Shewanella sp. H8: ABIS04_16080
Help
Entry
ABIS04_16080 CDS
T10623
Name
(GenBank) mechanosensitive ion channel domain-containing protein
KO
K22051
miniconductance mechanosensitive channel
Organism
sheh Shewanella sp. H8
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sheh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sheh02000
]
ABIS04_16080
Transporters [BR:
sheh02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
ABIS04_16080
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MscS_TM
MS_channel_2nd
MS_channel_3rd
MS_channel_1st
FIMP
DUF6594
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBJ50546
LinkDB
All DBs
Position
3720724..3723933
Genome browser
AA seq
1069 aa
AA seq
DB search
MFRLACLCLCFLIVNTLSIPVLANTPLTLDKRLGLNSQPENQPLDIQSQIAELESSIEKL
QIEQQTYSKIERSNNQIKLSLAGQLREAQVALNLDADIALDQQASMAYFRLSELKETESS
LNQQLRVISQRQTQLPQLITQAENALTQHNKTQQVPIDTPLGKRNNLQSALLTQQIETLQ
AERLANPKQLEITQLQQQLNRLSLEQQEDFIELINKYNIASRQQQTADTIANNLIDTQEL
ADPWSLELSKLNQRYATQLQTLTSKIKAAIEKQQRIEKRYQSQNAQLSNVLEQITWVKTN
SAFGDRFLQMLQSLPKPPNLDKLQTELADARLERYQLEQQQALNSQQLDDSETFSETQNK
LLQSQQILIEQLLQSYDQYLAEFAKLRIGYEQLNQLHDTLKNTLNEHLFWVPNAPSIGAL
WLIDLSHSSVWLLQSNQWQSLQQAWSEQSNYWAWWGILLLCCLMAQDMLTPKFNKALNRY
AVFVGNVTQDKFKYTIKTLIISLVYALIKPLPLIVAGIIFSSSEQNMVHAVGVGILAIGV
CFLIYQFFFLLTLDKGILISHFRRPKKIVKQAQQTMASFVLVSAPLIGLMGFTEALDTSL
VRNSIGRGAFIIFCILLCRLYKDIMLLIGQYRKNKPSATNMAIIQQAVWLILIVTPIFSA
ILAGIGYYFTAFQLLLQLQISVLLGLGFLLTYQLIKRWMLIERRLIAFDRAKAKRAERLA
QREKGELHNNEPIETYEEPIVDLETISSQSLGLVRSILILAFFASLLGILAQTHTAVFTF
LDGITLWTTNSNINGIEQQVPITLKSILFGFMLVGFTLVIAKNLPGLLELTLLQRLDLSP
GTGFAITTVSSYLVVFFGILLGFSTLGMEWSKLQWLVAALSVGLGFGLQEIFANFISGLI
ILFEKPIRIGDTVTIRDLSGTVSKIQIRATTIVDWDRKEIIVPNKAFITEQLVNWSLSDQ
ITRVIVNVSVSRDADPAKVEMLLHQAVRECDLSLAIPEPEVWFAGFGQHTQDYEIRSYAK
DMSARWPLRHNLHKLITKKLKENNVELAYPQMEIHINQSSKEDTGLYKG
NT seq
3210 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttcgtttagcgtgtttatgcctgtgtttccttatcgttaatacactgtcgattcct
gtattggccaatacccctctgaccttagataaacgtttggggcttaatagccaacccgaa
aatcaaccgcttgatatacaatctcaaattgcagaacttgaaagcagcattgaaaagctg
caaatagaacagcaaacctatagcaaaattgaacgctctaacaaccaaatcaagctatcg
cttgcagggcaacttcgtgaagctcaggtagcattgaatcttgatgcggatatcgcgctt
gatcagcaagcttcaatggcttattttcgtctatcggagttaaaagaaactgagtcgagc
ctaaatcagcagttacgtgtaatttcacaacgccaaacacaattaccgcagttaattact
caagccgaaaatgccttaactcagcataataaaacccaacaagtgccaattgatactcca
ttgggtaaacgtaataatcttcagtctgcactgctaacacaacaaattgagaccttacaa
gctgaacgcttagctaaccctaagcaattagaaattactcagcttcaacaacaactcaat
agattatctttagaacaacaagaagactttattgagctgattaacaaatacaatattgcg
tctcgtcagcaacaaaccgcagataccatagccaacaatttaattgatacccaagagcta
