Shewanella sp. MR-4: Shewmr4_3284
Help
Entry
Shewmr4_3284 CDS
T00388
Name
(GenBank) multi-sensor hybrid histidine kinase
Organism
she
Shewanella sp. MR-4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_7
HATPase_c
Response_reg
HisKA
SSF
PAS_8
PAS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABI40351
LinkDB
All DBs
Position
complement(3918688..3922194)
Genome browser
AA seq
1168 aa
AA seq
DB search
MLAWLSVDTWWISVISIAYLAVLFIVAQWGQNQAIDQWRKRPWVYSLSLGVCCTSWAFYG
TVGQAATTGAWLAPIYIGSIICLVLAWPMLMRTLQIIKSQNLTSIADFIACRFDRSPKIA
ASVAMVSLFGTIPYIALQLRAISTSFDLLTGTFQSGISTAFIVTIVLIIFSILFGTRQLS
ASKQNQGLVLAIAFSSIVKLFALTTVGLFATFYVFDGFSDLLARGQHLPPSSEGNSLYFV
LSQILLGAITIYALPQEFHMMMIENHHAKELKAARWMVPLYLLLINAFVLPIALAGQISF
PGGSVDADTYVLTLPLFYQQAWLGILVYIGGLAAATAMVIVAAIVLSTMISTEILTPLLL
RLPKFSSQQTPQLAGILLNLRRISIAAILLSAFAFERYIDQQNHLASIGLLSFVLLSQFF
PAAVGALYWRRATTQGAFWGMLMGSLVWLYTLLLPATFPDALWVTQGLLNIPWLTPTALF
GLTGLDNISHGLLYSLLANVGCFVLISLLKEQSVGEVLQADVFVNRKQVALERHLSVEDL
ASLLHRFINKEEADALQARAKVLGSELQLATRREELVDYTRLKLSGVLGSASTRMVMNAA
SRSQQMPLEDVVSIVDEANQIFEFNRELLQSGVENIEQGISVVDADMRLVAWNKRYIELL
DYPKDYVKAGIPIETLLRFNIERGIIVGDEAHELVEKRLAHMRSGSPHHFQRTMLDGKVL
EIRGQAMPGGGFVSTFTDITAHIQAEKALQLANETLEKRVESRTRELAKAKAEAEAANSS
KTRFLAAASHDLMQPFNALTLFTEMLKQRVTSTELKDLATHIEASLNVVESLLSDLVEIS
RLDGGSLKTEQSQFALDDVLSTLVNEFKALSAEQGIDFSYQFSSCLVQSDQRLLRRIIQN
FLSNAFHYSPAGALNRQTPVSMNASAALAKPVESAFVPKVLLGVRRLEHSLLIQVWDNGP
GIPQDKQQAIFGEFERLEQTREIPGLGLGLAICDRIAKLLGLKIALHSEVGKGTCFSVEV
PRVSALKKPSNVVKLRSEEESVSDSFNISVLVIDNDELMLKAISSLLLGWGCHVLTARDK
TSAEQQLVQQVLPKLIIADYHLDDDQNGVDLVQSLLTHPVFSSQCPTCIICSADPSESVR
QHTSSALFSFVRKPVKATALKRLIKQLS
NT seq
3507 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgctggcgtggttgtctgttgatacttggtggatcagcgttatatcgattgcctatttg
gctgtgctgtttattgtcgcccaatgggggcaaaatcaggcgatagatcaatggcgtaaa
cggccttgggtgtacagtttatccttgggggtgtgttgtacttcttgggcgttttacggc
acggtagggcaagcggcgaccacgggcgcttggttagcgcccatctacataggttcgata
atctgcctagtgctggcgtggcctatgttgatgcgcacattgcagatcatcaaaagccaa
aacctgacctcgattgccgactttatcgcctgccgcttcgaccgctcgcctaaaattgcc
gccagcgttgccatggtgtcgctttttggcactattccctatatcgcgctgcaactgagg
gcgataagcaccagcttcgacctcttaactggtacttttcaatctgggatcagcacggcg
tttatcgttactatcgtgttgattatctttagtatcttattcggtacacggcagctttcg
gccagtaaacaaaatcaagggttggttctggcgattgcctttagctctatcgttaagctg
tttgcgctcaccacggttgggttgttcgcgactttctatgtgtttgatggttttagtgat
ttactcgctcggggtcagcatttaccgccgagctctgagggtaattcactctattttgtg
ctgtcacaaattctgctgggcgccattaccatctatgcgctgcctcaggaattccacatg
atgatgattgaaaatcatcatgccaaagagttaaaagccgcccgttggatggtgccactc
tatctgctgctgattaatgcctttgtattgcctatcgcgcttgcggggcagattagcttt
cccggcggcagtgtcgatgccgacacctacgtgctgaccttgccactcttctatcagcaa
