Shewanella sp. Arc9-LZ: GUY17_13865
Help
Entry
GUY17_13865 CDS
T10509
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase family protein
Organism
shea Shewanella sp. Arc9-LZ
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
SWIM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QHS14123
UniProt:
A0AAE6VTQ6
LinkDB
All DBs
Position
complement(3238093..3241305)
Genome browser
AA seq
1070 aa
AA seq
DB search
MSAKLFNLPIKLSLEMIAKLFSATQIQKAQNYLIQGRVLEVTASSNNHDIEAYVEGSAAE
PYRQEITLVNVNHKIVMRSHCTCPVRTNCKHVAAAMLALVDKKPVEEQRIHQWLRQLDEQ
KTVAEFEEEDEEKDRIIYVLSNDPHGIFVEFKRSKFNKKGQYNKGSKLALADIRYSMPWW
IDPEDKQIISLLLSSNNHGSKIYIEGEISFLALTKMLTAEVCFWEENRIPLTWAKAVVPE
FVWCEIDKKHTQMQMRMPGLDNWEFIATEPPLYVELDYLHLGRIDTDLPVKKLSLLQHMP
PVPLAQVDAISHKMLQHFSPKTVPVPSEIDFCEITDSLLTRLTFTRELIANNLILQPVIR
VDHCYGEITFNASTKPERISLVKKNQVQYQVHRHVEQELAALQSLADIGLVTLEPDATLA
SSQQPYYVSVGLLPESIFEWSELTDNGLDALTALGMDIHFDDDFDLQITDAQLDVDLVDD
DESGWFSLSLSADIDGQSVPLLALVARWLQQNGEPADDDELLLPGPNGGFIKIKAKTIKP
LISIIQELFNRHSGDVISIPRNRAHILNDLSASDVRLLNGERVRNLATKLAEFKGVVPVE
LPDGLNATLRDYQKQGFDWLCFLKEYQLGGILADDMGLGKTVQALAFLLKAKQDATERRT
SLIVCPTSLVGNWLKEANKFAPSLNVVVIHGNKRQPLLDQINQFDVVVTTYPLMLRDEAI
YCEYVFEHIILDEAQQIKNAQAKVTQVIKTLRGRFRLCLSGTPLENHLGELKSLMDFCLP
GLLGQHTYFNKQFRGPIEKQADVEKSQLLSQRIAPFMLRRTKKEVVSELPEKTVIIQTLE
LERDQRNLYESIRLVMEKKLRELFAKKGVSSSHIEFLDALLKLRQACCDPRLVKLEQAQQ
VKDNAKMTWLIQNLPEMIEEGRKILIFSQFTGMLALIEDELKRLAISYSKLTGQTRDRQT
QIDSFQEGDNSVFLISLKAGGTGLNLTAADTVIHFDPWWNPAAERQATDRAHRIGQLNPV
FVYKLIAQGTVEEKIQEMQQHKQGLADSILSDGTQGPWQGSANDLLALLS
NT seq
3213 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcggcgaaactgtttaatctccccattaagctttcattagagatgattgcgaaactg
ttttcggccacccaaattcaaaaagcgcaaaactatttgatccaaggtcgagttctagaa
gttactgccagcagtaataatcatgatattgaggcctatgttgaaggatctgctgctgaa
ccctatcgtcaagaaatcaccctagttaatgtgaatcacaaaattgtgatgcgttcacat
tgtacttgccctgtgagaacaaattgtaagcacgttgccgcagcaatgctggcactggtc
gataaaaagccggttgaagagcagcgtatccaccaatggttacgccaacttgacgagcaa
aaaacggttgccgagtttgaagaagaggacgaagaaaaagaccgcattatttatgtgtta
tctaacgatcctcatggcatttttgtcgaatttaaacgcagtaaatttaataaaaaaggt
caatacaataaaggcagcaagctagcattagccgatattcgctatagcatgccatggtgg
attgaccctgaagataaacagattatcagcttgttattgtcatcaaataatcatggttct
aaaatttatattgaaggtgagatttcatttttagcactgactaaaatgctcaccgccgaa
gtgtgtttttgggaagaaaatcgtatccccctaacatgggctaaagccgttgtgcctgag
tttgtctggtgtgagattgataaaaaacatacccaaatgcaaatgcgcatgcctgggctg
gataattgggagtttattgctaccgagccacctttgtatgttgaattagactatttgcat
