Saprospira grandis: SGRA_0483
Help
Entry
SGRA_0483 CDS
T01764
Name
(GenBank) conserved repeat domain protein
Organism
sgn
Saprospira grandis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ig_7
Por_Secre_tail
PKD_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFC23222
UniProt:
H6L9P4
LinkDB
All DBs
Position
complement(482443..492846)
Genome browser
AA seq
3467 aa
AA seq
DB search
MRQIILNFLLLFLSVTTVFGQLDGNLAWLLRDTDSPEPLMVGNSNGLFTNDRGLGVGKDS
DGNIYTAGMYNNYSIYLYKLSPAGEILWEVSIQTDRTISNPLSMGPSQGNTLAVGHDGIY
VAGSFRSTRNNATLIFSSTNSATPVTEVNQEPVFFVSKYGFDGRYIKTAYVRTNSNGGTV
YANSSQLQDIAVDDQGDCYVVGMSDKTLRPETGSERLKRGRCTGGGSSSDALIFKLDMSQ
FDELVWAKALDAEGTAIFRGVAVDGSHVYAVGDYIGDLIGEYNLENNPGTCISDSRGNYP
FTPDGIALKIDRSTGATVWRKSIESTTTTNSDQRIVDVAIDDNLGLFFSFEYESTANLRV
NGSTVNLPTLDVNPGAVTAHTVAVGRVIDDSAPTVNFSWLQRLGVPVNYRDVRLHGGSGL
VLDEIGNINVLFYSETIEDLAVGSSPMTTATVPVVQQIGFPVTGGSFTDAGIASFDASTG
SFNNHIQFWGTSAEYLTGIVFSEEAYYLSGYSTGVTNYSPAPGSPYTEESSYYDGFLAKY
DCPTIVLSAEKDTICLSESIEITAWTDSPEGSVNFQNTWTDVNNNVVLTNNLSTFSLNTN
NLGTNQVHLEAVEAYSACVSRDTFNFVVNPSVTVSTSLSNAVICFGDSTTLGASASPSAG
ASYIWLNSSGDTVSMVQNASLFDDDIYTVEANVDGCKGQASVNLDYYPFTAARIIPDTAK
ICANTGALLTVIDCPGCSYVWDPPTTSLASSNNEQILADIAGVYDVEISDQYGCPTILQK
DVQPGAYLTPPIYAEDINGVIRPSICNGRPVVIRSIPRASCSSCQYSWSDGTTGPFTFAM
GTGTYSVTVTDVVSGCEGRSNDLVIESSSLAVPQIDADPYNICGTNPAILQVDNPCLGCT
YSWYETDNNGTISSSVVGTGTVLSLPNVADTGSYIVQVTDTLACEEESAVADIGVGTTTP
PVITGTGSKLCGTNTITLSTNSCVDCHYQWYLNAAVIPGATSSSYVANQAGVFSVELQYP
NSCIHKSSDYTITFEAFNPKVDSTDLYLCNGAAVSLEIIGSYELPPNWSYQWYYNGVQIP
GSNGYTHSASQAGTYFLEVVNASGCRAFSDSVVVRSSSAGANPVLNASPSIYSCGGDSVT
LSVPPSPNCLYTFKLASGVNRQPDSINSYRTNVPNGYSVEVRDTISNCVYQSPVIEIKDT
VLPVPAVTVASATNICSTSPVILSTPACAGCQYIWTYSGYNEQGDTVTWQETVSQSTYSA
DTTGSYEVQTLQSGCASPVSNSVPITRLSYNAQLNTAPLANVCNQDTVIIEAVPDTTLCP
NCTYEWFQDNVQVPVPDTQDYFEVVQGGDYYVVVTQNYPGYSSSPYTFGCTDTSVVRNYS
DVSLGVAMRASSEAICGPSGQVVLEVDSCVGCTYNWYYDGDTTNGFNYSNLGVNDTFYLV
NGVAATGMYKVSVGLNGCFVEDSIYLYDTTALAIAIDTSTALYANICNGQPFELSSNCTS
CDSIRNLSLHYQWYQDSMLIPGAIGASYQIDNAADYQLVVSDDLGCVNYSPITTAIEVLP
PANFGLVLDSVAVVPISQGPILLDNYLQPVLVHNSGSYLSVPQATAVTTDSFIPALAGSG
SHIISFEYQNQNCFFETFDTIDVLSPPSLDVANLNPLAPAEEACVQDSLVFYLSNITLEP
NQILIATSATTYDTLAVSTAGLSEYAGVWSGNIPVVVPSSAVTGKVVLRDSVSGNEYVSD
FFLVVQNPSVAISLNGVPQPLCSSADTIALSGFPQPGIFKAAYAATPSTYEPSLISGNNL
LVENVQNYTPVSGTQQLEVTYVYQPTYSNNAAACPDSVVAVIPVSINNNEVDSIEFTPIS
VTETNVPMTDLTRLIWPLDSRFFPGFYVGTYINSGELLANTIPLAATANQTVDTAIYRFV
NGSCRNETEQLIDVWQKPITLDSIPKFLCRNADTIFIGRNANSMYLEIDGMTYLLDSNYA
