Strigops habroptila (Kakapo): 115611793
Help
Entry
115611793 CDS
T08851
Name
(RefSeq) multiple epidermal growth factor-like domains protein 6 isoform X1
KO
K24333
multiple epidermal growth factor-like domains protein 6
Organism
shab
Strigops habroptila (Kakapo)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shab00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
shab04990
]
115611793
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
shab04990
]
Laminin domain-containing proteins
Laminin EGF-like domain-containing proteins
115611793
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FXa_inhibition
EGF_laminin
cEGF
EGF_CA
EGF_2
EGF_TEN
hEGF
EGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115611793
NCBI-ProteinID:
XP_030351090
LinkDB
All DBs
Position
8:29207409..29421130
Genome browser
AA seq
1598 aa
AA seq
DB search
MGAGPAGLYFGLCWALAARASGEMEPRLQRGMPNVCPVLELALVGHPQPCVQAFSRMVKM
WKQGCTRRRWCMGYERRSGYYTIYKQVYRLEHQTVYKCCPGWVQHDNEPGCLHLLCTVGT
CFNGGKCSEAGSEVCQCTAGFQGPRCQYDVNECTMENGGCHDQCCNTVGSYHCKCPAGQK
LEEDGKSCRDVDECTVVNGGCQQGCVNTHGSFHCQCWAGYRLHADGRTCIAINSCSVNKG
GCEQDCVQIGEDHYKCQCQPGYQLKRDARSCEVIDPCTTGNGGCPQICQNERGIAKCECH
AGYYLSADKTSCLDIDECAEGRARCAHRCVNSLGSFTCVCNPGFELGADGKQCYRIEMEI
VDSCQESNGGCSHHCEHTTAGPRCSCDHGYHLDFDGKTCAELDECKTGESCCSQFCINYA
GGYECACKAGFQPNADGCDCDDVDECHLDNGNCDHFCVNFLGSYECACKEGYRLGVNRRS
CIALGGEDVDAEEAVGFAGAPGLQFRDPPQLLRYALGALYEDADPRGELTLLHRVVCLDN
TFGNDCSLSCEDCLNGGRCNSEHSGCVCSPGWTGIICNETCSPGMSGRGCASICKCQNGG
SCDPVTGQCRCPPGVHGKLCEDGCPKGFFGKNCNKPCNCANNGYCHRLYGACLCDPGLYG
RFCHLTCPRWAFGAGCSEECQCMKEHTLECNARNGTCTCKPGYHGKKCQKECTPGFYGAG
CKLRCNCPTDVLCDHETGVCQHSCPPGFHGEKCHLSCQPGSFGVNCRQRCSCGELPCNPK
TGQCICPAGKTGATCEQDCPAGQWGPDCQSSCKPCANGGQCNRETGACNCPPGYSGASCS
TSCPDGYYGQNCLLLCSCSSSTQCHHVTGECICSPGWTGHDCKHPCNSGRWGQRCENMCV
CNNSDGSCDPVTGSCFCEPGFTGKHCEWRCPEGSFGPSCEHSCQCQNGAACDHVSGACTC
TAGWTGTFCERACPDGFFGLDCHQVCKCKNAAGCDHVLGTCHCLPGWLGETCEQPCQGDS
YGPGCSHTCQCHNGAFCHHITGTCLCSPGWKGATCQEACPTGWYGANCLQRCICHGQATC
DHITGKCQCPQGWTGIACELECGNRRYGEGCEQSCSCHHGVCDQHSGKCICHTGWTGDHC
DAVCPVGFFGKWCEEQCDCIHGLSCHHQTGACHCEKGWRGRHCDKPCLPGRYGVGCAQRC
RCPMGTPCHHLTGECGCPPGFTGSSCEKTCPPGMYGKNCKQVCQCSAENEECHPVTGNCM
CRPGYYGARCNLRCPKGTYGSNCQNLCKCMNGGHCDPASGTCDCTPGFIGADCSKTCPEN
RYGKDCTLFCVCGKGQCDPRTGKCTCPPGQMGPSCQQVCPQGQYGPNCLLTCTCQNGGIC
DHVDGNCTCGLGWTGRLCEKAECLPGKYGSGCVLDCSCQHNGTCDRFTGCCQCPEGYYGH
SCEHRCPLGFYGLSCLHACACKNGASCDAVTGQCICRLGFQGVHCEKGCDRGWFGEKCRH
QCNCGDAPCDPETGKCLCPPGKTGEKCDVGCRSDQYGPDCSLRCQCANKSQCNPYNGNCV
CPATWMGPTCKEGGLPKLPFYEEQTQERGNIFPRALQQ
NT seq
