Strigops habroptila (Kakapo): 115601359
Help
Entry
115601359 CDS
T08851
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
shab
Strigops habroptila (Kakapo)
Pathway
shab04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shab00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
115601359 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
shab00536
]
115601359 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
shab00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
115601359 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
hEGF
TB
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115601359
NCBI-ProteinID:
XP_030327131
LinkDB
All DBs
Position
Z:complement(53530296..53674507)
Genome browser
AA seq
2861 aa
AA seq
DB search
MGRRRWLWVQACVLLLGCGALWTQGAAGQQQQPPPLRLGGTHPNAAYREDGGGSAAGRVR
RRGQQDVLRGPNVCGSRFRSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNMCTCASG
QISPTCGSKSTVCESGCQNGGRCIGPNRCACVYGFTGPQCERDYRTGPCFTQVNNQMCQG
QLTGIVCTKTLCCATIGHAWGHPCEMCPAQPQPCRRGFIPNVRTGACQDVDECQAIPGVC
QAGNCINTVGSYECNCPAGHKQNEATQKCEDIDECSIIAGICEGGVCSNTVGSYFCICTR
DYVTSVDSSRCIDQRASMCFSNIVNGRCAQELPGRFTKRQCCCESGQCWAIRSVPEMCPV
RGSDEHRRLCVDGASAGGRSRGGGTGGNRFLPGGNGNGYGPGGAGFIPIPGNNGFSPGIG
GAGIGRGGQSPNGNGPIITGLTILNQTIDICKHHPKLCLNGRCIPTLSSYRCECNMGYKQ
DANGDCIDIDECTSNPCSDGDCVNTPGSYYCKCHTGFQRTPTKQACIDIDECIQNGVLCK
NGRCVNTDGSFQCICNAGFELTTDGKNCVDHDECTTTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGF
VLAPNGRYCTDIDECQTSGICMNGHCINTEGSFRCECPPGLAVGVDGRVCVDTHMRSTCY
GGIKKGACVRPFPGAVTKSECCCANPDYGFGEPCHPCPAKNSAEFHGLCSSGIGITVDGR
DINECALDPNVCSNGICENLRGSYRCNCNSGYEPDPSGRNCVDIDECSMNGLLCDNGLCR
NTPGSYSCTCPKGYVFSTGMGTCEDIDECESSPCVNGACRNNLGSFSCECSSGSKLDSTG
LICIDSLKGTCWLNIQDSRCEVNINGATLKSECCATLGAAWGSPCERCELDTACSRGFAR
VKGVTCEDVNECDVFPGICPNGRCINSRGSFHCECPEGLTLDGTGRVCLDIRMEQCYLKW
DEDECLHSVPGKFRMDACCCAVGAAWGSDCEECPEPGTKEYQALCPRGPGFSNRGDILTG
RPFYKDINECKMFPGMCMNGKCRNTIGSFKCRCNSGFTVDMAERNCTDINECRISPDLCG
SGTCVNTPGSFECECFDGYESGIMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGTCVNTEGSFRCDCPS
GHELSPTREECIDVNECSLSNNLCRNGKCVNMLGAYQCSCSAGYQATPDRQGCIDIDECM
IMNGGCDTHCTNSEGSYECSCSGGYALMPDVRTCADIDECENNPDICDGGQCTNIPGEYR
CLCYDGFMASMDMKTCMDVNECDLNSNICIFGECENTKGSFICHCQLGYSVKKGTTGCTD
VDECEIGAHNCDMHASCVNIPGSFKCSCREGWVGNGIKCIDLDECSNGTHQCSVNAQCVN
TPGSYRCACAEGFTGDGLTCSDVDECAENIHLCENGQCLNVLGAYRCECEMGFTPTSDSK
SCQDINECAFQNICVFGTCNNLPGMFHCICDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLC
VNTPGRYECNCPPDFQLNPTGVGCVDNRVGNCYLKYGPRGDGSLSCNTEIGVGVSRSSCC
CSLGKAWGNPCETCPPMNSTEYNTLCPGGEGFRPNPVTIILEDIDECQELPGLCQGGNCI
NTFGSFQCECPKGYYLSEETRICEDIDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPAEYMQVN
