Shewanella sp. FDAARGOS_354: CEQ32_20005
Help
Entry
CEQ32_20005 CDS
T04944
Name
(GenBank) TonB-dependent siderophore receptor
KO
K16090
catecholate siderophore receptor
Organism
shf
Shewanella sp. FDAARGOS_354
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
shf02000
]
CEQ32_20005
Transporters [BR:
shf02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CEQ32_20005
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASF17064
LinkDB
All DBs
Position
4450797..4452989
Genome browser
AA seq
730 aa
AA seq
DB search
MKFAKRRNGRVTLGAHVLGSLTIGMAVSAIPAMAAEQAQVADKKVEHIEVNGEYLGYNTR
KVQSGKFTEDLLNTAKTVTVINQDLIKDMGAQSFTDALRATPGITLGTGEGGNPYGDRPF
IRGYDAQSSTFINGMRNVGSQSRETFNIEQIEVLKGPSSVYNGRGAVGGSINIVTKKAQA
EDFINADVAVGTDALKRANVDINHVITDEAAVRVNMMAHDANTPGRDEVTGNRWGVAPSV
TFGLTTPTKVTLEYYHFENHDIPDYGIPYDQATGKPADVDPDNFYGLLSRDFRDTMDDTA
SVLISHDFNNDMQFTSTSIYSRNSNDYIVTNPDDTTGNVANGYVWRNTKSRHSVTKTLAT
QLQLSGEAKLAGMTNRFAVGTELSNERTSNLSYTVDTGNGRNAGCNQAMLDNYNCTLLDN
PNPHDPWVGTITLGTDATVTETDTRSIYAFNTIELTEAWMVNAGIRWDDYTTSAENSTSR
FSNDADFFNYQLSVLYKPAENGSIYAAWGTSSNPPGTSNGDGADRLGSTNADLEPEDTES
YELGTKWDLWEGRLSLNGSVFQIEKNNARVATSGDRNAPQENVGEQKVKGFEIGFSGDFT
KDWHGFGGYTYLDATLESNGYNAALNGNRFPNTAKNSLSLFTTYDITEQLTVGTGAYYMD
KVYGNTANTLSIPSYWRFDLTSSYKMSEFLTLRLNVQNLTDERYYDKAYTAHFANMAPGR
LVMLSADMHF
NT seq
2193 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatttgcaaaacgtcgcaatggtcgagtcacgcttggtgcccatgttttaggttcg
ttaaccatagggatggcggtttctgctatccctgctatggcagcggagcaggcacaagtc
gcagataaaaaagttgaacatattgaagtcaatggtgagtacttgggttataacacccgc
aaagtacaatcgggtaaatttaccgaagacctgctcaatactgcgaaaactgtaacagtc
atcaatcaagatctgatcaaagatatgggcgcgcagagttttactgatgcgctacgagcg
acgcctggtattaccttgggtactggcgaaggggggaacccctacggtgataggccgttt
attcgtggatacgatgctcaatcctctacttttatcaatggtatgcgtaatgtgggttca
caaagccgtgaaacctttaacattgaacaaattgaagtcctgaaaggcccaagctctgtc
tataacggccgtggcgcggttggcggtagcattaacattgtgaccaaaaaagctcaggct
gaagattttattaacgccgatgttgccgtggggactgatgccctcaaacgtgccaatgtt
gatattaaccatgtgattaccgatgaagctgcggttcgtgtcaacatgatggctcacgat
gccaacactcctggacgtgatgaggtcacaggtaatcgttggggcgttgcaccgtctgtt
acctttgggttaacgacgccaactaaagtgacccttgaatattatcattttgaaaaccat
gatattcctgattatggtattccctacgatcaggcgacaggcaaacctgccgatgtcgat
cccgacaatttctatggcttattatcgcgggattttcgcgatacgatggacgatacagct
tcggtgttgatcagccatgattttaacaacgacatgcagttcacttcgacgtctatctat
agccgtaacagcaatgactatattgtgactaacccagacgacaccactggcaacgtggct
aatggttatgtttggcgaaacactaagtcgcgccattcggtcactaaaaccctagcgact
caattgcaactctcgggtgaagcaaaacttgcaggaatgactaaccgttttgcagtcggt
actgaactcagtaacgaacgtactagcaatttgagttacaccgtcgatacgggcaatggt
cgcaacgcgggttgtaatcaggcaatgctggataactacaactgtacgttgctggataat
ccgaatccccacgatccttgggttggtacgattacactcggtaccgatgcgacagtgact
gaaaccgatactcgctctatctatgcctttaatacgattgagttaactgaagcatggatg
gttaacgcaggtatccgctgggatgactataccaccagtgctgagaactcaacctctcga
ttcagcaatgatgctgatttcttcaactaccaattgtcggtgctatataagcccgcagaa
aatggcagtatctacgctgcgtggggcacttcctctaatccacctggcacgtctaacgga
gatggggcagatcgtcttggtagcactaacgccgatttagaaccagaagacaccgaaagc
tacgagttaggcactaaatgggatctttgggaggggcgtttatctctgaatggctctgta
ttccaaatcgagaaaaacaatgcccgcgttgcgacctctggcgatcgtaatgcaccgcag
gaaaacgtcggcgagcaaaaagtcaaaggctttgaaatcggcttttccggtgactttact
aaagattggcatggttttggtggttatacgtatttggacgctaccctcgaaagcaatggt
tacaacgctgcgcttaatggtaatcgcttccctaatacagccaaaaatagtcttagctta
ttcacaacttacgatattaccgagcagttaacggtcggcacgggtgcctattatatggac
aaagtgtatggcaatacggctaatacgctgtcaattccgtcttactggcgttttgatttg
acctcatcctataagatgagcgaattcttgaccttacgcctgaacgttcaaaatctaacg
gacgagcgttattacgataaagcgtacaccgcgcactttgccaatatggcgcctggacgt
ttggtgatgttaagtgccgatatgcacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
