Spiroplasma helicoides: SHELI_v1c04350
Help
Entry
SHELI_v1c04350 CDS
T04620
Name
(GenBank) type II restriction enzyme
Organism
shj
Spiroplasma helicoides
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DpnII
EcoRII-C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOG60386
UniProt:
A0A1B3SKE3
LinkDB
All DBs
Position
481794..482642
Genome browser
AA seq
282 aa
AA seq
DB search
MNKYEKNFEKFMKALKNTSFELKDYVDFEKIAINVDKVKDELSILNNYIGKTQLDFYNLF
IEKPELKVIIPSLIALRNKKVYTKSKEYVFSENMSNEDLFKAIQEIEFFKLLEFKKITNV
TDYLTGIEVGMDTNARKNRSGTLMEKRCEDILKAKKVKFHKQIDVKKLEEKIPNFNFNEI
QQAFSGKNAPKRFDFMFEFNNKYYLTEVNFFSNGGSKLNETAKSYILLNEIISKYDNIEF
VWITDGAGWNTAKNQIRDAYFKINYLFNLEEFENNSLEFLLD
NT seq
849 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaatatgaaaagaattttgaaaagtttatgaaagcattaaaaaatacttcattt
gaactcaaagattatgttgactttgaaaaaatagctatcaatgtggataaagttaaagat
gagttaagtattttaaataactatataggaaaaactcagctagatttttataacttattt
atagaaaaaccagaacttaaagtaataatacctagtttaattgcgttaaggaataaaaaa
gtctatacaaaatctaaggaatatgtttttagtgaaaatatgagtaatgaagatttattt
aaagctattcaagaaatagagttttttaagttgttagaatttaaaaaaataacaaatgta
acagattatttaactggaattgaagttgggatggacactaatgcaaggaaaaatagatct
ggtactttaatggaaaaacgatgcgaagatattttaaaagcaaaaaaagtaaaatttcat
aaacaaattgatgttaaaaaattagaagaaaaaatcccaaattttaacttcaatgaaatt
caacaagcattttctggtaaaaatgcacctaaaaggtttgattttatgtttgaatttaat
aataaatattacttaactgaagtaaatttcttctcaaatggtggtagtaagttgaatgaa
actgcaaaatcttatatattattaaatgaaattatcagtaaatatgataatatcgagttt
gtttgaattactgatggagcaggatgaaatacagcaaaaaatcaaattagagatgcatat
tttaaaataaattatttatttaatttagaagaatttgaaaataatagtttagaattttta
ttagattag
DBGET
integrated database retrieval system
