Spiroplasma floricola: SFLOR_v1c07930
Help
Entry
SFLOR_v1c07930 CDS
T05283
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha (PolC)
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
sfz
Spiroplasma floricola
Pathway
sfz03030
DNA replication
sfz03430
Mismatch repair
sfz03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sfz00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
SFLOR_v1c07930 (polC)
03430 Mismatch repair
SFLOR_v1c07930 (polC)
03440 Homologous recombination
SFLOR_v1c07930 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
sfz03032
]
SFLOR_v1c07930 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sfz03400
]
SFLOR_v1c07930 (polC)
Enzymes [BR:
sfz01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
SFLOR_v1c07930 (polC)
DNA replication proteins [BR:
sfz03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
SFLOR_v1c07930 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
sfz03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
SFLOR_v1c07930 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
RNase_H_2
DNA_pol3_a_NII
DUF655
T6_Ig_like
DEDDh_C
DNA_pol3_a_NI
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUB31841
UniProt:
A0A2K8SEH5
LinkDB
All DBs
Position
complement(918112..922560)
Genome browser
AA seq
1482 aa
AA seq
DB search
MNKEVKDMFEKLNVFLEESEEVYFDGAHFYKEAEFSASINKLRVFIKIKDFLPIHLLNKI
ETILNTNTLIPTKLNLLVDNNNYSKELIWNHIEYVKEQKAEVKTGTIKILSPSTVEYFNE
HRIVIFNVSNETEKILLEEHKDYYKNKLLKYGFKDIDLEIKVKKNSQTDVLEPIREKYEK
ASKIIPNQQNEMSDSKPNYSLSKTKYRSNEEILNKPTYEKIVDLEEDAQNVTIQGEVISK
NTRKSKAGRNIYNIAITDGTSSVMCIFFQRNNDPTFFDEITEETKESLTGFENQIIRKGD
WVSFNGNFNFSTFDKGYIFYINKYKKIESKKTYRKDEAKVKRVELHTHTKMSVMDGVSSA
KSYIEAAKRFGWKSIAITDHLNVQAFPEAYYALLDVNKGVEEENKLKLIYGSELVMLQDE
AWIIKNPKNQNLREAKFVVFDLETTGLSPEYDEIIEFGANVYDYAKGTSKKYDILIKPTK
PISKFTIDLTHITNEMLEDKNSIEIEFKNIMEIIKDGILIAHNANFDFNFLQAFASKLGY
GELTNTVIDTLSLSRLLQPKLKNHRLGTVAKAYQILYDEKIAHRADYDAEVLTNMYEHMW
SEAKKITPIDVDSDWNKFNKNKFENENFRRSRGFHVNVLAKNQDGLKDLYKLISYSHTEN
FLGSPKIFQSKLLEMREKNNILIGSGCVNGIVFEYARTGTFKMLEEAINLFDYIEIQPLS
VYKKLLQTDDLTMDCLKKVILKIIEVSKKLNKKIIATSDAHYIDPELKQIRDIYINTKGL
GGVYHPLYDFKQRVKDNPDQHLRTTNEMLEEFKWLENSELINEIVIQNSLALSDLIDKNI
IPIKSGSYPPNIENVDKLLTDECYKNAKAIYGEELPEIVKTRLEKELASIIKHGFAVVYW
ISHLLVKKSNDDGYLVGSRGSVGSSFVATTSLITEVNPLKAHYICTECKYSDFDTSEEFK
CGYDLPDKMCPKCNSKLIGEGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQPIAHNFTKEIF
GENNVFRAGTISTVAEKTAYGFTMGYFEKQNANLDLIRKAEIERLASLSTGVKRTTGQHP
GGIIILPKEYEIEDFTPVNYPADDETSDWRTTHFDFHSIHDNLLKMDILGHVDPTALRML