YQPSLGVTDNVNYSYDEFINVMSLSSSNGGLQPISLTQGAERFAFIPALVSGTTTDLSIS
FRYERYHTYFTPTFSLNNVAYTIAELSKQVVIEDPIAAQINPAILADTIFCQDNSTQQFS
GIPNGGQYYINYQPLVGNLFNPNQQAASQGVGSHLLTYVYQGNACVDSTSTSIYIPDTFS
VSIFAPNGPTYCRLDPADTISVSSSVPGVLDTAAGMFLVGTTRSGQVFNPAFAPAVVGGN
NVVYIAQDTFGCEARDSALFTVFAMPDIAITALDSVYCLNADTTILDLYEHNTSWHLQAP
MAYNPGDVVQLTGNGVYNGGTNPTNPLYNPSAAGVGLDTITYDYTDVNGCNTVLTQYVEI
LPLPNLTLTTDNGVPLDSFYCEGDSVALFASPLGGDFFSLFSYEQGNPSNTIPSSFDTSV
SPPLFTPFISGTAIPFGEEGLAYTYQDPITLCKDTIVDTIQINNFLTDATITGLPTQICA
DDTIYVLGVNPNGGPMPTPGLTTGYFGAFAAIDTNMIVDAVAGHFNPALSGIFDRGRSAI
VTYTYLSNGCYNTVYDTAVLNPLPQLIYNMPGDSLFNRNDPTIHACFSQPAATLQAYNQY
QGNINPIPQYIGTQPSLSQSGIFTTSSGLGMTWSVTFGNWAYEAQQANGGVDTIHYSFTD
ARGCSNTRSEVIVIDTVPELGFAGFDSKYLDTITGRYVYCENDPASLIIPSPFGGTSYLN
YYEIPTGIFELIPDTLAYGDTTNIHRITYEFISARYHAGGVCLDSTIQMIEVRPTPDLQL
VNAPNTFCVADSAQRVPLSATPYGGTFEDITLGAIAGIVGDSLFNPMAQLGSRQVIYYYT
DTVSGCTDTIQHQIDVYNAPEVHFFSEGGCQGDSVQFNASPPGLSNSVPALDSITMVVWN
YGDGLSDTLFSLVDPVNVPTQYHNYAQPGIYFPSLTVVNRGQCDTSFSRRIVVSPKYLVN
DTMPYFQDFEADAGNWFQENEDSTINLPNDSLWAWGLADGFRITTIQYGNHVWATAPNGP
YPEAEAGWVYSPCFDISTLGRPMVKLNIWRDSRQGTDGAVMQYFDDSTQTWRNLGIRNKG
LNWYNPTYVVSDPGNQDGTPIGWSGTSNSWEDARYRLDVSGGDLRNRDNLRFRIAFAAAN
GSGGALYEGFAFDDVYIGNRSRSVLLEHFSNQNYAGIDDIERDLYSTVYSNLYGRDVQIL
QIHTNYGGYDYLNVFSADESSARVLYYGINDADQVRLNGSALANTTSSLVRYQQELMDMQ
MLQDAKFDIKMFPVNVQNGVLSTAFEIEALEDVMLLTDSLDVHVAITQDSIPSLQAHTMM
SVLKAMRPDGAGEQIPSAWVMGDVLPYTRTWTFDPTQIDPTQLKVTVFVQNRQSKEVLQV
NSSRNLNLFNGPVAIEELADEDGAEILDLNLYPNPAKEQFQVDFGAPLKGDYNWQLVDLL
GRRLKDGQLQPGLQNLQIQTDGLTPGVYIFSVYNETVYSQRKVVIYR
NT seq
10404 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagacaaattatacttaattttttgttgttgtttttgtcggtaacgacagtatttgga
caattggatggcaaccttgcgtggttgttgcgggatacggattcgccggagcctttgatg
gtggggaatagcaatgggttgtttaccaatgaccgcggtttgggggtaggaaaggacagt
gatgggaatatatatactgcggggatgtataataattatagtatttacttgtataagcta
tcgcctgctggagaaattttgtgggaggttagtatacagacagatcgtacaatttctaat
cctttgagcatggggccttctcaggggaacaccttggctgttgggcatgatgggatttat
gtggcgggatcatttcgatctacgaggaataatgccactttaattttttcgagcactaat
agtgctactccggtaacggaagtgaatcaggagcctgtattttttgtaagcaagtatgga
tttgatggtcgttatataaaaacggcttatgtgcgtacaaactctaatggagggacggtt
tatgctaattcttctcagttacaggatattgctgtagatgatcagggggattgttatgtt
gtgggaatgtctgacaagacacttcgtccggagacaggttctgagcgtttgaagcggggg
cgttgtactggaggaggatcttcttctgacgcacttatttttaagttggatatgagtcaa
tttgatgaattggtttgggccaaggcattggatgcggaggggacggctatttttcgtgga
gtagctgtagatggaagtcatgtttatgctgtaggggattatattggagatttgataggg
gagtataacttggagaataacccgggtacttgtataagtgattcgcgggggaactatcct
