Shewanella frigidimarina: Sfri_4001
Help
Entry
Sfri_4001 CDS
T00395
Name
(GenBank) major facilitator superfamily MFS_1
KO
K25223
MFS transporter, APGE family, 1-arseno-3-phosphoglycerate exporter
Organism
sfr
Shewanella frigidimarina
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sfr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sfr02000
]
Sfri_4001
Transporters [BR:
sfr02000
]
Major facilitator superfamily (MFS)
Phosphate and organophosphate transporters
1-Arseno-3-phosphoglycerate exporter (APGE) family [TC:
2.A.1.83
]
Sfri_4001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MFS_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABI73826
UniProt:
Q07VY8
LinkDB
All DBs
Position
complement(4768712..4769929)
Genome browser
AA seq
405 aa
AA seq
DB search
MGLDSLRSLSPSIKQYLLITGNYWAFTLTDGALRMLVVLYFHQLGYSPLNIAMLFLFYEI
FGVVTNLVGGWLGARLGLNNTMNIGLGLQIVALAMLTVSTEMLTVVYVMAAQALSGIAKD
LNKMSAKSAIKTLVPADAEGKLYQWVALLTGSKNALKGIGFFLGGVLLTSLGFRGAIILM
ASLLGIVWLCSLVALKDNLGKAKNKPKFKDIFSKSQSINILSAARMFLFGARDVWFVVAL
PVFLATTFGWDHWWVGSFMASWVIGYGVVQSVAPYFTGKRQGKVPSGRAVFAWATYLLLI
PVAIAVALHADFYVLESVVIGLLVFGAVFAINSSLHSYLIVSYAGSDGVSLDVGFYYMAN
AMGRLIGTVLSGWVYQAYGLEACLWISSGFIALAALISLKLPHKG
NT seq
1218 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggctggattcattgcgttccttatcaccatcgataaagcagtatttactgatcact
ggtaattactgggcatttaccttaaccgatggcgctttgcgtatgctggtggtgttgtat
ttccatcaattgggttacagcccgttaaatattgcaatgttgtttttgttttatgagatt
tttggcgtagtgactaatcttgttggtggttggttaggcgcaaggcttggcctaaataac
accatgaacattggcttaggcttgcaaatagtggcgttagctatgcttaccgtatccaca
gaaatgttgactgtcgtttatgttatggcggcacaggccttgtcgggtatcgccaaagat
ttaaataaaatgagtgccaaaagtgccattaaaaccctagtgccagcagatgctgaaggc
aaactttatcaatgggtggcgttgttaacgggctcaaaaaatgccttaaaagggattggt
ttctttttaggcggcgtattgctcacaagcttaggatttagaggcgccattatcttaatg
gcttcactattaggcattgtatggttatgtagtttagtggccttaaaagataatttgggc
aaagctaaaaacaaacctaaattcaaagatattttttctaaaagtcagtcgattaacatc
ctttcggcggcgcggatgtttttatttggcgctagggatgtatggtttgtggtggcacta
ccggtatttttagccacaacctttggttgggatcattggtgggttggcagctttatggcc
agttgggttattggttatggtgtggtgcaatccgttgcaccttatttcaccggtaaacga
caaggaaaagtacccagcggccgagcagtatttgcatgggcaacttacttactactcatt
cccgtcgcgattgcagtggcgttacatgcagatttttatgtgctggaaagtgtcgttatc
ggcttattagtgtttggtgcggtgtttgcgattaactcgtcattgcatagctacttaatt
gttagctatgccggcagtgatggtgtgtcactggatgtgggcttttactatatggccaat
gccatgggaaggttaatcggtacggtactgtctggttgggtgtatcaagcttatggttta
gaagcctgcttatggatatccagtggctttatagctcttgctgctttaatttcacttaag
ttgcctcataaagggtaa
DBGET
integrated database retrieval system