Selenobaculum gibii: P3F81_03420
Help
Entry
P3F81_03420 CDS
T09332
Name
(GenBank) autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein
Organism
sgbi
Selenobaculum gibii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WIW71374
UniProt:
A0A9Y2EVL7
LinkDB
All DBs
Position
731216..740839
Genome browser
AA seq
3207 aa
AA seq
DB search
MKKIISSKKKNPIAKKKYARLLAMVLGGCLMTGNVFAADLAAVASSDYTNSQVGKVTGSR
VTTHVDADPSAGVIKELNGDAGLYAINENGESKLVLRQYTYSTTELKPNRVLDVNGDWNN
PDQTGVIKAVANMHAAASNGKYLFATGYDLGQIGVAEIAGGSLKDQPSLTVNLKNCINDN
CSAGYGAKTTVHGEGIAVRGDKLYLVASVNLEGGYDNYDNGYLLQFNIKDNGSLEFNSYT
RVGKNADQVRLSFYNDSVFIPFIGGMQNYGAGNAESRIDVVKISNGQLNTTSQAIKKPEN
VKCDFRNLKILPNGTAYVMTYNLAATGSGMDAHVYKTTVSNLMSENPKNWEEIVSGQYEG
WFGKLDAEYYTKRLWLEAGDKLQVYTDGSTKPIVWNAKDFSTDEQYSLFNAVEIIPTDTV
NGELAQLKFMADEGLTQSSQTLNKRVNLNATSNSGDYKSSITGTASDVQYNAVTNDNSHY
HFDADKTINLGLEKSGGNLDNNILADIYANDGNDIVIDASANTLQLQAKNYIGTPVGIFA
GNGKNVSIDAGKLNIITSGYQGGNSLTNAIWNDAGKDKTSTIEINAPVNISMSDGLGGNG
IAIQKTDRWGEKSNEANDSSKVIIHGDVSILGADNTVWGIPINGENVYSRFNNAGILTAV
DKSEVVIDGNVDFAVYGNGVTTNAKDSKVSINGGKIVAPSSTQYGYYALSSYLGAINMNT
GIDGKTVGSNTVKLDGDLFALNTGTINLALINNNSYLNGIIDNGGTANLYLQNGATWYNA
KQNNRYADDNEDIGAGQISHVSRLTGGNTPQNRGVIYQKDSNPITIDRYSGNTLAWYDHN
TSSPAEIIGGAIHIKSADLDSTMTLWTGNNGINTADSATDSEKATLNTVLDNLAKKLVYE
GYKGKVENNLKGTVGIAEGMTSSSALKSGDITFSQITGEGSYQSTSNPPIPTEQITTSFT
TTLTGLKDNDIQYVNGGVVQKNATGQEGYRLTKDSTITVNDQNVTASNIGYYPAVVGILG
NGNDITVVADGKSLDLDCVSTTGTSQAIGVYANKNVNVQANNLNIKATAPGKTAAGIFVQ
NGGQAVINGNVDMSVKNSTDGDADGIYLYNGGSKLTINGDLNMKGNGEGDLAYGVLAAEK
GGYGTKVYQAKGIYMYDNSTDGGEVKITGKADIAVKGTGIDMRGSKNNKITIDSGSIITP
ESTTDEFKAIGIAAGTFNMGMTDQGIVNGKDVTVKGQIYALEKGTINLGLGSSNSLFAGV
VSNTNGGAINLFLEKGATWENTLNSKSATFNGSHVNTVSGGKTKQNQGVISQKDSNPITI
DKYSGYTTVLYGHDKTTPTNIIGGILTINSALGDSFITLRTDNVGLNTDSDKANDKNLVS
ETLNALANKLYYTAHTNGEKNLSGMVEIAEGLTAASASKKSGSITYKTDGQGQYEYTQAV
DAPKTDPITKSMTLTDDYEAIATVANAYGDKYVSALFNGSESTSKQNPMVIDMAGHNLTL
KSESPDKIAAGMFVSANDYINVKNNDATKKLSISSTINDTRGAMGIQLDGNSHLAISGAV
DIDGVSTNGDSVTGIHIQGQNSDIKIDGPLTMKNITAKRERGNGINAAGIRVTGDNSTVT
VNDIVDITGIRGNGLNTVGADSSISVKGGTITAAEDADKSKLFYAIRVDKGTVSVNMNGQ
NAGNTTTKINGDVFVNKEYGKRVVEYSGGELVDFTKNGNLNLALTDNQSFWTGVAGYSID
KSDYGTGGFTAHDAGDFNLYLQNGATWTNQQQSSVKQQTNNEATFSGSKVTKLTGGTDKD
HAGLIFQKDNRDITVDNYSGNMKVFYEHELSTPTTMIGGNIKINHAATDSGIIFSTDNAG
