Shewanella glacialimarina: FJ709_19325 Help Entry FJ709_19325       CDS       T07885                                  Name (GenBank) alpha-amylase   KO K01176   alpha-amylase [EC:3.2.1.1] Organism sgla  Shewanella glacialimarina Pathway sgla00500   Starch and sucrose metabolism sgla01100   Metabolic pathways sgla01110   Biosynthesis of secondary metabolites Brite KEGG Orthology (KO) [BR:sgla00001]  09100 Metabolism   09101 Carbohydrate metabolism    00500 Starch and sucrose metabolism     FJ709_19325 Enzymes [BR:sgla01000]  3. Hydrolases   3.2  Glycosylases    3.2.1  Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds     3.2.1.1  alpha-amylase      FJ709_19325 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Alpha-amylase_C Alpha-amylase Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  UCX06774 LinkDB All DBs Position complement(4412265..4414217) Genome browser AA seq 650 aa AA seqDB search MSSSVFANPQPTTFVHLFEWNWQDIAQECEQFLGPNGYAAVQVSPPNEHIQGSQWWTRYQ PVSYVLQSRGGNRGQFIDMVSRCKAVNVDIYVDAVINHMASGSGTGTAGSAYGNKSYPAY SPQDFHNTCAIKDYNNRWEVQNCELVGLTDLNTSANYVQTSIAGFLNDLTNIGVAGFRFD ASKHMAVEDIQGVMSKVNGTPLVFQEVIDQGGEAISASEYTSVGLVTEFKYSTQLGNTFR NGNLASLKNFGEGWGFMASSSAVVFVDNHDNQRGHGGAGNVITFEDGRLYDLANVFMLAY PYGYPKVMSSYAFNGNTDVGAPSVRVHNNGNLECFDNNWKCEHRWGYIAGGVSFRNNTAD NWTTTNWWDNGNNKIAFGRGSSGFVAINKENSNLTATLATSMAPGTYCNVLKGKVAQDKR SCSGETIVVNNNGSINANVGAWDAFAIHQGAKLITGEVINNPDWKRTVIFVQAQTQSGQD MFVRGGIDHAYAASNLNKTCTSSNFECAIPIRHNNLRNTTTAPWKANDVYLDWYGPEAAQ SPESSGSALDWTTNLWPVAWGAKQTVANNGFGEEPLNIWGQHYWMLDVDMDCSKTVNGYF EVKAFVKNGQGWESNISQSNTPFPSSNHVAQCGKVNQFNFNSNGVQIGNL NT seq 1953 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgtcatcatcagtatttgccaacccacaaccgactacatttgttcatcttttcgaatgg aattggcaagatattgctcaagaatgtgaacaatttttggggccaaatggttatgcagcg gtgcaagtatccccaccgaacgaacatattcaaggtagccagtggtggactcgttatcag ccagtaagctatgtactacaaagtcgtggcggtaaccgtggtcagtttattgatatggtt agccgctgtaaggcggttaatgtagatatctatgttgatgcggtgattaatcatatggct agcggcagtggtacaggcaccgcaggcagtgcttatggtaataaaagctacccagcatat agcccgcaggactttcataacacatgtgcgattaaagattacaacaaccgttgggaggtt caaaactgtgagcttgttggtttaactgatcttaataccagtgctaattatgttcaaacc tcgattgcgggttttttgaatgatttgactaatataggtgtcgcaggctttcgctttgat gcctctaaacacatggccgttgaagatattcaaggtgtgatgtcaaaggtaaatggcaca cctttggttttccaagaagtgattgaccaaggtggcgaagccattagtgccagtgaatat accagtgtgggcttggtgactgagtttaaatactcaacccagttaggcaatacattccgt aatggcaatttagcatctttaaagaactttggtgaaggctggggttttatggccagcagt tccgcggttgtttttgttgataatcatgacaatcaacgtggtcacggcggcgctggtaat gtgatcacatttgaagacggacggttatatgacttagccaatgtatttatgttggcttac ccctacggttacccaaaagtgatgtcgagttatgcattcaatggcaataccgatgttggc gcgcctagcgttagggttcataacaatggcaatttagaatgttttgataacaactggaag tgtgagcatcgttggggctatattgctggtggggtgagttttcgaaataacaccgctgat aattggacgaccacaaactggtgggacaacggcaacaataaaattgcgttcggtcgtggt agttcaggttttgtggctattaataaagaaaactctaatttaaccgcaacattagcaaca tctatggcgccagggacttattgtaatgtgctaaaaggcaaggttgctcaagacaagcgc tcatgcagcggcgaaacgattgttgttaataataatggttctatcaatgctaacgtcgga gcttgggatgcgtttgccattcatcaaggtgctaagctcatcactggtgaggttattaat aatcctgattggaagcggacggttatttttgtgcaagctcaaacacaaagcggccaagat atgtttgtgcgtggtggcattgatcatgcctatgcggcaagtaatttaaataaaacctgt accagcagcaattttgaatgtgctattccaattagacataacaacttgcgtaataccact acagcaccttggaaagccaatgatgtttatctagattggtatggccctgaggctgctcaa agccctgaatcatcaggttctgcattagattggacaaccaatttatggccagtagcttgg ggagctaaacaaacggttgctaataatggcttcggagaagagcctttaaacatctgggga caacattattggatgttagatgtggatatggattgcagtaaaacggttaatggatacttt gaggttaaagcgttcgtcaaaaatggccagggctgggaaagcaatatcagtcagtccaac acaccattcccttcaagtaatcatgtcgctcaatgcggtaaagtgaatcaatttaacttt aatagcaatggcgtacaaataggtaacttgtaa

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