Spiroplasma floricola: SFLOR_v1c07910
Help
Entry
SFLOR_v1c07910 CDS
T05283
Name
(GenBank) bacteriocin ABC transporter
Organism
sfz
Spiroplasma floricola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
Peptidase_C39
ABC_membrane
AAA_21
AAA_29
Guanylate_cyc_2
AAA_22
AAA_18
Peptidase_C39_2
RsgA_GTPase
NPHP3_N
NACHT
cobW
AAA_16
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUB31839
UniProt:
A0A2K8SEG8
LinkDB
All DBs
Position
complement(915487..917523)
Genome browser
AA seq
678 aa
AA seq
DB search
MINLNYKFLKQKGENDCGIAISSMLINYYHNKDFGIEEIKFENSLNDEMLSLYDIENLLT
KYKIEFVSYTCNFNELLEIDITNPIVLNVLNDNDLDHFIIVYKKRKNEFLIADPNLNDLK
WVSCDEIKKIYQGYLSTTKVFDKVNFKNKSLLNWFTFLKKFKLEISLLFIVSILLNVLIL
ISNNFIKIYMDNINLKNNKTMQLIFLTFALIFVVQTITSYFINKIIFTIKNKVTKDIFCF
YKTKLVDLNIEKFNSFSKEEWIKKLSYINSMSDFISQCTISLPLGLTLFLMSSLFLLLIS
PFILTLVLVQNLISVCLSIVCFYFMKELKLRKERKIIEFFLGYRQLLDGFEEIKYKNIEL
EIKTENYKNYLSTIKETKNIFNLDSKTQVLFSLTNKLFFYLIFYISIIYINQEKYSLPDL
LFYTAVSSYINIFFSNIESFILNIQETLIADKSLNFIFNSKDNNIEYKKINKIENITAKN
LYKYKSDSCLLKDFNFEFDKNTFIHGKSGSGKTTLLKLLSGHYEKYEGELIVNHNINFNN
LDKNSFLSKTIYLGQYDYLFNGTVWQNIQQFKNKVDFQILQDFHLIEILERNNIDLTKRI
YDNGYNLSKGQRQIINFIALFFTNKDLYLIDEPLSNVDKHTAYFLFKTFMEYKKSSLIIM
CDHDLAYSNFFEKRVEVI
NT seq
2037 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgataaatttgaattataagtttttaaagcaaaaaggagaaaatgattgtggtattgca
ataagttcaatgttaataaattattatcataataaagattttggaattgaagaaattaaa
tttgaaaattctttaaatgatgaaatgttaagtttatatgatattgagaatttattgact
aaatataaaattgaatttgtatcttatacatgcaactttaatgaactattagaaatagat
attacaaatccgatagttttaaatgttttaaatgataatgatttggatcattttataatt
gtctataaaaaacgaaaaaatgagttcttaatagctgatccaaatttaaatgatttaaaa
tgagtaagttgtgatgaaataaaaaaaatatatcaaggatatttatcaactacaaaagta
tttgataaagtaaattttaaaaataagagtctacttaattgatttacttttttaaaaaaa
tttaaactagaaatatcattattatttattgtttcaatattgcttaatgtcttaatttta
attagtaataattttataaaaatttatatggataatataaatttaaaaaacaataaaaca
atgcaattaatttttttaacttttgctttaatttttgtagttcaaacaataacttcttat
tttattaataaaataatatttacaataaaaaataaagttacaaaagatatattttgcttt
tataaaaccaaacttgtagatcttaatattgaaaaatttaactctttttcaaaagaagaa
tgaataaaaaaattatcttatataaattctatgtctgattttataagtcaatgtacaata
tctttaccattgggcttaactctttttcttatgtcttcattatttttacttttaatatct
ccttttattttaactttagttttagttcagaatttaatttctgtttgcttatcaattgta
tgtttttattttatgaaggagttaaaattaagaaaagagcgaaaaataattgaatttttt
cttggttatagacagttattagatggatttgaagaaataaaatataaaaatattgagcta
gaaattaaaactgaaaactataaaaattacttatctactattaaagaaactaaaaatatc
tttaatttagatagtaagactcaagtattattttctttaacaaataagctatttttttat
ttaatattttatatatcaattatttatataaatcaagaaaaatactctttacctgattta
cttttctatacagcagttagctcatatataaatattttttttagtaatattgaaagtttt
attttaaatatacaagaaacattaattgctgataaatcattaaattttattttcaattct
aaggataataatattgaatacaaaaaaataaataaaatagagaatataactgcaaaaaat
ttatataaatataaaagtgattcttgtttattaaaagattttaattttgagtttgataaa
aatacatttatacatgggaaaagtggtagtggtaaaactactttgttaaaacttttatct
ggacattatgaaaaatatgaaggggaattaattgttaatcacaatataaattttaataac
ttagataaaaactcatttttgagtaaaacgatatatttaggtcaatatgattatttgttt
aatggaactgtatggcaaaatattcaacagtttaaaaataaagtagattttcaaatttta
caagactttcacttaatcgaaattttggaaagaaacaatatagatttaacaaaaagaatt
tatgacaatggttataacttgagcaaaggtcaaagacaaattattaattttatagcctta
ttttttacaaataaagacttgtatcttattgatgaacctttaagtaatgttgataaacat
actgcttattttctatttaaaacttttatggaatataaaaaaagtagcttaattataatg
tgtgaccatgatttagcttattctaatttctttgaaaaaagagtggaggtaatctag
DBGET
integrated database retrieval system