Shewanella frigidimarina: Sfri_4008
Help
Entry
Sfri_4008 CDS
T00395
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor, plug
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
sfr
Shewanella frigidimarina
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sfr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sfr02000
]
Sfri_4008
Transporters [BR:
sfr02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Sfri_4008
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABI73833
UniProt:
Q07VY1
LinkDB
All DBs
Position
complement(4778193..4780235)
Genome browser
AA seq
680 aa
AA seq
DB search
MLKLKMTFYSALFVFSASSTAIAADSDSLDLSLQELMNVEVTSVSKQKQSLSNSPAAIYV
VTSESIRRSGATSIPQALRDVPGLHVAQIDSQKWAIGSRGFNGRYNNKLLVLMDGRTLYS
PAFSGVYWEVQDTLMADIERIEVIRGPSAALWGANAVNGVINIITKHSADTLGGYGELGA
GDYEQGFAGFRYGSTLSDKVTSRVYLKGHERDSFELDLNDLESDLLVPFADAGKDNSWQH
LQLGGRIDIQLETDTSLTLSSDFYKSKMQQAPNIASTEAPLYRNYYTDEVKSDGFNLLSK
YTKALSATSEYSVQTYYDYANRDENLYGLSSETFDVDFQHQLIIGQNHNVVWGLGYRYIQ
DELGSSPILESSEASSTNTDLWSAFISDEIMLVKDELWLTLASRFEQNDYTGFEVQPNIR
LRWQLDTRNSVWTSIARAVRTPSRLENNISANALNIPPSDVAPLVKVWVSGNDNFESEEM
VSYEIGYRFIPASQWSFDTTVFYNDYGKLRSVSESDSTIDFSTFPNYISQYVLFGNSLDG
YNYGVELSSLWVATHSLQLRANYSFIQSEFGSSLNQNTDAPEHMLSTIIDWNITDDIDVN
FVWRFIDNNNVISQNGTSMKTIPSYHSVDIGLRWMVTPDISLSAFGKNLLHPTHLEYEGE
SLQFPYRVGPSYFVKATLSF
NT seq
2043 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaagctgaaaatgactttttattctgcattatttgttttttctgcgagttctaca
gctatagccgctgattcagactctttagatctcagtctacaagagttaatgaatgttgaa
gtgacttctgtatcaaaacaaaagcagtctctatccaattcaccagcagcaatttatgtt
gttacaagcgagagtattcgtcgctctggtgcgacctcaattccacaagcgcttcgcgat
gtgccagggctgcatgtagcgcagattgattcacaaaagtgggccattggaagtcgtggt
tttaatgggcgctacaataacaaattattggttttgatggatggccgaactctttattct
ccagcattctccggtgtctattgggaagtgcaagacacgcttatggctgacattgagcgt
atcgaagttatccgtggtccaagtgcagctttgtggggggcgaatgcggttaatggtgtg
attaacattatcactaaacacagtgccgacacattaggaggctatggagagctaggtgcc
ggagattatgagcaaggctttgctggttttcgttatggatcaacattgtctgacaaggtc
acgtcgagagtatatttgaaaggccatgaaagagattcgtttgagcttgacctaaatgat
cttgagagtgacttactggtaccatttgccgatgcaggcaaagataatagctggcagcat
ctgcaattaggtgggcgcattgatattcagctagagacagacacaagtctcacgttaagc
agtgacttttacaaatctaaaatgcagcaagcacctaatattgcatcaacagaagcgccg
ctatatcgaaattattatactgatgaagtcaaaagtgatggctttaacttgttatcaaag
tacaccaaagcattatcggcaacctctgaatatagtgtgcaaacttattacgattatgcc
aacagagatgaaaatttgtatggtttaagcagtgaaacctttgatgttgattttcagcat
cagctaattattgggcaaaatcataatgtggtttggggattaggataccgttatatacaa
gatgagctcggatccagccctattttagaaagtagtgaggcttcctcgacaaatactgat
ttgtggagtgcgttcatcagtgacgaaattatgctagttaaagacgagttgtggcttact
ctggcttcgcgttttgaacaaaatgactatacaggttttgaagttcaacccaatattcgt
cttaggtggcagttagatacaagaaacagcgtatggacttctattgctcgagcagtgcga
accccatcaagattagaaaacaatatatctgcaaatgcccttaatataccgccttctgac
gtggccccgctggttaaggtatgggtgtcgggtaacgacaactttgaatctgaagaaatg
gtctcatacgagataggatatcgttttattccggcaagccaatggtcttttgatactacc
gtattttataacgattatggcaaactgcgcagcgtgtcagagtctgacagtacaattgat
ttcagtacattccctaattatatttcgcaatatgtcttatttggcaatagtttggatgga
tataactatggggttgaattatcttcgctgtgggttgcaactcactcacttcagttaaga
gccaattacagctttatccaaagcgaatttggtagcagtttaaatcagaatactgatgca
cctgagcatatgttatcaacaataatcgattggaatattaccgatgatatagatgttaac
ttcgtatggcgttttatcgataacaataacgtgataagccaaaacggcacaagtatgaag
actattcctagctaccatagtgtggatattgggctacgctggatggttacgccggatatc
tcattatcggcgttcgggaaaaatttgcttcatcctacccaccttgaatatgaaggagaa
agcttacaatttccttatcgggtgggaccaagttactttgttaaagcgacgttaagcttt
taa
DBGET
integrated database retrieval system