gcttggctggggatcttggtgtatattggcggccttgcggcggcaacggccatggtcatt
gtggcggcgattgtactgagcaccatgatttcgaccgagattttgactccattgctgctg
agattaccgaaatttagctcgcagcagacgccgcagctcgcagggatattgctcaattta
cggcggatatcgatagcggcgattctgctatcggcctttgccttcgagcgttatatcgat
cagcagaatcacttggccagcattggcttgttatcctttgtgctgttgtcgcagtttttt
cccgccgccgtgggcgcgctctattggcgccgcgctaccacccaaggtgccttttggggc
atgttgatgggcagtttagtctggctctataccttgctgctacccgcgaccttccccgat
gcactctgggtcacccaagggctgttgaatattccatggttaactccaaccgcgctattt
ggcctgacggggctggataatatcagccacggcctactgtatagtttgcttgcgaatgtc
ggttgttttgtgctgatttcgttgctgaaagagcagagtgtgggggaagtgcttcaagcc
gatgtgtttgttaaccgtaaacaggtggcgctggaaaggcacctctcggttgaggatctg
gcgagcctattacaccgctttatcaataaggaagaagccgatgccctgcaggctagggcg
aaagtgcttggatcggaattgcaattagccacacggcgcgaggagctggtggattacacc
cgccttaagctgtcgggggtgcttgggtctgcctcgacgcggatggtgatgaatgccgcc
tcacgctcgcagcaaatgccgctggaggatgtggtcagcatagtcgatgaggctaaccag
atcttcgagtttaaccgcgagttgctgcaatctggggtcgaaaacatcgagcaggggatc
agcgtggtcgatgccgatatgcgcctagttgcatggaacaaacgctatattgaattgctt
gattatcctaaagattatgtcaaagcaggcataccgatagagacgctgctgagatttaat
attgagcgcggcattattgtgggcgatgaggcccatgagttggtggaaaagcgcctcgcc
catatgcgtagcggcagcccacaccattttcagcgcactatgctcgatggcaaggtgctg
gagatccgtggtcaagccatgccgggtggcggctttgtcagtacctttaccgacattacc
gcccatattcaggcagaaaaagccctgcaactggctaacgaaaccctcgaaaagcgggtc
gaaagccgcacaagggaactcgctaaagccaaggccgaagccgaggcggccaatagcagt
aagacacgcttcttagcggcggcgagccacgatttaatgcagccctttaacgcgctcact
ctgtttaccgagatgctcaaacagcgggtgacgtcgaccgaactcaaggatctcgccacc
catatcgaagcctccttaaatgtggtggagagtctgctatccgatctggtggaaatctcc
cgcctcgatggcggcagccttaaaaccgaacagagccagtttgcactcgacgatgtactc
tcgaccttagtgaatgaatttaaagctttatccgccgagcagggcatcgatttttcctat
cagttttcctcctgcctagtgcagagcgaccaacgtttgctgcgacgaattattcaaaac
ttcctctccaatgcgttccattattcccctgcgggggcacttaatcggcaaacgccggta
tcaatgaatgccagcgcggccttggctaagccagtggaatccgcctttgtacctaaggta
ttactgggcgtgaggcggctcgaacacagcctgcttatccaagtgtgggacaatggcccc
ggcattcctcaagataagcagcaggcgatttttggtgagtttgagcgcctcgagcaaacg
cgggagatcccagggcttggacttgggctcgccatttgcgaccgcatcgctaagttactc
gggcttaagattgccttgcactctgaggtgggcaaaggcacttgctttagtgtcgaagtg
ccgcgagtctctgccctgaaaaaaccttccaatgtcgttaaacttcgcagtgaggaagag
tctgttagcgatagctttaatatcagcgtgttagtcatagataacgacgagttgatgtta
aaagccatctcctctttgttgttgggctggggctgtcatgtactcaccgcgcgggataaa
accagtgccgagcagcaactggtacagcaggtgttgcctaagcttatcattgccgattac
cacttggatgatgaccaaaacggtgtcgatctggtgcaaagcttactcactcatcctgtg
tttagcagtcagtgtccgacctgcattatctgctcggcagatccgtctgaatctgtacgt
caacacaccagcagtgcactgttcagttttgtgcgtaaacccgttaaagccaccgcctta
aaacgattgattaagcaattgtcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
