Shewanella sp. H8: ABIS04_17110
Help
Entry
ABIS04_17110 CDS
T10623
Name
(GenBank) PLP-dependent aminotransferase family protein
Organism
sheh Shewanella sp. H8
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Aminotran_1_2
GntR
Asp_aminotransf
DegT_DnrJ_EryC1
Cys_Met_Meta_PP
HTH_24
HTH_41
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBJ48155
LinkDB
All DBs
Position
3929266..3930723
Genome browser
AA seq
485 aa
AA seq
DB search
MAKYEDLVYQLKRQIKSGVWRAGDKLPSLRKQSEHSGLSLMTVLHAYQVLESQGYVVSQA
RSGYRVTPELKETEPHRHIAVSLTEKVDINDFVFEVLQAGRNPYMVNFGFAYPDPSLYPR
QQVNRSLMSAARNLPISSTFDNLPPGNEELRTILAKRYATKGVNISPEEIVITAGALEAL
NLSLQVCTKPGDWVVVESPTFYGALQSLERLGLKALSVRTDTIAGIDLDALEKALQSHDV
KACWLMSNHQNPLGFTLTLEKKQSLNDLLNRYNVALIEDDVYGELYQEGSPVMPVKQFDQ
TGNVMLCSSFSKSLVSGFRIGWVAAGKRALEMQKLQLMSTLATSAPIQLALTDYLSKCNY
ETHLKQLRKKLHERKRQMECLLTKYLPSGVNITSQQGGYFIWVELPLGIDSVDVFHAAIK
QNISIAPGKMFSVTEHYNHCMRLNASFALNDKTVQAIITLGQIISECMVVNASKNEQLRN
NEPKF
NT seq
1458 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggcaaagtatgaagatctggtttatcaactcaaacgtcagataaaatctggagtctgg
cgtgcgggcgataaattaccgtcgcttagaaaacagtctgaacatagtggtctaagtttg
atgaccgttttacatgcttatcaagtcttggagtctcaaggttatgtggtttctcaagcg
cgttcaggctatcgtgtgacacctgaattaaaagaaaccgaacctcatcgacatattgcg
gtgtcgttaactgaaaaagttgatattaacgactttgtgtttgaagtgctgcaagcaggt
cgtaacccgtatatggttaattttggtttcgcgtatccagatcctagtttgtatccacgc
caacaagttaatcgttcgctaatgtctgccgcccgaaatctaccaatttctagtacattc
gataatttaccgcctggtaatgaagagttaagaacgatccttgctaaacggtatgcgaca
aaaggagttaacatatcgcctgaggagattgtgattaccgccggcgcactcgaagcgtta
aatctcagcttgcaagtgtgcaccaaaccgggtgattgggtggtggttgaatctcccacg
ttttatggtgcacttcaatcattagagcggctgggattaaaagccttgtcggtaagaacc
gatactatagcaggaattgatctcgatgctttggaaaaggcacttcaatcccatgatgta
aaggcgtgctggttgatgagcaatcatcagaacccactgggttttacactaacattagag
aaaaagcagtcgttaaatgatctgcttaatcgttataacgtggccttgattgaagatgat
gtctatggagagctttatcaagaaggctctccagttatgccagtcaaacagtttgatcaa
actggaaacgtaatgctttgttcttctttttcaaaatctttggtttcggggtttagaatt
ggttgggtagcagcagggaagcgtgcgttggagatgcaaaagttgcaattaatgagcacg
ctagcaacaagcgcacccattcaattagcgctaacggactatttaagtaagtgtaattac
gaaacccatttaaagcagttgagaaaaaaactgcatgaacgtaagagacagatggagtgt
ttgcttactaagtacttaccttcaggagtgaatataacgagtcaacaaggaggttatttt
atttgggtagaacttccgcttggaattgattctgtggatgtttttcatgctgctataaag
caaaacatcagcattgcgccgggaaaaatgtttagcgtaaccgaacactacaaccattgt
atgagattgaacgcgtcctttgcactgaatgataaaacagtacaagcaataataacatta
ggacaaataatcagtgaatgtatggtggtgaatgcatcaaaaaatgagcaacttcgaaat
aacgaacccaagttctaa
DBGET
integrated database retrieval system