Shewanella sp. YLB-09: FS418_07665
Help
Entry
FS418_07665 CDS
T11533
Name
(GenBank) response regulator
Organism
shey Shewanella sp. YLB-09
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
Response_reg
PAS_9
HisKA
PAS
PAS_4
PAS_8
SPOB_a
Egg_lysin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QFU21764
LinkDB
All DBs
Position
1815247..1817295
Genome browser
AA seq
682 aa
AA seq
DB search
MFKEFSQTDTNSFWPRLLAELGKLQAGFINGEDILLPLCRILAEVSQSQAVLIISKDSLG
SDDMPASATCWCRDPVRYLTLWKEAKAWPFVNQEPMVHRWQSFVVWPAKRVNIQIFFHSS
SDQWLSFLLSANELLSDILMGMLVQQTVEWQERARTRVVHSVDSEMFQSIVSNSEDLILV
ASRSPFGVPSIMYANAAATSISHYPRSQLIGKPITLLFQDDLTNGTALNGNEQSELLQAI
DTRTEFDGELICTKADKEEALLHMHLVALEEHSEHGSLFALVGRDITEHKQLQHIMARTQ
KMQAMGQLVGGIAHDFNNILGVLRGNLELMELKVKEDKIVRYLATAFKACQRGTDLTRRL
LQFSRQEQFSANHHQVNHVVEGIEELIGKSLTTQINLVLELSEDFAEILVDRGDLEDALL
NLVLNARDAMGGEGQITIRTGKEGLAGSLPGLTGRIMVETGQYITVSVIDTGKGIDSHIL
EKIFDPFFTTKDKSDGTGLGLSMVYGFVKRSKGYMSVIKSDNEGTEFRLWFPVAKDVQRH
PLQDEERPEAPKLSTKLKVLIVDDEEDLLCVLKDYCEILGMDVEAYSDPLEVREKFKSGL
NGIELLITDVLMPGGINGYELAKEISGKQDISVLLISGFIGDIGIKSNDEMPYKVLHKPF
ALDGLVEALQQIGIKFSQRECN
NT seq
2049 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgtttaaagaattctctcaaacagataccaattcattttggcctagattattagccgag
ctgggaaagttacaagcgggctttattaatggcgaagatatccttttacctctttgccga
attctggccgaagtcagtcaatctcaagcagtgctaattatttctaaagattcactcggt
tctgatgatatgccagcatcagcaacgtgttggtgccgtgatccggtgaggtacttaacc
ttatggaaagaggctaaggcttggccatttgtcaatcaggaacccatggtacatcgttgg
caatcctttgttgtatggcctgcaaagcgggtcaatattcaaatatttttccattcatct
agcgatcagtggctttcctttctattaagcgcaaatgaactactttcagacattcttatg
gggatgttggtccaacaaactgttgagtggcaggagagggcacgtacacgtgtggttcat
tcagttgatagtgagatgtttcagtcaatagtcagtaatagtgaagatttaattctggtc
gccagccgctctccgtttggggtgccaagtatcatgtatgccaatgctgcagcgacgagt
attagtcattacccgcgtagtcagctgattggtaagcctataaccttattgtttcaggat
gatctaactaatggcacagcgcttaatggcaatgaacaaagtgaattattacaagccatt
gatacgagaaccgagtttgacggtgagttgatttgtactaaggctgataaggaagaggcg
ttattgcatatgcatttggtcgcgcttgaagagcacagtgagcatggaagtttatttgcc
ttagtcggtagagatattactgagcataagcagttgcaacatatcatggcacgaacccaa
aaaatgcaggccatggggcagctggttggagggattgctcatgatttcaataatattctc
ggggtgctcaggggcaatttagaattgatggagctaaaagttaaagaggacaagattgta
cgttatcttgcgacagcctttaaagcttgccagcgaggaaccgacctaacgagacggctt
ttacagttctccaggcaagaacaatttagcgcaaatcatcaccaggtcaatcatgttgta
gagggaatagaagaactcattggtaagtctttaacgactcaaattaacttagtactagaa
ctcagtgaagactttgctgagattttggtcgacagaggcgatcttgaagatgccttgttg
aatcttgtattaaatgccagagatgcgatgggaggagaggggcagatcacaatcagaacg
ggtaaagaagggctcgcaggctcactgcctgggctgacaggacgaattatggttgaaact
ggtcagtatattaccgtctctgtcattgatacggggaaaggtattgactcccacatatta
gagaagatatttgatccattctttaccactaaagataagagtgacgggacaggattaggg
ctctcaatggtttatggttttgttaaacgctctaaaggatacatgagtgtgattaagtct
gataacgaaggtactgaatttagactttggtttcctgttgcaaaggatgtccagcgacat
cctcttcaggatgaagaacgaccagaggcacctaagctgtctacaaagctaaaagtcttg
attgttgatgatgaagaagatctgctttgcgtattaaaagattactgtgaaattttgggt
atggacgtagaggcttattctgaccccttagaagttagagaaaagtttaaaagtggctta
aatggtattgaactattaatcaccgatgttttgatgccaggagggatcaatggttatgaa
ttagccaaggagatcagtggcaagcaagatatttcagtgttacttatctccggctttatt
ggagatataggcatcaagagtaatgatgagatgccctacaaagtgttacataagccattt
gccttagacggtttagttgaggcactgcagcagatagggattaagttttcacaaagagag
tgcaactag
DBGET
integrated database retrieval system