Shewanella sp. MTB7: HWQ47_01235
Help
Entry
HWQ47_01235 CDS
T10730
Name
(GenBank) HD-GYP domain-containing protein
KO
K25135
cyclic di-GMP phosphodiesterase [EC:3.1.4.-]
Organism
shem Shewanella sp. MTB7
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBJ95792
LinkDB
All DBs
Position
270220..271398
Genome browser
AA seq
392 aa
AA seq
DB search
MVRLVESRAHVKFAVSKLKVGMFVASIDNDGQVAITNAGQIKDNESIKKLLNNGIKHVWV
DIDRSCDSCGFNKTRLPPPTVKKPPPSRDALQQKAKKLITEAKDLLAKVLSETFEGKAIE
IGPFEEFADNMIKSALLDSDALKCVSALRNKDAYLLEHSVNVAFLLITFGQYLSFDKERL
KEMAVGGILHDVGKTQVDDSVLHKPGKLTQQEFEHMKLHQNFAVEIMDKTVGMSKISKDV
CLMHHEKLDGSGYPNGLKGDELPIHGRMSCIVDIFDALTAKRCYKDSMSPASAFKILLRL
TPFHLDEALVYQFIRCVGVYPVGSLVELSDGRIGIVWYAKGRDALHPILKCFYSLKQKRY
LAVIFVDLLESEAHIERGVSPCSLEVDCTPFY
NT seq
1179 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgaggttggtagagtctagggcccatgttaagtttgctgtatcaaaattgaaagtt
ggaatgtttgtcgcttccattgataatgatggacaagtagccatcacaaatgcaggtcaa
ataaaagataatgaatcgattaaaaagctgcttaataatggcattaaacatgtgtgggtt
gatattgatcgctcttgtgactcttgtggatttaacaagacaagattaccacccccgaca
gtaaagaagcctccaccttcaagagatgcattgcaacaaaaagctaaaaagcttattact
gaagctaaagatctattggctaaagtcttgtctgaaaccttcgaaggtaaagcgattgaa
attggtccttttgaagagtttgccgataatatgatcaaatcggcattgctcgactcagat
gcactcaagtgtgtgtcggcgttaagaaacaaggatgcttatctgctcgaacattctgtt
aatgtggcttttttattaattacctttggacaatatcttagttttgataaagaacggctt
aaagagatggctgtgggggggatcttacacgatgtcggtaagactcaggttgacgatagt
gtgctgcataaaccaggaaaactaacccagcaagagttcgaacatatgaaattgcatcaa
aattttgctgtagagattatggataagacagtgggtatgtctaaaatcagtaaagatgtc
tgtcttatgcatcatgaaaagctcgacggtagtggctatcccaatggtttaaagggtgat
gagcttcctatccacggacgtatgagttgtatcgttgatatttttgatgctttgaccgca
aaacgctgttacaaggattctatgagcccggcttctgcgtttaaaatactactccgttta
accccttttcatcttgatgaagccttggtctaccaatttattcgttgtgtcggtgtctac
cctgtcggttcgttggtggagctctctgatggacgtattggaattgtgtggtatgccaaa
ggaagggatgccttacatccaatacttaaatgcttttattcattgaaacaaaaacgctat
cttgctgttattttcgtcgatctgcttgagagtgaggctcatatcgaacggggtgtatca
ccctgtagcctagaggtggattgcactccgttttattaa
DBGET
integrated database retrieval system