GGHNCMDMRKSFCYRSYNGTSCENELPFNVTKRMCCCTYNVGKAWNKPCEPCPTPGTGEF
KNICGNIPGFTFDIHTGKAVDIDECKEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLV
CEDIDECSNGDNLCQRNADCINSPGSYRCECAAGFKLSPSGACVDRNECLEIPNVCSHGL
CVDMQGSYQCICHNGFKASQDQTMCMDVDECERHPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTH
NNDCMDTDECSSFFGQVCRNGRCFNEIGSFKCLCNEGYELTLDGKNCIDTNECVALRGSC
SPGTCQNLEGSFRCICPPGYEVKSESCIDINECNEDPNICLFGSCTNTPGGFQCICPTGF
VLSDNGGRCFDTRQSFCFTNFENGKCSVPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEE
EVAFQDLCPYGHGTIPGIDDTREDVNECLESPGICLNGHCINTDGSFRCECRMGYNLDYT
GVHCIDIDECSIGNLCGNGTCTNVIGSFECSCHEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFR
CINTYGSYECTCPVGYVLREDQKMCRDLDECAEGLHDCESRGMTCKNLIGTFMCICPPGM
IRRLDGEGCTDENECRTKPGICENGRCMNVIGSYRCECNEGFLSSPSGIECLDNRQGFCF
AEVLQTMCQMASSSRNLVTKSECCCDGGRGWGNQCELCPLPGTTQYKKLCPHGPGYATDG
RDIDECKVMLNLCRNGQCINTMGSFRCFCKVGYTTDISGTSCNDLDECSRSPKPCNFICK
NSEGSYQCSCPRGYILQEDGKTCKDLDECQTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHT
ACIDNNECASQPSLCGSKGICQNTPGSFICECQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHG
CQNTLGGYRCGCPQGYIQHYQWNQCVDENECSNPNACGSASCYNTLGSYKCACPSGFSYD
QFSSACHDVNECSSTKNPCNYGCSNTEGGYLCGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYMPL
DGDADKDNALSPEACYECKINGYSKKDNRKKRSANYTIEQISLESLDMDSPLKMRVNISR
LDNKQHILELMPAIKPLTNHMRYIISHGNDDGIFRIHQRDGLSYLHTVKKISPPGTHTLE
IISIPLYKKKQQKKLEDSNEDNYLLEELGEALRMRLWIDLY
NT seq
8586 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggagaaggcgatggctgtgggtgcaggcctgcgtcctgttgctgggctgcggggcg
ctctggacacagggcgcagccgggcaacagcagcagccgccgccgctgcgcctgggcggc
acccaccccaacgccgcgtaccgggaggatggaggtggcagcgccgccggccgggtccgc
cggcgagggcagcaggatgtgctccgcgggccaaatgtgtgtggctctagattccgatcg
tactgttgccctggatggaaaacactcccaggaggaaatcagtgcattgttccaatttgt
agaaatagctgtggtgatggattttgttcccgtcctaacatgtgcacctgtgcaagtgga
caaatatcacctacctgtggatcaaaatctactgtctgtgaaagtggctgccagaatgga
ggacggtgtattggacctaatcgctgtgcatgtgtctacggatttactggcccgcagtgt
gaaagagattacagaacaggcccatgtttcacacaagttaacaaccagatgtgtcagggc
cagctaactggaattgtttgcacaaaaacactctgttgtgcaaccattgggcatgcatgg
ggtcacccctgtgaaatgtgcccagctcagcctcaaccatgccgtcgtggcttcatccct
aacgttcgcactggagcatgtcaggacgttgatgaatgccaggctatccctggagtctgc
caagcaggaaactgcattaatacagtaggttcgtatgaatgtaactgtcctgctggtcac
aagcagaatgaggcaactcagaagtgtgaagatattgatgaatgcagcatcattgcagga
atctgtgaaggtggtgtatgctctaacaccgtgggaagttatttctgcatctgcacacgg
gattatgtcacatctgtggatagctcccgctgtattgatcagagggcaagtatgtgtttc
tccaacatagtgaacggccgctgtgcacaggagcttcctggtaggttcactaaaaggcag
tgctgctgcgagtctggccagtgctgggcaatcaggtctgttccagagatgtgtcctgtc
