Shewanella sp. WE21: CKQ84_02090 Help Entry CKQ84_02090       CDS       T05404                                  Name (GenBank) TonB-dependent receptor   KO K02014   iron complex outermembrane recepter protein Organism shew  Shewanella sp. WE21 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:shew00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:shew02000]     CKQ84_02090 Transporters [BR:shew02000]  Other transporters   Pores ion channels [TC:1]    CKQ84_02090 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  TonB_dep_Rec_b-barrel Plug Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AVI64768 LinkDB All DBs Position complement(505351..507975) Genome browser AA seq 874 aa AA seqDB search MRPSTFKKTVLATNIAILLGSAVSISAVAADAVATTAAPENIEKIEVRGMRASMKASVND KRFSDAVVDAVTAEDIGKFPDGDVGESLGRIPGVAVNRQFGQGQQVSIRGASSQLTSTLL NGHSVASTGWFDQQAIDRSFNYSLLPPEMVGGIQVFKSSQADIAEGGIGGTVIVKTRKPL DLDANSVFLSTKGDYGTVSEEIDPQTSGLYSWKTEDEKFGFLVAGSLDKTQYQRNGIESL LGWGEIVPTTFQQDRERTAVNAAFQYRPTDNLEFGLNLMSLQLDANNANTSIFLFPTQQG ENTCLKKNAAGVCTLVEHTGKGGFAWAQTWARKASMSSDTIDLDFAYQADAYKLEGRIGK TKAEGGTDLTSNYGQSIGKPEDFAGIYDATGDVIDINIANNAFDASDFNGKLETAGWALK KQPNTDEESFATFDITIPVELGAITSFKSGISYADHDVTQTTEAAQSSNIVAKDASAYYS GTMSSGAGFTLPKPIFDNMINDAYAAIDGFTLDKSGYGTLQEKNLALYTMATFAGEGVRG NFGLRYVSTDVESDYYAFSKTGTYADGLSTDKASYNDVLPSVNIAFDLASDLILRASAAQ VISRPNYADLFATSKLPGFNDGTPGNEKKVTGSVNLQPFKASQADVSLEWYFSGEGLFAA TYFIKDVSSFISTREKLNQQIGIEDPNLITAGGSTCGAGIYDCWTVSENYNANGGSIDGI ELQLQDSFDSGLGYSVNYTFADASSPAENYADRVGVFSDSSKHTVNLVGYYEMDDFSARV AYNWRSEYMMRELPGFYGNREHQAYGTLDLSASYNLTDYLSLTFEVVNLLEEDSVQKGVS PVDAEGVISEFKDNYPVWSFDGEARYKLGVALRF NT seq 2625 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgcgaccatcaacctttaagaaaactgtactagctacaaatattgctatcctactcggc agtgctgtatccattagcgctgttgctgcagacgccgtggcaaccaccgcagcacctgaa aatattgaaaaaattgaagttcgcggtatgagagcatcaatgaaggcatcagttaacgac aaacgtttttctgatgctgtagtggatgcggtcacagcagaagatattggtaaatttcca gatggagatgtgggtgagtctttaggacgcattcctggtgttgcggttaatcgtcaattt ggtcaaggccaacaagtatcaattcgtggtgcttcaagccagttaaccagtactctatta aatggtcattctgtggcttcaacgggttggtttgatcaacaagctattgaccgtagcttc aattacagtctattaccaccagaaatggtgggcggtattcaagttttcaaatcatctcag gcagatattgccgaaggtggtattggtggtactgtaattgttaaaacccgtaaaccatta gatttagatgcaaattctgtatttttaagtacaaagggggattacggcactgtatctgaa gagattgatccacaaacctcaggactttatagctggaaaacggaagatgaaaagttcggt ttcttagtcgcaggttctttagataaaactcaatatcaacgtaatggtatcgaatcttta ctaggttggggagagatagttccgaccacattccagcaagaccgagagcgtaccgctgtt aatgctgcattccaatacagaccaactgataatcttgagtttggtttgaatttgatgagc cttcaacttgatgcaaacaatgctaatacttcaattttcttatttcctactcagcagggt gaaaatacttgccttaagaaaaatgctgcaggcgtatgtacattagttgagcacacaggt aaaggtggatttgcttgggctcaaacttgggcacgtaaagcgagtatgtcttctgacaca attgatttggattttgcatatcaggcagatgcttataagttagaaggtcgtattggtaag accaaagctgaaggtggtaccgatttaacttcaaactatggtcagtctattggtaaacct gaagatttcgcgggtatctatgatgctactggcgatgtcattgatattaacattgcaaac aacgcatttgatgcttctgattttaatggaaaattagaaacagcgggttgggctctaaaa aaacaacctaatacggatgaagagtcctttgcgacatttgacattactattcctgttgag ctaggtgctattacgtcatttaaatcaggcattagttatgccgatcatgatgttactcaa actaccgaggctgctcaatcctctaatatagtagcaaaagatgcatcagcttattattct ggtactatgtcatctggcgcaggcttcaccttacctaagcccatttttgataacatgatt aatgatgcctatgctgctatcgatggttttactctcgataaatcaggatatggcacactg caagaaaagaatttagcgctctatactatggctacattcgctggtgaaggcgttcgtggt aacttcggtttaagatatgtgtctactgatgttgaatctgattattatgcgttcagcaaa acaggtacatatgctgatggtttaagtactgataaagccagctataacgatgttttacca agtgtaaatattgcatttgaccttgcaagtgatttaattttaagagcctcagcagctcaa gttatttcacgtccaaattatgccgatttattcgcaacctctaagttacctggcttcaac gatggtactcctggtaacgagaagaaagtcaccggtagcgtaaatttacagccttttaaa gcttcacaagcagatgtcagtttagaatggtacttcagtggagaaggtttatttgcagca acttactttatcaaagatgtaagttcatttatctctacaagagaaaaactgaatcaacaa ataggaattgaagatcccaacttaatcactgctggtggtagtacatgtggtgcgggtatt tacgattgttggactgtaagtgaaaattataacgctaatggtggctcaattgatggtatc gaacttcagttacaagattcattcgatagtggtttaggttactcagttaactacaccttt gcagacgcttcatcaccagctgaaaactatgcagaccgtgttggagtattctctgactca tccaaacatactgtaaacttagttggttactacgaaatggatgatttctcagctcgggta gcttataactggcgttctgaatatatgatgcgtgaattaccagggttctatggtaaccgt gaacatcaagcgtatggcaccttagatttaagtgctagctataatctaacagattatctg tcgttaacttttgaagtggttaacttgcttgaagaagatagcgtacaaaaaggtgtatct ccagtggatgcagagggggttattagtgaatttaaagataattaccctgtatggagtttt gatggtgaagcccgttataaactcggtgttgcgttgcgcttctaa

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