ttaggtagaatagacactgacttgcccgttaaaaagttaagtttattgcaacacatgcca
ccagtgccattggctcaagtggatgccattagtcataaaatgctccagcatttttcgcct
aaaaccgtgcctgtgccgagtgaaattgatttttgcgagataacagactcactgttaaca
cgcttaacctttacgcgtgagctcattgccaacaacctgattctgcaaccggttattcga
gttgatcattgttacggtgaaattacttttaatgcatcgactaaacccgaacgcataagc
ttagtcaaaaaaaatcaagttcagtatcaagtgcatagacatgtcgagcaagaactcgcg
gcattacagtcattagcggatataggcttagtgacgcttgagccagacgctacgctggcc
agttcacaacaaccctactatgtcagtgtcggcttattaccagagtcgatttttgaatgg
tctgaattgaccgacaatggtcttgatgcgttaactgcgctgggtatggatattcatttt
gatgatgacttcgacttacaaattaccgatgcacagttagatgtcgacttagttgacgat
gatgagtctggctggttttcgttatcgctcagtgccgacatcgatggtcaaagtgtaccg
ttattagccttagttgcccgttggttacaacaaaatggtgaaccagcagacgatgatgaa
ttgctattacctggccctaacggtggttttattaaaatcaaagccaaaaccattaagccg
ctgattagtattatccaagaattatttaatcgtcattctggcgatgtcatttcgatacca
cgcaaccgtgcgcatattttgaatgatttatctgccagtgacgtgcgtttactcaatggc
gaacgtgtgcgcaatttagccaccaaactcgcagagtttaaaggggtggttccggttgag
ttacccgatggcttaaatgcgacattacgtgattatcaaaaacaaggttttgactggttg
tgttttcttaaagaatatcaactaggtggtattttagccgatgacatgggcctgggtaaa
accgttcaagcattggcatttttactcaaagccaagcaagacgctaccgagcgtcgtacc
agtttaattgtttgtcccactagcttagtgggtaactggttaaaagaagccaataagttt
gctccgtcgctgaatgtagtggtgatccacggtaataaacgccagccgttattagatcaa
attaaccagtttgatgtggtcgtaacaacctatccattaatgttacgtgatgaagccatt
tattgtgaatatgtgtttgagcatattattttggatgaagcacaacagattaaaaatgcc
caagcaaaagtcacccaagtgattaaaacccttagaggtagatttcgcttatgtttatcg
ggtacgccgcttgaaaaccatttaggcgaattaaaatcattgatggatttttgcttgcca
ggtttattaggtcagcatacttactttaataaacagttccgtggtccgattgagaagcaa
gccgatgttgaaaagtcgcagttactgagtcagcgtattgctccttttatgctgcgccgc
actaaaaaagaagtggtatcagaattacctgaaaaaaccgtgattattcaaactctggaa
cttgaaagagatcaacgtaatttgtacgagtctatccgtttagtgatggagaaaaaattg
cgtgaactgtttgccaagaaaggagtatcgagtagtcatattgagtttttagatgcattg
ttgaagttgcgtcaagcctgttgcgacccgcgtttagttaagcttgaacaagctcaacag
gtaaaagacaacgctaaaatgacttggttaatccaaaacctgcctgaaatgattgaagaa
ggtcgtaagatccttatcttcagccaatttaccggcatgctggcactcattgaagatgaa
ctgaaacgcttagctatcagttatagcaagttgacaggccaaactcgtgaccgtcagacc
caaattgattcgtttcaagagggtgataactcggtgtttttgatcagtttaaaagccggt
ggaaccggacttaaccttactgctgcggacacggttattcattttgacccgtggtggaac
cctgccgcggagcgccaagcgaccgatcgcgctcatcgtattggccagttaaatccagtg
tttgtttataaactcattgcccagggcaccgttgaagagaaaattcaagaaatgcagcag
cacaaacaaggtttggcagacagtattttatccgatggtactcaaggtccatggcagggc
agtgcgaacgatttattggcattattgagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
