Sinocyclocheilus grahami (golden-line barbel): 107582926
Help
Entry
107582926 CDS
T04918
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(I) chain-like
KO
K06236
collagen type I alpha
Organism
sgh
Sinocyclocheilus grahami (golden-line barbel)
Pathway
sgh04510
Focal adhesion
sgh04512
ECM-receptor interaction
sgh04518
Integrin signaling
sgh04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sgh00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
107582926
04518 Integrin signaling
107582926
09140 Cellular Processes
09144 Cellular community - eukaryotes
04510 Focal adhesion
107582926
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
107582926
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
sgh00536
]
107582926
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
sgh00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
107582926
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
COLFI
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107582926
NCBI-ProteinID:
XP_016124437
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1391 aa
AA seq
DB search
MKEKDRVCLMDGPLAPSGLFGDAVDSFVDRYQEAQFHEPSVEGPRGPAGEKGDRGPPGPS
GNDGIPGQPGLPGPPGPPGPPGLGGNFSPQMSGGFDEKSGGAMAVPGPMGAMGPRGPPGP
PGTSGPQGFTGHPGESGEAGAPGPMGPRGSAGPPGKNGEDGESGKPGRPGERGPSGAQGA
RGFPGTPGLPGIKGHRGFSGLDGAKGDSGPAGPKGEPGASGENGTPGAMGPRGLPGERGR
SGPPGAAGARGNDGAAGAAGPPGPTGPAGSPGFPGGPGAKGEVGAQGSRGAEGPQGTRGE
PGNPGPAGAAGPAGNNGADGAPGLKGAPGASGIAGAPGFPGPRGPPGAAGAAGAPGPKGN
TGEVGTPGSKGEAGAKGEAGAQGVQGPPGPSGEEGKRGARGEPGSAGTRGPPGERGAPGG
RGFPGADGSAGPKGATGERGGPGAVGPKGATGEPGRNGEPGMPGSKGMTGSPGSPGPDGK
TGTPGASGQDGRPGPPGPLGARGQPGVMGFPGPKGAAGEAGKPGERGVMGALGATGAPGK
DGDVGAPGAPGTAGPAGERGEQGPAGPPGFQGLPGPQGSTGEPGKSGEQGLPGEAGALGP
VGSRGDRGFPGERGAPGPAGPAGARGSPGSAGNDGAKGDAGAPGASGTQGSPGLQGMPGD
RGSAGLPGLKGDRGDQGAKGADGSLGKDGIRGMTGPIGPPGPAGAPGDKGETGAPGLVGP
NGARGPPGERGETGSSGPAGFAGPPGADGLPGAKGEPGDNGAKGDAGLPGPAGATGTPGP
QGPVGSTGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRVGPPGPAGNAGPPGPSGVPGKEGQKGNRGE
TGPSGRTGEIGAAGPPGAPGEKGAPGAEGPSGSSGIPGPQGIAGQRGIVGLPGQRGERGF
PGLSGPSGEPGKQGPSGPSGERGPPGPMGPPGLAGSPGEPGREGTPGNEGSAGRDGAAGP
KGDRGETGTAGTPGAPGPPGASGPLGPAGKTGDRGESGPGGPAGPAGPSGPRGPAGPAGA
RGDRGETGEAGERGMKGHRGFTGMQGPPGPPGPSGEPGPAGASGTGGPRGPAGSSGAAGK
DGMSGFPGPIGPPGPRGRTGEIGPAGPPGPPGLAGPPGPSGGGFDIGFIAQPQEKAPDPF
RSYRADDANVMRDRDLEVDTTLKSLSQQIESIISPDGTKKNPARTCRDLKMCHPDWKSGE
YWIDPDQGCNQDAIKVYCNMETGETCVYPTESSIPKKNWYTSKNIKEKKHVWFGEAMTDG
FQFEYGSGDSKPEDVNIQLTFLRLMSTEATQNITYHCKNSIAYMDQASGNLKKALLLQGS
NEIEIRAEGNSRFTYSVTEDGCTSHTGAWGKTVIDYKTTKTSRLPIIDIAPMDVGAPNQE
FGIEVGPVCFL
NT seq
4176 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagagaaggacagggtctgccttatggatggcccgcttgcaccttctggtctgttc
ggcgatgccgttgattccttcgtcgacagataccaggaggctcaattccacgagcccagt
gttgagggaccaagaggtcctgccggtgagaagggtgacaggggtcctcctggtccttcc
ggcaatgatggaatccctggacagcctggccttcctgggcccccaggcccccctggacct
cctggccttggtggaaacttttctcctcagatgtctggtggatttgatgagaaatccgga
ggagcaatggctgtcccaggccccatgggagctatgggcccccgtggaccccctggacct
cctggaacttctggaccccaaggatttactggccaccctggtgaatctggtgaggctggt
gctcctggtccaatgggtccccgtggttcagctggtccccctggaaagaacggagaggat
ggtgagtctggcaaacccggtcgccctggtgagcgcggaccctctggcgcacagggtgct
cgtggattccccggaaccccaggacttccaggcatcaagggacacagaggattcagcggt
ctagatggagctaagggagactctggccctgctggacctaagggtgagcctggtgcctct
ggtgagaacggaactcctggagctatgggtcctcgtggtctgcctggtgagagaggccgc
tctggtcctcctggtgctgctggtgctcgtggtaacgatggtgccgctggagctgctggt
cctcctggcccaactggccctgctggttctccaggattccctggtggccctggagctaag
