Shewanella sp. LZH-2: JM642_16290
Help
Entry
JM642_16290 CDS
T10525
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
shel Shewanella sp. LZH-2
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MHYT
HATPase_c
HisKA
Response_reg
PAS_3
PAS
PAS_9
Hpt
PAS_4
Diguanyl_cycl_sensor
PAS_8
HATPase_c_3
UDPG_MGDP_dh_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QRK78823
LinkDB
All DBs
Position
complement(3698286..3701627)
Genome browser
AA seq
1113 aa
AA seq
DB search
MGLNIMIFNWLSSFFTSSQDSLLLNVYYDPLLVAISIFIAIFSAFMAFQVATQAARTQSK
SRQQIMLFTGSLVLGGGVWSMHFIGMLAFNLCTPVSYQFGLTALSVLPSIAASWVALSLL
SQPRIRFPQVLIGGVLVGVGIGVMHYVGMAAMDMAPLLRYDPLIFALSIIVAVILAIIAL
WVRTGLNQFISSSMSTITSNFIASIVMGLAIAGMHYTGMAAARFVKPAGLELSEQTSEIS
FYLALGVSIITVVIICLVLIVNVIFKYKDLSLLAKSNEDRMLAMMDTAVDGIITIDGQGI
IVSVNQAVTRILGWPSTELLGSNVKKIVPASIRPQHDSYIAQYVKTREAQIIGTGREVLA
QHKNGHLVPVRLGIGHMMQGKSHYFVGFISDLSQRNEMEQELKNNEAKLRSLISNIPGVA
YRCMNTQGWPMVYISDAVFNITGYPASDFELPNAKRLFSSLYYPDDVDTIYAQAQPPTFS
MEYRIIRADGEVRWLFEHGNYIFDEQNPDGWIDGFIMDITERKVMEQDLVAAKNTAEQAA
AARSAFLANMSHEIRTPMNAIIGFSDILLESSLDYEQQKQLSTINRSAKSLLHLLNDVLD
SAKLDKGKLELETRVFSLTAEIDTVISTLWLQAQKQHLLLEVDIAPTMGTHFMGSPERIR
QVLLNLIGNAVKFTAEGKVTVRVFSPLDNQVTFEVIDTGIGMSPEQLERVFDAFSQADAS
MSRKYGGTGLGTTISKQLVELMGGHIEVESRLGLGSTFRFTIPLIQSVENLTLPSYDKVS
LPPLTILVVDDIQQNIDLLSVYLTRHGHRVITARDGEQALLRMQRHDIDITLIDLQMPVM
DGLTAARRRRQQELESGLTYMPMIALTASVLEQDKLETKQVGMDGFANKPIDFYLLNVEI
ARVLNLELSTQSFNKNEPDLNAIIDEQRGIQLWGSKAKFIQELEKFIAQWPEKSRQLEQA
INQSDRDAIVQQGHGLKGISGNLGLFRCMALFAALEQMADSEPQVLVARQQLFNELESTI
VQITRYVQQLAHYKDVQISNPQTDPNQALPHIDALIAAVQHHSFEEADLTAIENLSVHQP
MVNTIVDALDNFDFDIAHTELVKLRLVISSNKE
NT seq
3342 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggcttgaatattatgatttttaattggttatcatctttttttacttcatctcaagat
agcctgttactcaatgtttattacgaccctttattggtcgctatttctatttttattgct
attttttctgcctttatggcgtttcaggttgcgacacaagccgcacgaacccaatctaaa
tcgcgacagcaaatcatgttattcactggcagtcttgtcctcggtgggggcgtgtggtca
atgcattttattggcatgctggcctttaatttatgcactccagtttcttatcagtttggt
cttactgccttatcggtgttacccagtattgcagcctcgtgggtggcgcttagcctacta
tctcaaccacgtattcggtttccccaagtattgattggcggtgttttagtgggtgtcggt
attggggtaatgcattatgtggggatggctgccatggatatggcgccattattgcgttac
gaccctctaatatttgctctgtcgattatcgttgcggtgattttagccattattgcactt
tgggttcgtactggactgaatcagtttatctcatccagcatgagcactattacgagtaat
tttattgccagtatcgtgatgggattggcgattgctggtatgcattacacgggtatggcg
gcggcacgttttgttaaacccgctggactagagcttagcgaacaaacgtctgaaatttcg
ttttatcttgcgctcggggtatcgattattaccgtcgtcattatctgcttagtgctgatt
gtgaatgtgatctttaaatataaagatctgtctttactcgctaaatcaaacgaagatcga
atgctggctatgatggataccgcagtggatggcattatcaccatcgatggtcaaggtatt
