KEGG   Shewanella glacialimarina: FJ709_13825
Entry
FJ709_13825       CDS       T07885                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
sgla  Shewanella glacialimarina
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sgla00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:sgla02000]
    FJ709_13825
Transporters [BR:sgla02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   FJ709_13825
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug
Other DBs
NCBI-ProteinID: UCX05468
LinkDB
Position
complement(3161945..3164923)
AA seq 992 aa
MLKSKPSVLSLALATAGMSVMFMSYGANAADDIKPIVQHKTVKADASLEVDKTTSVQAAS
DAIADDTLAENDQAIERIAVKGYSRSLIDSLNSKRFSDTVSEQLSADDLGALPDVSMADA
LTRLPGISAVRTGGQAAEINIRGMSGGFVFSTLNGREQVSTSGSRSIEFDQYPSELISSA
AVYKSPKASLIEGGVAGTVELQTISPLSIDKDYSFVVNARGMHNDRASEVFGAEEYGSRL
SFSYQGKFLEDTVGIAVGYARLEQPSVATQFIGLAYNDSKELDGLANDTNGPVDNPSYEY
ISEGFEMQHLGGVETRNGYMGAIEWAPVDNFVLKADAFMSRFDSESFARGFRAKLGGRNA
SVANPVFDGNSVTGGTFNRTSKSYTRVEIVNDDNQDFDEVNNFGINADWQVTDRLNVNVD
VSLSSAKSDFRNGLLWANVAQDANAETPIFDENVSISYLLNGLDLPDVGFNQADAFSDID
RVMVSKYGIYPFLNEDEVKAYRVDFKYDLEMDVITSVEFGARYSDRNYSNDRSVFEYGND
GAFSKSQPPLKLTDDMTTVVDWQGDFSYFPSYLAIDLDSALNAWFPNGVPQPVQTWGNAG
GVIDPQGYTTNYSWTMLQSGEVYEEVLSAYVMANIDSEIAGIPVTGNFGVRMVDTDQSAT
MLQNVEGDVNLGAQNIADSIGIINQNYAPTVQGVSYTDYLPSINLNFKVAEDSQIRVAAA
KVMSRPPINRLAGDISASVSDDGKINGSSTNNPFLMPFYADQYDLSFEQYFDEGAFVAAI
FYKNIDSFIDTVAIENFDFKGNGFNVPEYITDEISGEQIATTNGTYTTAVNNAEGGYIRG
LELAYTQVFASLPDAWSGLGFNASYSYTESEVQSITNLGGDTTAQALPGLSNNVVSATLF
YSYEGFETRVSARFRDEFVSEQVAINEQVVNFDGETVIDYQASYQVTDGLGVLFQVNNLT
DEPTRSYFGTENKTGTLQYFGREFYMGFTYAM
NT seq 2979 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctcaaaagtaaacccagtgttttatcattggctttagcaacagcaggtatgagcgtg
atgttcatgtcttatggcgctaatgcagcagatgatataaagcccatagtgcaacacaaa
acagttaaagctgatgctagccttgaagtggataaaaccaccagtgttcaagctgccagt
gacgctattgcagatgacacgcttgcagaaaatgatcaagcaatcgagcgcattgccgtc
aaaggctacagtcgtagccttattgattcacttaactctaaacgatttagtgacacggtt
tccgagcaattatctgccgatgatttaggcgccttgcccgatgtctcaatggccgatgca
ttaacgcgtttaccgggtatttccgcggtacgaaccggtggccaggccgctgaaattaac
attcgcggaatgtctggcgggtttgtattttcaacacttaatggtcgcgaacaagtctct
accagtggttcgcgcagtattgagtttgaccaatatccttcagagctgattagctctgcc
gccgtttataagtcgcctaaggcttcactcattgaaggtggtgtagcggggacggttgag
ctgcaaactattagcccgttaagcatagataaagactatagttttgtggtcaatgccaga
ggcatgcataacgatcgcgccagtgaagtgtttggcgcagaagaatatggcagccgctta
