Shewanella sp. H8: ABIS04_07735
Help
Entry
ABIS04_07735 CDS
T10623
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
sheh Shewanella sp. H8
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sheh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sheh02000
]
ABIS04_07735
Transporters [BR:
sheh02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
ABIS04_07735
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Polysacc_synt
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBJ50020
LinkDB
All DBs
Position
1777328..1778818
Genome browser
AA seq
496 aa
AA seq
DB search
MTAAKFVEGSILRHILVMSSTAAVGISALFVVDLLDIFFLSLLGEVELAAAAGYASTISF
FTTSIGIGLSIALGALVSKAVGSKNIKLAKRLFLNSAIVTLLTSVLVAAIVIAFIPELLA
LVGATGRTAELAQSYLYILVPSLPFICLAMALGGALRAVGDAKLSMMSTLAGGGVNAILD
PIFIFSLSMGIEGAAAASVLARIAVFIISARGVVIKHKLLGRFSFAEFKQDLGVIFAIAA
PAMLTNVATPIGNAVVTRAIADFGDSYVAGWAVLGRLIPVSFGMIFALSGAVGPIVGQNF
GANEIERVRLSLTKAIQFCVAYVLVVSLGLFLLRNVIISSFDMKGDAAELILFFCQYIAV
FFIFSGMLFIANASFNNLGKAKYSTLFNVGKATIGTIPFVYFGAQWGGVFGVLIGQVIGA
VIFGVIGILCAYRLVDKISRQGLLSASVNQQLLEDDAINIDMVAAPSPMPGRTLMAQLDE
DPLCKQLGQQENSDKS
NT seq
1491 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccgccgctaaatttgttgagggctcaattttacgccatatattggtcatgagctct
actgctgcagtggggatttcggcgttgtttgtcgtcgatttactcgatattttcttttta
agtctgctcggcgaagttgaacttgccgccgctgcaggttatgccagcactatttcattt
tttaccacttcaattggcatcggcttatctattgcactaggtgcattggtgtcaaaagcg
gtgggttcgaaaaatattaagctcgctaaacggttgtttttaaacagtgccatcgtgacg
ttattgaccagtgtgctggtggctgcaattgttatcgcgtttattcctgaattgttagcg
ttagtgggtgctacggggcgcacagcggagttagcgcaaagttacttgtatattttagtg
ccttcattaccgtttatttgtttagccatggcgcttggtggtgcattacgtgctgtgggt
gatgctaaattgtcgatgatgtcgaccttagctggcggtggggttaatgccatattagat
cctatattcattttttctttatcaatgggcattgaaggcgcggctgccgcgtctgttttg
gcgcgtattgcggtgtttatcatctcagcccgtggagtagtgataaaacataaattattg
ggtcgattctcgtttgccgagtttaaacaagaccttggggttatttttgccattgctgca
cccgccatgctcaccaatgtagccactccaattggtaatgcggtggtaacgcgtgctatt
gcagattttggtgatagctatgtagcaggttgggctgtattgggacgtttgatccccgta
tcgtttgggatgatatttgcgctatctggtgcggttgggccgatagtggggcagaacttt
ggcgccaacgaaattgagcgtgttaggctgagtttaaccaaagcgattcaattttgtgtt
gcttatgtattggtggtgtcactgggactgtttttattacgtaatgtcattattagtagt
tttgacatgaaaggcgatgctgcagagcttatattatttttctgtcagtatattgcagtg
ttctttattttctcgggaatgttgtttattgctaatgcctcgtttaacaacttaggtaag
gccaagtactccactttatttaatgtaggtaaagccactattggtaccataccattcgtg
tattttggtgcgcaatggggcggtgtgtttggcgtattgattggtcaggttattggcgcg
gttatctttggggtgataggtattttatgtgcttatcggttagtcgataaaatcagtcgc
caaggtttattgtcggctagcgtaaatcaacaactgttagaagatgatgctattaatatt
gatatggtggctgcgccgtctccaatgccagggcgaactttaatggcgcaattagatgaa
gaccccttgtgtaaacaattaggccaacaagagaacagcgacaaaagttag
DBGET
integrated database retrieval system
