KEGG   Shewanella sp. MR-4: Shewmr4_1497
Entry
Shewmr4_1497      CDS       T00388                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
she  Shewanella sp. MR-4
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:she00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:she02000]
    Shewmr4_1497
Transporters [BR:she02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   Shewmr4_1497
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug OMP_b-brl_3
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABI38575
LinkDB
Position
complement(1755543..1758194)
AA seq 883 aa
MRANSTLAKAVRFALIGGATTAALSSTAVYAAEENAKVERIEVTGSRIQRTDMESALPVT
VLSAEDIAKTGLSDVSAVLAQMPFNTAGSFISDAGSSASNHASSGMRGLGSNRTLTLING
RRIAPSATFGGDSTNLNLIPMDAIERIEILRDGASAIYGSDAIGGVINIILKKTFDGLAF
DAKFGSPTQGGRDEKSASVTFGNTSDKSNSLVIIEHKQFDPLQGGQRPHLTANWDKKYGR
SGLYAPEGTYRPVESRPVKGADGTFGTPVYTGLQVPGKDCPADRIVTSKDGSACGFNQFD
GTDYLPDQTKDSVFSNMTYRITDELEWFGQAIVMRDKSSTSSTALWTPNLYMAADNPLNP
TFGTANASEVQAYHRLKGVADRKTEFDSNVVDIVTGLNLELDAGSLSWYVQYSDQIVNIE
TDSYVFEDKLQEAVDKGLYNPFVEGGNATQETLDTFLHTATRKATSNTTGTGLSWAALAP
ISLPGGDLGYAVGMEYQKIEYKDTRDAQQAAGNVLGTYGGDSAGDRSYKAAFVELELPVL
DHLNVKLASRYDQYSLPDVGQLSSSVNVRYEALDNLVLRASYGQGFRAPSLDDLLGKPAT
SYDRITDTTLCQSLPDDQKDGNPACEDNQYLRKSSGNKELDPEKSAQYSFGAVWNITENI
DLVVDYYNIEITDQVSYIDAQTIVDLEAIGGLGAYDPNYIYVKRKDDGTIDEIGAGNINM
DGVQTSGLDVSFTSNFDFAEFGAFKFAVEGTYALEYTEQASPIAKRYDVLGTKGYPPLRF
NTTFSYAIDDFSASLIAKYIDSYDGETPQQQEVGTNKQDFSSFTTWDLTLNYDFDSYGKV
TVGARNLFDAMPTVNYSLGYPGYDTDTHNIVGRVVFAGYKVKF
NT seq 2652 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcgcgctaattcgacattagccaaagcggttcgctttgcgttaattggtggtgccaca
acagcggctttatctagcactgctgtttatgcggcagaggagaatgctaaggtagaacgt
attgaagtaacgggatctcgtattcaaagaacggatatggaatctgctttacctgttact
gttttatcagcagaagatattgccaaaacaggtttaagtgatgtttctgctgttttagca
caaatgccatttaacactgctggtagttttattagtgatgcaggtagctctgcaagtaac
cacgccagttctggtatgcgtggtttaggttcaaaccgcacgttaaccttgatcaacggt
cgccgtattgcgccatctgcaacctttggtggcgattcaacgaacctcaacttaatccct
atggatgcaatcgagcgtattgaaattttacgtgacggtgcatcggcaatttacggttcg
gatgctatcggtggtgtaattaacatcatcctaaagaaaacgttcgatggtttagcattc
gacgcaaaatttggtagtccaactcaaggtggtagagatgagaaatcagcttctgtcact
ttcggtaatactagcgataaaagcaacagcttagtgatcatcgagcacaagcaatttgat
ccactacaaggtggccaacgtcctcacttaacggctaactgggataagaaatacggtcgt
agcggcttgtatgcgccagaaggtacatatcgtccagttgaatctcgccctgttaaaggt
gctgatggtactttcggcactcctgtttatacaggtttgcaagttccaggtaaggactgc
cctgcagatcgtattgttaccagcaaagacggttcagcttgtggttttaaccagtttgat
ggcacagactatttacccgatcagacaaaagactctgtattctctaatatgacttaccgt
attaccgatgaattagagtggtttggtcaagctatcgttatgcgagacaaatccagtact
tcttcaactgcgctatggactcctaacttatacatggcggcagataatccattaaaccca
acattcggtaccgctaatgcatcagaagtgcaagcctatcaccgtttgaaaggtgtagca
gaccgtaaaacagaattcgactcaaacgtagttgatatcgtaacgggtctaaaccttgaa
ttagatgcaggctctttgagctggtacgtacaatactcagatcaaatcgtaaacattgaa
actgactcttatgtattcgaagataagttacaagaagcggtagataaaggcttgtacaac
ccattcgttgagggtggtaatgcgacccaagagactttagatactttcctacacacagcc
actcgtaaagcaacctcaaatacgactggtactggattatcttgggcagcccttgctcca
atttcattgcctggtggtgacttaggttacgcagtaggtatggaataccaaaaaatcgaa
tacaaagatacccgtgatgctcaacaagccgcaggtaacgtattaggaacttatggtggt
gattctgctggtgacagaagctataaagcggcattcgttgagttggaactgccagtatta
gatcacttaaacgtgaaactagcgagccgttacgaccaatatagcttgcccgatgttggc
cagctttcaagctctgtaaacgtacgttacgaagcattggacaacttagtgttacgtgca
tcttacggccaaggctttagagcaccttcactggatgacctgttaggcaagccagcaacc
agttatgacagaatcactgacacaaccctgtgtcaaagtctgccagatgaccaaaaagac
ggcaacccagcttgtgaagataaccaatacctacgtaagagttcaggtaacaaagagcta
gatccagagaaatctgctcagtactctttcggtgccgtatggaatatcactgaaaacatc
gacttagttgttgattactacaacatcgaaatcacagaccaagtcagctacatcgatgca
caaacaatcgttgacttagaagcgattggtggcttaggtgcttatgaccctaactacatc
tacgtcaaacgtaaagatgacggcaccatcgatgaaattggcgctggcaacatcaacatg
gatggcgtgcaaacatcaggtcttgacgtgtcattcacatcaaacttcgattttgctgaa
tttggtgcatttaagtttgcggttgaaggaacctatgctcttgaatacacagagcaagca
agcccgatagctaaacgttatgacgtattaggtactaagggttatccaccactacgtttc
aacacaacatttagctacgccattgatgacttctcagcatctttgattgctaagtacatt
gattcttatgatggtgaaactccacaacaacaagaagttggcacaaataaacaagacttc
tcatcgttcacaacgtgggatctgacattgaactacgacttcgacagctatggcaaagtc
acagtaggtgctcgtaacttgttcgatgcaatgccaacagttaactacagcttaggctac
cctggatacgatactgacacccataacatcgtgggccgtgtagtgtttgcaggatacaaa
gtgaaattctaa

DBGET integrated database retrieval system