tttactccggatggaattgcattaaagatagatcgttctacaggggcaacagtttggcgc
aagagtatagaatctacgacgaccaccaactcggaccaacgtattgttgatgtagcaatt
gatgataatttggggctgtttttttcttttgagtatgagagtacagctaacctacgggta
aatgggtctacggtgaatttaccaacattagatgttaatccaggagcagtaacagcgcat
acggttgctgtaggtcgtgtaatagatgacagtgctcctacagttaatttttcttggtta
cagcgtttgggggtacctgtaaactaccgagacgttcgtcttcatggggggagtggttta
gtattggatgagataggaaatatcaatgtattattctattcggaaacgatagaagactta
gctgtaggcagttctcctatgacaacggctactgtgccggttgttcagcagattggtttt
ccggtgacgggaggcagttttactgatgcggggattgctagttttgatgcgagtacgggt
agttttaataatcatatacagttttggggaacatctgctgagtatttaacaggaattgtt
ttttcggaggaggcttattatttgtctggatatagtacaggcgtaactaattattctcct
gcgccaggatctccctatacagaggagagttcatattatgatggtttcttggccaagtat
gattgtccgactattgtattgtctgcagaaaaagatacgatatgtttgtcagagtctata
gaaatcacagcttggacggatagtccagaagggagtgtaaactttcagaatacatggaca
gatgtaaataataatgtagtcttgacaaataacttgtcgacttttagtttaaatacaaac
aatctagggacgaatcaggtgcatttagaggcggtagaggcttattctgcttgtgtgtct
cgggatacgtttaactttgtagttaatccttcagttactgttagcacctcattaagtaat
gccgtaatttgctttggtgactccaccactttgggggcatcagcctcaccttctgcgggg
gcatcttatatttggttgaatagttctggggacactgtgtctatggtacagaatgcctct
ttatttgatgatgatatttatacagtagaggcaaatgtagatggatgtaaggggcaggct
tctgtcaatttagattattatccatttacggcagcccgtattattccggatacggcaaaa
atttgtgcaaatacgggggctttattaacggtaatagactgtccgggttgtagttatgtt
tgggatccgccaactacctctttagctagctcaaataatgagcaaattttggcagatata
gcgggtgtttatgatgtggagatttctgatcagtatggatgtccgactattcttcagaag
gatgtacaacctggtgcttatctgactcctcctatttatgcggaagatattaacggagta
attcgtccttctatatgtaatgggcggccggtggttattcgttctattcctcgagcctct
tgttcgagttgtcagtatagctggagtgatggaacgactggtccattcacttttgctatg
gggacagggacttatagtgtcacggttacagatgtggtgagtggttgtgagggtcgttct
aatgatttggtgattgagagtagcagtttggctgtgcctcagatagatgcagacccttat
aatatttgtgggacgaatccagctatactgcaggttgataatccttgtttgggttgtact
tatagctggtatgagacagataataatggaactatttcttcctctgttgttggtacggga
actgtattgagtttacctaatgttgcggacacaggtagttatattgttcaggtaacagat
acgctagcttgtgaagaagaatctgctgtagcggatattggggtcggaacgacaactcct
ccagtgattacagggacaggaagtaagttatgtggtactaatacgattactctgagtaca
aatagctgtgtagattgtcactatcaatggtatctcaatgctgctgtaattccgggagct
actagttctagttatgtagcgaatcaggctggagttttttctgtagagctacaatatcca
aatagttgtatccataaatcttcagattatacgattacatttgaagcctttaatcctaaa
gttgattcaactgacctttatttgtgtaatggggctgctgtaagtcttgagattattggg
agttatgagttacctcccaattggtcttatcagtggtattataatggagttcaaattcct
