Shewanella sp. MTB7: HWQ47_24860
Help
Entry
HWQ47_24860 CDS
T10730
Name
(GenBank) MSHA biogenesis protein MshQ
KO
K12287
MSHA biogenesis protein MshQ
Organism
shem Shewanella sp. MTB7
Brite
Secretion system [BR:
shem02044
]
Type II secretion system
MSHA pilus biogenesis protein
HWQ47_24860
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBJ95022
LinkDB
All DBs
Position
complement(5697866..5702230)
Genome browser
AA seq
1454 aa
AA seq
DB search
MINIVRLIILTILLLPTMAIAVPQCDEVFTDPPTGNLGVNGLTPPINIGPSLGNLTCSGG
GCSGHSSGFTPGDYDFDAGSFNNSSSLSTNGETTRLYFDSLSLNNSTLNDSGDTEDLIIY
VRGSLSVAGNNRINGIVYVAGSVSMAGNAKIDGALASAGALSISGNGEVDFEDDAIEDAD
FGGMCTNVQSSFNFQFGKAFSGTVTFDKPFETGVTPIIFLMPTISTNNPDSTDGPASVFP
ANITNTGFTWSQEEPVSPASRYKASLPMAEVHWIAVTPGEHTLSDGTELVAKVINQNRAF
GVNNSPYTNIPLDSDLDVFLHQKQTSINNCWLTTTSQFYNSGAQLAMEASEVRSGNRCRP
GYINSLQNEEVGYLAIESGTGTFNFDGDEIIYQFGRNYRTAPGTGDLSYQCGSESTLTGF
SNIPTLVSGKNSRRGGDGGWLRRCKLTNNRVSMVTDEDTYRDTDRRHVYEFYSFVALEKK
EQELTCFNDDFSQGDLTDNWVVARSNGNFTPAIVNGRLRQTQDVNNQSTSATYQRLFPAA
ENLVVVEFDHFAYGGSGADGIAVVLSDARITPQPGAFGGPLGYGFKPGLDGFAGGWLGVG
IDEYGNFSGEGGSSNIGQRRQSVAVRGSGSGTSGYRYLKGACNNGTTNTNGNCLNPKVDD
NNGSPIHRYRITVDSRVAGESMVEIQRKTSGGFVSIVPAFNAVSQTGQAVVPQDFILSLT
GSTGGSDNVHEIDNIEICALESRPVGVVIDHFELTHSGSALTCSPENVTIKACADAACTQ
TIQEEVVATLTPATVTGGGGWSGTGVVGNQVTFSGGTAQIQLSRTTIGNVTMEVTGSIPG
AKPFSQTLCRIGNSTPSVANCTLTYADSGFVFGDITAIPNNGIPDEFSNKPSMGILVHAV
KTDGASQQCIANFANETKSVAFWSSYTDPSTGSKKVSVKSGTTTIDAGLSLATSVPLNLA
FNAQGQATVDVNYADAGQMTLNARYTGTGDDAGLVMNGADTFVRYPKGLCVLPETTCAAG
DAGCPPFKKAGESFTFDVQAMAWASDSDADLCDNLSTPNYAHQDVGLNFNLVAPSSGVDA
DQIADYDHVVSTDGANTLTRAVSEVGVFTITANPPSLYFGVNRAIESGISDPIGRFFPAH
FELSNWSILPACSNTFSYMEQPFSLMMTLSAKNVEDVITTNYFGAFAKATASLVAANNLD
GINRGARLSGLSTLAWPISDTGGKVRGKVDIVDNIKFSRLGNTLDGPYQSLDIGVVMDDG
EGGTHYSFIKDPDMNAASVGACSGAGCNARNISTQDLRYGRMVLENGYGPESESLRVPLR
TEYVSAVSAGVATWVTNTDDSCSVYNTLTSVDTAETATMGLNMAFPVGFPAINAYTDPTL
IQQVGTLGNGLDYIYFSVPNNSGIVPLKQHVEPWLKWYWNYEGNNPSGLYDPRASVYFGT
YRGNDKVIYWREVN
NT seq
4365 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgattaatattgtacgcttgataatactgactatattactgcttcccaccatggcgatc
gccgttccccagtgtgatgaggtttttactgatcctcctactggtaacttaggggttaat
gggttaaccccaccgattaatattggtccgagtttagggaacttaacttgtagtggaggg
gggtgttcaggccatagttccggcttcacgcctggagactatgattttgatgctggtagt
tttaataacagctcgtctctaagtactaatggcgagacaacccggctctatttcgatagt
ttatccctaaataactcaactcttaatgattctggtgacactgaagatttaattatctat
gtcagaggttcattgtcagttgcgggaaataatagaattaatgggatcgtctatgttgcc
ggatcggtcagtatggcgggcaatgcgaagattgatggtgcattagcgtcagctggagca
ctctctattagtggaaatggcgaggttgattttgaagatgatgctattgaagatgcagac
tttggtggtatgtgcacgaacgttcagtcttcgtttaattttcaatttggcaaagccttt
tctggcactgtgactttcgataagccattcgaaactggcgtcacgccgataattttctta
atgccaaccatctcaaccaataaccctgacagtactgatggtccagcgtcggtttttcca
gccaatattaccaacacggggttcacatggagccaagaggagcctgttagcccagctagt
cgctataaagcttcattacctatggcagaggtacattggatcgcagtgacgccaggtgaa
cacaccttgtcagatggcactgagttagtggccaaagtgatcaatcaaaatagagcgttt
ggtgttaacaatagtccttacaccaatatacctctcgattctgatctcgatgtattttta
catcaaaaacaaacatcaataaataattgttggttgacgacgacatcacagttctacaac
tcaggagcccagttagccatggaggcctcggaggtgcgttcggggaatcgatgtcgtcct
ggatacattaactcactacaaaatgaggaagttggttatttggccattgagtcgggtact
ggaacgtttaattttgacggtgatgaaatcatctatcaatttggtcgtaactatcgcacc
