KEGG   Spiroplasma helicoides: SHELI_v1c06800
Entry
SHELI_v1c06800    CDS       T04620                                 
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha (PolC)
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
shj  Spiroplasma helicoides
Pathway
shj03030  DNA replication
shj03430  Mismatch repair
shj03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:shj00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    SHELI_v1c06800 (polC)
   03430 Mismatch repair
    SHELI_v1c06800 (polC)
   03440 Homologous recombination
    SHELI_v1c06800 (polC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:shj03032]
    SHELI_v1c06800 (polC)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:shj03400]
    SHELI_v1c06800 (polC)
Enzymes [BR:shj01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     SHELI_v1c06800 (polC)
DNA replication proteins [BR:shj03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     SHELI_v1c06800 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:shj03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     SHELI_v1c06800 (polC)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T DNA_pol3_finger PHP HHH_6 tRNA_anti-codon RNase_H_2 DNA_pol3_a_NI DNA_pol_A_exo1 HHH_3
Other DBs
NCBI-ProteinID: AOG60631
UniProt: A0A1B3SL18
LinkDB
Position
complement(772557..776984)
AA seq 1475 aa
MQDNLKTFLEKMNIYFSEEEEKYFEDAYIFDAFFSINENYLRVFIKLKNFLPINILHKLE
NELINNSYIPTKINFEVEERKYDEELIWKYIEYIKDLKAEVKNGVIKTLSPSTVKYFSDY
NLVKFITGNDMQKDLLEKHKNYYKNKLIKYGFKSIDLEIEVTDDINEDVLKDVNKMFEEA
SKIKFVPVQETKPIFEKPKYKSNKDILDNPSYEKIIDLEENAKNVTIHGKVISKNIRVSK
AGRNIYSIAINDGSSSVQCTYFGKNDAPTFFDEVTEENKEKFEGYENKIIRKGDWVSFNG
NYTYSTFDNCYIFYIDKYKKIQSKSVARKDTADLKRVELHTHTKMSVMDGVSHVNDYIET
AHKWGWKAIAITDHLNVQAFPEAFYSVNKINKSLNDEEKFKLIYGCELSMIEDDYWMVKN
PHNQKMRESKFVVFDLETTGLSPEFDEIIEFGANVYDYAKGSSKKYDILIKPKKPISQFT
TDLTHITNGMLEDKQSIEIEFKNIMEIIKDGILVAHNANFDFNFLNVYAKKLGYGELTNT
VIDTLTISREVKPKLKNHRLGTVAKEFGITYDEKIAHRGDYDAEVLTNVFEHLWTEAKKT
HLIDYVEDWNKFNVDKYINENPKRVRGQHINVIVKNQEGLKDLYKIISHTHTKSFFGSPK
IFKSELLEFRNKKNLLIGSGCSGGLIFDLIRTGTFEMLKKEIANLDYVEIQPLSAYKHLI
QTGDSTLEDIKMYIKKIIEIAKEMNVLVVATSDAHYVEPELKIVREIYISTKGLGGQYHP
LYDFRQRIKDYPDQHLRTTNEMLEEFKWLEDSELIHDVVINNSLKIANQIDNDIKPIKSG
SYPPNIENVDKLLTEECYKNAREIYGEDLPEIVKNRLEKELQSIIKHGFAVVYWISHLLV
KKSHNDGYLVGSRGSVGSSFVATTSKITEVNPLKAHYICKECKFSDFDTPPEYKCGYDLP
KKLCPKCNSELVGEGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQAVAHNFTKEIFGENNVF
RAGTISTVADKTAYGYTMGYFEKQNKNNVPKVEIDRLAELSTGVKRTTGQHPGGIIILPK
