Shewanella sp. LZH-2: JM642_05520
Help
Entry
JM642_05520 CDS
T10525
Name
(GenBank) rRNA (guanine-N1)-methyltransferase
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
shel Shewanella sp. LZH-2
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shel00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
shel02044
]
JM642_05520
02035 Bacterial motility proteins [BR:
shel02035
]
JM642_05520
Secretion system [BR:
shel02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
JM642_05520
Bacterial motility proteins [BR:
shel02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
JM642_05520
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T4P_PilY1
Catalase_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QRK80566
LinkDB
All DBs
Position
1229343..1233014
Genome browser
AA seq
1223 aa
AA seq
DB search
MSQFLFKCQKSSLMIFSLNYVLLKHICQSRLQNVRYTLTSIVAFIISSLVVGAASLFTAS
SIADDTELYVFEASARNGSRPQVLIIFDNSGSMSNLAYGVDAPYENKRNANYAQSGKLFY
SRGSADNAELPNPASQREMRQFNAALNGCESSWDYLNRYGTFTGFFREYGFSGGTGAWKE
FSELNGSSIAAVDCFEDIQEERLGNAAGEANGLPVDSLGSAAKPVRYTAVNIHSSESAKA
SAKAKAQKTGFGSGKVVTVYTEDYLKWHHGTKKKVNKTRLELAQDAIESVVLTTPGVDFG
LAIFNMNGPRDGARDGGRIISGIKTMSAQAKIDLLKRVNLISYAQNTPLCETLYEAYRYF
GGQEQYFGDDDSDYNYYDNRGRYQGTYNASSNPFTDPAALIIGSNTYNSPFKPCQNEAYI
VYITDGEPTLDNAADGIIERLTNGVGKHTSNPKSYLSALSGWMRTEDVNPNLAGKQTVRT
FTIGFSEGAASAEHLLKQTADNGGGKYFDATDASQLRSSLQTALNNILEKNASFTSPSVA
SNNFNRTQTFDSAYYSMFLPNKGPRWLGNIKKFKVTSDGDIVDSKGKNVIGEDGNIKADA
CSYWTSAEECGSSGDGNDVKRGGVLAAMQQATSRTLYSNFGSGLSAFTLSNAARKAGDNV
RLATYMGVDETELTGLFDWAKGIDVDNDKNQDLSTASGATPNWRADIMGDALHSKPLALN
FGSEAKPDIRILVGTNHGFLHMFKDEGDSVSETWGFIPYELLPNFRDLKANAPTGVHSVY
GIDGSPVAYTKMQGKRIEKAWVFVGMRRGGNAYYALDVTTPDNPSFMWKIDASSPGMGEL
GQSWSTPVVTTIPSATGDKPVLIFGGGYSPSTKDGAEIGTDDSSGRGVFIVDAQTGALIH
QFGGSGANTPLPGIANSIPSSVAVLDGNGDGHTDRIYATDIQGNVWRMDMPSANVSTWSG
FKFAALGDKSSVAGDRRFFSGPIVAQTLISNTFEQTKVVNGASTKVVTSQNIPYDAIVVG
SGHRAKPSDVSRSDMFFALQDRNIVTQSFQGKSNQKPVPKTLQLSDLYDVSSAAPNDQAS
EIVFSQKRGWYYNFSRKGEKSLSSATIVGGEVYFSSFVPGSDGSVNQCLSSGKGYLYKKN
LHRGTRGYKTDYLYAGELVLDTPQLVIPPAEQPKDPNAKVPTPDMFLIGIGNAVPDEATC
ESGNPKCIGGGPTTNKIYYYISQ
NT seq
3672 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcagtttttatttaaatgtcagaaaagctcgttgatgatcttttcgcttaattac
gttttattgaaacatatttgtcaatctcgccttcaaaacgtccgctatacgttaacttca
atagtcgcttttattatttcgagcctcgttgtcggcgcggcgagtttatttaccgcgtca
agcattgctgatgatacagagctttatgtgttcgaagcgtccgcccgtaatggctcgcgc
ccgcaggtgctgatcattttcgataactccggcagtatgagtaatcttgcctatggggtc
gatgctccttacgagaataaacgtaatgctaactatgcccagtcgggaaagctattttat
agccgaggttcggctgataatgctgagttacctaatcctgcctctcagcgtgaaatgcgt
cagtttaatgcagcactcaatggctgtgaaagctcgtgggattacctcaatcggtatggc
accttcactggtttctttcgtgagtatggtttttcgggggggactggtgcgtggaaagaa
ttttctgaactaaatggtagctcgatagctgctgtcgattgctttgaagatatccaagag
gaaagactcggtaatgcagcaggagaggctaacggtttacccgttgacagtttaggctct
gcggctaaacccgttcggtacacggcagtcaatattcactcatccgagagtgctaaggca
agcgcgaaggcaaaggcgcagaaaacaggttttggctccggcaaagtggtcacagtttat
accgaagattatttaaaatggcaccatggtactaaaaagaaggtcaataaaacccgtcta