gcaccaggtacaggggatttatcgtatcaatgtggcagtgagagtacgctaacgggtttt
agtaatatccctactctcgtgtcgggtaaaaactctaggcgtggtggagatggtggctgg
ttaagacgctgtaaactgaccaacaacagagtcagcatggtgaccgatgaggatacctat
agggacactgataggcggcacgtctatgagttttatagttttgttgcgctagagaaaaaa
gaacaagagctaacttgcttcaatgatgatttctcccaaggtgatttaactgataactgg
gtagtagcacgcagtaatggcaactttacgccagcaattgttaatggccgcttaagacag
acgcaagatgtaaataatcaatccacgtcagctacttatcaacgattgtttccagcagct
gagaacttagtggtagttgaatttgatcactttgcctatggtggtagtggagctgatggt
attgccgtcgtattgtctgatgcgaggattactccacaaccgggagcatttggtggtcca
ttaggttatggatttaagcctgggttagatgggtttgctggcggttggttaggtgtaggt
atcgatgaatatggtaatttttctggtgagggtggcagcagtaatattggtcagagacgc
caaagtgttgctgtgcgaggttcaggctctggaacgtcaggttatcgttatttaaaaggg
gcttgtaataacggtacaaccaatactaacgggaactgtttaaaccccaaagtcgatgac
aataatggcagtccgatacacagatatcgtattactgttgactccagagttgcaggggaa
tcaatggttgaaattcagcggaaaactagtggtggatttgtttctatcgttccggcgttc
aatgctgtgagccaaacaggtcaagctgtcgttcctcaagattttattctctcattaact
gggtcgactggtggttcagataatgttcatgaaattgataatattgaaatctgtgcgtta
gagtctagacctgttggtgtggttattgatcacttcgagcttactcattccggtagtgct
ctgacatgtagtcctgagaatgtaacgattaaagcgtgtgcagatgctgcttgtactcaa
acgatacaagaagaggttgttgcgacacttactccggcaactgtcacaggaggagggggg
tggagtggtacaggtgtggtaggtaatcaggtgactttcagtggcggaaccgcacagatc
cagctgagtagaacaaccattggcaatgtaacaatggaggtgacgggatctatccctgga
gcaaagccttttagtcaaactctttgccgtattggcaactccacaccgtcagttgcaaac
tgtacgctaacttatgctgatagtggttttgtatttggggatattactgccatacccaat
aatggcattccagatgaattctccaataaaccgtcaatgggtattcttgttcatgcagtg
aaaactgatggggccagccaacagtgtattgcaaacttcgcgaatgaaactaagtctgtt
gcgttttggagtagttatactgatccaagtacgggaagcaaaaaagtaagcgtgaagtct
ggcacaacgactattgatgcaggtttaagtttagccacctcagtaccgttaaatttagcc
tttaatgctcaagggcaagcaaccgttgatgtcaattatgcagatgctgggcagatgact
ctcaatgcccgttatacaggaactggagatgatgcaggattagttatgaatggggctgat
acttttgtccgttaccctaaaggtttgtgtgtgttacctgagacaacttgtgctgctggt
gatgcaggctgtcctccttttaaaaaggctggtgagagttttacattcgatgtgcaggct
atggcttgggcaagtgatagtgatgccgatttatgtgacaacttatctacaccaaactat
gctcatcaggatgttggcctcaattttaatcttgtagctcctagcagtggtgtcgatgct
gaccagattgctgactatgatcatgtggtctctacagatggtgccaataccttaactcgt
gcggtttcggaagttggtgtatttactatcacagctaaccctccttcgttatattttgga
gtcaatagggctattgaatctggaataagtgatcctattggccgtttttttcctgctcat
tttgaattatcaaattggagtattttgcctgcttgcagtaatacgtttagctatatggag
cagccgttttctttaatgatgactcttagtgcaaaaaatgttgaggacgtcattaccact
aattatttcggtgcttttgcgaaggcgacagccagcttggttgccgcaaataaccttgat
ggtataaatagaggggcaagattatcaggtttatcaacattagcttggccaatttctgat
actggaggaaaggtgcgggggaaggttgatattgttgataatataaaatttagtcgcctt
gggaacacgctagatggcccataccagtcactcgatattggggtggtgatggatgatggt
gaagggggaactcattactcttttattaaagatccggacatgaacgcagctagtgtagga
gcctgtagtggggcgggctgtaatgctagaaatatatcgacacaagatctacggtacggc
cgtatggtgcttgaaaatggatacggtcccgagtctgagagcctacgtgtaccgctgcga
actgagtatgtcagtgccgtgtcggcaggagtggcgacttgggtaacgaatacagatgat
tcctgttctgtttataacaccctgacgtcagttgatacggctgaaacagcaactatggga
ctaaacatggcatttccggttgggtttccagcgatcaatgcttacacggatccaacatta
attcagcaagttgggacgcttggaaatggtttagattatatctatttttctgtaccaaac
aattcaggtatcgtgccgcttaaacaacatgttgagccttggttgaagtggtattggaac
tatgaaggtaacaatcccagcgggctttatgatccgagagcatcagtctattttggtact
tatcgtggcaacgataaagtgatctattggcgtgaagtgaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