agtttttcctatcaaggcaagtttttagaagatacggtgggtattgcggttggttatgcc
cgtttagaacaacctagcgtcgcgacgcagtttattggtttggcttataacgactctaaa
gagttagatggcctagcgaacgatactaacggcccggttgataacccaagctatgaatac
attagtgaaggttttgaaatgcagcacctaggcggcgtagaaacccgcaatggttatatg
ggcgccattgaatgggcacccgttgataactttgtgctcaaagccgatgcgtttatgtct
cgctttgacagtgaatcgtttgcccgtggttttcgcgccaaattaggcggccgtaatgct
agtgttgctaacccggtatttgacggcaacagcgtcactggcggcacgtttaatcgcacc
tcaaaaagctatacccgggtagaaattgttaacgatgacaatcaagactttgatgaagtt
aataattttggcattaatgccgactggcaagtcactgatcgtttaaatgtgaatgttgac
gtgtcgttatcatcggctaaaagtgatttccgtaacggtttgttatgggctaatgtcgcc
caagatgctaatgcagaaacccctatttttgatgaaaatgtgtcaatcagttatttactc
aatggcctagatttacccgatgtgggttttaatcaagccgatgctttttctgatatagac
cgcgttatggtcagtaaatacggtatttatccttttctgaatgaagatgaagttaaagcc
tatcgtgttgattttaaatacgacttagaaatggatgtgattaccagcgttgagtttggc
gcgcgttattctgaccgtaactattcaaatgaccgctcggtatttgaatacggtaatgat
ggcgctttttctaaatctcagccgcccttaaagcttactgacgacatgaccacagtggtc
gattggcaaggtgactttagttacttcccctcttatttagccattgacttagattccgcg
ttaaacgcttggtttccaaatggtgtaccacaaccggtacaaacctggggcaatgcgggt
ggcgttatcgaccctcagggttacaccactaactactcgtggaccatgctacaaagcggc
gaggtgtatgaagaagtattatctgcttatgtgatggctaacatcgattctgaaatagcg
ggtattcctgttaccggtaactttggtgtgcgtatggttgataccgatcaatcagccacc
atgctgcaaaacgttgaaggcgatgtaaacctaggcgcgcaaaatattgctgacagcatt
ggcattattaaccaaaactacgcgccaacggtgcaaggggttagctataccgattatctg
ccatcgattaacttgaacttcaaagtggctgaagactcacaaatacgggttgctgcagcc
aaagtgatgtcacgcccaccgatcaatcgtttagccggtgatatcagtgcatcagtatct
gatgatggcaaaattaatggttcaagcaccaacaacccatttttaatgccattttatgct
gatcaatacgacttatcctttgaacagtattttgatgaaggtgcatttgttgcggccatc
ttctacaaaaacattgattcattcattgataccgtcgcgattgaaaactttgactttaaa
ggcaatggattcaacgtacctgaatatatcactgatgaaatcagcggtgagcaaattgcc
accaccaatggcacttacaccaccgcagtgaacaacgctgaaggcggttacattcgaggc
ttggaactggcttacacccaagtgtttgcctcgctacccgatgcctggtctggattaggt
tttaatgcgagttactcctacacagaatctgaagtgcaatcaattactaaccttggcggc
gatacgacagcccaagctttacctggtctgtctaataacgttgtcagtgccactttgttt
tattcctatgaaggttttgaaacccgcgtaagtgcgcgtttccgtgatgaatttgtctcg
gaacaagtcgctattaatgagcaagtggttaactttgacggcgaaaccgtgattgattac
caggcatcataccaagtcactgacggtctaggggtgttgttccaggtgaataacttaacc
gacgagcctaccagaagttacttcggcaccgaaaacaaaaccggcaccttgcagtacttt
ggtcgcgaattctatatggggttcacttatgcgatgtaa

DBGET integrated database retrieval system