KEGG   Shewanella halotolerans: K0H81_14585
Entry
K0H81_14585       CDS       T09172                                 
Name
(GenBank) type IV pilin biogenesis protein
  KO
K02674  type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
shao  Shewanella halotolerans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:shao00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:shao02044]
    K0H81_14585
   02035 Bacterial motility proteins [BR:shao02035]
    K0H81_14585
Secretion system [BR:shao02044]
 Type II secretion system
  Pilin secretion/fimbrial assembly protein
   K0H81_14585
Bacterial motility proteins [BR:shao02035]
 Pilus system
  Pilus assembly proteins
   K0H81_14585
SSDB
Motif
Pfam: T4P_PilY1
Other DBs
NCBI-ProteinID: QYJ88993
LinkDB
Position
complement(3354497..3358045)
AA seq 1182 aa
MFKKLLCSTVMAMVVISGMTVADDTELYLIDSNVRSGKRPQVLFVFDNSGSMSTEDQNAT
SSYCSADDKANGICDYADGFGDYLAGYSGYINEKGIYWNAGGIDNTSNMPTPDEPKDSRR
FYADNNNCNKAAIALKERGRYTGYLREFKSSGKTGKWYPLADNEGFNTGQIVDCHQDILE
SDPKNPGRKKQGGGTVAFADGYPIDTKDMYTSGATAADRESSLGGTEFGKGTPVTLYTAH
YLVWYQWVTTTEEGQNSGGTGTRLEVAKDALTTALTSLSIPIDAGLAVFNLNYPSEGDAD
GGRIVYDIKEMTSTNQNSLISLINGMPAQTNTPLCETLYEAYQYFSGGPVTFGNDDKNAQ
GSYKIDGYIPNSPPSILTGGNYTTPFKKCPDTAYIIYITDGAPTIDSNADSAIISLASSA
ENSANYSGFDFVNSWGDTETSYLPALAAYMYNNDMVKGVKDVNGIDNKQNVRLFTIGFSE
GADVAAKLLEEAAFRGGNPRDDSGISKGYYVAKNGLDLVAAMDDALKSILSIDSSFTSPS
IASNNFDKTQTYNSAYFAMFLPGKGPRWSGNLKKLKVNSSGEIVGPGGSSKAIDSNGNIA
ASTCTYWNTCSANNVDGNKVNSGGVLPILRSTLKNRNIKTNSGSSIMDIRTSGFASTYSQ
EDLDWLFGVDVDDDDKDGNIYDAREDIMGDPLHSKPLAINFGEKPNADGTENLDVRVIVG
TNQGLVHMFKDSDSGSGDYSIGSVTETWAFLPQELWMNIPKLRENAPTGEHSVYGMDLSP
VAYTETDSSGKVNKAWVFLGMRRGGTSYYALDITNPDVPSYKWKIDSNSTGFEELGQSWS
EPVVTFVPGIDDPVLVIGGGMASSEGTGEAVYIVNAKSGAFIKKFSDTGMASVPNKVAVL
DSNNDGITDRIYAADIGGNIWRIDMPGKMQSTWSTFKFASIATSTSPNDRMFFAEPSVAQ
TQFNNIHNNSGELTYQSVPYDAVTIGTGNRTHPLDINTNDMFYVFQDRNVVTKTFTSTDA
PAALTISNLYDVTTAAPSSQSEEITFGTKRGWYYDYSVTGEKTLSASLIFDGKVYFTSFI
PPTRTDVDLDAGICGFAGQGRLYVFDLHKGTRSYSETYYEIGERVPDTPQIVIPKPEEGE
ESTAYIIGVGKGECEEGECKGTVSLGSGLSTNRIYYHLDESN
NT seq 3549 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttaagaaattactatgcagcacagttatggctatggtcgtaatttccggaatgact
gtagctgatgatacagagctctatttgattgactcgaatgttcgctcgggtaaaaggcct
caagttttatttgtatttgataattcaggtagtatgtcaactgaggatcagaatgcgact
agttcctattgttctgctgatgataaagcaaatggtatttgtgactatgctgatggtttc
ggtgattatttagctggctattccggctatataaatgagaaaggaatttattggaatgct
ggcggtatagataataccagtaacatgccaactccagatgagccgaaggattcgcgtcgt
ttttatgctgataataataattgtaataaagctgcaatagctctcaaagaacgaggacgt
tatactggatatttacgcgagtttaaatctagtgggaagactggtaagtggtatccgctt
gccgataatgaagggtttaatactgggcaaattgtcgattgccatcaggatattttagaa
tccgatcctaagaatccgggacgaaaaaagcaaggggggggcacagttgcctttgcggat
ggttatcctatagacaccaaggatatgtatacgtcaggagcaactgctgctgatagagaa
tcaagtttaggtggtacagaatttggcaaaggtactcctgtaaccctttatacagcccat
tatttagtttggtatcagtgggttactaccacagaggaaggacagaacagtggtgggaca
