Shewanella glacialimarina: FJ709_00370
Help
Entry
FJ709_00370 CDS
T07885
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
sgla
Shewanella glacialimarina
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_5
SO2946-like_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UCX03115
LinkDB
All DBs
Position
89909..91900
Genome browser
AA seq
663 aa
AA seq
DB search
MSQFSKGFALGALVLLLAGCGGGSDSSPAITPPPVTPPVTPLPTFKVQDDPVNTSTMALS
VAESFIQVGTFANTIIKQASFNDLGIDKSCNNGGISTRTINDIDGSNTISAADVISIDYR
DCYIPSLNSTISGVVAVKIVSLNSDDGKTLAEVNLSDVEFDGETLLQFKGVLGTEIQKLA
DSQKTTVKNIGSVSLIVDRNADLKMNFVNTAITRSEQLSDATYSISGAGKIELPVAAVSF
SFAFKEPLVGHFSEYPHKGLMHVFTSNTDIVETSSNFVTNSESMNVKSGSDIYSISWSYA
VEGSLWWFSGGANNYVNAYRSDNFDFVGVLNSDLLTEFPASGGTVQFLMSRPVKSGAYTT
TFNTTNWPYQNIAATVSVAGAIVSITPKTPLAAGREYEIDSFELVSTQDVTRYVYRISGI
HINDAILMSLDKGTGLYQADDFPTLDASKSVMNKGTKLNFKWIDVNNVGLVFADKSASKT
TFSAPAGHANDISVRLEIDNGQGYAISSDFTIKYFTPSDTVLHFVSSTGDYIGGGQTLTL
DTSEALFNVSSNGSENEDHLSVSIRTNTWWTLDIAAPKGEKLALKKYENATRYPFQSPVT
AGLSFTGDGRGCNNSLGSFEILELVYDANNNVEKLAVNFQQSCENTNPLLIGLLRVNSSA
KLN
NT seq
1992 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagccagttttcaaagggatttgcattaggtgcattggtacttttattagcgggttgc
ggcggtggatctgattcttcgcctgcaattacgccaccaccagtgacgccaccagtcact
ccgcttccaacctttaaagttcaagatgatcccgtaaacacatcgactatggccttgagt
gtggcagaaagctttattcaggttggcacatttgctaataccattatcaaacaagctagt
tttaacgatttaggtatcgacaaaagttgtaataacggcggtatttccacaagaacaatc
aatgatattgatggcagtaacacaatttcagcagctgatgttatttctattgattaccgt
gattgctacatcccctctctaaatagcactatttcaggcgtagttgccgttaaaatcgtt
agccttaattctgacgatggtaaaacactcgcagaagttaatttatcggatgttgagttt
gacggagaaacccttcttcagttcaaaggggttttgggtaccgaaattcaaaagctcgct
gatagtcaaaaaaccacagttaaaaatataggtagtgtatcgcttattgttgatcgcaat
gctgatctgaaaatgaactttgttaatacggcgattacccgttctgagcagctttcagac
gcgacctatagcattagcggggcggggaaaattgaattacccgtggcggcagtgagtttt
tcttttgcatttaaagaacctttagttgggcacttttctgagtatcctcataagggcttg
atgcatgtttttacttcaaataccgatattgttgagaccagcagtaactttgtgaccaac
tctgaatctatgaatgttaaatcgggttctgacatttacagtatttcttggagctatgct
gttgaaggttccttgtggtggttttcgggtggcgcaaataactacgtaaacgcctaccgt
tcagacaactttgattttgttggcgtgttaaatagcgatttgctgaccgagtttcctgcc
agtggtggaactgttcaatttcttatgtctagaccggtgaagtctggggcttataccacc
acattcaatacgactaactggccttatcagaacattgccgcaaccgtgtcagttgcgggt
gcaattgttagtattacacctaagacgccattagcagcaggtagagaatatgaaattgat
tcattcgaattagttagcactcaagatgtgactcgatatgtataccgaatttctggcatt
catattaatgatgcaatattgatgagcctggacaaagggacaggcttgtatcaggcggac
gacttccccactttagatgcatctaaatcggtgatgaataaaggcacaaaacttaatttc
aaatggattgatgtcaataatgtaggtcttgtatttgccgataaatcagcgagtaagacg
acattttctgctcccgcagggcatgctaatgatatttcagtacgccttgaaattgataat
ggtcagggctatgcaatttcatcagattttacaataaagtactttactcctagcgataca
gtgcttcattttgttagctcaacgggtgattatattggtggcggacaaacgttgacttta
gatacatcagaagcattatttaacgtttctagcaatggctcggaaaatgaagatcacctt
tcggtcagtattcgtactaatacgtggtggactttagatattgccgcgcccaaaggtgag
aagttagcactaaaaaaatatgaaaacgcaacacgctatccattccaatcacctgttacc
gcggggttaagttttaccggcgacggtagaggctgtaacaatagcctaggtagttttgaa
atattagaattggtatatgatgccaataataatgtggagaaattagcggtgaatttccaa
caaagttgtgaaaacaccaatccactattaattgggttattgcgcgttaattcttccgct
aagttgaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