gccgacccgtggtcgctagaattaagtaaattaaatcagcgctatgcaacacaattacaa
acactgacaagcaaaatcaaagcagcaatagagaaacaacaacgaattgaaaagcgctat
caatcacaaaatgcacaactttcaaatgttcttgaacaaatcacttgggttaaaaccaat
tcagcattcggtgaccgtttcttgcaaatgctgcaatcattacctaagccacccaatctt
gataaattgcaaacagaattagcggatgcgcgactagaacgctatcaattagaacagcaa
caagcattaaatagtcaacagctcgatgacagcgaaactttttcagaaacgcaaaacaag
ttactgcaatcacaacagatactgatagagcaattgctgcagagttatgatcaatattta
gctgaatttgctaaattacgtattggctatgaacaattaaatcaattacatgacacatta
aaaaatacccttaacgaacatttattttgggtacctaacgctcctagtattggcgcatta
tggttaattgatttaagccacagtagtgtttggttactgcaatcaaatcagtggcagtca
ttacaacaagcttggtcagaacaaagtaattattgggcctggtggggcattttattgttg
tgctgtttaatggcacaagacatgctgacacctaagttcaataaagcgcttaatcgttat
gctgtgtttgtgggcaatgtgacgcaagataaatttaagtacaccatcaaaacgctcata
atcagtttagtgtatgccttgataaaacccttaccgttaatagtcgcagggattattttc
tcaagttcagagcaaaatatggttcatgctgtgggcgtcggcattttagccattggtgtg
tgttttctgatttaccaattctttttcttattaaccttagataaagggattttaattagt
catttcagacgaccgaaaaaaattgtcaaacaagcacaacagactatggcttcatttgta
ctggtatcagcaccgttaattggcttaatgggctttaccgaggctttagatacttcatta
gtacgcaacagtattggccgtggtgcatttatcattttctgtattttgttgtgccgactg
tataaagatatcatgttacttattggccaatatcgtaaaaataagcctagtgccactaac
atggcgattattcaacaagcagtatggttaatcctgatcgtcacccctatttttagtgct
attttagcgggtatcggctactacttcacggcttttcaacttctattacagctacagata
tcggtattattaggtttgggcttcttacttacctatcagttaattaaacgttggatgctg
attgagcgccgcttaatcgcgtttgaccgcgccaaagccaagcgtgcggaacgtttagca
caacgtgaaaaaggcgaattacacaacaatgaaccgatagaaacctacgaagaacccatt
gttgatttagaaacgatttctagccaatcactgggcttggtcagatcaattttgattcta
gcctttttcgccagtttattaggcatattggcgcaaacgcatactgcggtattcacgttt
ttagacggtattaccttatggaccaccaatagcaatataaatggcattgagcaacaagta
cccattacattaaagtcaattttatttgggttcatgttagttggtttcacgttagtaatt
gctaaaaacctccctggcttgctagaacttaccttgttgcagagattagatttatcgcca
ggaaccggttttgccatcactaccgttagcagttatttagtggtgttttttggcatactg
cttgggttttcgacccttggcatggaatggtcaaaattacagtggctcgttgcggcgctc
tctgtgggtttgggctttggcttacaagaaatttttgctaactttatttctggtttaatc
attttatttgaaaaacccattcgtattggcgataccgtcactatccgcgatctctcagga
acggtcagtaaaatccaaatcagagccactacgattgtcgactgggatcgcaaagaaatt
attgtgcctaacaaagcttttattactgaacaattggttaactggtcgttgtccgatcag
atcactcgtgtgatcgtgaatgtatcggtatctcgtgatgctgaccctgctaaagttgaa
atgttacttcatcaagccgtgcgagaatgtgacttatcattagctatcccagaacctgaa
gtatggtttgcaggctttggtcaacatacacaagattatgaaattcgttcgtatgccaaa
gacatgtccgctcgttggcctttacgtcacaacttacataaacttattactaaaaagctt
aaagaaaataatgtcgaacttgcttatccacaaatggaaattcacattaatcagtcatct
aaagaagatactggcttatataaaggttaa
DBGET
integrated database retrieval system