Shewanella sp. MTB7: HWQ47_06080
Help
Entry
HWQ47_06080 CDS
T10730
Name
(GenBank) DUF6531 domain-containing protein
Organism
shem Shewanella sp. MTB7
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
TEN_YD-shell
DUF6531
RHS
CoV_NSP3_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBJ96682
LinkDB
All DBs
Position
complement(1474450..1478475)
Genome browser
AA seq
1341 aa
AA seq
DB search
MDKLLEYKSFLFLIFLALGGLSQSHSVKADIWDTDDDCEVMECIGTVGQRPPPSDIKYLD
LEDLMDEAFEELLAEDEIEGFDTGLSEGLTCANPIMVRTGAKIEKVVDFQGKGEFPLKIE
RTYNSKGRGNSWFGFKWSSNLRFKLDFKGYILNHRPNGKQIKFVKDAQGTWSDYKEDSIQ
TLAQSGNKWILKTEGGITEEYDTSGKILKRTHPTGIAHTYSYSNGIRVTHSSGRWLHYTM
YYGDVTKVEDNAGNQYLYTYVNNRIAKVVKPGSLRHVTDYYYTGGKLSRININYRNYASF
VYDSSGDAISSEHTGGVEKSTFSYSTNSTTVTNPLGQKTKYNYTKIKVGTPEEPVFLKRL
ASVDRVASIDCPDAVKNITYTATGLKKTSTDWNGNLTEYDFAENGQLKSKITAKGTALAF
TQEYIWLAGQNKIARLTSRDLRVDYDYLSNGRLKSVIKTDLSSHGNYGEQRKTTYSYINH
SNAILKKMTIDGPRTDISDIITLEYDSAGNLTKMTNPIGHRVTYSNYDALGNARRMLDSN
GLQTDYSYSPTGQLLTTKRYNSTGQQLHKTSYNSIGKLRQVTYPNGNYYRYDYDDAHRLV
TVRDKNNNQQGYGYNKNSDITWRDIGSEPVEVYEYDDDCDPDEEDSDDDCEPDVELVQDI
YFDQGYTYDKLGRMKTQGSFSKKYTFGYDNNSNVTSVSDPMGYSVNSTFNALDQLTKVKH
QDGGYTHYTYDHKSRVTSITDARGLVTRYRYNGFGDVISIVSPDTGTTELSYNQLGQPIW
SKSNDGTVSTFTYDALGRLKSSSIGSDQTIYTYDTGTYGKGRLHYVSDITGQTTYAYDKI
GNVTLKSTQLDSRTYHTRYSYNNMNQVSVITYPSGHKIKYSYDALGRVAGVAYSSGSSSY
ANVISNAQYIPFGPNKSFTFGNNAVRSIAYDGKFKPTQIFTSGIQDLRYAYDSRDNISKL
TNNRVSGLTQTLAYDPASRLTSERSSTGGSKYFTYDKVGNRKSYRLYPQATQTYNYSSLS
NQLTSITNGIGAIGYTTNGNTGTKAGASYSYNSGNRLTKFTKGSSVTHYRYNSLGERAKK
SGSGGNVHYLYNESGQLLAEYTSSGSLIKEYVYLHGQPVAIIKAGQRYYVHNDHLGRAER
ITNQSRSTVWQARNFAFDREVMTNSIGGYNLGFPGQYWDEEKGSYYNMFRDYDAATGRYL
QSDPIGLAGGLNTYAYVGGNPLSYVDQLGLAKKKAWLDAFLGAVGMLNGDIGHNIDSSDA
NGPNSPDNKHNSTKNTQPYDPKNSAHYKKLQKIFGKAFKNSPLSLVFISVMYQNCLSGDV
GACMIVNELGYDTAGTGQQCI
NT seq
4026 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacaaattacttgagtataaatcatttctcttcttaatatttttagcgctaggtgga
ttaagccaaagccactctgtaaaagctgatatttgggatactgatgatgactgtgaagtt
atggagtgtattggaactgttggtcagcgtcctcctcctagcgatattaaataccttgat
ttagaagatttgatggatgaagcatttgaggaattactagcagaagatgagatcgaagga
ttcgatactggtttatctgaagggttaacttgcgctaatccaattatggtgcgtacaggg
gcaaagattgagaaggttgttgattttcaaggtaagggggaattcccgcttaaaattgag
cgaacatataactcaaagggtagaggtaactcatggtttgggtttaaatggtcaagtaac
cttcgctttaagcttgattttaaaggctatattctcaaccatagaccaaatgggaaacag
attaagtttgttaaagatgcacaagggacatggtcggattataaagaggattcgattcaa
accttggctcaatcaggtaacaagtggattttaaagaccgaaggcggcattaccgaagaa
tatgatactagcggtaaaatactgaaaagaacccacccaacagggattgcgcatacctat
agctactcaaatggcattagagtgactcattcatcgggtcgctggttgcactatacaatg
tactatggtgatgtcactaaggtcgaagataatgctggcaatcaatatttatatacatat
gtaaataatcgaatagcaaaggtcgttaaaccaggttcacttcgccacgttaccgactat
tattacactggcggcaagttatcacgcatcaatattaattatagaaattatgcttctttt
gtttatgatagcagtggggatgcaatatcatctgaacataccggtggtgtcgagaagagt
acttttagttattcaacgaattcaactacagtgacaaatccattagggcaaaagactaaa
tataattacactaaaattaaagtcggtaccccagaggagcctgtttttctcaagaggtta
gcttctgtagatagagttgcctctattgattgtcccgacgcagttaaaaatattacctat
