgaaatgtcaattgcaggtttaccttatgttgag
agtactagatcgctatctcgttacgcactctcacaagttactgttgtgtttgagaaagga
actgatatttattttgctcggaatcttattaacgaacgtttgcaacaagctaaaagtgag
atgccgtcaggtattgagcccgtaatgggacctgttgcaactggattaggtgaaatcttt
cactattcagttcatgcagcgccaggggctttgcaagcagatggacaaccttacgatgca
acagctttgcgtacattgcaagattgggttattcgtcctcaattgcgtttggttgagggg
gttactgaagtaaatacaatcggagggtatgaaaaggagtttcatattacaccagaacct
tcaaagctattggcttaccaaattagttttgatgatttagtcgctgcgttgcagaaaaat
aattcgaatgtaggtgctgggtatatagagaaaaatggtgaacaatatttgatccgtgct
ccaggtcaggttactgatatttcatcgattaagcagatcattgttgctcgtagggatgga
attcctattaccgtaggtgatgttgcagagattgggtttggtaaacagcttagaactggt
gctgcaactcgcgatggcgaagaaactgtgttgggcacagctgttatgttgcttggcgga
aatagtagaactgtttctcaggcagtatcagcaaaattgcttgagattaataaaactctt
ccagaaggtgtgattgctgaaccagtttacgatcgtactgtattggtagataagacgatt
gcaacagttcagaccaatttagctgaaggtgctgtgttggtcattgtcgttcttctcgtt
atgctgggtaatgttagggctgctttattaactgccatggtgatccctttatcgatgttg
atgttgatgactggcatggtagaaaccaaagtaagcgcaaatctcatgagtctaggtgca
cttgattttgggttaattgttgacggtgctgtaatcatagttgagaactgtattttaagg
ctggcaggaagacagcatcacctggggcgaatattgacattggatgaacgttttcagacc
gtctttacggctacccgtgaagtgtttactccaagtctgataagtgttttagttgttatt
atggtcaatttgccaattttggcgctgacaggtgtcgaaggtaaaatgtttactccaatg
gcaatggccgtaatcatggctttattgtctgcacttgtattgtctctcacttttgttcct
gcggcagtcgctttgtttatgacaggccacatagaagaaaaagacaactttatcgtcagt
caatctaaacgattatatctgccaattttgtcgattgtgttgagattccgagtacttgta
atttcaatagcattgatatttgtgattttagtcggatttgttgcaacaaaaatgggaacc
gagtttgttcctaatcttgatgagggcgatattgcgatccaagcacttcgaattccaggg
accagtttaactcaatcattagatatgcagtttaagttggagaaggcaattctagagatt
ccggaggttaaaacttatttctcgagagttggtactgcagaggttgcgagtgatcctatg
gggccaaatatatctgatggttatgtgatgcttaaggatcatagtgagtggccaaatcct
gaaaagactaaggctcaacttttagaagaaataagtgaaaaactagccttactaccaggt
aatgctttcgaaataagccaacctattcaacttcggtttaacgaattgatttcaggtgtc
agatctgatttaggtataaaaatttttggagatgatttatctaaattactgagttcaggt
gctgaaatagcaaaagtgttaagtagtattgaaggggctgaaggcgtaaaagtagagcaa
gtttctggattacccatcttatcaattgatgctgacagagctgctatgtaccgtttaggc
ttaaacgtctcggatgtccaagatgtagttgctgctgcaacgggaggtgagagtgctggc
ttgatttttgatggtgatcaacgtttatcaatcgttgtaagggttgatgagagggttcga
ggaaatttagaagcgttagagcgtttacctattccgttacctgaaggtggttatgtacca
ttaagagaagtcgctaaacttactttagcacctggccctaatcagatttcacgtgaaaat
ggaaaacgaagattggtcgttagcgcgaacgtccgtggtagagatctaggcggatttgtt
gcagaagtacaaagtaaggttgctgagcaagtcaaattatctccaggatattggttagaa
tacggtggtacttttgagcaattacaatctgcttctgatcgtttaactatacttgtgcct
ataacattgataatgatatttgctcttttaatgatgacatttggctcagcaaaagacgca
gctttagtctttagtggagtaccactagcccttactggaggcgtcatagctttatggttg
cgtgatatccctctatctattacagctggtgtaggttttattactttgtgcggcgtttct
gttttgacgggggttatgatggtatctgcatttaaagatgaactggatcgtggaagtcct
atcgatcaagctattcaaactggtgcaatgttgcgattaagaccaattatgatggttgca
cttgttgcagcattagggtttttaccaatggcgcttaatactagcactggtgcagaagtc
cagagaccactagctacagtcgttattggtgggatcatttcatcaacattactcacttta
ttagtattacctggcttgtacagacttacttggcgaaagacgaaacagctaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