VTNENSNAVLNALANKLYYNAYISGERNLIGQAEITEGLTSSAKALKLVDMTFNETTGQG
EYKVPVIPDNQTETEFTRAITGNKETNSEYVDSGVLKENGTYSFTKDTTINAEKNLIAAG
AWMPKISSAISGSTEATSVLLDMNNKDLIINATTDTHTTGITAIGDGKVEIDHAGKITIN
TESTGGGQTAALYTNGGGHIVIHNGGENLEDKVLTVRANTTSIANGAVIKSMNGVGGKES
SIIIDGLVDVVADGNGDAKNGKGANEGISAVASTIEIGGGSIKAVNGAWCAIRAYGEFVS
NNYGTVNINVAKDEQGNIIGAGKNKTTIEGAIVTNGGMGTKGRVSIGLSTPDSYWKGDYT
DVTGYGVTQGQLGNVNLFMTNGANWTGYTKGTMNVDMSSGATWEGYNVGDNFNLSLSDQA
IWKNNNKTENPSKVQYLTGAKDKNKIGYIQMTQDATANLVIDNYSGNTLAWYDHNTASPT
ELIGGSITVKSAAPDSTMTLWTGNNGVNTATSATDAEKETLNTVLDNLAKKLIYTGYIGK
AEENLKGYVGIAEGMTSSSAIKNSEIKFSKTTGEGSYEHQITPPTPPIPPVIPSEFNTPI
GKDNANDEYKDVMDDTGRTYTFTKDTKVDVDDTKQVADGVTAAVYSNNKDTIINAEGKNI
VLDANGTANKSYGIAATAENSNINVNASNVTIHTSGSNESSGIYSDQGNVSIINNISVHA
KNGNGILAKDNGKVTINGDADITVDENNAQAVWASAGTVEIKGDTTINAVNKTALLAEAG
GQIKLDTTNKRVNITGDIENHGGSIAIVPGEDSVIKGAIRNTSGNVEISLGKGSVLEGGI
ETGSTQKTFSMMRNVSAEPITKLSLVDGAIWRFNADKDANVSDLVGGSKGHEGIIEQKSA
HEITAHTFSGNMNVKYASTYADGNLMINDNQGNFVINGLKAGSSNNSITISTDNNNVNAL
DNTSWEKTLNSLANKVQYNGVINEDGRVSNLTGMATVNESITAPSAKAEILFKNGTDSNI
IDKITFNNGSSGTITYGDYETAVMSGVKSAMTSAAMGWRTENNNLMKRMGDLRLSSGDVG
AWARIYRGKSSSDKNKTDYKANYNTVQVGYDKEVDGNWRVGTAISIMEGDSSYQYGGSGD
DKSKSIALYGTWNGEKGHYADLILKGTKLTNDYTVFNADGHQVEGDYDTWGTSISAEYGR
RIKQDNGFYYEPQLEFTYGHLNGSDYDATSDFMDVNGKYKTMNVNQSSMNSLIGRIGIAF
GREMEKNSVYAQLSYSHEFCGDMNTYYDADNMPKSTKQDFKDSWVTFMLGGTSQLNDKLY
AYGNFEKSIGGDIKTDWRIDAGLRWSF
NT seq
9624 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaataatatcaagcaaaaagaaaaatcctatagcgaaaaagaagtatgctaga
cttttagcaatggttttaggtggatgcttaatgactgggaatgtttttgctgcagattta
gcggcagttgcttcttcggattacacaaatagtcaagtaggaaaagttacaggatcaaga
gtaactacgcatgtcgatgcggatccatcagcaggcgttattaaagagttaaatggggat
gctgggctatatgcaatcaatgaaaatggtgaaagtaaactagtcttgagacaatatact
tacagcacgactgaattaaaacccaatcgtgtattggatgtaaatggggattggaataac
cctgatcagactggagtgataaaagcagttgctaatatgcatgcagccgcttctaatgga
aaatatttatttgcaacaggatatgatttaggtcaaattggtgtagcagaaattgcagga
ggctctttaaaagatcaaccgagtttaactgttaatttgaagaattgcattaatgacaat
tgtagtgctggttatggcgcaaagactacggtacatggtgaaggtattgcagtacgtggg
gataaactttacttagttgcaagtgttaatttggaagggggctatgacaattatgacaat
ggatatttattgcaatttaatattaaagataatggcagtttagagtttaatagttatact
agagtaggtaaaaatgcagatcaggttcgattgagtttttataatgattcagtgtttatc
ccgtttattggtgggatgcaaaattatggggcaggtaatgcagagtcaagaattgatgtc
