Sphingobacterium sp. 21: Sph21_3188
Help
Entry
Sph21_3188 CDS
T01450
Name
(GenBank) surface antigen (D15)
KO
K07277
outer membrane protein insertion porin family
Organism
shg
Sphingobacterium sp. 21
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03029 Mitochondrial biogenesis [BR:
shg03029
]
Sph21_3188
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
shg02000
]
Sph21_3188
Mitochondrial biogenesis [BR:
shg03029
]
Mitochondrial protein import machinery
Outer membrane
TOB/SAM complex
Sph21_3188
Transporters [BR:
shg02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Sph21_3188
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Omp85
POTRA
Fe-S_biosyn
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADZ79731
UniProt:
F4C3X0
LinkDB
All DBs
Position
3951694..3954024
Genome browser
AA seq
776 aa
AA seq
DB search
MYFFVFIVLTSLFFSSCRSTRLLNDDQALVTKVKLNGINKEFKEGAEAYVQREIRPNSKI
NLFIYNFANSKGGKYRTDKIRNVGEPPSILDSSLVEISRNQIERFLVSKGYFNAEVKSHI
YVRRKKAEIDFDVKQGGVFKIRYIEHEIGDPQVDKLYKQHIARFPVLRPGMRFDADTLVK
ERESIYNLMKHNGYYDYLRQYVRFEVDTNMNSSQADLRLFIDNPEGKSGHTVFKIDSSYV
VIKNSDGEVGINKPDSTQLAHGLEVKDYTQRFRPKPLARYIYPKIGDIFDIEKENLTYDR
LYELNSFRGIRTSYKKKDSTHLTVHYELTPLKRMSNRVEGEYVFTSGRSGFNIGNTYTNR
NLFGGSEQLEIKARFGALFDSQLGGPLWSRIWNRDLQFGANLSIPRLIVPFRIPLVGKNG
MPHTIFSTNWQIFDQLNTYSNRYIINSISYNWYDTKYKLHSVTPISLEYRLGRLDNAFKD
SLQNNGYELYVKSNDRAYFGIGSQYTYTFNTLRLNTYDNFLYFRGALDLSGNTLNLLSKI
INFKKNDIGQNTILNVPYLQYVKTEVDFRIYRHLGGERQFVARINAGIGVPFGNNSEFLI
FEKQFFGGGMNDQRAWQARTLGPGNYNRSILTEDLRNRLRNLDQLGEIKIFSNFEYRFKL
LNDFFGAKLKGATFTDIGNIWRLKESAENPGGEFKFNKFLGQMAIGAGAGLRFDLQYFVF
RFDAGIKVKDPQFEGADQWVITDLFNSREFKRNYKLTNGPDPYNFIQYNFGIGMPF
NT seq
2331 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtatttttttgtattcatagtgctcacatcactatttttctcgtcttgcagatccacg
agattgttgaatgatgaccaggcattggttacaaaggtaaagttaaatgggataaataaa
gaatttaaagagggtgctgaagcttatgttcaacgggaaatccgtccgaactccaagata
aatctcttcatttataattttgcaaacagtaaaggtggaaaatatcgaacggataaaatt
aggaatgtcggcgaacctcccagtatactagacagttccttagttgagatttcccgaaac
caaatcgaaaggttcctggtatccaagggttattttaatgcagaagtcaaaagccatatt
tacgtgagacgtaaaaaggcagaaattgacttcgacgtgaagcagggaggcgtttttaag
atccgttatattgagcatgagattggtgatccacaggttgataaattgtacaaacaacat
attgcacgctttcccgtattgcggccgggtatgcgcttcgatgcagatactctggtaaag
gagcgtgagtcaatctataaccttatgaaacataatggatattacgattatctacgtcaa
tatgttcggtttgaagtggataccaatatgaacagtagccaagctgatcttaggcttttc
atcgataatcccgaaggcaagagtgggcacactgtttttaaaatcgatagtagttatgtt
gtcataaaaaacagtgatggagaagtcggaataaacaaaccggatagcactcagttagct
catggcttggaggtaaaggattatacacaacgttttcgtccaaagccacttgcacggtac
atttatcccaaaattggcgatatcttcgacatcgaaaaggagaacctgacttatgatcga
ttatatgaattaaatagctttaggggaataagaaccagctataagaaaaaagactccacg
catctcactgttcattatgagttgacgcccttgaagcggatgtctaaccgtgtggaaggt
gaatatgtattcacctcggggcggagtggtttcaatattggtaatacttatacgaatcga
aatttattcggcggttctgagcagcttgagatcaaggcacgttttggcgctttgttcgat
tcgcaactcggaggtcctttgtggagcaggatctggaaccgcgacttacagtttggcgct
aatttatccattccacgattgatcgttccttttcgtatcccgttagtaggtaaaaatggt
atgccccatacgattttttcaaccaactggcagatatttgatcagttgaatacctatagc
aatcgctatattattaattcgatctcctataactggtatgatacgaaatataaattgcac
agtgttacgccaatatccctcgaatatcgactgggacgattagacaacgcattcaaggat
tccctgcagaataatggctacgaactttatgtaaagagtaatgaccgtgcctattttggt
attggcagccaatatacttatacgttcaatactttgcggttgaatacatacgataacttt
ttatatttccggggtgcattggatttaagtggtaatacgcttaacttactcagtaagatc
attaattttaagaagaatgatatcggccaaaataccatattgaatgttccgtatttgcaa
tatgttaaaacggaggttgacttcaggatatataggcatctagggggagaacgccagttt
gtggcccgcataaacgccggtataggtgttccttttgggaataattcagagttcctgatt
ttcgaaaagcagtttttcgggggcgggatgaatgatcagcgtgcctggcaggcgagaact
ttaggtcccggtaactacaatcggtcgattttaacagaagacttgagaaatcgactccga
aatcttgatcaactgggagaaattaagattttcagcaattttgaatatcggtttaagctg
ttgaatgatttttttggtgctaaattgaaaggggcaacctttacagatatcggtaatatt
tggcgattaaaggagagcgctgaaaaccccggcggtgaatttaagtttaataagttcttg
ggacaaatggccattggggcgggagccggcttacggtttgacctgcagtactttgttttc
cgttttgacgcaggtattaaagtcaaagacccacaattcgaaggcgctgatcaatgggtt
attaccgatttattcaacagtcgcgaatttaaacgaaactataaactgaccaacggaccg
gatccttataattttatccagtataactttggtattggtatgcctttttag
DBGET
integrated database retrieval system