gagctggcacaagatgcgattgaaagtgtggttttaactacgccgggggtggattttggt
ttagctatttttaatatgaatgggccacgtgatggtgcgcgtgacggtgggcggattatc
tctgggattaaaactatgtccgcccaagccaaaattgatttattgaaaagggtcaatctt
attagttatgcccaaaatacgccgctatgcgaaacgctctacgaagcctatcgttatttt
ggtgggcaggaacagtattttggtgatgatgatagcgattataattactacgataatagg
gggcgttaccaaggtacctacaacgccagttctaatccctttactgacccagctgcgctt
attattggaagtaatacgtacaattcgccgtttaagccttgccaaaatgaagcgtatatc
gtctacatcaccgacggcgagccgacgcttgataacgcggccgatggcattattgagcgt
ttaaccaatggtgtaggtaagcatacctccaacccgaaaagttatctcagtgcgctttct
ggctggatgcgaactgaggatgtgaatcctaatttagccggaaaacaaaccgttagaacc
tttaccattgggtttagtgaaggtgcagccagtgccgagcacctactgaagcaaaccgcc
gataatggcggtggtaagtattttgatgccaccgatgccagtcaattacgttcttcattg
caaacggctttaaataatatcctcgaaaaaaatgccagctttacttccccctcggtagcg
agcaataacttcaatcgtactcaaacctttgattcagcatattattctatgttcttgcct
aataagggaccaagatggctagggaatattaaaaagttcaaggtgaccagtgacggtgat
atcgttgatagcaaaggcaaaaatgtgataggcgaagatggcaatatcaaagccgatgct
tgctcctattggacatcagctgaagaatgcggaagcagcggtgatggtaacgatgttaag
cgtggcggggtgctcgctgcgatgcagcaggcgactagtcgcactttatacagtaatttt
ggcagtggattgagcgcttttactctgtcaaatgcagctcgaaaagctggcgataatgtg
cgtttagccacctatatgggggtcgatgaaacagaactcactgggctatttgactgggcg
aagggaatcgatgttgataacgataaaaatcaggacttaagtactgccagtggcgcaacc
ccaaattggcgcgccgatataatgggagatgctctacattccaagcccttagcactcaat
tttggttctgaagctaaacctgatattcgaattcttgtcgggacgaaccatgggttcctg
catatgtttaaggatgaaggtgatagcgtgtctgagacttggggatttatcccctatgag
ctactgccgaattttcgcgatctcaaggctaacgcgccgacgggcgtacactcggtatac
ggtattgatggctcgccagttgcctacaccaaaatgcagggcaaacggattgaaaaggca
tgggtatttgtgggaatgcgccgaggcggcaatgcgtattacgccctcgatgtgaccaca
cctgataaccccagttttatgtggaagatagatgccagctcacccggtatgggcgagtta
gggcaatcttggtcgacgcctgtggtgacgacaattccgagtgcgactggcgataagcct
gtattgatttttggtggtggatattccccttcaactaaagatggcgctgagattggtact
gatgacagcagtggccgtggcgtgtttattgtcgatgcgcaaacgggggcgttaatccat
caattcggcggcagtggggctaacacgccattgccaggtattgccaacagtattccaagc
agtgttgctgtattagacggcaatggtgatggtcataccgatagaatctatgccacagat
atccaaggtaatgtatggcggatggatatgccctccgcgaatgtgtcgacctggtcggga
tttaaatttgccgcattaggggataagagttcagtggcgggagataggcgattcttttct
gggcctatagtggcccagaccttgatctcaaatacctttgagcagactaaagtcgttaat
ggagcatcgaccaaagttgtcacgtcacagaatattccttacgacgcaattgttgtcggg
agtggccacagggcaaagccaagtgatgtctcccgctcggatatgttttttgcattgcaa
gatagaaacatagtcactcaatcattccaaggtaaatcaaatcaaaagcctgtgcctaaa
acgctacagttaagtgatttatatgatgtcagttcggcggcgcccaatgatcaggccagt
gaaatcgtttttagtcaaaaacgaggttggtactataacttctctcgtaaaggcgaaaag
agcctgtcatctgcgaccatagtggggggggaagtgtacttcagcagttttgtgcctggt
agtgatggctcagtcaaccaatgtttgagttcgggtaagggctatctttataaaaagaat
ttgcacaggggcactcgtggttacaaaacagattatttgtatgcaggtgagttggtactg
gatacgccgcagttagtgatcccgcctgccgagcagcctaaggacccgaatgctaaagta
ccaacgccagatatgtttttgattggtatcggtaatgcggtgccagatgaggcgacatgt
gaaagtggtaaccctaagtgtattgggggcgggccaacaacgaacaaaatttattattac
atcagtcaatga
DBGET
integrated database retrieval system