EYDVEDFTPVNYPADDETSGWLTTHFDFHSIHDNLLKMDILGHVDPTALRMLQDLTGVDP
ISIPTNDEKVYSLFSNLDALGLKPTQLYGESTGAIGLPEFGTQFVRSMLKETQPKNFADL
VQISGLSHGTDVYVGNAQVLIKDGVANISSVIGCRDDIMVYLMSKNIDPSTSFTIMESVR
KGNGLKKEWIDIMKQHNVPEWYINSCLKIKYMFPKAHATAYVLMAYRVAWFKIYYPEEYY
ATWFSTRSDFFDLEVTIGGLNAVRAKLESFKQRIADKEKLSAKEVGLISTFEVLIEMFER
GISINNLDFNISDATKFVIVKDSKGKKIIYPPFNVIDSLGEAVAKSIVNARKEKQITSIK
DLKNRTQITQTQMAILNKLKVTDNLKDDEQLSFDF
NT seq 4428 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaagataatttaaagacctttttagaaaaaatgaatatttattttagtgaagaagaa
gagaagtattttgaagatgcttatatttttgatgcttttttttcaataaacgaaaattat
ttaagagtattcatcaaactaaaaaattttttaccaattaatatattgcataagttagaa
aatgaactaattaataatagttacataccaacaaaaataaacttcgaagtagaagagcga
aaatatgatgaagaattaatttgaaaatacatagagtacattaaagatttaaaagctgag
gtaaaaaatggtgttatcaaaaccctttcaccatcaactgtaaagtatttctcagattat
aatcttgtaaaatttataactggaaatgatatgcaaaaagatttattagaaaagcataaa
aattattataaaaacaaattaataaagtacggatttaaaagcattgatttagaaattgaa
gttacagatgatattaatgaagatgtcttaaaagatgttaataaaatgtttgaagaggca
agtaaaataaaatttgttccagtccaagaaactaaaccaatttttgaaaaaccaaaatat
aagtccaataaagatattctagataatccaagttacgaaaaaattatagatttagaagaa
aatgcaaaaaacgttacaattcatggaaaagtaatttcaaaaaatattagagtctcaaaa
gctggtagaaacatttactcaatagcaataaatgatggttcatcatcagtgcaatgtaca
tattttggtaaaaacgatgcaccaactttttttgatgaagtaaccgaagaaaataaagaa
aagtttgaaggttatgaaaataaaataatcagaaaaggtgattgagtttctttcaatggt
aattacacatattctacttttgataattgttatattttttatattgataaatataaaaaa
attcagtcaaaatcagttgcaagaaaagatacagctgatttaaaaagagtggagttacac
acacacactaaaatgagtgttatggacggagtaagccatgtcaatgattatattgaaact
gcccataagtgaggatggaaagcaattgcaataacagatcatttaaatgtacaagcattt
cctgaagcattttattcagtaaataaaattaataaatcactaaacgatgaagaaaaattt
aagctaatttatggatgtgaactttcaatgattgaagatgattattgaatggtaaaaaat
ccacataatcaaaaaatgcgcgaatctaaattcgtggtttttgacttggaaacaacagga
ctttctccagagtttgatgaaataattgagtttggagcaaatgtgtatgattatgcaaag
ggtagttcaaaaaaatacgatatacttataaaaccaaaaaaaccaatatcacaattcaca
acagacttaactcatattacaaatggtatgttagaagataaacagtcaattgaaattgaa
ttcaaaaatattatggaaataataaaagatggtattctggttgctcataacgcaaacttt
gactttaattttttaaatgtctatgccaaaaagttaggatatggagaattaacaaataca
gtaattgatacattgacaatttcaagagaagtaaaacctaaattaaaaaatcatagatta
ggaactgttgctaaggaatttggtataacatatgatgaaaaaatagctcaccgtggagat
tatgatgcagaggttttaacaaatgtttttgagcatttatgaacagaggctaaaaaaaca
catttaatagattatgtggaagattgaaataaatttaatgttgataaatacataaatgag
aatcctaagagagtgcgtggtcaacatatcaacgttattgttaaaaatcaagaagggtta
aaagatttatacaaaattatttcacacacacatacaaaaagtttttttggtagtcctaaa
atatttaagtctgagttattagaatttagaaataaaaaaaatcttttgattggttctggt