gtcaaaatttctaatgggcagctaaatacaacatcccaggctataaaaaaaccggaaaat
gttaagtgtgattttagaaacctgaaaattttgccgaatgggacagcctatgtaatgact
tataatttagctgcgacaggtagtggaatggatgcgcatgtttataagacaactgtatct
aatttgatgtcagaaaatccaaaaaattgggaagaaattgttagtggtcagtatgaaggc
tggtttggtaagctggatgcggagtactatactaaacggctatggctggaagccggcgat
aaattacaggtatatactgatggcagtacgaagccgattgtttggaatgcgaaagatttt
tctaccgatgagcaatattctttgtttaacgcagttgaaatcatacctacagatactgta
aacggcgagcttgctcaattaaaattcatggcagatgaaggattgacccaatcgtcacaa
acattgaataaaagagtaaatttaaatgcaacaagtaatagtggtgactataaaagtagc
attacaggaacggcatccgatgtacagtataacgcagtaacaaatgataatagccattat
cattttgatgcggataaaacaataaacttggggctcgaaaaatcaggggggaatttagat
aacaatatattagcagatatctatgcaaatgatggcaacgatattgtaattgacgctagt
gcgaatacattgcaattgcaagctaaaaactatatcgggactccggtagggatttttgcg
ggaaacggtaaaaatgtaagtattgatgccggaaaattaaatattattacgagtggatat
caagggggaaatagtttaacaaatgctatttggaatgatgccggtaaagataaaacgagt
acgattgaaatcaatgctccggtaaatatttctatgagtgacggtttaggtggaaatgga
attgcgatacaaaaaacggatcgctggggcgagaaaagtaatgaagcaaatgatagttca
aaagttatcattcatggagatgtaagtattttaggtgcagataatacggtgtggggaatc
ccaataaacggtgaaaacgtttattcaagatttaataatgcaggcattttaacggctgtt
gacaaaagtgaagtcgtgattgatgggaatgtagatttcgcggtatacggaaatggtgtt
acgacaaatgccaaagatagtaaggttagtatcaatggaggaaagattgtagctccgtca
tccacgcaatatggatattacgcattatcatcttatcttggtgcaatcaatatgaatacg
gggatagatggaaaaacagtagggagtaatacggtaaaacttgatggtgatttatttgca
ctaaataccggtacgataaatcttgcactaataaataataattcttatttaaatggaatc
attgataatggtggcacagcaaatctatatttgcaaaatggtgctacttggtataatgca
aaacagaataatcgctatgcagatgataatgaagatataggtgcaggacagattagtcat
gtaagtcgtcttacaggtggaaacacaccacaaaatcgaggtgtgatttatcaaaaagac
agcaacccgattacgatcgataggtatagcggaaatactttggcttggtatgatcataat
acatcatcgccagctgaaataattggtggggctattcatataaaatcggcagatttagat
tctacgatgactttatggacaggaaataatgggattaatacagcagatagtgctacagat
agtgaaaaggcaactttaaataccgtattggataatcttgcaaaaaaactggtttatgaa
gggtataaaggtaaggttgaaaataatttaaaaggaacagttggtatcgcggaaggaatg
acatcttcatcggcgttaaaaagtggggatatcacatttagtcaaataacaggagaaggg
agttatcaaagtacaagtaatccaccaatacctacagaacagattactacatcatttact
acaactttgaccggacttaaggataatgatatccaatatgtaaatggcggcgtggttcaa
aaaaatgcgacgggacaagagggatatcgtcttacgaaagatagtacgattaccgtgaat
gatcagaatgtaacggcgagcaatattggctattatccggcagtcgttggaattttaggc