atcgttagcgtaaaccaagcggtgacgcgtatcttggggtggccctcgacagagttactt
ggtagcaatgtcaaaaaaattgtgcctgcctccattcgcccccagcatgatagttatatc
gctcaatatgttaaaacccgtgaggcacagattattggtacggggcgagaggtgctggcg
cagcataaaaatggccatttagtgcccgtccgcctcggtattgggcatatgatgcaaggc
aaatcccattactttgtcggttttatttccgatctcagccagcgaaatgagatggagcaa
gagctgaaaaataatgaggccaagctgagatcgttgatcagtaatatccccggggtggcc
tatcgctgtatgaatactcaaggctggcccatggtttacatcagcgatgcggtatttaat
atcacgggatacccggcttcagattttgagcttcctaacgctaaacgtttattctcttcg
ctttattatcccgatgatgtcgatactatttacgcacaagcacagccaccaaccttttca
atggaataccgtattatccgtgccgatggtgaggtgcgttggctgtttgagcatggaaat
tatatttttgatgagcaaaatccagacgggtggattgatggttttatcatggatattact
gaacgtaaggtaatggagcaggatctggtggccgcgaagaatactgcggaacaagctgcc
gccgctcgctcagccttcttggccaatatgagccatgagatccgtaccccaatgaatgcc
atcataggttttagcgatattttgttagagtcatccttggattatgagcaacaaaagcaa
ttatcaaccattaatcgttcggccaaatcattattgcatttactcaatgatgttttagac
agtgccaaactcgacaaaggcaagctggaacttgaaacccgcgttttttctttaacggct
gagatcgatactgttatctcaaccttgtggttgcaggcccaaaagcagcatttattactg
gaagtggatatcgcgccaacgatgggaacccactttatggggtcgcctgagcggatacgc
caagtgctgctcaacttaataggtaatgctgttaaattcaccgcagaaggaaaagtgacc
gtaagagtcttctctccgttagacaatcaagtgacatttgaagttattgatactgggatt
ggtatgtcgccagagcagcttgagcgagtgtttgatgctttttcccaggcggatgcctct
atgagccgtaaatacggtggtactggcttaggtactactatcagcaaacaattagtagag
ttaatgggcgggcatattgaggttgaaagccgcttaggtttgggtagtaccttccgattt
acaattcctctcattcaaagtgttgaaaacttgactctaccgagttatgacaaggtgtca
ctgcctccattaacaatactggtagttgatgatattcaacaaaatattgatctgctttca
gtatatttaactcgacatggacatcgagtgattactgcccgtgatggtgagcaggctcta
ttacgaatgcaaaggcatgatattgatatcaccttaattgacttacagatgccagtaatg
gatggcttaaccgcagcaaggcgtagacgccaacaggagcttgaatccgggttaacctac
atgccgatgattgcgttaacagcgagtgtgcttgaacaggataaactcgagacaaaacaa
gtaggaatggatggttttgctaataaacccattgatttttatttattaaatgtcgaaatc
gcccgcgtattaaaccttgaactttctacacagtcattcaataaaaatgagcccgatctc
aatgccatcatcgatgagcaaagagggatacaactctggggaagtaaagcaaagtttatc
caagaattagaaaagtttatcgctcaatggcccgaaaagtctcggcagcttgagcaggca
attaaccaatcggatcgggatgcgattgtccagcaaggtcatggattaaaaggcatttct
ggcaatttaggcttattccgatgcatggccttgtttgcggcattagaacaaatggctgac
tcagagccacaggttttagtggctagacagcagttattcaatgaacttgaatcaaccata
gtgcagatcactcgttatgtgcagcaactcgctcactataaagacgtgcagatatctaat
cctcagactgatccaaaccaagctttaccgcatattgatgctttaattgcggcagtacaa
caccactcctttgaagaagctgatttaaccgccattgaaaatctatcggtccatcaaccc
atggtaaacaccattgttgatgccctcgataattttgattttgatattgcccatactgaa
ttagttaagttgcggcttgtcattagctcaaataaggaatag
DBGET
integrated database retrieval system
