Shewanella halifaxensis: Shal_3819
Help
Entry
Shal_3819 CDS
T00654
Name
(GenBank) amino acid carrier protein
KO
K03310
alanine or glycine:cation symporter, AGCS family
Organism
shl
Shewanella halifaxensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shl00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99977 Transport
Shal_3819
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Na_Ala_symp
LrgA
AA_permease_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABZ78359
UniProt:
B0TVQ6
LinkDB
All DBs
Position
complement(4631003..4632382)
Genome browser
AA seq
459 aa
AA seq
DB search
MEAITDFVGMINGVVWGTPMLVMILGVGLFLTVGLRLMPILKLGTGFKLLWSGRIPDKDK
RMKGEISPFNALMTSLSATIGTGNIAGVATAIFIGGPGALFWMWCTALVGMATKFAEAVL
AVKYREVDDNGNHVGGPMYYIKNGLGSKWAWLGTAFALFGSLAGFGIGNTVQANSVADAL
SSNFGVPNWITGVVLMVLVGAVLMGGIKRIADVAGKLVPMMTVFYIAAGIAVLVVYAAEI
PAAIELILHSAFNPVAAQGGFAGAAVWAAIRFGVARGVFSNEAGLGSAPIAHAAAQTNNP
VAQGLVAMLGTFIDTLIVCSITGLAIIVSGAWTSGENGAALTSFAFSHAFPLGNYVVAIA
LSVFAFTTILGWSFYCEKCVQFLFGVKAIKPFRIVWTLVVPLGAVSSLEFIWLLADTLNA
MMAIPNLIALALLSPVVFALTREYFLKKRETDLESQKAK
NT seq
1380 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagctattactgattttgtaggcatgatcaacggcgtggtctgggggacacccatg
ttggttatgattttaggtgtgggcttatttttaacagtgggtttgcgtttgatgccaatt
ttaaaactcggcaccggatttaaactcttatggtctgggcgtattcccgataaagataag
aggatgaagggggaaattagcccttttaatgccttaatgacctcactgtcagccaccata
ggtaccggtaatattgccggtgttgctactgcgatttttatcggcggaccgggtgcgtta
ttttggatgtggtgtacggcgctggtgggcatggcaacaaagtttgccgaagccgtatta
gcggttaaataccgtgaagtggatgacaatggtaaccacgttggtggcccaatgtactac
atcaaaaatggactaggttcgaagtgggcgtggttagggaccgcttttgcactgtttggc
tcgctagcgggttttggtattggtaatactgtgcaggctaactctgtagccgatgcgctt
agcagtaactttggtgtgcctaattggatcacaggcgttgtgctaatggtattggttggt
gcagtgctaatgggcggtattaagcgtattgccgatgttgctggcaaattagtgcctatg
atgacggtattttatattgcggcaggtattgcggtattggtggtctatgccgctgagatc
cctgctgccattgagttgatcttacacagtgcctttaatccagtggctgcacaaggtggt
tttgccggagcggcggtttgggctgcaattcgttttggtgttgcgcgtggtgtgttctcc
aatgaggcgggtctgggtagtgcgcctatcgctcacgcggcagcgcaaacaaataatccg
gttgctcagggcttagtcgctatgttgggcacatttatcgataccttgattgtttgtagc
attactggcttggcaattatcgtatcgggagcctggacctcgggtgaaaatggcgcggcg
ctcacctcgtttgccttttctcatgctttcccgcttggaaactatgtggtagcgattgcc
ctaagcgtatttgcgtttacgactatcttaggttggagcttttactgtgagaagtgtgtg
cagttcctatttggcgtgaaagcgattaagccatttagaatcgtttggaccttagtggta
ccattaggtgcggtgagttcactcgagtttatctggctgttggccgataccctcaacgct
atgatggcgatccctaacttgatagctttagcattgcttagccctgtagtatttgcgtta
accagggagtattttctgaagaagcgtgagacggatttggaatcgcaaaaagcgaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