aatggaaatgacattaccgttgttgcggatgggaaatcgctggatttggattgtgtaagc
acaacgggaaccagtcaggcaattggtgtatatgcgaataaaaacgtaaatgtacaagcc
aataatttgaatattaaagcgacagctccaggaaaaacggctgcagggatttttgtccaa
aatggcggtcaagctgtaatcaatggaaatgttgatatgtcagtcaaaaactctactgat
ggtgatgcggatggaatttatctttataacggcggctctaagctcacaatcaatggtgac
cttaatatgaaaggaaacggtgaaggcgatttagcctatggtgttttagctgctgaaaaa
ggtgggtatggaacaaaggtatatcaagctaaaggcatttatatgtacgataacagtact
gacggtggggaagtaaagattaccggaaaagctgatattgccgttaaaggtaccggaatc
gatatgcgagggagcaagaacaataaaataacgattgacagtggaagtattatcacacct
gaaagtacgactgatgaatttaaagcgattggcattgcagcgggtacattcaatatggga
atgacggatcaaggaattgtaaatgggaaggatgtaactgtcaaagggcaaatttatgct
ttagaaaaagggacgattaaccttggattaggtagtagtaactccttgtttgcaggcgtt
gttagtaatacgaacggtggcgctattaatttatttttagaaaagggtgctacatgggaa
aatacgcttaattcaaaatcagctacttttaatggcagtcatgtcaatacagtatcgggt
ggaaaaacaaaacaaaatcagggtgtaatttctcaaaaagacagcaacccgattacaatc
gataagtatagcggatatactactgttttatatgggcatgacaagacaacaccgaccaat
atcattggtggaattttgacgataaatagtgcgttaggcgatagctttatcacattgcgc
acggataatgtaggattaaatactgattctgataaagcgaatgataaaaatctggtaagt
gaaacgttaaatgctttagcaaataaattgtactatactgcccatacaaatggagaaaaa
aatcttagcggtatggtagagattgctgaagggttaacggctgcttccgcaagtaaaaaa
tctgggtctataacgtataaaacagatggtcaaggacaatatgaatatacgcaagctgta
gatgcacctaaaactgatcctattacgaaaagtatgacattaactgatgattatgaagct
atagccacagtggcaaacgcgtatggtgataaatatgtaagtgcattgtttaatggtagt
gaaagtacatcaaaacaaaatccaatggttattgatatggcaggacataatttaacgttg
aaatcagaaagccctgacaagattgcagctggtatgtttgttagtgccaatgattatatc
aatgtaaaaaacaatgatgctactaaaaaattatctatcagttcgacgattaatgatacc
cgcggtgcaatggggattcagttagatgggaattctcatttagctatttcaggtgcggta
gatatcgatggcgtatcaacgaatggggatagtgtaacaggaattcatatccaggggcaa
aatagtgatatcaagattgatggtccattaacgatgaaaaatataacagcaaaacgagaa
cgagggaatgggatcaatgctgcgggaattcgagtgacgggggacaattcaactgttacg
gtaaatgatatcgttgatattactgggataagaggaaatggtcttaatactgttggcgca
gattcatcaatttccgttaagggtggaacgattactgcggcagaggatgctgataaatca
aaactgttttatgcaattcgcgtagataaaggtactgttagcgtgaatatgaacggtcaa
aatgccggaaatacaacgactaaaataaatggtgatgtctttgtcaacaaagaatacggt
aaaagagtagtagaatacagtggtggagaacttgttgattttacgaagaacggtaatcta
aatttagcacttactgataaccaatctttttggacaggtgttgcagggtattctattgat
