Shewanella sp. WE21: CKQ84_02655 Help Entry CKQ84_02655       CDS       T05404                                  Name (GenBank) TonB-dependent receptor   KO K02014   iron complex outermembrane recepter protein Organism shew  Shewanella sp. WE21 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:shew00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:shew02000]     CKQ84_02655 Transporters [BR:shew02000]  Other transporters   Pores ion channels [TC:1]    CKQ84_02655 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  TonB_dep_Rec_b-barrel Plug Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AVI64872 LinkDB All DBs Position complement(629382..631958) Genome browser AA seq 858 aa AA seqDB search MMTSKKQKFGLSAVSLAITLALSGSLISPQAIAEEDETAVKNENVEKIAVVGSRAAPRSI GDSPVPIDIISSDDLKKNGSTDMIDMLVTSVPSFNSRAQPISDAATLVRPVNLRGLPSDS TLVLVNGKRRHRASVIAFQGGGINDGAQGPDISVIPGSALKQVEVLRDGAAAQYGSDAIA GVMNFVLKDNSEGGSITVTQGEYYEGDGATTTVEGDVGLPVTENGFVNLSFQYKNADSTS RSVQRPDAANLAEQGNTAINDPAQVWGNPEINDDYSVFINSGLDINANMHAYAFGNLSSR DAVGGFYYRYPQNRSNVYSNDGGQNLLVGAVNGDPSTCGLVPIPKNADGSDGNVLDTDAY KAMVADPNCFAMNQIFPGGYTPQFTGTIEDMSFFAGVKGDIGEWNYDFSAGTGANKASFG LKNSLNPSLGLDTPTDFDTGAYEQVETTVNLDFSRFITLGGIEDISFASGFEWRNESFEI SQGDEASWIAGPYASQGFNIGAHGFKGFGPESAGKNSRHNIGIYTDLEAYLSDDWLLGLA LRYEDFSTFGDTLNYKLTLQYSATDELSFRASHSTGFRAPTVGQENVVNTQTSIIDGELI QTFIAPPTDPLAAFYGGEVLKPEESISYAIGAVYEYESFFLTVDYYNIGVEGRIAQSSKI DVEATDYDALRAAGVEFPELIQGVSYYTNDFDTTTQGIDIVASYDAEILSGNAKFSLAYG WTDTSVDKFDLKTTDAGKVRRLEDGIPAHRATLTWAQSWDKVTLSLRGNYFGEYYATHAD DTSDWGSEMADAAVTVDLEMSYQLLDGLTLAVGANNLFDQEAQKLKEGTLGELGGVYYES GPFDYNGGFYYGRVNYRF NT seq 2577 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgatgacctcaaagaagcagaagtttggattaagtgcagtgagtttggcgattactcta gccttgtctggtagtttaatcagtccgcaggcaatagcagaagaagatgagacggctgtt aaaaatgagaacgttgaaaaaattgcagttgtagggtcccgtgctgcgccacgctcaatc ggcgattcccccgttcctattgatattattagtagtgacgaccttaaaaaaaatggctca actgacatgattgatatgttagtgacttcggtgccatcgtttaactcacgcgctcaaccc attagtgatgcagcaaccttagttcgtcccgttaatttacggggtttgccatcagacagt acgctagtgctagtcaacggtaagcgtcgtcaccgtgcatctgtgattgcgttccaagga ggtggtattaacgatggcgctcaaggtcctgatatttcggttattcctggttctgcatta aagcaagttgaagtgttgcgcgacggtgctgctgcgcaatatggctctgatgcgattgca ggagtcatgaactttgttttaaaagataattccgagggtggttctatcactgtgacccaa ggagaatattacgagggtgatggtgctacgactacggtcgaaggtgatgtcggtttacct gtgactgaaaatggcttcgtcaatttgagcttccagtataaaaatgctgactccactagc cgtagtgtgcagcgtcctgatgcggctaacttagccgagcagggtaataccgcgattaat gaccccgctcaagtgtggggtaatcctgaaattaatgatgactattcagtgttcatcaac tcaggcttagacattaatgccaacatgcacgcctatgcctttggtaatctttcttcccgc gatgccgtgggaggcttctattatcgttacccgcaaaatcgtagcaatgtgtattccaat gatggtggccagaatttacttgtgggcgctgtaaatggtgatccatcaacatgtggactc gtaccgatccctaaaaatgctgatggaagtgacggcaacgtactcgacactgatgcatac aaggcgatggttgccgatcccaattgctttgccatgaaccaaattttcccagggggttat acaccgcagttcaccggcaccattgaagatatgtccttcttcgcaggcgtaaaaggcgat atcggtgaatggaattatgatttcagtgctggtacgggggcgaacaaagccagttttggt cttaaaaattcgttgaatccatcattgggattagataccccgacggatttcgatacggga gcttatgagcaagttgaaactaccgttaacctcgatttctcgcgcttcataaccttagga ggcattgaagacattagttttgcttctggttttgaatggcgaaatgagtcgtttgagatt tctcaaggtgatgaagcctcgtggattgctggcccttatgctagtcaaggtttcaacatt ggtgcgcatggttttaaaggctttggcccagagtctgcgggtaaaaactcacgtcataac ataggtatttatactgatttagaagcttatttaagtgatgactggttactcggtttagca ctgcgctacgaagacttttcaacctttggtgatacgttaaattacaaattgacgttgcag tattctgcaacggatgaattgtcgttccgcgcctcacacagcaccggctttcgtgctcca acggttggccaagaaaacgtggtgaatacccagacatcgatcatcgatggtgaattgatc cagacctttattgcccccccaaccgatccgcttgcggcattttacggtggtgaagtgtta aagccagaagagtcgattagttatgcgattggggctgtatatgagtacgaaagcttcttc ttaacggtcgattactacaacattggcgtagagggccgtattgcacagtcgagtaagatt gatgttgaggctacagattatgatgcgctacgtgccgctggggttgagttccctgagttg atccaaggcgtgagttattacaccaacgactttgatactaccactcaaggtatcgatatc gtcgcttcctatgatgcggaaatcctatcgggtaatgctaagttcagtcttgcctatggt tggaccgataccagcgttgataagtttgatcttaaaacgaccgatgcgggtaaagttcgt cgattagaagatggtatcccagcgcaccgtgccaccttaacttgggcacagtcatgggac aaggtaaccctgtcactacgtggtaactattttggtgagtactatgcgactcacgctgat gatacctctgactggggctctgaaatggctgatgctgcagtgaccgtcgatcttgaaatg agctatcaattacttgatggcttaaccctggcggtgggggctaataatctatttgatcaa gaagcgcaaaagctgaaagaagggaccttgggtgaactcggtggcgtttattatgaaagt gggccattcgattacaacggcggtttctactatggtcgagtgaattaccgtttttaa

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