Shewanella sp. MTB7: HWQ47_08145
Help
Entry
HWQ47_08145 CDS
T10730
Name
(GenBank) rRNA (guanine-N1)-methyltransferase
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
shem Shewanella sp. MTB7
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shem00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
shem02044
]
HWQ47_08145
02035 Bacterial motility proteins [BR:
shem02035
]
HWQ47_08145
Secretion system [BR:
shem02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
HWQ47_08145
Bacterial motility proteins [BR:
shem02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
HWQ47_08145
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T4P_PilY1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBJ97065
LinkDB
All DBs
Position
1940198..1943764
Genome browser
AA seq
1188 aa
AA seq
DB search
MRIFIYDLVTIGGRFFSCVTVLFLLSFFISADDTELYVYEASARSGARPQMLIIFDNSGS
MRTTIVGADKPYSSHAGGISGDSLGKQNNLYFTRGATAAEDQPNPANSSETRHFPGVMNS
CESAWSSLHQYGFYTGYFRGYSFSGSEGMWKELDDTGSDDVIAVDCFEDIQEEKWTNAAS
VASGLPVDSSGSVSSPLFYTHANASSSETVKQDARDLAELTGFGTGRPLTIYTQDYLTWQ
HGTKVKVNISRLDIAKNAIKSIILTTPSVDFGLAVFNVNAWNEFERDGGRVISGLKENTA
TVKSGLINTIDGISASTNTPLCETLYEAYRYFSGLSVDFANSNTDLPNAGYYVSQQPQAD
SSVVNSGSYISPFKKCQNNASVVIITDGVPTKDAAANGFINTLTGGVDKYGSEAGGDLNY
LSAMSSWMNKYDLNASEPGDQTVSTHTIGFSKGAASAAALLQKTAEAGGGRYFDATNASL
LQGSLQQVVSEALDTNSSFTSPAVASNNFNRTQSFEYAYYSIFLPNEGPTWLGNLKKYRV
LGKGEVVDKAGKPAIGLDGNIKSTACSFWTPDSVCNAGGDGNEVDKGGVLSAMQSAESRT
IYSNLNTGLTELTVTSVTSTAGSTDNLINYLGVGEEELLSLFGWAKGLDVDNNKNLTTIP
NPNTNWRDDIMGDALHSKPLALNFGTKSSPDVRIVMGTNHGFLHMFEDDSSSNSVTENWA
FIPYELLPNLKTLRANVPTGVHSVYGVDGSPVAYTKTNDSGIEKAWLFFGMRRGGSSYYA
IDISDPDNPSFMWKVDASSPGMSELGQSWSTPVVTTIPGRSADSPVIIVGAGYSPSGKDG
AGVGADDIKGRGVFILDAETGDLVHQFGSASTGGTQLPGISDSIPSGVAVLDSNADGATD
RIYATDTGGNIWRMDMPSINTDEWSGFKFASLGGGVQSSDRRFYSGPAVAQTVITNIAEV
TVEDGETTTTIKTKMNIPYDAVVVGSGHRAMPSDLSRSDMFFTLQDRNVVSRSFKGTGGV
AIPTSLTLAELYDVTSSPPADSDEAEQINFGKKRGWYYRFSRTGEKNLSPATIVNGRVFF
TSFVPPGDNSDSELCISSGAGFLYNFDLHRGTRTYTYIRTGEFVPDTPQLIIPPRDPNEG
EEAEAPNMYLIGIGAALPGNPPTGCDPSDLRCVGGGLNTNRIYYYTSD
NT seq
3567 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaatttttatttatgatttagtcacaattggtggccgcttttttagctgtgtaact
gttttgtttttgctttctttctttatatcggcagatgacactgaactctatgtttatgaa
gcttcagcacgcagcggtgcccgaccacagatgcttattatttttgataactctggcagt
atgcgaacaaccattgttggggctgataagccatattcctctcatgctggtggtattagt
ggcgatagtttaggtaagcaaaataatctctatttcaccagaggtgcgacggcagctgaa
gatcaacccaatcccgctaattcatctgaaacacgtcatttcccaggagtgatgaatagc
tgtgaaagtgcttggagttcgcttcatcaatatggtttttatactggatatttcagaggt
tattcattctctggttcagaagggatgtggaaagagttagatgataccggcagtgatgat
gtgattgcggttgactgttttgaagatatccaagaagaaaaatggaccaatgctgcgagt
gtggcaagtggcttacccgttgacagtagtggttctgtatctagtcctcttttttacact
catgctaatgcaagttccagtgagacggttaagcaagatgcgagagatctcgctgaactt
actggttttggcactggtcgtcctctgacaatctacactcaagattatctaacctggcaa
catggtactaaggtcaaagtaaatattagccgtttagacatcgcaaaaaacgcaattaaa