ggttcaaatgggtatactcatagtgcatcacaggcaggaacatatttcttagaggttgtt
aatgctagtggatgtcgtgcattttcagatagtgttgtggtgcgttcatcttctgccgga
gccaatccggtgcttaatgcaagtccatcaatttatagttgtggtggagactctgttact
ttgtctgtgccgccttctccaaattgcttgtatacctttaagttggcaagtggggttaat
cgtcaacctgactccattaactcttatcggactaatgttccaaacggttattctgtagag
gtaagagatacaatttctaactgtgtttaccaatcgccagtaattgagattaaagatact
gttttgcccgtgccggctgtaactgttgctagtgctacaaatatctgtagtaccagtcca
gtgattttatcaactcctgcttgtgctggctgtcagtatatctggacctatagtggttat
aatgagcaaggagacactgtaacttggcaagaaactgttagtcaaagtacgtactcggca
gataccacaggaagttatgaggtgcaaacgctacaatcaggttgtgcctcaccagtttct
aactcagtgccgatcactcgtctttcttataatgcgcagctgaatacagctcctttggcc
aatgtatgtaatcaggatacggttatcatagaggccgtgccagatactacgctttgccca
aattgtacttatgagtggtttcaagataatgtacaggttcctgttcccgatacccaagat
tatttcgaggtggtacagggtggtgattactatgtagtggttactcaaaattacccaggt
tactcttcctctccttatacctttggctgtaccgatacttctgtagtacgaaactatagt
gatgtgagtttgggagtagctatgcgagcctcttcggaagcaatttgtggtccttctgga
caggttgttctagaggtagactcttgtgtaggttgtacttacaactggtactatgatgga
gatactaccaatggatttaattatagtaacttaggtgtaaatgacaccttctatttggtg
aacggtgtggccgctacggggatgtataaggtaagtgttggccttaatggctgttttgta
gaggattctatttatctatatgatactaccgcattagcgattgcgattgatacctcaaca
gcactttatgcgaatatttgtaatggtcagccttttgagctgtcttctaattgtacaagt
tgtgatagcataagaaatctatctttgcactatcaatggtaccaggacagtatgcttatt
cctggtgcaattggggcttcttaccaaattgataatgcagcagattatcaattggtcgtc
tcagatgacttgggctgtgttaattactcaccaataacaacggctatagaggtcttgcct
ccagctaattttggcctagtgctagattctgttgcggtggtccccatttctcagggccca
attttattagataattatttgcaacccgttttagtgcacaactcagggagttacctttcg
gtccctcaggctactgcagtaactaccgatagctttattcctgctttggctggttctgga
agtcatattattagctttgagtaccaaaatcaaaattgtttctttgaaacttttgatacg
attgatgttctctctccacctagcctagatgtagcgaacctcaatcccttggctccagcc
gaagaggcttgtgttcaagatagtctagtcttttatttgagtaatattacactagaacct
aaccaaattcttattgcgacttcagccactacttatgatacactagctgtttctacggca
ggcctgagcgagtatgcaggggtttggtctggaaatattcccgttgtggtgccttcttct
gcagtgacaggaaaagttgttttgagagatagtgttagtggaaatgaatatgtctctgat
ttcttcttggtggtccaaaatccttctgtagccattagcttaaatggagtgcctcaacca
ctctgctcttccgcagatactattgcgctttcaggcttccctcaacccggaatctttaag
gcggcttatgcagctaccccatctacctatgagcctagcctgatttctggcaacaactta
ttggtagaaaatgtacaaaactatacgcctgtatctggtacacaacaattagaggtgact
tatgtctatcaacctacttattctaataatgcagcagcttgccccgactctgtggtggcc
gtaattcctgttagcattaacaataatgaggtggatagtattgagtttacgcctatctct
gtaacagagaccaatgtacctatgacggacttgacgcgcctgatttggccactcgatagc