actgcaacaggtttaaaaaagaccagtaccgattggaatggtaatttaacagagtatgac
tttgctgaaaatggtcagcttaagtccaaaatcactgctaaaggaacagcgttagcgttt
actcaagaatatatctggttggcaggtcaaaataaaatcgctcgtctgacaagtagagat
ttaagagttgattatgattacctctccaatgggcgtttaaaatcggttattaaaacggac
ttaagtagccatggtaattacggtgagcagagaaaaaccacatatagttacataaatcat
tcgaacgctattttaaagaagatgaccattgacggtcctcgcactgatatctcggatatc
atcacactagaatacgatagcgctggtaatctgactaaaatgacgaatcctataggccat
agagtaacctactcgaattatgatgctctgggtaatgctcgtcgaatgctcgatagcaat
ggcttacaaacggactatagctatagtccaacggggcagttattaacgacaaaacggtat
aactctacagggcaacagctacacaaaacttcctataattcgattggcaaactaagacag
gttacctatcctaacggtaactattatcgctatgattacgatgatgcacatcgattggta
accgttagagataagaataataatcagcaaggctacggctacaacaaaaacagtgatatc
acttggcgggatattggaagtgagccagtagaagtttacgagtatgatgacgattgtgac
ccagatgaagaggatagcgacgatgattgtgagcccgatgtcgagttagtgcaggacata
tatttcgatcaaggctacacatacgacaaactaggaaggatgaaaactcaaggttctttt
tcgaaaaagtatacctttggctatgacaataatagtaatgtcacttcagtctccgatcct
atgggttattctgttaacagtacctttaatgcgcttgatcagctgactaaagttaaacat
caagatggtggttacactcattatacttacgatcataaaagccgcgttactagtattact
gatgcacggggtttagtgactcggtataggtacaatggctttggtgatgttatcagtatt
gttagccctgatactggaacaacagagcttagttataatcaactgggacagccaatatgg
tcaaaaagtaatgatggtacggttagcacttttacttatgatgctttaggccgtttaaaa
tcgagttcgattggcagtgatcaaactatctatacctatgacacaggtacatacggcaaa
ggaagattacattatgtcagtgatattacaggccaaacaacttacgcttatgacaaaata
ggtaatgtcacattaaaatcaactcagcttgactcaagaacatatcatactcgttactca
tataataatatgaatcaagtcagtgtgataacctatccatctggacacaagattaagtat
agctatgatgcgttaggcagagtggctggcgtggcatactcttcgggttcaagcagttac
gctaacgtgatatctaatgctcaatatattccctttggtccaaataaaagtttcactttt
ggcaacaatgcagtgcgaagtatagcttatgacggtaagtttaagccaacccaaatcttt
acctctgggatccaagatttacgctatgcatacgatagccgagacaatatcagcaagctg
accaataatcgagtatcagggttaacccaaacgttagcgtacgatcccgcgagtcgttta
acctcagagcgctcatccaccggcggcagtaaatattttacttatgataaagtcggtaat
cgtaaaagctatcgtttatatcctcaagcaacacaaacctataactactcaagcttaagt
aaccagttaacatcaattactaatggtatcggtgcaattggctataccaccaatggtaat
actggcaccaaagcgggagctagttatagctacaacagtggcaatagattaactaagttc
acaaaaggcagtagtgttacccattaccgatataacagcttaggagagcgggcgaaaaaa
tcaggtagcggtggcaacgttcactacctctataacgaatccggacagctattggcagaa
tacaccagcagtggtagcctgattaaagagtatgtctatcttcatggtcagccagttgcc
atcattaaggctggacaacgttattatgtacataatgaccatttaggccgtgctgagcgt
attactaatcagagtcgcagtaccgtgtggcaagcacgtaactttgcctttgaccgtgag
gtgatgactaattcaataggcggttataatctcggattcccgggacaatattgggacgaa
gaaaaaggctcttactacaatatgtttagagattacgatgcggcaactggtcgctacttg
caatctgatccgattggtttagcgggtgggttgaatacctatgcgtatgtgggtgggaat
cctttgagttatgttgaccagttagggttggctaagaaaaaagcttggttagatgcgttc
ttaggtgctgttggtatgctaaatggtgatattggtcataatatagactcttcagatgct
aatggaccaaatagtcctgacaataaacataattctaccaaaaatacacagccatatgat
cccaaaaactctgctcattataaaaagttgcagaaaatatttggtaaagcatttaaaaat
tcaccactttcgttggtttttatttcagtgatgtatcaaaattgcttatctggtgatgtc
ggtgcatgtatgattgttaatgaattagggtatgatactgcagggactggacaacaatgc
atttag
DBGET
integrated database retrieval system
