Shewanella sp. FDAARGOS_354: CEQ32_18345
Help
Entry
CEQ32_18345 CDS
T04944
Name
(GenBank) bifunctional diguanylate cyclase/phosphodiesterase
Organism
shf
Shewanella sp. FDAARGOS_354
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
EAL
GAF_2
GAF
GAF_3
ALIX_LYPXL_bnd
YlxR
COG5_N
EMC3_TMCO1
Spectrin
Folliculin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVL27179
LinkDB
All DBs
Position
complement(4076448..4079078)
Genome browser
AA seq
876 aa
AA seq
DB search
MFRDEDETTQPRAPELERLKKRLNRLKYLAHKYKRAEIVQNALLELSHIATQVPSLEEFY
LGVHHHLKKLISADNFFIATLDINTNTISVPFFADEKDAHPAQLYPEQSLSTLLQQGLTG
YVFRTGKTLLCDESKVEELVEAEEIVNLGSPCHLWLGVPIKHEGIVTAVLVVQTYDTNVS
YGDIEVELMTFICHHIAGVMERLKHQEQLEQAIQQRTKELSQAYDKLKQEVYERRRAERL
QKSLFEIAELASSSSDNPEFYAQLHNVIRHLIPANNCYIALLNEQGTHLTFPFYVSQLGN
QHPGTRPLQDGLTEYVLKHKRPLLLDQNDIHGLIASKEIYAKAPALNHTQTMHQWIGIPL
FIHDVVRGALTIYSFSMTQNYQTKDLELLTFVSQHIGAAIEKKLAAESLRRSYEELEEKV
AARTTALAELNKDLEKEIRQRRNMEAKLVHDAKHDALTGLPNRAMFMERLNQAIKHVRRH
SLEQFALLFIDLDRFKQINDTMGHLEGDRFLIETATRLRGCIRSNDTLARLGGDEFVILL
DTINGINDARDVAERVIQKVSQSYKLGTIEFHSGASIGITISGNKLDTSESMLRNADTAM
YQAKANGKGCYVIFDDSASQQKIQDIAFENDFKQALQAEELQLNLLPIVDLQTLQPHAFE
CRLIWEHPVWGSIPHEVLSQLAEQANLMVELDKYAINLLNKHYHQLVVSHGDNLDLHLML
SSQHLKHKHVLRGLKNALKQTQLPLPQLWLFFNEKALVQETENHISGFELLNKQGVNLGI
SHYGSGHSALNSLLFLPVKGLKLDANITKQLQDEQHIKLMSAYQKAASTLNLQTFVDGLH
HPEQINIFNALGYRFGQGSAIAHPFTLVETLHQVCA
NT seq
2631 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttagggatgaagatgaaactacccaacctcgagctcctgagcttgaacgcttaaaa
aaaagacttaatcgccttaaatatttggcgcataagtacaagcgggcggagatcgttcaa
aatgcgttactcgaattatcccatattgccactcaggttccttccctcgaagaattctat
ttaggggttcaccaccacctaaaaaagcttatttctgctgataatttttttatcgctact
ctcgatatcaataccaacactatttcggttcccttctttgccgatgaaaaagatgcccat
cctgcccagctttatcccgagcaatccctatcaacgctgttgcaacaaggattaactggt
tacgtttttcgcacaggaaaaaccctactatgcgatgaatccaaggttgaagagctggtc
gaagcagaggaaatcgtcaatttaggttctccttgccacctttggcttggagtgcccatc
aagcatgaaggcatagtcactgccgtactggtagtacaaacctatgatactaatgtcagt
tatggcgatatcgaggtcgagttaatgacctttatttgtcaccatattgctggcgtgatg
gaaagacttaagcaccaagaacagctagagcaagcaatacaacaacgaactaaagagctt
agccaagcctatgacaagctcaagcaagaagtgtatgaaagacgcagagccgagcggctg
caaaaatccttatttgaaatagcagaactagcaagctctagttcagataatcctgaattt
tatgcacagctacataatgtgattcggcaccttattcctgccaataactgttacatcgca
ctgctaaatgaacaaggtacccacttaaccttcccgttttacgtttcccaattaggtaac
caacaccctgggactcggccattacaggatgggcttacggagtatgtgctcaaacacaaa
cgtccactactgctagaccagaatgatattcatggtttgattgcctcaaaagaaatttac
gctaaggcacccgcacttaatcacactcaaacaatgcatcaatggataggtatcccactg
tttatccatgatgtagtacgaggtgcgctaaccatttatagctttagcatgacccaaaac
taccaaacgaaagacttggagttactcacctttgtgtcacaacatatcggtgctgctatc
gagaaaaaactcgctgcagagtcattacgccgcagctatgaagaactagaggaaaaggtt
gcagctcgtacaactgcactcgctgagctcaataaggacctagagaaagagatccgtcag
cgccgtaatatggaagctaaactcgtccatgatgccaaacacgatgcgctcacaggattg
cccaatcgtgcgatgtttatggagcgtctcaatcaggctatcaaacatgttcgccgccat
agcctagaacagtttgccctgctgtttatcgacctcgaccgctttaagcagattaacgat
actatgggacatttggagggcgatagattcttaattgaaaccgccactcgcttacgcggc
tgcatccgtagcaacgataccttggcaagactcggtggtgatgagtttgttatcctgctc
gataccatcaacggcatcaacgatgcccgtgatgtggccgaacgagtcattcaaaaagtc
tcacaatcctacaaattagggacaatcgagtttcactcaggtgccagtatcggcataacc
attagtggtaataagttagataccagtgaatcgatgctacgtaatgccgacaccgcaatg
taccaagccaaggcgaatggcaaaggttgttatgttatttttgacgatagcgcgtcacag
caaaaaatccaggatattgccttcgagaatgattttaaacaggcgctgcaagcagaggag
ttacaactcaatcttctcccaattgttgatttacagactctacaaccccatgcttttgag
tgtcgattaatttgggagcatcccgtatggggaagtattccgcacgaagttttaagccaa
ttagctgagcaagctaacctcatggttgagttggataagtatgcaattaacttactgaat
aagcattatcaccagctcgttgtgagccatggagataaccttgatttacaccttatgctt
tccagtcaacatcttaaacacaagcatgtacttcgtggtcttaaaaatgcgctcaaacaa
actcagcttcctctcccgcagctatggttattttttaatgaaaaagccttagttcaagaa
acagagaaccacataagcggctttgaattattaaataagcagggggttaacttagggatt
agccactacggaagcggccacagtgcgttaaacagtttgttattcctccctgtaaaaggc
ttaaagcttgatgcgaatatcacgaaacaactgcaagatgaacaacacataaagctgatg
tctgcctatcaaaaggcagcctcaaccttaaacttacaaacctttgttgacggacttcat
caccctgagcaaatcaatatattcaatgcactaggttatcgcttcggccagggtagtgcc
atagcccacccttttaccttagtggaaaccctgcatcaggtttgcgcctaa
DBGET
integrated database retrieval system