Shewanella sp. H8: ABIS04_07615
Help
Entry
ABIS04_07615 CDS
T10623
Name
(GenBank) EAL domain-containing protein
Organism
sheh Shewanella sp. H8
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
PAS
PAS_4
PAS_8
PAS_3
PAS_13
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBJ49999
LinkDB
All DBs
Position
1747204..1749696
Genome browser
AA seq
830 aa
AA seq
DB search
MLKKAISQAKLREWQLEINDISVEFHLAIIFYQVNAENSFEAICTSNNIDKKTELLHEAN
LLQLFNVAQYHSEKSIKQDTVVFHQLLRSSQDNIIGVISFSAKNIESSQVTLLQPLTKIQ
TRIANMLSNAIRYHINDFDLDRHGSVLLDVSLQSFIDAFDEHIWVKDTLGQYVACNKSVE
LAWQKTKQQIVGKTDIELFDQRTADEFLEGDNLAINAGKTVVVSECQEVDIDFNKVWIET
IKSPIRNAHGDLSGVIGMTRNIAKHKEAEEQLVLAANVFQNAVEGVVITDRNGRITEINQ
AFTDITGYSREEVLGQNPRLLNSGRHPKSFFERMWNTLLVQGKWHGEIWNRRKHGAIFPQ
SITISAVYDKLNFIQYYVAVFADISAQKQNEEKLKNLAYFDPLTQLPNRMQFMSLLEQEV
NHTNRAKKQLAIIFLDIDFFKQINDSLGHMIGDEILIELAKRLSYALSDFDVLSRLSGDE
FAVMLPSIMGTDSVTLSVDRIRSVFEQPFILDNSQSVRLTASMGIAIYPSDGDDHDSLLR
HADAAMHRTKLNGRNNYAFYTESMTKQAVEQLKLQTALHQALVNKDFYLVYQPKLKLSDL
SPCGFEALIRWSDPVLGNIPPGEFIPLAEKIGLIWDIGLWVLKTACIQGVEWLTQGKTFE
RISVNVASLQLQRNDFVDKVRSILLETGLPAKHLELEVTESCMMQDPDAIIRDLKLLGAM
GIALSIDDFGTGYSSLNYIKKLPIDKLKIDQSFVRDIPHDPNNTAIAKAVIALGHALNLQ
IIAEGVETAEQADFLRLHGCDLVQGYLFSKPRLPEDLNDFLPVFTQNKTI
NT seq
2493 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgaaaaaagctatttctcaagcgaaattaagagaatggcagctcgaaatcaatgat
atttctgtcgagtttcatcttgctatcattttttaccaagtcaacgctgaaaatagtttt
gaagctatttgtacaagcaataatatagataaaaaaaccgaattactgcatgaggcgaat
ttattgcaactttttaatgttgcacaatatcactctgaaaaatcaataaaacaagatacc
gtcgtatttcatcaacttcttcgttcgtcccaagataatattattggtgtgatcagtttt
agcgctaaaaatattgaatcttctcaagttacattgctccagcctttaacaaaaattcaa
acacgcatagcaaatatgttaagtaatgccattcgttatcatataaacgactttgactta
gatagacatggttcagtgcttctagatgttagtttgcaatcttttattgatgcttttgat
gaacatatttgggttaaagatactctcggtcaatatgtcgcatgtaacaaaagtgttgaa
ttggcttggcagaaaacaaaacaacaaatagtcggtaaaaccgatattgagctttttgat
cagcgtactgcagatgaatttctcgagggtgataatttagcgattaatgcaggtaaaact
gtggtggtatcagaatgccaagaagttgatatcgatttcaataaggtgtggattgaaacc
attaaatcgccgatccgtaatgcccatggtgatttaagtggtgttatcggtatgactcgt
aatattgccaaacacaaagaggctgaagagcagttagttttagcagccaatgtgtttcaa
aatgcggttgaaggtgtggtcattactgacagaaatgggcggataactgaaattaatcag
gcttttacggatattactggctatagccgtgaagaagtcttaggacaaaatccaagactg
cttaattcggggcgtcatcccaagagtttttttgagcgtatgtggaacacattacttgtt
caaggtaaatggcatggtgaaatttggaacagacgtaaacatggtgccatctttccgcaa
tcgattaccattagtgccgtatacgataagctcaatttcattcaatattatgtagcggta
tttgccgatatttcagcgcaaaagcaaaatgaagaaaaacttaaaaatcttgcttatttt
gatcctctgacccaactgccgaatagaatgcagtttatgtcgttacttgaacaagaagtt
aatcatactaaccgtgcaaaaaaacagttagcaataatctttttagatatcgactttttc
aaacagatcaatgacagcttaggccatatgattggtgatgaaattttaattgagcttgcc
aagcgtctgtcttatgcattgtctgattttgatgttctctcccgattaagtggcgacgag
tttgctgtgatgttacccagtattatggggacagattcagtgactttatcggttgaccgt
attcgtagtgtgtttgagcagccatttatacttgataattctcaatcggtgcgtttaact
gccagtatgggtattgccatttatcctagtgatggcgatgaccatgacagcttattacgt
catgcagatgctgctatgcatcgtacaaaattaaatgggcgtaataattatgccttttat
acggagtcgatgaccaagcaggcagtggagcaattaaaactgcaaacggcattgcatcaa
gcgttggttaataaagatttttatttagtttatcaaccaaaattgaaattatctgatttg
tcaccttgtgggtttgaagcgttaattcgctggtccgatcctgttttaggtaatatccct
ccaggggagtttattccgttagctgagaaaattgggttaatttgggatattggtttatgg
gtattaaaaacagcttgtatacaaggggttgaatggctgactcaaggaaaaacttttgaa
cgcatttccgtcaatgtggctagtttacaactgcaaagaaatgattttgtcgataaagtt
cgatcgattttgttagaaacaggattgcccgctaaacatttagagttagaagtaacagag
tcttgtatgatgcaagatcctgatgcaattattcgtgacttaaaattattaggggcgatg
gggatagccttgagtattgacgattttggtaccggatattcgtcactcaattatattaaa
aaattacccattgacaagttgaaaattgatcagtcgtttgtgcgggatattcctcatgat
cctaataacactgcgattgcaaaagcagtgattgcattggggcatgctttgaatttacag
ataattgccgaaggcgtagaaactgccgaacaagcagattttctgcggctccatggctgt
gatttggtacaagggtatttgtttagtaaaccacggttgccggaagatcttaatgatttt
ttacccgtgtttacgcaaaacaaaacaatatag
DBGET
integrated database retrieval system
