Shewanella sp. MTB7: HWQ47_15890
Help
Entry
HWQ47_15890 CDS
T10730
Name
(GenBank) ExeM/NucH family extracellular endonuclease
KO
K07004
uncharacterized protein
Organism
shem Shewanella sp. MTB7
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shem00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
HWQ47_15890
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_4
LTD
PKD
K319L-like_PKD
Exo_endo_phos
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBJ93414
LinkDB
All DBs
Position
complement(3687068..3689896)
Genome browser
AA seq
942 aa
AA seq
DB search
MFTKASLLALAIGGVSTFAQAADDLIFSEYVEGSSNNKAFELYNPTVTSIDLSQYQVEFY
FNGNTTVGSNISLSGSLAAGETYVVADNDASAEILAIADQVSNSSFFNGDDAIVLTSGGE
VVDSLGQVGFDPGSQWGSGDLSTQNNTLRRNPEMLTADTVADDVASLDTWLGFAQDDISD
LGQFDGSGPIDPPPPVELVCHDPAVSIHAVQGQTDVSPLNGQTIEVEAVVTSNQEAGLKG
LFIQTPDDAVDADPLTSEGVFVYTGGGTDYLAGDLIRVQAVVKEYNGLTELADIVSHTLC
GSSQAMPTAASVTLPVADMADLEAFEGMRVSFAQNLVVNEVYNLGRFGELLLGSQRHFIG
TQVAAPGADALAVTAANARDAIVLDDGLTSQNPDPVRYPAPGLSASNTVRVGDMVTGLNA
MMHYGFGKYRLMPVDTVNFVADNARTLAPDLAAGGNLTVASFNVLNYFNGDGAGAGFPTP
RGADTATEFERQRVKIISAMVGIDADLFGLMEIENDGFGGSSAIADLVSGLNIALGDTRY
GYVNAGGSGIGIGTDAIAVGIIYRLDKVTPEGAAKILSSANSPLDGDGQPLFNDGKNRPM
LTQAFLLNDSDESLVVAVNHLKSKGSNCDSLGDPDLNDGQANCNLTRTRAAQAVGTWLDG
EYPEAAILLIGDLNAYAQENPLSALSDAGFTELFAHLGKTGAYSYVFSGETGQLDHALAN
SELLDNVVDVTEWHINTDEPRSIDYNEEFKSASQLETLYNDDAYRSSDHDPVIVSLLLEA
ANVAPVASFTSDIQGAVVNFTSTSTDEDGSLVSYEWQFGDDSAANGESVSHEYAQDGDYI
VTLTVTDNGGLSHSVSQTITISTEPENINPVAVIHHIDLWFIDIFVSLSYDEDGYITRHK
WKFNDGSRVSGPVAVKFASRASKVKLVVKDNDGLKDSATLRF
NT seq
2829 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaccaaagcaagcttgcttgccttggcgataggtggtgtgtccacgttcgcacag
gcagctgatgatctgattttttctgaatatgtcgaaggcagtagtaacaataaagccttc
gaactctacaatcccacagttacttcaatcgaccttagccaataccaagtcgaattttac
tttaacggtaatactactgttggctctaacattagtctgagtggctcattggctgcgggt
gaaacctatgtggttgctgataatgatgcgagtgccgaaattttagcgattgcggatcaa
gtcagtaatagtagttttttcaatggtgatgatgccattgtgttaacgtcaggcggtgaa
gtcgtcgacagtttaggtcaagtgggttttgatccaggaagccaatggggcagtggcgat
ttatcgacacaaaataacacattgcgtcgtaatcctgagatgttaactgctgacacagta
gcagatgatgttgccagtttagacacttggcttggcttcgctcaggatgatatttcagat
cttggtcaattcgatggttcaggtcccattgatccgccacctccagtcgagctagtgtgt
catgatcctgcggtgagtattcatgctgtgcagggccaaactgatgtgagtccgttgaat
ggacaaaccattgaagttgaggctgttgttaccagtaatcaagaggccggtcttaaaggg
ctctttattcagactccagatgatgcagttgacgctgaccctctcacttctgaaggtgta
tttgtttataccggtggtgggactgattacctcgcgggcgatcttatccgtgttcaggct
gtggtcaaagaatataacggcttaacagagttggcagatattgtgtcacacacattgtgt
ggttcatcacaagcgatgccaactgctgcaagcgtgacactgcctgttgctgatatggcc
gatcttgaagcctttgaagggatgcgtgtgagtttcgctcagaatctcgtcgttaatgaa
gtgtataacctaggccgttttggagagttattgttgggtagccagcgtcactttattggt
acgcaagtcgcagcgccgggagcggatgccctagcggtgactgcagccaatgcaagagac
gcgattgtacttgatgatggtttaacgtctcaaaatcctgatcccgttcgttatcctgcg
cctggtttgagtgcaagtaatacggtgcgtgttggtgatatggtcacaggtctgaatgca
atgatgcattatgggtttggtaagtatcgtttaatgcccgttgatacggtcaattttgtt
gccgacaacgccagaacgttagcacccgatctcgctgctggtggtaatttaaccgtggcc
agttttaacgtactcaactacttcaatggtgacggtgcgggcgctggattcccaacacca
cgaggggcggatactgcgacggagtttgaacgtcaacgagtcaaaattatcagtgctatg
gttgggatcgacgccgatctgtttggtttgatggagattgagaatgacggtttcggtggc
agttcagccattgccgatctggtctctggtcttaacatagcgcttggcgatacccgttat
ggttatgtcaatgccggtggtagtgggatcggaatcggaaccgatgcgattgcagtcggt
attatctaccgacttgataaggttactccagaaggggctgcaaaaattctatcatcagct
aactcgccgttagatggtgatggtcaaccgctgtttaatgacggtaaaaatcgtcctatg
ctaacgcaagctttcttgcttaacgatagtgatgaatcgctggtagtggctgtgaaccat
ttaaagtcgaagggcagtaactgtgacagtcttggggatcctgatctcaatgatggtcaa
gctaactgtaacttaacacgtactcgtgcggcgcaagcggtgggaacttggttagatgga
gaatatccagaggctgcaattctgcttattggtgacttgaatgcctatgcgcaagaaaac
ccattgtcggcattaagtgatgcaggctttacagagttgtttgcccacttaggcaaaaca
ggggcttattcttatgtgttttcaggtgaaacgggccagctagatcatgcattagccaat
agtgagctgctcgacaatgttgtcgatgtcactgagtggcatatcaataccgatgagcca
cgctcgattgattataacgaagagttcaagtcagcttctcagttagagacgctgtataat
gacgatgcataccgctcttcagatcatgatcctgttatagtctctttactgcttgaagcc
gctaatgtggctcctgtagccagctttacttctgatattcaaggcgcagtggttaacttt
actagcacctctactgatgaagatggttccttggtaagttacgaatggcagtttggtgat
gacagtgccgctaatggcgaaagtgttagtcatgaatatgcacaagatggtgattacatt
gtgacattaacggttactgataatggtggcttaagccacagtgtttcacaaacaatcacg
attagcactgagccggaaaatattaatccagttgctgtgatccatcatatcgacctttgg
tttatcgatatcttcgtctcgcttagctacgatgaagatggctacattactcgtcataaa
tggaagtttaatgatggcagtcgggtatctggtccggtagcggtcaagtttgccagtcgc
gcctctaaagttaaattagtggtgaaagacaatgatggtttgaaagacagtgctacgtta
agattctaa
DBGET
integrated database retrieval system