YDLTGFDPIKVPTNDKKVYSLFSELSALKIDSQSILGETTGAIGLPEFGTQFVRNMLKET
KPKTFADLVQISGLSHGTDVYVGNAQSLIKDGVANISSVIGCRDDIMVYLMSKGLDSSNS
FNIMESVRKGKGLSKEWIALMKNHNVPEWYINSCLKIKYMFPKAHATAYVLMAYRVAWYK
IYYPEEYYAVWFSTRADFFDLETALKGKEAIKASIEDIKQRLNNKLPVTAKEISLITVYE
VLLEMFARGIEIKNIDFNISEGNRFVIFKEDNKKILIPPFNVIDSLGEAVAKSIVNARKD
RQITSVNDLKQRTQVTQTQIEIFAKLKITDNLKDDEQLSFNF
NT seq
4449 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaagaagtaaaagatatgtttgaaaaattaaatgtttttttagaagaatctgaa
gaagtttattttgatggagctcatttttataaagaagctgaatttagtgccagtattaat
aaattgagagtttttattaaaattaaagattttttaccaattcatttattaaataaaatt
gaaactattttaaatacaaacactttaattccaacaaaattgaatttactagttgataat
aataattattcaaaggaattaatatgaaatcatattgaatatgttaaagagcaaaaagca
gaggttaaaacaggaacaattaaaattctttcaccttcaactgttgagtattttaatgag
cacagaatagttatttttaatgtctctaatgaaactgaaaaaattcttttagaagaacat
aaggattattataaaaataaacttttaaaatatggttttaaagatatagatttagaaatt
aaagttaaaaaaaattcacaaacagatgtattagaaccaattagagaaaaatatgaaaag
gcttctaaaataattccaaatcagcaaaatgaaatgagtgattctaagccaaattattct
ttgtcaaaaactaaatatagatcaaatgaagaaattctaaataaaccaacttatgaaaaa
atagttgatttagaagaagatgctcaaaatgtaacaattcaaggtgaagttatctctaaa
aatactcgtaaatctaaagcaggaagaaatatttacaatattgcaataactgatggtaca
tcatcagttatgtgtatttttttccaaagaaataatgacccaactttttttgatgaaata
acagaagagacaaaagaaagtctgacaggttttgaaaaccaaattataagaaaaggagat
tgagtttcttttaatggtaatttcaatttctcaacttttgataaaggatatattttttat
attaataaatacaagaaaattgaatcaaaaaaaacttatagaaaagatgaagcaaaagtt
aaaagagttgaattacatactcacacaaaaatgtctgtaatggatggagtaagtagtgca
aaaagttatattgaagctgccaaaagatttggttgaaaatctattgctattacagatcat
ttaaatgtacaagcatttcctgaagcatactatgcactgttagatgttaataaaggtgta
gaagaagaaaataaattaaaactaatttatggtagtgaacttgtaatgttacaagatgaa
gcatgaattattaaaaatcctaagaatcaaaacttacgtgaagcaaaatttgttgttttc
gacttagaaacaacaggtttatctccagaatatgatgaaattattgaatttggagcaaat
gtttatgactatgctaaaggtacttcaaaaaaatatgatattttgattaaaccaactaaa
ccaatatcaaaatttacaatagatttaactcatattacaaatgaaatgttagaagacaaa
aattcaattgaaattgagtttaaaaatataatggaaattattaaagatggtattcttatt
gcccataatgctaactttgactttaacttcttacaagcttttgcaagtaaacttggctat
ggtgaattaacaaatactgtaattgatactttatcactttcaagacttttacaaccaaaa
ttgaaaaatcatcgattaggaactgttgctaaagcatatcaaattttatatgatgaaaaa
attgctcaccgtgctgactatgatgcagaagtacttacaaatatgtatgaacatatgtga
agtgaagctaaaaaaattactccaattgatgttgactcagattgaaataaatttaataaa
aataaatttgagaatgagaattttagaagatctagaggttttcatgtcaatgtattggca
aaaaatcaagatggattaaaagatttatataagctaatttcttattctcatacagagaat
tttttaggatctccaaaaatatttcaatcaaaacttttagaaatgagagaaaaaaataat
