Shewanella sp. H8: ABIS04_16785
Help
Entry
ABIS04_16785 CDS
T10623
Symbol
rapA
Name
(GenBank) RNA polymerase-associated protein RapA
KO
K03580
ATP-dependent helicase HepA [EC:5.6.2.-]
Organism
sheh Shewanella sp. H8
Brite
Transcription machinery [BR:
sheh03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
Other transcription-related factors
RNA polymerase-associated proteins
ABIS04_16785 (rapA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBJ48094
LinkDB
All DBs
Position
3859388..3862294
Genome browser
AA seq
968 aa
AA seq
DB search
MPFALGQRWISDTESELGLGTVVQVEGRMVTLLFPATGENRMFSRSEAPLTRVIFNPGDT
VESGEGWSITIEELEEKNQLVIYHGIHSETQEKVSLRETMLSHNIRFNKPQDRLFAGQID
RLERFGVRYQCQLLRHKLATSDLLGQQGPRVGLIAHQQWIAHEVGRRYAPRVLLADEVGL
GKTIEAGLIIHQQLLTGRAERILVIVPDTLRHQWLVEMLRRFNLRFSVFDEDRCVEAYAD
NDNPFYTEQLIICSLDLLRKKKRLEQALDADWDLMVVDEAHHLEWSEDAPSRAYQIVDAL
SKVVPGVLLLTATPDQLGHQSHFARLRLLDPDRFYDYDAFLAEEASYKDVAEAAEALSQD
KKLPDSAINSLTELLSEKDIEPSIRLIQSKDVDAEAQQAARQELLQELLDRHGTGRVLYR
NSRASVKGFPKRFFNTYPQEMPDQYITADRVNSMMGGSKPPLAKAAQALSPEKLYQAFES
DSASWWKFDPRVDWLIEFLKSHRSKKVLIIASQAETALSLEEALRTREGIQATVFHEDMS
IIERDKAGAYFAQEEGGAQALICSEIGSEGRNFQFASHLVLFDLPLNPDLLEQRIGRLDR
IGQQNDIQIHLPYLRDTAQERLMRWYHQGLNAFELTCPSGHVLFNEFADELINVLCNADE
DLMTQLLNHTQHRYKELKQAMEQGRDKLLEINSHGGERADALIKRLSESDNDTHLIGSVI
RLWDIIGVDQEDRGENSIILRPSEHMMFPTYPGLNEDGITVTFDRETALSRDDIAFITQE
HPLVQTGLDLITGSETGTTSVAILKNKALPAGTLFLELIYMADASAPKSTQLYRYLPPTP
IRVLLDKNGLNMADKVDYASFDKQLSAVNRHIASKLVNASQPILHPLLAKGEEYAKQSLT
QLVVEARAKMTQQLTSELERLEALKAVNPNIREDELEYIRNQMAELTGYMDNSQLQLDAI
RMVLVSHV
NT seq
2907 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccgtttgccttaggtcaacgctggattagtgataccgagtcagaactcggattaggg
acagtcgttcaagttgaaggccgcatggttacgctgctatttcctgccactggagaaaac
cggatgttttcccgcagtgaagctcccttaactcgggttatctttaacccaggtgacact
gtcgaaagcggtgaaggttggagtattaccattgaagagcttgaagaaaaaaatcaattg
gtgatttatcatggtatccatagcgaaactcaagaaaaagtcagtcttcgtgagacaatg
ctgagccacaatattcgctttaacaagccacaagatcgtttatttgctggacaaattgac
cgcttagaacgctttggtgtgcgttatcaatgtcagttattgcgccacaaattagccacc
tcagatttactcggccaacaaggcccgcgcgtcggtttgattgcccatcaacaatggatt
gctcacgaagttggtcgtcgttatgcgccacgagtattacttgctgatgaagttggtcta
ggtaaaactattgaagcaggcttaattattcatcaacagttactgactggtcgtgcagaa
cggattttagtgatagtgcctgacaccttacgccaccagtggttagttgaaatgttgcgc
cgctttaacctgcgtttctccgtgtttgatgaagatcgttgtgtagaagcctatgccgac
