KEGG T08546: MZ182

Shewanella sp. JNE2: MZ182_07345

Entry

MZ182_07345       CDS       T08546

Name

(GenBank) HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease

K01153

type I restriction enzyme, R subunit [EC:3.1.21.3]

Organism

shej Shewanella sp. JNE2

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:shej00001]
09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:shej02048]
    MZ182_07345
Enzymes [BR:shej01000]
3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.21  Endodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.21.3  type I site-specific deoxyribonuclease
     MZ182_07345
Prokaryotic defense system [BR:shej02048]
Restriction and modification system (R-M system)
  Type I R-M system
   MZ182_07345

SSDB

Motif

Pfam:

SWI2_SNF2 T1R_D3-like ResIII EcoR124_C HSDR_N DEAD NNH2

Other DBs

NCBI-ProteinID:

UPO32640

LinkDB

Position

1649567..1652755

AA seq 1062 aa
MITFKKEADFEAAFVDILTHKGWGSEILKNKTEADLLQNWATILFENNRQRDRLNEVPLT
QGEMQQIIEQIKDLKTPLKLNGFINGKTVAIKRDNPADTLHFGKEVSLKIYDRQEIAAGQ
SRYQIVQQPKFERGSPLRNDRRGDVLLLINGMPVIHVELKRSGIPVSQAINQIDKYSKEG
IFTGLFSLVQIFVAMTPDETKYFANQGMDGVFNPDYQFHWANYNNEPLKNWKEVTSELLS
IPMAHQLIGFYTVADDTDGVLKVMRSYQYYAASAISDKVAKTNWKQIGGNADRLGGYVWH
TTGSGKTMTSFKSAQLIAQSKDADKVVFLMDRIELGVQSLAEYRNFAGDGEDVQATENTD
VLVTKLKSTNPADTLIVSSIQKMSKIFEAVDDAGSAINSADIEKIRAKRLVFILDEAHRS
VFGDMLITIKNTFPSALFFGFTGTPIHEENEKKGNTTSTVFGPELHRYSIADGIRDRNVL
GFDPYKVPTFKDADIRQQIAFKEANATSIADALSTPAKKKIYNRFVNELKMAGGKDAAGG
YINGIEDYLPKSQYLTEAHQQKVVEDITAKWDVLSKNNKFHAIFATDSIVEAIQYYRRLK
AAKPELKISALFDANTDNNDGTIFKEDGLEEIIADYNARYGQDFDIAKHAKFKKDIAARL
AHKAPYQRIDTDPEKQLDLLIVVDQMLTGFDSKWVNTLYLDKVLEYQNIIQAFSRTNRLF
GKSDKPHGTIRYYRKPHTMERNIQDAIKLYSGDKVIGLYVDKLEANLEAMNRLFAEIQSV
FVDSGIKNFEKLPDDTEVCAKFASLFNKFNKHLDAAKVQGFLWNKLENSFGENNERSVEL
LINEQSYLVLVLRYKELASSGGGGGSGGDVPFDLVGYLTEIDTGKIDADYMNSRFDKYLK
EINKGLNSLEVEQTLNELHKSFASLTQLEQKYAKLFLHDLQRGDVAPSVGKCFRDYINDY
QNYAENKRVDAVVSSLGLDKKQLLALIKSDVNDKNINRFGRFDNLISTVDKVKAKAYFEK
LEGGTILPFKLNVRISQYLQQFILAQTDDNLADVDVEIAENS