4797 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggagcggggccggcgggcctgtacttcggcctgtgctgggcgctggccgcccgggcg
agcggcgagatggagccgcggctgcagcggggcatgccaaatgtctgtccagtgttagag
ttggcactggtaggacacccacagccatgtgttcaagcctttagtcgaatggtgaagatg
tggaaacaaggttgcacaaggaggaggtggtgtatgggctatgagagaaggtctggatac
tacacaatttacaagcaggtgtacagattggagcatcagactgtctataagtgctgccct
ggatgggtccaacatgacaatgaacctggctgtttgcacttgctgtgcactgttggcact
tgcttcaatggagggaagtgttctgaagcaggatccgaggtttgccagtgtactgcagga
tttcagggtcctcgctgccagtatgatgtaaatgagtgcaccatggagaatggtggctgt
catgaccagtgctgtaatactgttggcagctaccactgcaaatgtccagctggccagaaa
ctggaggaagatggaaaatcatgcagagatgtggatgagtgtacagtggtgaatggtggc
tgccagcaaggctgtgtcaacacacatggctccttccactgccagtgctgggcaggatac
aggctccacgctgatgggcgcacttgcatagccatcaattcctgcagtgttaacaaggga
ggctgcgagcaggactgtgttcagatcggtgaagaccactataagtgccagtgccagcca
ggctaccagctgaagagggatgccagatcctgtgaagtgatagacccctgcacaactggg
aatggaggatgcccacaaatctgtcagaatgagagaggaattgcaaaatgcgagtgtcat
gcagggtattatctttccgcagacaaaacgtcctgtttagacattgatgagtgtgcagaa
ggaagagccaggtgtgctcatcgttgtgtgaacagtctgggatccttcacctgtgtctgt
aatccgggcttcgaactgggggctgatggaaagcagtgctaccgcatcgaaatggaaatt
gtcgatagctgccaggaaagcaatggtggctgctctcaccactgcgagcacacgactgcg
ggaccacgatgctcctgtgaccatggctatcacctcgattttgatggcaaaacgtgtgcg
gagctggacgagtgcaagaccggagagtcctgctgctcccaattctgcatcaactatgca
ggtggctacgagtgtgcctgcaaagcagggttccagccaaatgccgatggctgtgactgt
gacgatgtggatgaatgtcatctagataacggcaactgtgaccatttctgtgttaatttt
ctggggtcatacgaatgtgcatgtaaggagggttacaggcttggtgttaacagacggtcc
tgcattgccctaggtggggaggacgtggatgcagaggaggcagtggggtttgccggggct
ccagggctgcagttcagagatcccccccagctccttcgctacgcacttggtgccctctat
gaggatgcagatccacgaggagagctcaccctgctgcacagggtcgtttgccttgataac
acttttggaaatgactgtagcttgagctgtgaggattgtctgaacggaggcagatgtaac
agtgaacacagtggctgtgtttgctctcctgggtggactggcattatctgtaatgaaact
tgctccccagggatgtccggcagaggctgtgccagcatttgcaagtgccagaacggaggc
tcgtgtgaccctgtcacagggcagtgccgctgcccgcccggtgtgcatggcaagctctgt
gaagatggttgcccaaaaggcttctttgggaagaactgtaataaaccatgcaactgcgcc
aacaacggctattgccacagactctatggagcctgcctctgtgacccggggctctacggg
cgcttctgccatcttacctgtcccaggtgggccttcggagctggctgctcagaggagtgt
cagtgcatgaaagagcacacgctggaatgcaacgcaaggaatgggacttgcacctgcaag
cctggttatcatggcaaaaagtgtcagaaagagtgcacgcctggattttatggggctggt
tgcaaactgaggtgtaactgtcctactgatgttctgtgtgatcatgagacaggagtctgc
caacattcatgtccacctgggtttcatggagaaaaatgccatttatcctgtcagcctggg
agctttggggtgaactgcaggcagaggtgcagctgcggagaactgccatgcaatccaaag
acagggcagtgtatttgcccagctgggaagactggtgctacatgtgagcaagattgccca