agagggtctgatgaacaccgcagactttgtgtggatggtgcttctgctggaggtcgttcc
agaggtggtgggacaggaggaaacaggttccttcctggtggcaatggcaatggctatggc
ccaggaggagcaggattcattcccatcccgggaaacaatggtttctccccaggcataggt
ggagcggggataggaagaggtggccaaagtcccaatggaaatggaccaataattacaggg
ctaacaatactcaatcagacaatagacatctgtaagcatcatcccaagctttgcttaaat
ggccgttgtataccaaccctttctagttaccgatgtgagtgcaacatgggatataagcag
gatgcaaatggagattgtattgacattgatgaatgcacatctaatccatgctctgatgga
gactgtgtcaacacacctggttcctattactgcaagtgccacacaggtttccagagaact
ccaaccaagcaagcttgcattgatatagatgagtgcatccagaatggtgttctttgtaaa
aatggccgctgtgtaaacactgatggaagtttccagtgtatttgcaatgctgggtttgaa
ctgactacagatggaaaaaattgtgtggaccatgatgagtgtaccactacaaacatgtgt
ttaaatgggatgtgcataaatgaagatgggagttttaaatgcatctgcaaaccaggattt
gttctggctccaaatgggcgttactgtactgatattgatgaatgtcagacatcaggaatt
tgcatgaatggtcattgtataaatactgaaggatcctttcggtgtgagtgtccgcctggc
ttggctgttggagttgatggtcgtgtgtgtgtagatactcatatgcgtagcacatgctat
ggaggcattaaaaaaggagcatgtgtccgtccttttcctggtgctgtgacaaaatctgaa
tgttgctgtgccaatcctgactatggttttggagagccatgtcacccctgccctgctaaa
aactcagctgaattccatggcctgtgtagcagtggaataggtattactgtggatggacga
gatattaatgagtgtgcactggatcctaatgtttgctccaatggaatttgtgaaaactta
cgtggcagctatcgttgtaactgtaacagtggctatgagcctgatccttccggaaggaat
tgtgtggatatcgatgaatgttcaatgaatgggctgctgtgtgacaacggtctctgtcga
aacacccctggaagttacagctgcacttgtccaaagggttatgtgttcagcactgggatg
ggcacatgtgaagatatagatgaatgtgaaagcagcccatgtgtaaatggtgcctgcagg
aacaaccttggatctttcagttgtgaatgttcatctggcagcaagttggactctacagga
ctgatatgtattgatagcctgaaggggacttgctggcttaacatccaagacagtcgctgt
gaagtcaacatcaatggtgctacactgaaatctgagtgttgtgctaccttaggagcagct
tggggcagcccatgtgagcgatgtgaattagacacagcttgctcaagaggatttgccaga
gtgaagggtgttacctgtgaagatgtaaatgaatgtgatgttttccctgggatttgtccc
aatgggcggtgcataaacagtagaggctcatttcactgtgagtgccctgaaggactgaca
ctggatggaacagggagagtctgtttagatattcgcatggagcaatgctacctgaaatgg
gatgaagatgagtgccttcactccgtgcctggcaagtttcgtatggatgcctgttgctgt
gctgtgggggctgcttggggctccgactgtgaggagtgtcctgagcctggcaccaaggaa
taccaggctctgtgccccagaggtcctggcttttccaacaggggagatattctaactggc
aggccgttttataaagatatcaatgaatgtaaaatgtttcctggtatgtgcatgaatggt
aaatgcagaaacacaattggaagtttcaaatgtagatgtaacagtgggtttactgtagat
atggcggaaagaaactgtacagacatcaatgaatgccggatctccccagacttatgtgga
agtggtacttgtgtcaacactcctggaagctttgagtgtgagtgctttgatggttatgaa
agtggaattatgatgatgaagaactgtatggatattgatgaatgtgaacgcaaccctctg
ctgtgtagaggtggcacatgtgtgaataccgaagggagttttcggtgcgactgcccttca
ggacatgagctgtcaccaacacgtgaggaatgcatagatgtaaatgagtgctcgttaagt
aacaatctctgcagaaatggcaagtgtgtgaacatgcttggagcataccagtgttcctgt
agcgctgggtaccaggctactcctgacagacaaggctgcatagatattgatgagtgtatg