NT seq 3189 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgattacgtttaaaaaagaagctgattttgaagccgcttttgttgatatcctcacccat
aaaggctggggatctgagatattaaaaaataaaactgaagcggatttattgcaaaattgg
gcaactattttatttgaaaataaccgccaacgtgaccgcttaaatgaggtgccactgact
caaggcgaaatgcagcaaattattgagcaaattaaagacctcaagacccccttaaaatta
aatggttttatcaatggcaaaaccgttgccattaagcgcgataatccagccgatacgttg
cattttggtaaagaggtcagtttaaaaatatacgataggcaagaaatcgccgcaggccaa
agccgttatcaaattgtacaacaacccaagtttgaacgtggaagtccgctgcgtaacgac
agacgtggagatgtgctgttattaatcaacggcatgcccgttatccatgttgagcttaag
cgtagcggtattcctgtaagtcaggctatcaatcaaattgacaaatatagtaaagagggc
atttttacagggttattttctctggtgcaaatatttgttgctatgacaccagatgaaact
aaatattttgctaaccaaggcatggatggagtatttaatcctgactatcaattccactgg
gcaaattataataacgaaccgttgaaaaactggaaagaagttacctcagagttattgtct
attccaatggcgcatcaactcattggcttttataccgtcgccgatgataccgatggcgtc
ttaaaagtgatgcgtagctaccagtattatgctgcgagtgctatttctgacaaagtggct
aaaacaaattggaagcagattggcggtaatgccgaccgcttaggcggttatgtttggcat
acgacaggctcaggcaaaaccatgaccagctttaagtctgcccagttaatcgctcaatct
aaagacgccgataaagtggtgtttttgatggaccgtattgagcttggcgttcagtccctt
gctgaatatcgcaactttgcaggtgatggtgaagacgttcaagcgacagaaaataccgat
gtgttagtcactaaattaaagagcactaaccctgcagatactttgattgttagctccatc
caaaaaatgagtaaaatttttgaagcggtagacgatgcgggttcagccattaattctgct
gacattgaaaaaatccgtgctaaacgtctcgtttttatccttgatgaagcccatcgttca
gtctttggggatatgctaataacgattaagaatacctttccaagtgcgctgtttttcggt
tttacaggcacacccattcacgaagaaaatgagaaaaaaggcaatacgacttcaacggta
tttggtcctgaacttcatcgttatagtattgctgatggtattcgtgataggaacgtactg
ggatttgacccttacaaggtgccaacatttaaagatgctgatattcggcaacaaattgca
ttcaaggaggctaatgccacctcaattgccgatgccttatcaacaccagctaaaaagaaa
atatataatcggtttgtcaatgagttaaaaatggctggtggcaaggatgcagcaggtggt
tatatcaacggtatcgaggattatttacctaagtcacagtatttaaccgaagctcatcaa
caaaaagtcgttgaagatattacggcaaaatgggatgtactgagtaaaaataataagttt
catgccatatttgcaacagattctatagtcgaagctatccagtattatcgccgtttaaaa
gcggctaaacctgagcttaaaatttcagctctgttcgatgctaatactgataacaatgat
ggcactatctttaaagaggatggccttgaagaaattatagcggattataatgcccgctac
ggccaagattttgatattgcaaaacatgcaaaatttaaaaaagatatcgcagcacggctt
gcccataaagcaccttatcaacgcatagataccgacccagagaaacagttagatttgctc
attgtagttgaccaaatgttgacgggattcgactcaaaatgggtgaacactctgtatctg
gataaggtgctagaatatcaaaatattatccaagcattctcgcgtaccaatcgactgttt
ggcaaaagcgacaagccccatggcactattcgatattatcgtaagccccatacgatggaa
cgtaatattcaagatgccataaaactctactcgggtgataaagtgataggattatatgtc
gataagctggaagcgaacctagaggcaatgaacaggttatttgcagagatccagagtgtg
tttgttgattcaggcattaaaaattttgaaaaattacccgatgatacagaagtttgtgca
aaatttgcctccttgtttaataagtttaacaaacacttagatgcggcgaaagtgcaaggt
tttttatggaataaattagaaaactcctttggtgaaaataatgagcgtagcgttgagctt
ctcattaatgaacaatcttatttagttctcgtacttaggtataaggagttagcaagctcg
gggggcggtggtggctccggtggggatgtaccatttgaccttgtcggatacctaacagag
attgatactggcaagattgacgccgattatatgaatagtcgctttgataagtatcttaaa
gaaataaataaagggctcaacagccttgaggttgaacaaacactaaacgagttacataag
tcatttgcatcattaacccaactagagcaaaagtatgccaagttatttttacatgattta
cagcgtggtgatgtagcaccgagtgttggtaaatgctttcgagattacataaacgactat
caaaactatgcggaaaacaagcgtgtagatgccgttgtgtcgtcgttggggctcgataaa
aagcagcttttagcattgataaaaagtgatgttaatgataagaatatcaatcgatttggt
cgttttgataatctgatatcgacagttgataaagtaaaagctaaggcatattttgaaaaa
cttgaaggcggtacaatactgccatttaaattaaatgtgcgcataagtcagtatttacaa
caatttattcttgcacagaccgacgacaacttagctgatgtcgacgttgaaatagctgaa
aatagttaa

DBGET integrated database retrieval system