agtattattttaacgaccccaagcgtggattttggtttagcagtgtttaatgtcaatgcg
tggaatgagtttgagcgtgatggtggcagagtgatctcgggactaaaggaaaacaccgct
acagttaaatccggtttgattaataccattgatgggattagtgccagtactaatacccct
ttgtgtgaaaccttatatgaagcatatcgttacttttctgggttaagtgtcgacttcgcg
aacagtaacactgatctacctaatgcgggttattacgttagtcagcaacctcaggcggac
tcctctgtggtgaacagtggcagctatatttcaccgtttaaaaaatgccagaataacgcc
agcgtggtgattattactgatggagtgccaacaaaagatgctgcagcaaacggttttatt
aatacgttaacgggaggcgttgataaatatggtagcgaggcggggggcgatcttaattac
ctgagtgcgatgtcaagttggatgaataagtatgatcttaatgccagtgagccaggtgat
caaaccgtaagcactcatacaatcggcttcagcaaaggggctgcgagtgcggcagccttg
ttgcagaaaacggctgaggcaggtggaggccgctattttgatgcaaccaatgcaagcttg
ttacaaggatcactacagcaggtggtgagtgaagctttagatactaactccagctttacc
tctccagctgtagcgagtaataattttaatcgaactcaatcattcgaatacgcttattac
tccatttttttgccgaatgaaggcccaacctggcttggtaaccttaaaaaatacagagtc
ttagggaagggagaggttgtggataaagcaggcaaacctgcaattggacttgatgggaat
attaagtcaacagcttgctctttttggacaccagattcagtttgtaatgctggaggtgat
ggtaatgaggtcgataaaggaggtgtgttgtctgcaatgcaatctgctgaatccagaact
atttatagtaatttaaacacaggcttgactgagttaacagtaaccagcgtcaccagtacc
gcaggcagtaccgacaacttgatcaattatcttggcgtgggtgaagaggaactgctctcc
ctttttggttgggcaaaaggtttagatgttgataacaataaaaacctaacgaccatccct
aatccaaatactaactggcgtgatgatattatgggggatgcacttcattcaaagccgtta
gcacttaattttggcactaaatcgagtcctgacgtacgaattgttatggggactaaccat
ggttttctgcatatgtttgaagatgatagtagcagtaatagtgttactgaaaactgggcg
tttattccctatgagttgttgccaaatttaaagacactcagagctaatgtgcctactgga
gttcactctgtttatggtgtcgacggttcacctgttgcttataccaaaaccaatgattcg
ggaattgagaaagcttggttatttttcggcatgcgtcggggaggcagcagttattacgct
atcgatattagcgatcctgataatccgagctttatgtggaaagtggatgcgtcttcgcct
ggcatgtctgagttaggtcagtcttggtcgactccagttgtgacaaccattcccggacga
agtgctgatagcccagtcattattgtcggtgccggttattcaccatcgggtaaagacggt
gccggtgttggagctgatgatattaagggccgtggcgtttttatactcgatgcagaaaca
ggggatttggtgcatcagtttggttctgcaagtactggtgggacacaactgcctgggatc
tcagacagtattccaagtggggttgcagttttagattcaaatgcagatggggctactgac
cgtatttatgcgaccgatactggtggcaacatatggcgtatggatatgccatcgattaat
acagatgaatggtctgggtttaaatttgccagtttaggtggaggtgtccaatcttcagat
cgacgcttctattcaggacctgctgtggcccaaaccgttatcaccaatatcgccgaggtg
actgtcgaggatggcgaaacgacaacgacaatcaagacaaagatgaatataccctatgat
gctgttgtcgtgggtagtggtcatagggcgatgccgtcagatctcagtcgttcagatatg
ttctttacactacaagatagaaatgttgtaagccgctctttcaaaggcactggcggggta
gctattcctacaagtttaaccttggcggaactttatgatgtcacatcatcgccgcctgct
gattccgatgaggctgagcagataaactttggtaaaaagaggggctggtattatcgcttt
tcccgcacgggagagaagaatttatctcccgcgacgatagtcaacgggcgagtgtttttt
acttcatttgtgccaccaggtgacaattctgatagtgagctgtgcattagttcaggtgct
ggatttctatataacttcgatctccatcgaggtacccgaacctatacctatataaggacg
ggagaatttgtgcctgatacgccacagctcatcattcccccacgtgatcctaatgaaggt
gaggaagccgaggcgccaaatatgtatcttattggtataggcgctgcgctgcctggtaac
cccccaacaggctgtgatcctagtgatttgagatgtgtgggtggtgggttaaataccaat
agaatttattactacacatccgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