ataatgaatggtggctgtgacacccactgcactaactcagaaggcagctatgaatgtagc
tgcagtggtggctatgctctcatgccagatgtcaggacatgtgcagatattgatgaatgc
gaaaacaatccagatatctgtgatggtgggcaatgtactaatattccaggggaatatcgc
tgtctctgttatgatggatttatggcttctatggacatgaaaacttgtatggatgtgaat
gaatgtgatttgaattccaacatctgtatatttggggagtgtgaaaacactaaaggttcc
ttcatttgtcactgtcagctaggatattcagtcaagaaaggaaccactggatgcacagat
gtggatgagtgtgaaattggtgctcacaactgtgacatgcatgcctcatgtgtcaatata
ccaggaagttttaaatgtagttgcagagaaggatgggttggaaacggcattaaatgtatt
gatctagatgagtgctccaacgggacccaccagtgcagtgtgaatgctcagtgtgtaaac
accccagggtcataccgctgtgcctgtgcagagggattcactggggatggattgacttgt
tctgatgttgatgagtgcgcagaaaatattcatctgtgtgaaaatggacagtgtttgaat
gtccttggtgcctaccgttgtgagtgtgagatgggattcactcccacctcggacagcaag
tcatgccaagatatcaatgaatgtgccttccagaacatatgtgtatttggtacctgtaat
aatctaccaggaatgtttcattgtatctgtgatgatggctatgaactagaccgaactggg
ggaaactgtacagatatcgatgaatgtgctgatcccattaattgtgttaatggtctttgt
gtaaatactcctggaaggtatgagtgtaattgccctccagacttccagctgaatcctact
ggagtgggttgtgtggataaccgtgttggcaattgctacctgaagtatggaccacgaggg
gatggcagcctatcctgcaacactgaaattggggttggagtcagtcgttcctcatgctgc
tgctccctgggaaaagcttggggaaacccttgtgagacatgtccccccatgaacagcacg
gaatataatactctctgtccaggcggagaaggattcagaccaaatcccgtcactattatt
ttagaagacattgatgaatgtcaggaactgccaggtctctgccaaggtggaaattgcatc
aatacttttggcagcttccagtgtgaatgtccgaaaggctactacctcagtgaagagaca
agaatctgtgaagatattgatgaatgtgttgcacatcctggtgtctgtggtccaggtacc
tgctacaatacattggggaactacacctgtatttgcccagcagaatatatgcaggtgaac
ggaggacataattgcatggacatgaggaaaagcttttgctacagaagctataatggaacc
tcctgtgagaatgagctgcccttcaatgtgaccaaaaggatgtgttgctgcacatacaat
gttgggaaagcctggaacaaaccttgtgaaccatgtccaactccaggaacaggtgaattc
aagaacatatgcgggaatattcctggcttcacttttgatattcatactggaaaagctgtt
gacattgatgaatgtaaggaaatcccaggaatctgtgcaaatggtgtttgcatcaatcag
atcggcagcttccgctgtgaatgccccactggattcagctacaatgacctgctcttggtc
tgtgaagatattgatgagtgcagcaatggagacaatctctgtcagagaaatgcagactgt
atcaacagtcctggtagttaccgctgtgaatgtgctgctggttttaaactttcacccagt
ggtgcctgtgttgatcgcaatgaatgtctggaaattcctaatgtttgcagtcatggttta
tgtgtggacatgcaaggaagttaccagtgcatatgtcacaatggctttaaagcgtcccaa
gaccagactatgtgcatggatgttgatgaatgtgaacgccatccatgtggaaatggaact
tgtaaaaacactgttggatcatataactgcctgtgttatccaggatttgaattaactcat
aataatgattgtatggataccgatgagtgcagctccttctttggtcaggtgtgcagaaat
ggacggtgtttcaatgaaattggttccttcaaatgtttatgtaatgaaggatatgaactt
actctagatggcaagaattgcattgatactaatgagtgtgtggcactacgtggttcatgc
tctcccggtacttgtcaaaatttggaaggatcattcagatgcatctgtccaccaggatat
gaagtaaaaagtgaaagttgtattgatattaatgagtgtaatgaggatcccaacatctgt
ctctttggctcttgtacaaacactccaggaggtttccagtgtatctgtcctacaggtttt
