KEGG   Shewanella sp. Pdp11: AYJ58_07720
Entry
AYJ58_07720       CDS       T11329                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
shep  Shewanella sp. Pdp11
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:shep00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:shep02000]
    AYJ58_07720
Transporters [BR:shep02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   AYJ58_07720
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug
Other DBs
NCBI-ProteinID: AUD61940
LinkDB
Position
1778387..1780963
AA seq 858 aa
MMTSKKQKFGLSAVSLAITLALSGSFISPQAMAEEEDAAVKNEGVEKIAVVGSRAAPRSI
GDSPVPIDIISSDDLKKNGSTDMIDMLVTSVPSFNSRAQPISDAATLVRPVNLRGLPSDS
TLVLVNGKRRHRAAVIAFQGGGINDGAQGPDISVIPGSALKQVEVLRDGAAAQYGSDAIA
GVMNFVLKDNSDGGSITVTQGEYYEGDGATTTVEGDVGLPLTDNGFVNLSFQYKNADATS
RSVQRPDAANLAVQGNTAINDPAQVWGNPEINDDYSVFINSGLDINANMHAYAFGNLSSR
DAVGGFYYRYPQNRSNVYSNDGGQNLLVGAVNGDPSTCGLVPIPKNADGSDGNVLDTDAY
KAMVADPNCFAMNQIFPGGYTPQFTGTIEDMSFFAGVKGDIGEWNYDFSAGTGSNKASFG
LKNSLNPSLGLDTPTDFDTGAYEQVETTVNLDFSRFITIGGIEDISFASGFEWRNESFEI
SQGDEASWIAGPYANQGFNIGAHGFKGFGPESAGKNSRHNIGIYTDLEAYLSDDWLLGLA
LRYEDFSTFGDTLNYKLTLQYSATDELSFRASHSTGFRAPTVGQENVVNTQTSIIDGELI
QTFIAPPTDPLAAFYGGEVLKPEESISYALGAVYEYESFFLTVDYYNIGVEGRIAQSSKI
DVEAKDYDALRAAGVEFPELIQGVSYYTNDFDTTTQGIDIVASYDAEILSGNAKFSLAYG
WTDTSVDKFDPETTDEGKVRRLEDGIPAHRATLTWAQSWDQLSMSLRGNYFGEYYATHAD
DTSDWGSEMADAAVTIDLEVSYELFDGLTLAVGANNLFDQKAQKLKDGTLGELGGVYYES
GPFDYNGGFYYGRVNYRF
NT seq 2577 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatgacctcaaagaagcagaagtttggattaagtgcagtcagtttggcgattacatta
gctttgtctggtagcttcattagcccgcaagccatggctgaggaagaagacgctgctgtt
aaaaatgaaggcgtggaaaagattgcagttgttggttcacgtgcggcaccacgctcaatc
ggtgattcccccgttccaattgatattattagtagtgacgacttaaaaaagaatggttcc
actgacatgattgatatgttggtgacctcagtaccttcgtttaactcgcgcgctcaaccc
atcagtgatgcggcaaccttagtacgtcccgttaacttacgtggtttgccttccgacagt
accttagtgttagtcaatggtaagcgtcgtcaccgcgcagctgtgattgcattccaaggc
ggcggcattaacgatggtgctcaaggtcctgatatttcggttattcctggttctgcattg
aagcaagtcgaagtgctgcgcgacggcgctgcggcgcaatatggctctgatgcgatagca
ggcgtcatgaactttgtcttaaaagataattctgatggtggttccatcacagtgacccaa
ggtgaatattacgagggtgacggtgccacgaccacagtcgaaggtgatgttggtttaccg
ttgacggataatggctttgttaacttaagcttccagtataaaaatgccgatgcaaccagt
cgtagtgtgcagcgtcccgatgcggctaacttagctgtgcagggcaatactgcgattaat
gaccccgctcaagtatggggtaatcctgaaatcaatgatgactactcagtgtttatcaac
tcaggcttagacattaatgccaatatgcatgcctatgcctttggtaacctgtcatcccgc
gatgctgtggggggattttattatcgttacccgcaaaatcggagcaacgtgtattccaat
gatggtggtcagaacttactcgtaggcgcggtaaatggtgatccatcaacatgtggactc
gtacctattcctaaaaatgctgatggtagtgacggcaacgtactcgatacggatgcttac
aaggcgatggtcgccgatcccaattgctttgccatgaaccagatattcccagggggttat
acgccgcagttcactggtaccattgaagacatgtctttcttcgccggtgtaaagggcgat
atcggcgagtggaattatgatttcagtgccggtaccggtagtaacaaagctagctttggc
cttaaaaattctttaaatccatcacttggattagacacaccgactgatttcgatacgggt
gcctatgagcaagttgaaaccacagttaacttagacttctcgcgtttcattactataggc
ggcatcgaagacattagctttgcttctggttttgaatggcgtaatgagtcgtttgagata
tctcaaggtgatgaagcctcgtggattgctggcccttatgcaaaccaaggtttcaatatt
ggtgcgcacggatttaaaggctttggcccagaatctgcgggtaaaaactctcgccacaat
atcggtatctatactgatctagaagcctatttaagtgatgactggttactcggtttagca
ctgcgttacgaagacttttcgacctttggtgatacgttaaattacaagctgacattgcag
tattccgcaacggatgagttgtcgttccgcgcgtcacacagcacaggtttccgtgcgcca
accgtgggtcaagaaaacgtcgtcaacacgcagacatcaattatcgatggtgaactgatc
cagacgtttattgcgccacccaccgatccacttgcggcattttatggcggggaagtgtta
aagcctgaagagtcaataagctatgcgctaggtgctgtctatgagtacgaaagctttttc
ttaacggtcgattattacaacattggcgtagagggtcgtattgcgcagtcgagtaagatt
gatgttgaagctaaagactatgatgcactgcgtgcagcgggcgttgagttcccagagttg
atccaaggcgtgagttattacactaacgactttgatactaccactcaaggtatcgacatc
gtcgcctcctatgatgcggaaatcctgtcgggtaatgctaaattcagtcttgcctatggt
tggaccgataccagtgttgataaattcgatcccgaaaccactgatgaaggcaaggttcgc
cgtttagaagatggtattcctgcacaccgtgcaaccttgacctgggcgcagtcatgggat
caattaagcatgtcactgcgtggtaactacttcggtgagtattatgcgactcatgctgat
gatacctctgattggggttctgaaatggccgatgctgctgtcaccatagatttggaagtg
agctatgagttatttgatggcttaacgctggcggtaggggcaaataacctattcgaccaa
aaagcgcaaaagctgaaagacggaaccttaggcgaacttggtggcgtttactatgaaagt
gggccgttcgattacaacggtggcttctactatggccgtgttaattaccgtttttaa

DBGET integrated database retrieval system