Shewanella sp. WE21: CKQ84_21575
Help
Entry
CKQ84_21575 CDS
T05404
Name
(GenBank) flavocytochrome c
Organism
shew
Shewanella sp. WE21
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
FAD_binding_2
Cytochrom_c3_2
HI0933_like
FAD_oxidored
DAO
GIDA
Pyr_redox_2
FAD_binding_3
Pyr_redox_3
NAD_binding_8
Thi4
AlaDh_PNT_C
Cytochrome_C7
Cytochrom_CIII
Cytochrom_c_NrfB-like
Galanin
Stc1
Lycopene_cycl
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVI68212
LinkDB
All DBs
Position
complement(4845637..4847406)
Genome browser
AA seq
589 aa
AA seq
DB search
MKIKYLSIIVCSILTASSWAADNKNDLASFHKDVNGCKTCHTAPNKVSDSETFENKQCKS
CHGDYGKLANPKLEIDPHSSHLGDINCTSCHKGHEQPKLYCNECHSFKGLDMPFNKAKSK
EPWDKGWDNEAINKAIAAGPKETTDVIVVGAGSAGFNAAIAAKKAGANVILLDKAPFSGG
NSMLAAGGYNAVGTVQQKDHKVDDKIEWYVEDTMKGGRYANDPKLVQILAEQSADGIKWL
ESLGANMDDLKRSGGARVDRTHRPSGGLSVGPHIIDVLRKASDKEGVDTRLNSKVVKLVV
DDEQKIVGVVIHGKHSGHYMVAAKSVVLATGGYGFNKEMIAFYRPTFKGMTSSNNITSTG
DGIELAKAVGASMTDIDWIQTHPTVGKDSRILISETVRGVGAIMVNKEGDRFINELTTRD
KASDAILKQPEQYAWLVFDNELYKKAKMVQGYDHLEMLEKANTVAELAKITGMTPSVLDK
TITNYNHYFKQGKDEAFNREQMPLSIEKSPYYAVKVAPGIHHTMGGVAIDTKAEVLDIQS
QPLKGLFAAGEVTGGVHGYNRLGGNAVADTVIFGKIAGTNAAKHALNTK
NT seq
1770 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagataaaatacttgagtattattgtctgttcgattttaactgcgtcatcatgggcg
gctgataataaaaatgatttagcatcattccataaagatgttaatggttgtaaaacctgc
catacagcacctaataaagtgagcgatagcgagacatttgaaaataaacaatgtaaatcc
tgccatggtgattatgggaaactagcaaatcctaaactagaaattgacccacattcttca
cacttaggtgatattaattgtacgtcttgtcataaaggacatgaacaaccaaagttatat
tgtaatgaatgtcattcatttaaagggctcgacatgccttttaataaagcaaaatctaaa
gaaccgtgggacaaaggttgggataatgaagcaataaataaagcgatagctgcaggtcct
aaagaaacaacggatgtgattgttgttggagccggtagtgctgggtttaatgctgcgatt
gcagctaaaaaggcgggggctaacgttatattgcttgataaagcaccatttagtggtggt
aactctatgctcgccgcaggcgggtataatgctgtgggtacagttcagcaaaaagatcat
aaagtcgatgataaaatcgaatggtatgtcgaagatacaatgaaaggcggtcgatatgct
aacgaccctaaattggtacaaatattagcggagcaatcggctgatggcattaaatggtta
gaatctttaggcgccaatatggatgatttaaaacgctctggcggcgctagagtcgataga
acacatcgtccatctggtggtttaagtgttggtccacatattattgatgtactaagaaaa
gcatcggataaagaaggggttgatacaagactcaactccaaagttgttaaactggttgtt
gatgatgaacaaaaaattgtgggtgttgtcatccacggtaaacactctggtcactatatg
gttgcagctaagtcggttgttttagccaccggtggttatgggtttaataaagaaatgatt
gctttttatcgccctacatttaaaggcatgacaagttcaaataatatcacttcaactggg
gatggtattgaacttgctaaagcagtcggtgcaagtatgactgatattgattggatccag
acacatccaacagtaggaaaagatagccgtatattaatttcagaaacggttcgaggtgtc
ggggccataatggttaataaagaaggcgatcgctttatcaatgaattaaccactcgagat
aaagcctccgatgccattctaaaacagcctgaacaatatgcttggctagtatttgataat
gaattatataaaaaagctaaaatggttcaggggtatgatcatttagaaatgcttgaaaag
gccaatactgttgcagagcttgcaaaaataacaggaatgactccaagtgttttagacaaa
actatcacaaactacaaccattatttcaaacagggtaaagatgaggcatttaaccgtgag
cagatgccgctatcaatagaaaaatctccttattatgccgtaaaagttgctcctggcatc
catcatactatggggggagttgccattgacactaaagctgaagtactcgatatacaaagc
caaccgctcaaaggtttatttgcggcgggagaggtgactggtggtgttcatgggtataat
cgactgggtggtaacgctgtcgctgatactgtaattttcggtaaaatcgcagggacaaat
gctgccaaacatgctctaaatacaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system