gctggtcagtggggaccagactgccagtcctcctgtaagccctgtgccaatgggggacaa
tgcaacagagagactggagcctgcaactgtcccccaggctacagtggggcatcctgttcc
acatcctgccctgatggttactatggacaaaattgcctgctgttatgcagctgtagcagc
agcactcaatgtcaccatgtcaccggagagtgtatatgttcccctggctggactggccat
gactgcaaacacccctgcaatagtggccgttggggacagcgctgtgaaaacatgtgtgtc
tgcaataatagcgacggtagctgtgatccagtcactggctcctgcttctgtgagccagga
ttcactgggaaacactgtgaatggaggtgccctgagggaagctttggcccgagctgtgag
cacagctgtcagtgccagaacggagctgcctgtgaccacgtgagcggagcctgtacttgc
acagcgggctggacgggaaccttttgtgaaagagcttgcccagatggattctttgggctt
gactgccaccaggtgtgcaagtgcaagaatgctgccggctgcgaccacgtcctgggaaca
tgccactgcctccctggctggctgggagagacctgcgagcagccctgccagggggacagc
tatgggccaggctgcagccacacatgtcagtgtcacaatggagcattctgtcatcatata
actgggacgtgcctttgtagcccagggtggaaaggagccacctgccaagaagcctgtccc
actggatggtatggtgcaaactgtctccagcgctgcatctgccacggccaggcgacatgt
gaccatataacgggcaagtgccagtgtccccagggttggacggggatagcgtgtgagctg
gagtgtgggaacaggaggtatggagagggctgcgagcagagctgtagctgccaccatggg
gtttgtgaccagcactcgggaaaatgcatctgccacactggctggactggggaccactgt
gatgctgtctgccctgtaggattttttggcaaatggtgtgaggagcaatgtgactgcata
cacggcttgtcctgccaccatcaaactggagcatgtcactgtgaaaagggatggagaggg
aggcactgtgacaaaccttgcttgcctggccgctatggtgtgggctgtgcccagcggtgc
cggtgtcccatgggtaccccctgccatcacttgaccggcgagtgtggatgtcctccggga
ttcactggctccagctgtgagaaaacttgtccaccaggcatgtatggcaagaactgtaag
caagtatgtcagtgctctgctgagaatgaggaatgtcacccagtgaccggcaactgcatg
tgccgcccagggtactacggggcacgctgcaacctccggtgtccaaaaggtacttatggt
tcaaactgccaaaacctctgtaaatgtatgaatggaggccactgcgaccccgcgtcagga
acttgtgattgcacgcctggttttattggagccgactgtagtaaaacttgccctgaaaat
cgatatgggaaggactgcaccctgttctgtgtgtgtggtaaaggtcagtgtgacccacgg
actggcaagtgtacctgtcctcctggccaaatgggacccagctgtcagcaagtgtgtccc
cagggacaatatggccccaactgcctcctgacatgtacctgtcagaacggtggtatctgt
gaccatgtggatggcaactgcacttgtgggcttggctggacaggaagattgtgtgaaaaa
gcagaatgtctcccagggaagtatgggtctggctgtgtcttggactgctcatgccagcac
aatggcacctgcgacaggttcacaggctgctgccaatgtcccgagggttactatggacac
tcctgcgagcacaggtgcccccttggattttatgggctaagctgtcttcatgcatgtgcc
tgtaaaaatggagcaagctgtgatgcagtgacaggacaatgcatttgtcgtttgggtttt
caaggtgtccactgtgaaaaaggctgtgacaggggctggtttggagagaagtgccggcat
cagtgcaactgcggagatgctccttgtgatccagagactgggaagtgcctctgcccacct
ggaaagaccggagaaaaatgtgacgttggatgcaggtcagaccagtatggccctgactgc
tccctgcgatgccagtgtgccaacaaatcccagtgcaatccatacaacgggaactgtgta
tgtccagccacgtggatggggccaacctgcaaagaaggtggccttccaaagcttcctttt
tatgaagagcaaactcaagaaagagggaatatttttccaagagctctacaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