atcttaattggtagtggatgtgttaatggaattgtttttgaatatgcaagaacaggaact
tttaaaatgctagaagaggcaattaatctttttgattatatagaaattcaaccattgagt
gtttacaaaaaattattgcaaactgatgatttaactatggactgtttgaaaaaagtaatt
ttaaaaataattgaagtttcaaagaaattaaataaaaaaattattgcaacaagtgatgct
cactatatagatcctgaattaaaacaaattagagatatttatataaatacaaaaggattg
ggaggagtttatcatccactttatgatttcaaacaaagagtaaaagataatcctgatcaa
catttgagaacaacaaatgaaatgttagaagagtttaaatgattagaaaatagtgaatta
ataaatgaaatagtaattcaaaactcattagctctttcagatttaattgataaaaatata
attcctattaaatctggttcatatccacctaatatagaaaatgtggataaattattaaca
gatgaatgttataaaaatgccaaagcaatttatggagaagagttacccgaaattgttaaa
acacgtttagaaaaagaattagcttcaattattaaacatggttttgcagtggtttattga
ataagtcatttattagttaagaaatcaaatgatgatggttatttagttggaagtcgtgga
tctgttggaagttcatttgtggcaacaacatctttaatcacagaagtaaatccacttaaa
gctcactatatttgcactgaatgtaaatactcagattttgatacatctgaagaatttaaa
tgtggatatgatttgccagataaaatgtgtccaaaatgtaattcaaaattaattggagaa
ggtcatgatattccttttgaaacttttttaggatttgatggagataaagttccagacata
gatttaaatttttcaggtgaatatcaaccaattgctcataattttactaaagaaattttt
ggtgaaaataacgtttttagagctggtactatatcaactgttgctgaaaaaacagcttat
ggatttacaatgggatattttgaaaaacaaaatgctaatttagatttaattagaaaagct
gaaattgaaagacttgcaagtttatcaacaggagttaaaagaacaacaggacaacatcca
gggggaattattattcttccaaaagaatatgaaattgaagattttacaccagtaaattat
ccagcagatgatgaaacaagtgattgaagaacaacacattttgattttcactcaattcat
gataatttattgaaaatggatattttaggacacgttgatccaactgctttaagaatgtta
tatgatttaactggatttgatccaattaaagtcccaacaaatgataaaaaagtttactct
ttattttctgagctttcagctctaaaaatcgattcacaatcaattcttggagaaacaaca
ggtgcaattggacttcctgaatttggaactcaatttgttagaaatatgttaaaagaaaca
aaacctaaaacatttgcagatcttgttcaaatttcaggattaagtcatggaactgatgtt
tatgttggaaatgctcaatctttaattaaagatggtgttgcaaatatatcttctgttatt
ggttgtagagatgatattatggtttatttaatgtcaaaaggtttagactcttccaattca
tttaatattatggaaagtgttagaaaaggaaaaggactttcaaaagagtgaattgctctt
atgaaaaaccacaatgttcctgaatgatatattaacagttgtttaaaaattaaatatatg
tttccaaaagctcatgccactgcttatgtattaatggcttacagagtagcttgatataaa
atttactatccagaagaatattatgctgtttgattttcaactagagcagatttctttgat
ttagaaactgctttaaaaggaaaagaagcaattaaagcatcaattgaagatattaaacaa
agactaaataataaacttccagttactgcaaaagaaatctctttaatcacagtttatgaa
gtattattagagatgtttgcaagaggcatagaaattaaaaatattgattttaatatctca
gaaggtaatagatttgttatttttaaagaggataataaaaaaatattaatacctccattt
aacgttattgactctcttggagaagctgtggcaaaatctattgttaatgcacgaaaagat
agacaaataacaagtgttaatgatttaaaacaaagaacacaagtaacacagacacaaatt
gagatatttgcaaaacttaaaataactgataacttaaaagatgatgagcaactttcattt
aatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
