Spiroplasma floricola: SFLOR_v1c09680
Help
Entry
SFLOR_v1c09680 CDS
T05283
Symbol
virD4
Name
(GenBank) type IV secretion system protein VirD4
Organism
sfz
Spiroplasma floricola
Pathway
sfz03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sfz00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
SFLOR_v1c09680 (virD4)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T4SS-DNA_transf
TraG-D_C
TrwB_AAD_bind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUB32016
UniProt:
A0A2K8SEZ9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1114750..1117212)
Genome browser
AA seq
820 aa
AA seq
DB search
MQKNKWLNRYRKFILIALFIISIFSILFLTLFLLFLVVLFKTEFNFIITIEKFKYFNFQN
EKNLIIYLVTFLSLIHTIFIILFAHIKGKVKSKSLVKEAKEKAFGKATWDINEYENPISN
KIRVRNLQLTKFEKVYNKNFTEASYITRTQIDYKKKNLEIWGIPVKKAVHSITIGSTGSG
KTERIIYVSAFVNCQLEFEKKPCMVFSDPKGELHANLGSILEEQGYEILVLNLRDPMYSQ
SWNPLSNAYKFLISAINYVKEHVVQNTFHSKFGFESYIKKIKCRNHKAKNCSICKEEILK
NNTVNNDVEPNTEKYELALIWKEVLIYQIDDYWTNDEQLAKELISGETNKLKNLAYEEVN
NLSAILLNPGADDKNKQWYDGAQGLFKGFIFSMMEMIEEDIDSIAENQFNIVTVTTHLSD
KDKIQKFFKKWSEGRESNQSVIAANKVLTSSSQSIGNFFSIISTSLQLFEGNELRSLLCK
NNINLFEFVTSEKPKAIFMIVPDDKEQKHPLASLFISQLYQANVFKAGQNLIKFGKEQLE
RDVIFYLDEFGNFPAIVNFATILTVSRGRRMFFNLVLQSFEQLNSKYGADTASTIMANCL
LTVYLKSASTKTHEQISKMCGDTTVEVSNSTPNIDNKTGKKNFSYHLQKKPLIEPSDIKL
IFPPNKKENNKYAIVIYQEANPNIVTYEYFYKIKEIFGIEIQDKDISLNKSINFEKDYFI
NLFKLDIKPKINEDDLLTDNVNLNEALEKDGTSAREDIFSILKETTDQDIDKLLELKTRE
RNIRNDLYILQSKSEDLLSSNEKEEIKRLQKELKSLLKQI
NT seq
2463 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaaaaataaatgattaaatcgatatagaaaattcattttaattgccttatttata
atttctattttttcaattttatttttaactttatttctattatttttagtagttttattt
aaaacagaatttaattttattattacaatagagaaatttaaatactttaactttcaaaat
gaaaagaatttaattatttatttagttacttttttaagtttaattcatacaatatttatt
atcttgtttgctcatattaaaggaaaagttaagtctaaaagtttagtaaaagaagctaaa
gaaaaagcttttggtaaagcaacctgagatataaatgaatatgaaaatccaataagtaat
aaaattagagttagaaatctacaattaactaaatttgaaaaggtatataataaaaatttt
actgaagcgagttacattacaagaacacaaattgattataagaaaaaaaatcttgaaatt
tgaggaatacctgttaaaaaagcagttcactcaataacaattggttctacaggaagtgga
aaaactgaaagaattatttatgtatctgcttttgttaattgtcaattagaatttgagaaa
aaaccttgtatggtattttcagatccaaaaggggaactacatgcaaatttgggttcaatt
ttagaagagcaaggatatgaaatacttgttttaaatttaagagatccaatgtattcacaa
agttgaaatccattatctaatgcttataaatttttaatttctgcaattaactatgtaaaa
gaacatgtagtacaaaatacttttcattcaaaatttggatttgaaagttatattaaaaaa
ataaaatgtagaaatcataaagcaaaaaactgttctatttgtaaagaagaaattttaaaa
aataatactgttaacaatgatgttgaaccaaatacagaaaaatatgaattagctttaatt
tgaaaagaagttttaatatatcaaattgatgattattgaacaaatgatgaacagttagca
aaggaacttatttcaggagaaacaaataaattaaagaatctcgcatatgaagaagttaat
aatctatctgcaattttattaaatcctggagcagatgataagaataaacaatgatatgat
ggtgctcaaggtttatttaaaggatttattttctctatgatggaaatgattgaagaagat
attgactcaattgcagaaaatcagtttaatattgttactgttacaactcatttatcagat
aaagataaaattcaaaaattctttaaaaaatgaagtgaaggaagagaatctaatcaatct
gtaattgcagcaaataaagttttaacaagttcaagtcaatcaattggtaactttttttca
attatctctactagtttacaattatttgaaggaaatgaattaagaagtctattatgtaaa
aataatataaatttatttgaatttgtaactagtgaaaaaccaaaagctatttttatgata
gttcctgatgataaagaacaaaaacatccattagcaagtctatttataagtcaactttat
caagctaatgtatttaaagcaggacagaatttgattaaatttggaaaagaacaattagaa
agggatgtaatattttatcttgatgaatttggtaattttccagctattgttaactttgca
acaatattaacagtttctaggggaagaagaatgttttttaatttagttttgcaatctttt
gaacagttaaattcaaaatatggagcagatactgcaagtacaataatggctaactgttta
ctaacagtttatttaaaatcagcttctacaaaaactcatgaacaaatttcaaaaatgtgt
ggagatacaactgtagaagtatctaacagtactccaaatatagataataaaactggtaaa
aagaacttttcatatcatttacaaaaaaaacctttaattgaacctagtgatattaaattg
atatttccaccaaacaaaaaagaaaataataaatatgctattgtaatttatcaagaagca
aatccaaatattgtaacgtatgaatatttttataaaattaaagagatttttgggattgaa
attcaagataaagatatatctttaaataaatcaattaactttgaaaaagattactttatt
aatttatttaagttagatataaaacctaaaattaatgaagatgatttattaactgataat
gtaaatttaaatgaggctttggaaaaagatggaactagtgctagagaagatattttctca
attttaaaagaaactactgatcaagatattgataaattattagagttaaaaactagagaa
agaaatattagaaatgatttatatattttacaatctaaatcagaagatttattatcaagt
aatgaaaaagaagaaataaaaagacttcaaaaagaattaaagtctttattaaaacaaatt
taa
DBGET
integrated database retrieval system