tgctcagggggtttaattttcgacttaataagaaccggaacttttgaaatgctaaaaaaa
gaaatagccaatttagattatgttgaaatacaacccttaagtgcatataaacatcttatt
caaactggtgattcaactttagaagatataaaaatgtatattaaaaaaataattgaaatt
gcaaaagaaatgaatgttttagttgtagctacaagtgatgctcattatgttgaacctgaa
ttaaaaattgttagagagatatatattagcacaaaaggacttggcggtcaatatcaccct
ttatacgactttagacagagaataaaagattatccagatcaacatcttagaactacaaac
gaaatgctagaagaattcaaatgacttgaagacagtgaattaattcatgatgtagttatt
aataattctttaaaaatagcaaatcaaattgataatgatattaaacctatcaagagcgga
tcatatcctcctaacattgaaaatgttgataagttattgacagaggaatgttataaaaat
gcaagagaaatatatggagaagatttacctgaaatagttaaaaacagattagaaaaagaa
ttacaatcaatcataaaacatggttttgcagttgtttattgaataagtcatttactagtt
aaaaaatcacacaatgacggttatttggttggtagtcgtggatctgttggttcttcattt
gtggcaacaacttcaaaaataacagaagtaaatccacttaaggctcattacatttgtaaa
gaatgtaagttctctgattttgatacaccaccagaatataaatgtggttatgatttacca
aaaaaactttgtccaaaatgtaatagtgagttagttggagaaggtcacgatatacctttt
gaaacttttttaggtttcgacggagataaagttcctgatatagatttaaacttttctggc
gagtatcaagctgtggctcacaatttcacaaaagaaatttttggtgaaaataatgtattt
agagcgggaactatttcaacagtagctgataaaaccgcatatggttatacaatgggttac
tttgaaaaacaaaataaaaataatgtaccaaaagtagaaattgatagattagcagaatta
tctacaggagttaaaagaactacaggtcaacacccaggagggattatcatattacctaaa
gagtatgatgttgaagatttcacaccagtgaactatcctgcagatgatgaaactagtggt
tgactaacaactcattttgatttccattccattcatgacaatttattaaaaatggatata
ttaggtcatgttgatccaacagcattgagaatgttacaagatttgacaggtgttgatcca
atatctattccaacaaatgacgaaaaagtatattcgctcttttcaaatctagatgcatta
ggtttaaaaccaactcaattgtatggtgagtcaacaggtgcgattgggttaccagaattt
ggtacacagtttgttagatctatgttaaaagaaacacaaccaaaaaattttgccgactta
gttcaaatatctggattgagtcacggtactgatgtttatgttggtaatgcacaggtgttg
attaaagatggggtcgccaatatttcatctgtaattggttgtagagatgatattatggtt
tacttgatgtcaaaaaatattgacccttcaacaagtttcacaattatggaaagtgtgaga
aagggtaatggtttaaaaaaagaatgaatcgatattatgaaacaacataatgtcccagaa
tgatatattaatagttgtttgaaaataaaatatatgtttccaaaagcccatgccactgct
tatgtattaatggcttatcgtgtagcgtgatttaaaatatattatccagaggaatattat
gcaacttgattttcaacaagatcagacttctttgatttagaagttactattggtggatta
aatgctgtaagagcaaaattagaatcatttaaacaaagaatagcagataaagagaagttg
tcagccaaagaagtcggtctaatatcaacatttgaagtattaatagaaatgtttgaaaga
gggatttctattaataatcttgattttaatatctctgatgcaactaaatttgttattgtc
aaagatagcaaaggtaaaaaaattatttacccaccatttaatgtgattgattcattgggt
gaggctgttgcaaaatctattgttaacgcaagaaaagaaaaacaaataacaagcattaag
gatctaaaaaacagaactcaaataacacaaactcagatggcaattttaaataaactaaaa
gttacagacaatctaaaagatgatgaacaactttcatttgatttttaa

DBGET integrated database retrieval system