aaaagtgattatggtactggcggatttactgcacatgatgcaggagatttcaacttatac
cttcaaaatggcgctacatggacaaatcagcaacaatcaagtgttaaacaacaaacaaac
aatgaggctactttcagtggtagtaaggtaacaaagttaacgggcggtactgataaagat
catgcaggtttgatattccaaaaagataatcgtgatattacggttgacaattatagcggt
aatatgaaagtcttttatgaacatgagttgagtacgccgacaacgatgattggtgggaac
ataaaaattaatcatgcagcaacggatagtggaattatttttagtaccgataatgcagga
gtaacgaatgaaaatagtaacgcagtattaaatgcattggcgaataagctatattataac
gcatatataagcggagaaagaaatcttattggtcaagctgaaatcacggaagggcttact
tcatcggcaaaagcactcaagttagttgatatgacatttaacgaaacgacggggcaaggg
gaatataaagtacctgtgattcctgataatcagactgaaacagaatttacgagggcgatt
accggaaataaagaaacaaatagcgaatatgtggatagtggtgttttaaaagaaaacgga
acgtatagttttactaaagatacaacaatcaatgcggagaaaaacctcattgctgccgga
gcttggatgcctaagattagttcggcaatatccggaagtactgaagctacatcagtgcta
cttgacatgaataataaagatttaataattaatgcaactactgatacacatacgacgggg
ataacggcaattggcgatggaaaagtagaaattgatcatgccggtaaaataacaataaat
accgaaagtacgggtggtgggcagactgctgcattatataccaatggcggtggtcatata
gtcatacataatgggggagaaaacctagaagataaagtattgacggtaagagcaaatact
acaagtatcgcgaacggtgcagtaattaaatctatgaatggagtcggcggcaaagaatca
agtattattattgatgggcttgtagatgtagtggcagacggtaatggtgatgcgaaaaat
ggaaaaggggcaaatgaaggcatcagtgcagttgcatcgacgattgaaattggtggaggt
agtatcaaagccgttaacggtgcttggtgtgcaattcgtgcttatggagaatttgtttcg
aataattacggcactgtaaacatcaatgtagcgaaagatgaacagggaaatatcattgga
gcaggcaagaacaagactacgattgaaggtgcgattgtaacaaatggtggaatgggaacg
aaaggtagagtgagcattggattaagtacgccagactcctattggaaaggtgattacaca
gatgtaacgggatatggtgtaacacagggacagttggggaatgtgaatttgtttatgacc
aatggtgcaaactggacaggatatacgaaaggaacgatgaatgttgatatgtctagcgga
gcaacttgggaaggatataacgttggtgataacttcaatttaagtctaagcgatcaagct
atttggaaaaataataataagacagaaaatcctagcaaagtccaatatttaactggtgct
aaagacaaaaataagattggctatattcaaatgacacaagatgctacggctaatttggta
atagataattatagtggaaataccttagcttggtatgatcataatacagcatctccgaca
gagctaattggtggttcgattactgtaaaatcggcagcacctgattcgacaatgacgttg
tggacaggaaacaacggtgttaatacagcaacgagtgcaaccgatgcagaaaaagaaacg
ctgaatacagtattagataatttggcaaagaaattaatttatacgggctatataggcaaa
gcagaagaaaatttgaaagggtatgtcggtattgcagaaggcatgacttcatcttcggcg
ataaagaatagtgaaattaaattcagtaaaacaaccggtgagggaagttatgaacatcaa
attacgccaccgactccgcctattccaccggtaataccaagtgaatttaatacgccaatt
gggaaggataacgctaatgatgagtacaaggatgtaatggatgataccggaaggacatat
