Staphylothermus hellenicus: Shell_0613
Help
Entry
Shell_0613 CDS
T01249
Name
(GenBank) Conserved TM helix repeat-containing protein
Organism
shc
Staphylothermus hellenicus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MS_channel_1st_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADI31738
UniProt:
D7DC41
LinkDB
All DBs
Position
569364..570749
Genome browser
AA seq
461 aa
AA seq
DB search
MADVFGNVSSAFNEVIVQIINYLPRIIGAAIIVLIGYVVGVLVKDATKIIIDKLFEKPLE
KTRSGKSLKEAGVDLGHLIGILMMALVIIISIVAAIDVLSITGYTGELVRAIAIAILNIT
AGITILAIGIPVSIIFAEYIASFFGGSFRDKHGLAVSLIYDVTALVLSVFVIALAVKVMF
QYDLLLNYIVSAAPGFITASIILFVGYVLGDAIGKVVDKIIDAIVEKPLEATDIGKSIKS
VNIDLSGLIGGLTKAFVIVVSIVAAVEIINLGGLTGELVYQIALYLPKLIGGITLLTLGL
ILSVALARYVGKFLHAMFKEKYAGLASLAENLILLGLITVILTISLNIMLLEGSLIYPLI
LGIIIIVTGVYVAGTVGSVLAETYPTYKRLAPFIESLIILIFVVIGASGIFSQFVGATNV
INTIAWGLSIAFALVLVPVTFYYTRLAWREAIKSTEEAKEE
NT seq
1386 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgatgtatttggaaatgtatcttccgcgtttaatgaagtgatcgtgcagataata
aattatttgcctagaattataggtgcagctattatagtattgattggctatgttgtgggt
gttcttgtaaaggatgctacgaagattattatagataaactatttgagaaaccattggag
aagacaaggtctggaaaatctcttaaagaggcaggtgttgatctaggtcatttaataggg
atcttaatgatggctcttgtaattattatttctatcgtagctgctatagatgtattatcg
ataacaggttataccggtgaattggtgagagctatagctatagctatacttaacataact
gcgggcattacaatactggcaattggtattcctgtatcaataatatttgcggagtatatt
gcaagctttttcggaggctctttcagggataaacatggtttagctgtttcactgatttat
gatgttacagcactggtattatctgtgtttgtcatagcattagcggttaaggtaatgttt
cagtatgatctgctcctcaactacatagtgtcggcggcgccaggctttattacagcttca
ataatattatttgtaggttatgtgctaggagatgctattggcaaagttgttgacaagatc
attgatgcaattgtggagaagcctcttgaagcaacagatattggtaaaagcattaagtct
gtaaatattgatttgtcaggtctaatcggtggcttaacaaaagcatttgtgattgttgta
tcaattgttgcagcagttgagattataaatcttggaggattaacgggtgagctagtatac
cagatagcattgtatctgcccaagctaatagggggaataacacttttaacattgggctta
atacttagcgttgctttagcgagatatgttggaaagttcctgcatgcaatgtttaaggag
aaatatgctggactagctagtttagcggagaaccttatattgctcggcttaataacagtt
atattaactatatcgttgaacattatgttgctggaaggatcccttatttatccattaata
cttggtataataataatagttactggagtatatgtagcgggaacagttggatcagtactg
gctgaaacatatccaacatataagagactagcacccttcatagagtcactgataatattg
atatttgtagtgatcggtgcaagcggtatattctcacagttcgttggagcaacaaatgtg
ataaacacaatagcttggggtctaagcatagcatttgcattagtactagtacctgtcaca
ttctactatactaggctagcatggagagaagctataaaatcaacggaggaagctaaagaa
gagtaa
DBGET
integrated database retrieval system