gtgctgtctgataatggagggagatgttttgatactcgccagagtttctgtttcactaac
ttcgagaatgggaaatgctcagtgccaaaggctttcaacaccacaaaggcaaagtgttgc
tgcagtaaaatgccaggagaaggatggggtgatccctgtgagctctgtccaaaagaagaa
gaagttgcttttcaggacctgtgtccatatggtcatggaactattcctggaattgatgat
acacgtgaagatgtcaatgaatgccttgaaagtccagggatttgtttaaatggacactgc
atcaataccgatggatcgttccgctgtgagtgccgcatgggatacaacttagattacact
ggagtacactgcatcgatattgatgaatgttccattggcaacctatgtggaaatggtacg
tgcactaatgtgattggcagttttgagtgcagctgtcatgaaggatttgagccaggccca
atgatgaattgtgaagatataaatgagtgtgctcagaaccccttgctgtgtgcttttcgt
tgtatcaacacttacggttcctatgaatgtacatgtccagttggctacgtactaagagaa
gaccaaaagatgtgcagagatctagatgagtgtgcagaaggtctccatgactgtgaatca
agaggcatgacgtgcaaaaatttgattggtaccttcatgtgtatttgtcctcctggaatg
atccggagacttgatggagaaggctgcacagatgaaaatgaatgccgaaccaagccaggt
atctgtgaaaatggtcgttgcatgaacgttattgggagctaccgatgtgaatgtaatgaa
ggattcctgtcaagtccatcaggcattgagtgtcttgataatcgccaagggttttgcttt
gctgaagttttacagacaatgtgtcagatggcttcaagcagccggaatcttgtcactaaa
tctgagtgctgctgcgatggaggccgtggctggggtaaccaatgtgagctctgtcctctt
cccggaaccacccaatataagaaactctgtccacacggaccaggttatgctacagatgga
agagatattgatgaatgtaaggtcatgctaaacctgtgtagaaacggacagtgtattaat
actatgggctccttccgatgcttttgcaaagttggctataccactgacataagtggcaca
tcttgtaatgatcttgatgagtgctcccggtctcctaaaccatgcaatttcatctgcaag
aactcagaagggagctatcagtgctcttgtcctcggggctacattcttcaagaagatgga
aagacatgtaaagatcttgatgaatgtcaaaccaaacaacacaattgtcagtttctttgt
gtcaacacacttggaggcttcacgtgcaaatgtccacctggttttacacaacatcacaca
gcttgtattgataacaatgaatgtgcttctcagccatcactttgtggatcaaaaggaatt
tgccaaaacacccctggaagttttatctgtgaatgtcaaaggggattttctctggattct
actggactaaactgtgaagatgtggatgaatgtgatggaaaccataggtgccagcatggc
tgccagaacaccctgggtggatacagatgtggatgtccacaaggatatattcagcattac
cagtggaatcaatgcgttgatgaaaatgaatgctccaatcctaatgcgtgtggctctgct
tcttgctacaacacacttggaagttacaagtgtgcctgcccgtctggattttcatatgac
caattctctagtgcatgccatgatgtgaatgagtgttcttctaccaagaacccttgcaat
tatggttgttccaacactgaaggtggttatctttgtggctgtccacctggctattacaga
gttggacaaggccactgtgtctcagggatgggatttaacaaaggccagtacatgccactg
gatggagatgctgataaagataatgctttgtcccctgaagcatgttatgaatgcaaaatc
aatggctattccaaaaaagacaacaggaagaagagaagtgctaattacactattgagcag
attagcttggaaagtctggacatggatagtcctttaaagatgagagtcaacatttctaga
cttgacaacaagcagcacatcctagaactcatgccagccattaagccccttaccaaccac
atgcgctacatcatttcacatggcaatgatgatggcatctttcgaatccatcaaagggat
ggattgagttatttgcacacagttaagaaaatatcaccgcctggaactcacacactggaa
atcattagcattcctctatataagaaaaagcagcaaaagaaactggaagacagcaatgag
gacaactacctcctagaagagctgggggaagctctcagaatgaggctgtggatagacctc
tactag
DBGET
integrated database retrieval system