acgtttacgaaagatactaaagtcgatgttgacgatactaaacaagtggctgacggtgtt
actgcagcagtatatagtaataataaagacactataattaatgctgaaggtaaaaatatt
gtattagatgcgaatggaacagcaaataaatcttatggtatagctgctacggctgaaaat
agcaatataaatgtaaatgcgagcaacgtgacaattcatacatccggtagcaatgaaagt
agtgggatctatagcgaccagggaaatgtaagtatcataaataatatttcagttcatgcg
aaaaatgggaatggaattttagcaaaggataatgggaaagttacaattaatggtgatgct
gatattactgtagatgaaaataatgcacaagcagtttgggcttctgccggcacggttgaa
ataaaaggtgataccacgattaatgcagttaataaaacagcactgctagccgaggcaggt
ggtcaaataaaacttgatacaacgaataaacgtgtgaatatcacaggcgacattgaaaat
catggtggaagtatagcgattgttccaggggaagattctgtaattaaaggcgcgataaga
aatacaagtggtaatgtagaaattagtttaggcaagggatcggtcttagaaggtggcatt
gaaaccggatctactcagaaaactttttcgatgatgcgtaatgtatcagcagagccaata
actaaactttctttagtagatggtgcaatatggaggtttaatgcagataaagatgctaat
gtaagtgaccttgttggaggaagtaaaggtcatgaaggaatcattgaacaaaagtctgct
catgagattactgctcatacctttagtggtaatatgaatgtaaaatatgctagtacatat
gctgatggaaatttaatgattaatgataatcagggtaattttgtaattaatggactaaaa
gcaggttcgagtaataacagtattacgatttctactgataataataatgtaaatgcattg
gataatacttcatgggaaaaaacgttaaacagcttggctaacaaagtgcaatataatggc
gtaattaatgaagatggacgagtaagtaatttgactggtatggcaactgttaatgaaagc
attactgcaccatcagcaaaagcagagatattatttaaaaatgggactgatagcaatata
atagataaaattacgtttaataatggttcaagtggaactatcacttatggtgattatgaa
actgcggtgatgagtggagtaaaatctgcgatgacatcagctgctatgggatggcgcact
gaaaataacaatctcatgaaacgtatgggggatttacggttatcatccggagatgttgga
gcatgggcacgtatttatagaggaaaatctagtagtgataaaaataaaaccgattataaa
gcaaattataatactgttcaagttggctacgataaagaagtcgatggaaattggcgtgtt
ggtactgcgataagcattatggaaggtgacagcagctatcaatatggaggtagcggtgat
gacaagtctaagagtattgcactttatggaacatggaatggagaaaaaggacattatgcc
gatttgatcttgaaaggaacgaaactgactaatgattatacggtattcaatgctgatgga
catcaggtagaaggagattatgatacttggggaacctctattagtgcagagtacggtcgt
cgaattaagcaagataatggtttttattatgaaccacagttagaatttacgtatgggcat
cttaatggaagtgattatgatgcgacgagtgacttcatggatgtcaatggcaagtataag
acgatgaatgtaaatcaaagtagtatgaatagtttgataggacgtattgggatagcattt
ggtagagaaatggagaaaaacagtgtttacgcacaattatcatatagtcatgaattctgt
ggtgatatgaatacgtattatgatgctgataatatgccaaaaagtacaaagcaagatttt
aaagacagctgggtaacattcatgttaggcggaacttctcaactcaatgataaactttat
gcctatggtaatttcgagaaatcaataggtggcgacataaaaactgactggcgtattgat
gctggtttacgttggagtttctaa
DBGET
integrated database retrieval system