ggagaggttggtgctcagggatctcgtggtgcagagggaccccagggaacccgtggtgag
cctggtaaccctggacctgctggtgctgctggacccgctggtaacaatggagctgatggt
gcccctggtcttaagggtgctcctggtgcttctggtattgctggtgctccaggtttccct
ggacctcgtggtcctcctggagctgctggagctgctggtgcccctggccctaagggtaac
actggtgaggttggcacccctggttccaaaggagaggctggtgctaagggagaggctggt
gcccaaggagttcagggtccccctggcccctctggtgaggaaggcaagagaggagctcgt
ggtgagccaggttctgccggtacccgcggaccccctggtgaacgtggtgctcctggtggt
cgtggtttccctggtgctgatggatctgcaggtcctaagggtgccactggtgagcgtgga
ggccctggagctgttggacctaagggtgccactggtgagcctggccgcaatggtgaacct
ggtatgccaggatccaagggtatgactggtagccctggcagccctggacctgatggaaag
accggaactcctggtgcttctggacaagatggccgccctggaccacctggcccccttgga
gccagaggacagcctggtgtcatgggattccctggacctaagggtgctgctggtgaggct
ggcaaacctggtgagagaggtgtgatgggtgctcttggtgccactggcgctcccggtaaa
gatggtgatgttggtgcccctggtgctcctggaactgctgggcctgctggtgagagaggt
gaacagggacctgctggtcctcctggattccagggtctgccaggacctcagggttcaact
ggtgagcctggcaagtctggtgagcagggtcttcctggagaggctggagctcttggacct
gttggatccagaggtgacagaggattccctggtgagcgtggtgcccctggccctgctggt
cctgctggtgcccgtggttctcctggttcagctggtaatgatggtgccaagggtgatgct
ggtgccccaggtgcctctggtactcagggttctcccggacttcaaggaatgcctggtgac
cgtggttctgctggtctgccaggtcttaagggtgacagaggtgaccaaggtgccaagggt
gctgatggttcccttggtaaagatggcatccgtggtatgaccggaccaattggacctcct
ggacctgctggagctcctggtgacaagggagagactggtgctcctggacttgttggacct
aatggtgcccgaggaccacctggtgagcgtggagagactggttcttctggacccgctgga
tttgctggacctcctggtgccgatggtctgcctggtgctaagggagagcctggagacaat
ggtgctaagggtgacgctggtcttccaggacctgcaggagcaactggtacccccggacct
cagggtcctgttggttctactggacccaagggtgcccgtggtgctgctggtcctcctggt
gctactggtttccctggtgctgctggcagagttggtccccctggccctgctggaaatgct
ggacccccaggaccttctggagtccctggtaaggagggccagaaaggtaaccgtggtgag
actggaccttctgggcgcactggtgaaattggtgctgctggaccacctggtgctcctggt
gagaaaggagctcctggagccgagggtccttctggctcttctggtatccctggacctcaa
ggtattgctggtcagcgtggtattgttggtctccctggacaaagaggcgagcgtggtttc
cctggtctctccggcccatctggagagcctggcaaacaaggaccttctggtccctctggt
gaacgtggacctcctggacccatgggaccccctggattggctggatctcctggtgagcct
ggtcgtgagggaactccaggtaatgagggttctgctggacgtgatggtgctgctggcccc
aagggtgaccgtggtgagactggcactgctggcactcccggtgctcctggacctcctggt
gcttctggaccccttggccctgctggaaagactggtgatcgtggagagtctggccctggt
ggtcctgccggtcctgctggcccttctggtccccgtggacccgcaggacccgctggagct
cgtggagacaggggtgagactggtgaggctggcgagagaggcatgaagggacacagagga
tttaccggaatgcagggacccccaggacctcctggaccctctggagaacctggacctgct
ggagcttctggaactggtggacctagaggcccagctggatcttctggagccgctggtaag
gatggtatgagcggatttcctggacccattggacctcctggaccccgtggtcgcactgga
gaaattggaccagctggacctcctggacctcccggactcgctggacctcctggaccctct
gggggtggatttgatatcggcttcattgcccagccacaggagaaggcccctgatcccttc
cgttcctaccgtgccgatgatgccaatgtgatgcgcgaccgtgaccttgaggttgacacc
accctcaagtccctgagccaacagattgagagcatcatcagcccagatggcaccaagaag
aatcctgcacgcacttgccgtgacctgaagatgtgccacccagactggaagagcggcgag
tactggattgaccctgaccagggctgcaaccaggatgccatcaaggtctactgcaacatg
gaaactggcgagacctgcgtctacccaactgagtcctccattcccaagaagaactggtac
acaagcaagaacatcaaggagaagaagcacgtctggtttggagaggccatgaccgatggc
ttccagttcgagtatggcagtggggactctaagcctgaggatgttaacattcagctcacc
ttcctgcgcctcatgtccactgaggccacccagaatatcacataccactgcaagaacagc
attgcatacatggaccaggcttctggcaacctgaagaaggctcttctgctgcagggctcc
aatgagatcgagatcagagcagagggcaacagccgcttcacatacagtgtcactgaggat
ggttgcacgtcgcacaccggtgcatggggcaagacagtcattgactacaaaacaacgaaa
acatcccgtctgcctattattgacatcgcccctatggacgttggtgcacctaatcaggaa
tttggcattgaagttggcccagtctgcttcttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system