cgcttcttccctggcttttatgtgggaacctatatcaatagcggcgaattactcgctaat
acgattcctctagccgctacagcaaatcaaacggtagatactgctatttaccgctttgtc
aatggaagttgtagaaacgaaactgaacaacttatcgatgtttggcaaaagccaattact
cttgattctattcctaagttcctctgccgcaatgccgatacgatctttattggccgtaat
gcgaactcgatgtacttggaaattgatgggatgacttatttgctcgactctaattatgca
tatcaacctagccttggcgtaacggataatgttaattatagctacgatgagtttatcaat
gtgatgagccttagctctagtaatggtggtcttcaacccattagcctaacgcaaggagca
gaacgctttgcttttattcccgctttggtgtctggaactactactgatctatctattagc
ttccgctatgagcgctatcatacctactttactcctacgttctcactgaataatgtagct
tatactattgcagaattgagtaagcaggtggttattgaagatcctattgccgctcaaatt
aaccccgctattttagccgataccattttctgccaagacaacagtactcagcaattttcg
ggtattcctaatggcggacaatattatatcaattatcagcctttggtcggaaacctcttt
aatcctaaccaacaggccgctagccaaggcgtaggtagccatttactcacctatgtctat
cagggaaatgcttgtgtagattctacttctacctctatttacattcccgataccttctcg
gtaagtatttttgcaccaaatggtcccacttactgccgacttgatccagccgatactatt
tcggttagctcttcggtgcccggcgtactcgatactgccgcagggatgttcttggtgggg
actacccgatctggacaggtctttaatcccgcttttgctcctgctgttgtgggggggaat
aatgtggtttatatcgcgcaagatacctttggttgcgaagccagagatagtgccttgttt
acggtttttgccatgcccgatatcgcaattacagcactagattctgtctactgcctaaat
gctgatacgactattttagacctctatgagcataatacaagctggcacctacaagctcca
atggcttataaccccggtgatgttgtacaactgactggtaatggcgtctacaatggcgga
actaacccaactaacccgctctataatccttctgcagctggagtgggattagatacgatt
acttatgattatacagatgtgaatggttgtaataccgtactcacacaatatgtagagatt
ctgcccttgcccaacttgacgctgacaacagataatggggtgccgctagattctttctat
tgtgaaggcgattctgtagcgctctttgctagcccattgggcggagatttctttagcctc
tttagttatgagcaaggaaaccccagtaatacaattccatcgagctttgatacttcagtg
agcccgcctctctttactccatttattagcggaaccgctattccttttggtgaagaaggt
ttggcctatacttaccaagaccctattacgctttgtaaggatactattgtggacaccatc
caaatcaataacttccttaccgatgcaacgattacaggactacctactcaaatttgtgcc
gatgatactatttatgtcttaggcgtgaaccccaatggcggtccaatgcctacgcccggt
ttgacaacaggttattttggtgcctttgccgctatcgataccaatatgattgtcgatgct
gtggccggacactttaatcctgcgctttcaggtatcttcgatcgaggtagaagtgcaatt
gtaacttatacttacctttctaatggatgttataataccgtctatgatacagcggtcctc
aatccacttccgcagttgatctataacatgcccggcgatagtttattcaaccgaaatgat
ccaactatccacgcctgttttagccagcccgctgctacgctacaagcttacaatcagtat
caaggaaatattaaccccattccgcaatatatcggaacacaacctagccttagccagtca
ggtatctttacgactagcagtggattaggcatgacttggagtgtgacctttggtaactgg
gcctatgaagctcaacaagccaatggcggggtagatactatccattatagctttaccgat
gctcgcggatgtagtaatacccgttcagaggtgatcgtcatcgatacggtgcccgaactc
ggttttgctggctttgatagcaaatatctagatactattactggacgctatgtctattgc