aatgacaacccgttttacaccgaacaattgatcatttgctcacttgatttattgcgaaag
aaaaaacgtcttgaacaagctttagatgctgattgggacttaatggttgtcgacgaagca
catcatttagaatggtctgaagatgcaccaagtcgagcttatcaaatcgttgatgcctta
agtaaagtggtccctggtgtattgctattaacagctacaccagatcaactcggtcatcaa
agtcactttgcccgtttacgtttactcgatccggatcgtttttatgattacgatgccttt
ttagctgaagaagcaagctacaaagatgtggcagaagcagctgaagcattgagtcaggat
aaaaagttacccgacagtgccattaacagtttaaccgagttgcttagtgaaaaagacata
gaaccaagcattcgcttgatccagtcaaaagatgtagatgccgaagcacagcaggctgca
cgccaagaattacttcaagaactactcgatcgtcacggtacaggccgagtgctatatcgt
aatagtcgcgcatcagtaaaaggctttccgaagcgtttctttaatacatacccacaagaa
atgcctgatcaatatattaccgcagatcgtgttaacagcatgatgggtggatctaaacca
ccgttggcaaaagctgcacaggcattaagccctgaaaaactgtatcaagcctttgaaagc
gacagtgctagttggtggaaatttgatccacgagtggattggttaattgagtttttaaag
tctcatcgcagtaaaaaagtactgattattgccagccaagcagaaacagcgttaagcctt
gaagaagcactacgtacccgcgaaggtattcaagcaacggtattccatgaagacatgtca
attattgagcgcgataaagcaggtgcttattttgctcaagaagaaggtggagcccaggca
ttaatttgttctgaaattggctctgaagggcgtaacttccagtttgcgagccacttagta
ttattcgatttaccactgaaccctgacttattagaacagcggatagggcgtttagatcgc
attggccaacaaaacgacattcaaattcatttaccttatctgcgcgataccgctcaagaa
agattaatgcgttggtatcatcaaggactcaatgcgttcgaactcacctgcccaagtggc
catgtgttgtttaacgaatttgctgacgaactgattaacgtactgtgtaatgctgatgaa
gatctgatgactcaactgttgaatcatacccagcatcgctacaaagaactcaaacaggca
atggagcaaggccgagataaactgttagagataaactctcacggcggcgaacgtgccgat
gccttaattaaacgtttgtcagaaagcgataacgatactcatctcatcggttcagtcatt
cgtttatgggacattattggtgtagatcaagaagatcgtggtgaaaattcgattatcctg
cgccctagtgaacacatgatgttccctacttatcctgggttaaatgaagacggtattact
gtaacgtttgatcgtgaaacggctttgtctcgtgatgacattgcatttatcacccaagaa
catcctttggtacaaaccggtttagatttaatcacgggttcagaaacaggcaccactagt
gtggcgattctaaaaaataaggcgctacctgctggtactttgtttttagagttgatttac
atggccgatgcctctgcaccaaaatcgactcagttataccgttatttaccaccaacgcct
attcgagtattgctggataaaaacgggttaaatatggctgataaagtcgattatgccagt
tttgataaacagctcagtgcagttaaccgtcatatcgccagcaagcttgtaaacgcctct
caacctattttgcacccgttattggctaaaggtgaagaatatgcaaaacaatcgctaacg
cagttagtcgtggaggctcgcgccaaaatgactcaacaattaactagcgaattggaacga
cttgaagccttaaaagcagtaaacccgaacattcgtgaagacgaactagaatatattcgt
aatcaaatggctgagttaacaggctacatggacaacagtcaattacagcttgatgcaatt
cgtatggtacttgtcagccacgtataa
DBGET
integrated database retrieval system
