Shewanella sp. H8: ABIS04_00410
Help
Entry
ABIS04_00410 CDS
T10623
Name
(GenBank) TonB-dependent siderophore receptor
KO
K16091
Fe(3+) dicitrate transport protein
Organism
sheh Shewanella sp. H8
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sheh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sheh02000
]
ABIS04_00410
Transporters [BR:
sheh02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
ABIS04_00410
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBJ48693
LinkDB
All DBs
Position
complement(95913..98048)
Genome browser
AA seq
711 aa
AA seq
DB search
MLPEKSRFTLTTIAVAIAASLASSAVFADDKSQTEVKPEVIVVTGSLLGNSEVADLKTYT
GNRSIITSDQIERTAARSIDTALQQVPGIKIKDETGTGILPNISVRGLDSSRSGYAQILL
DGIPMTLAPYGHTGQSLFPATLFMIDRIDVARGGASIQYGPNNVGGVINLISKPIPTDWE
TSLNERTTFFGDSNTLFDTNVSTGGAVNEDFSMRFDGNITKGESFREHSETDIKNLMLKT
LWNIDEQNSFDATLQYYDAFSELPGALNTAAYEADREQSLRPNDEFNANTKRVSLKYSHV
LDDSKIIDYGEIDLRVFGNKSSRNFQWDFYDSSKDTDGNLGTSWSDTTQEATHLRNSPRD
FTVFGIEPTASLLIDGDISQHIIAGARYINEDISYQLNHIEKSTQTATRPRDWQMDTNAM
AYYVSNKVGFFDDTFSITPGIRYEDVRMTFTNVGQGYSQDNHVTEWLPGITLGYEFSSNW
FAYTNAQRSLRTPQISQLWPKDQTLESELSWNYEAGVRFTPTERSNLSIAAYRIDFENKI
EYDGDVSLFVNIGQTRNQGIELEGTYSPMSLPDLVLTGAYNYLDTEQLDGEFAGNELAYV
SKHQLSASALYSIKDVDLGLMAFYYSKSFSDLANTVEENVSGTSGEVPAYTVVNFNIGTE
FFKQDSHGLKVGLSVNNLFDNEYYFRGLDVSPAGRVPASGRSLSLDVGYTF
NT seq
2136 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctacctgaaaaatccagattcactttgaccaccattgcggtggccattgcagccagc
cttgctagttcagcggtatttgctgacgacaaaagtcagacagaagtcaaacccgaagtc
attgtggtgacagggagcttattgggtaattctgaagttgctgatttaaaaacttatacc
ggtaaccgctcaatcattacttctgatcaaatagagcgtactgcagctaggtcaatcgat
acagcactacagcaggtccctgggattaaaattaaagacgaaactggaacggggatttta
cctaatatatccgtacgaggtttagacagcagccgcagtggctatgcccaaatattactc
gatgggatcccaatgacacttgctccatatgggcatactggtcagtcattattccctgcc
accttattcatgatagatagaattgatgtagcacgcggcggagcatcgattcaatatggc
cctaacaacgttggcggcgtaataaaccttatttctaagccaatcccaacagactgggaa
accagccttaatgaacgcacgaccttctttggtgacagtaataccttatttgatactaac
gtcagcactggcggcgcggttaatgaagatttttcgatgcgtttcgatggcaacatcacc
aaaggggaatcgtttcgtgaacactccgaaactgacattaaaaacctaatgttaaagacc
ctatggaatatcgatgagcaaaatagctttgatgccacgctacaatattacgatgctttt
tctgagctaccaggtgccttaaataccgccgcatatgaagctgatcgagaacaatctcta
cgccctaatgatgaatttaatgccaatactaaacgagtgtcattgaaatatagccatgtt
ctcgatgattcgaaaattatcgattatggtgagattgatctcagagtatttggtaataag
agttcacgtaattttcagtgggatttttatgactcaagcaaagacaccgacggtaattta
ggtactagctggagtgatactacgcaagaagccactcatctgcgtaactctccacgcgac
tttaccgtgtttggcattgagccaactgcaagtctgcttattgatggtgatattagtcag
cacattatcgctggtgctcgttatattaatgaagacattagctaccaactaaaccacata
gaaaaatcgactcaaactgcaactcgtccgcgcgactggcaaatggatactaatgccatg
gcctattatgtgagtaataaagtgggattctttgatgacacattttcgattacccctggc
ataagatatgaagatgtccgcatgacctttaccaatgttggacaaggttatagccaagat
aatcacgtgaccgagtggcttccgggcatcactttaggttacgaattcagttcaaattgg
tttgcgtataccaatgctcaacgctcattgagaacgccgcaaatttcacaattatggcct
aaagatcaaactctagaatcagagctatcgtggaactatgaagcaggcgtacgctttacc
ccaacagaacgcagtaacttaagtattgcggcttaccgtatcgattttgaaaataaaata
gagtacgacggtgacgttagtctgttcgtcaatattggccaaacccgtaaccaaggtatt
gagctagaaggcacttactcacctatgtcgctaccagatctggttctaacgggtgcctac
aactatttagatactgaacaacttgatggagaatttgccggtaacgaattggcttatgtg
tctaaacatcaactttctgccagtgctttatacagtattaaggatgtcgatttaggatta
atggccttttattacagcaaatcattttccgacctggctaacacagttgaagagaatgta
tctggtacatcgggagaagtgcctgcgtataccgtggttaacttcaatattggtactgag
tttttcaaacaagatagtcacggcctaaaagtgggattatccgtcaataatctatttgat
aacgaatactactttagaggcttagatgtatcgccagcgggacgagtgccagcatcgggt
cgttcactgagcttagatgtcggttacaccttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