gaaaatgatcctgctagcttgattattccttctccttttggtggaacgagctacctgaat
tattacgaaattccaacaggtatctttgagcttatccccgatacgctggcttatggcgat
accacaaatattcaccgaattacttatgagtttatctcggcccgctatcatgcaggtggc
gtttgtctagattctacaattcagatgattgaggtgcgccccacaccagatttacagctg
gtcaatgcacccaatacgttctgtgtagccgatagcgcacaaagagttccgctctctgca
acgccttatggcggaacctttgaggatattacgcttggcgccattgccggaattgtaggc
gatagcctcttcaatcctatggcccaattgggtagccgacaagtgatttactattatacg
gatacggtttcgggctgtaccgataccatccaacaccaaattgatgtctataacgctcca
gaggtccacttctttagcgaggggggctgccaaggcgatagcgtacaatttaacgcatct
cctcccggcctgagcaatagtgtccccgctttggatagtattacgatggtggtctggaat
tatggcgatggcctgagcgatacgctctttagtttggtcgatccggttaatgtgcccacg
caataccataattatgcgcagcccggaatttacttccccagtttgactgtcgtcaaccgt
ggacaatgtgataccagcttctctcgccgaattgtggtttcgcccaagtatttggtaaat
gatactatgccttatttccaagactttgaggccgatgccggcaactggttccaggaaaat
gaggatagcaccatcaacctacccaatgattcgctctgggcttggggcttggccgatggc
ttccgaattaccactattcaatatggcaaccatgtctgggccaccgctcccaacggtcct
tatccagaagctgaggccggatgggtctatagcccttgcttcgatatttctactttgggc
cgcccaatggtcaaactgaatatctggagagatagccgccaaggcacagatggtgccgtt
atgcagtatttcgacgattctactcagacttggagaaatctaggtatccgaaataaagga
ctcaattggtataaccccacttatgtggtgagtgatcccggtaaccaagatggtaccccc
atcggctggtccggaacgagcaatagctgggaggatgcccgctatcgcctagatgtgagc
ggaggcgatttgcgcaaccgcgataatcttcgcttccgtatcgcctttgccgcagcaaat
ggtagtggaggcgcactctatgaaggtttcgcctttgatgatgtctatatcggtaaccga
agtcgctctgttttgctagagcactttagcaaccagaattatgcgggcattgatgatatt
gaacgcgatctttatagcaccgtttatagcaacctttacggaagagatgtgcaaattttg
cagatccataccaactatggcggctatgattatctcaatgtcttttctgccgatgagtcg
agtgctagagtactctactacggaatcaacgatgccgatcaggtccgcctaaacggatct
gccttggccaataccaccagtagcctagtgcgctaccaacaggagctaatggatatgcaa
atgctgcaagatgcaaaatttgatatcaagatgttccccgtcaatgtgcaaaatggcgtc
ttgagcacggccttcgaaattgaagctttggaggatgttatgcttttgacggatagccta
gatgttcatgtggccattactcaggatagtattcctagcctgcaggcccatactatgatg
tcggtcctaaaggcaatgcggcccgatggcgctggcgagcaaattccaagtgcttgggtg
atgggcgatgtcttgccttatactcgaacctggacctttgaccccacgcagattgacccc
acacaactcaaggtgactgtttttgtgcaaaaccgccaaagcaaggaggtattgcaggtc
aatagctcaagaaacctcaatctctttaatgggccagtggctattgaggagttggccgat
gaagatggagctgaaattttggacctcaatctttatcccaaccccgccaaggagcagttc
caagtagactttggcgctcccctcaaaggagattacaactggcagttggtggaccttttg
ggccgccgattgaaagatggacaattgcagcctggcttgcaaaatttacagatccaaacc
gatggattgactccaggagtttatatctttagtgtatataatgagacggtatacagccag
cgaaaggtggtcatttatcgttag
DBGET
integrated database retrieval system