ggtactcgtttggaagttgctaaagatgcattgactacagcattgacatcattatctatt
cctattgatgctgggttagctgtatttaatttgaattatccaagtgaaggggatgctgat
ggcgggcgtattgtttatgacattaaggagatgacctctacaaatcagaattctttgatt
tctttgattaatggcatgcctgctcaaaccaacactcctttatgcgaaactctttatgag
gcttaccagtactttagcggtggtcccgttacttttggtaatgatgataagaatgctcag
ggcagttataaaatcgatggctatattcctaactcccctccaagtatccttactggcggg
aattatactacgccatttaaaaaatgtcctgatacggcctatattatttatattaccgat
ggagcgccgacaattgatagtaatgcagatagtgcgatcatatctttagcaagctctgct
gaaaatagtgcaaactattcaggatttgattttgtcaattcttggggagatacggaaacc
agttatttgccagctttagccgcttatatgtataacaatgatatggttaagggagttaaa
gatgttaatggtatagataataaacagaatgttaggttatttacgataggcttttctgaa
ggagctgacgttgcggccaaattattggaggaggctgcttttaggggcggtaaccctaga
gatgattccggtatatctaaaggttattatgttgctaagaatggtcttgatcttgttgcg
gcaatggatgatgccttaaagtctattttatcaattgactcatcattcacctcaccaagt
attgctagtaacaactttgataagacacagacttataactccgcttattttgcaatgttc
ttacccggaaaggggccaagatggagtggaaatcttaagaagttaaaggtcaattcttca
ggagagattgttggtccaggaggaagttctaaagcaattgattctaatggtaacattgcc
gcgtctacctgtacctattggaatacttgttctgcaaataatgtcgatgggaataaggtt
aattctggcggcgtactgcccattttgaggtcgactttaaaaaatcgtaatataaagact
aattccggttctagtattatggatattcgaacttccggttttgcttcaacttattcgcaa
gaggatttagattggttgtttggagttgatgtcgacgacgatgacaaagatggtaatatt
tatgatgccagagaagatattatgggtgatcctctgcattctaaacctttagcgattaac
tttggtgagaaaccaaatgcggatggaacggaaaacctggatgtgagggttatagtggga
actaatcagggattggttcacatgtttaaggattctgattcgggtagtggtgattattcc
attggctcggtcactgaaacctgggcatttttgcctcaagaactttggatgaatatccct
aagttaagagagaatgctcctacaggagagcatagcgtatatggaatggatctttcacca
gtagcctatacggaaacggactctagtgggaaagtcaacaaggcttgggtattccttggt
atgcgaagaggtggaacttcttattatgcgttggatattacgaatccggatgtacctagc
tataaatggaaaatagattcaaattcgactggatttgaagaactaggtcaatcctggtca
gagcctgtggtcacctttgtgcctggtattgatgatcccgtgttagttattggggggggg
atggcctctagtgaaggtacgggagaggcggtttatattgttaatgccaaatctggtgct
ttcattaaaaagttttctgatactggcatggcaagtgtgcctaataaagttgctgtttta
gacagcaataatgatggtataacggatagaatctatgctgccgatattggtgggaatatt
tggcgtatagatatgccaggaaaaatgcaatcgacttggtctacatttaaatttgcatct
attgcgacatctacctctccaaatgacaggatgttttttgcagagccatctgtcgcacag
actcagtttaataatattcataataatagtggcgaactcacttatcagagtgtgccatat
gatgctgtgactatagggacaggaaatcgaactcatcctcttgatataaatacgaatgat
atgttttatgtattccaagatcgtaatgtagttactaaaacctttactagtacagatgcg
ccagcggcattaactattagtaatctctacgatgtcaccactgcagcaccgtcatcacag
agtgaagaaattactttcggtactaagcgaggctggtattatgactatagtgtaacaggg
gaaaaaactttatctgcgtcattgatatttgatggaaaagtttacttcacttcctttatt
cctccgactcgaacagatgtcgatttggatgctggaatatgtggctttgccggacaaggg
cgtttatacgtgtttgatctgcataagggaaccagatcttacagcgaaacctattatgag
attggtgaacgggtaccagatacgcctcagattgtaatacctaagccagaagagggggaa
gaatctacggcttacattataggtgttggcaaaggggagtgtgaagagggtgagtgtaaa
ggtactgtatcattaggtagtgggttaagtacaaatagaatttattatcacctggatgag
agcaattaa

DBGET integrated database retrieval system