Shewanella sp. MR-7: Shewmr7_0048
Help
Entry
Shewmr7_0048 CDS
T00389
Name
(GenBank) Tetratricopeptide domain protein
Organism
shm
Shewanella sp. MR-7
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_11
TOM20_plant
TPR_17
TPR_Slam
TPR-S
SIR2_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABI41054
UniProt:
Q0I0Q1
LinkDB
All DBs
Position
complement(56438..59131)
Genome browser
AA seq
897 aa
AA seq
DB search
MSNYDVKDLAEYMRRAKRDNKPFVLFTGAGCSKSAGIPLASELVNEINEKHALDLKALSA
TDRHDYGRCMAALTKDDRRELLQDYIQKARINWAHIVQALLLEKGYIQRVLTFNFDNILS
RSCGLLGLYPSIYDFTSANLDLLSLIIDPSIVHLHGQSHGFVQLNTEEETKRHAEKLSQF
VANTLNQSPSIFIGYSGNADAFFPLLKDKFTDQKRLFWVGRSEKAPHHVNENLIAPNNVA
HYLHHEDADRFFIELAQELECFPPKAFDDPYGHLLDQLEPVLDFPTQPHNELDILASTRS
MLKKSQEEREQRARPNFERLLMKGNYNELIVLAKDTELDEEEKAVVAWAEIALGDQLVEQ
AKKAQQQKLFEQSFEKYQAALAIKPDMYEALNNWGIALSELAQLKQEPALFEQSIEKYQA
ALAINPDDHEAINNWGIALSDLAQLKQEPALFEQSFEKYQAALAIMPDDHQTLFNWGIAL
SELAQLKQEPALFEQSAEKYQAVLAIKPDKHEALFNWGNALSELAQLRQEPALFEQSFEK
YQAVLAIKPEKHTALFNWGIALSELAQLKQEPALFEQSIEKYQAALAIKPDKHEALLNWG
NALSELAQLKQEPALFEQSIEKYQAALAIKPDKHTALNNWGNVLSELARLKQEPALFEQS
IEKYQAVLAIKPDEHKALFNWGIALSELAQLKQEPALFEQSFEKYQAALAIKPDEHEALF
YWGIALSELARLKQEPALFEQSFEKYQAVLAIKPDEHEAFFNWGIALSELAQLKQEPALF
EQSAEKYQAALTIKPDKHQALNNWGIALSELAKLQQKTELFEEAKSKFIQARSLTNQPNY
NLACIYSLLHDDFNCREELLACYKTKILPDKNHLNTDSDLDFVRGKEWFKELLDTLP
NT seq
2694 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaactacgacgttaaagaccttgccgaatatatgcgacgagcgaagagagataat
aaaccttttgttctgtttaccggcgctggttgctcaaagagtgcaggtattccactggcc
tctgagctggtgaatgaaattaacgaaaagcatgctctcgacctaaaagcgctctcagca
acagatagacatgattatggtcgctgcatggctgcgttgacaaaagatgacagacgagag
ttgctacaagattatattcaaaaggcaagaattaactgggctcatattgtacaagccttg
ctgttggagaagggatatatccaaagagtcttgacctttaactttgataatatcctttca
agaagctgtggccttctcggtctttacccatcaatttacgattttacctctgcaaactta
gatttattgagcctgattatcgatccctcgattgttcacctacatgggcaaagtcacggt
tttgttcagcttaatactgaggaagaaactaaacggcatgcggaaaagcttagtcagttt
gttgcaaacacactgaaccaatcccctagtattttcattggctatagcggtaatgcagat
gcatttttcccgctgttaaaagataaatttaccgatcagaaaagattattttgggttggc
cgtagtgagaaagctccacatcatgttaatgagaatcttattgctcccaacaatgttgcg
cactacttgcaccatgaagatgccgatcgattttttatcgaacttgcccaagaattagaa
tgttttcctccaaaagcgtttgacgacccatatggccacttattggatcagttggaacca
gtgcttgactttccaacccaaccgcacaacgaacttgatattctggcctcaactcgaagt
atgctaaaaaaatctcaagaagagagagagcaaagagcgagaccaaactttgagcgacta
ttgatgaaaggtaactacaatgagctcattgtcttggccaaagatacagaactggacgaa
gaagaaaaagcggtcgttgcttgggcggaaatcgctcttggggaccaattagtagaacaa
gcgaaaaaagcgcagcagcagaagttatttgagcaaagttttgaaaagtatcaggccgca
ttggctattaagcctgacatgtatgaagcccttaacaactggggaatagccctttcagag
ttagcacaacttaaacaagagccagccttatttgagcagagtattgaaaagtatcaggcc
gcattagcgattaatcctgacgaccatgaagccattaacaactggggaatagccctttca
gatttagcacagcttaaacaagagccagcattatttgagcagagttttgaaaagtatcag
gccgcactagcgattatgcctgacgaccatcaaacccttttcaactggggaatagccctt
tcagagttagcacagcttaaacaagagccagcattatttgagcaaagtgctgaaaagtat
caggccgtgttggcgattaagcctgataaacatgaagcccttttcaattggggaaatgcc
ctttcagagttagcacagcttagacaagagccagccttatttgagcagagttttgaaaag
tatcaggccgtgttagcgattaagcctgagaagcatacagcccttttcaattggggaata
gccctttcagagttagcacagcttaaacaagagccagccttatttgaacaaagtatcgaa
aagtatcaggccgcgttggcgattaagcctgataagcatgaagcccttttaaattgggga
aatgccctttcagagttagcacagcttaaacaagagcctgccttatttgagcagagtatc
gaaaagtatcaggccgcgttggcgattaagcctgataagcatacagcccttaacaactgg
ggaaatgtcctttcagagttagcacggcttaaacaagagccagccttatttgaacaaagt
atcgaaaagtatcaggccgtattggcaattaagcctgatgagcataaagcccttttcaac
tggggaatagccctttcagagttagcacagcttaaacaagaaccagccttatttgagcaa
agttttgaaaagtatcaggccgcgttggcgattaagcctgatgagcatgaagcccttttc
tactggggaatagccctttcagagttagcacggcttaaacaagagccagccttatttgag
cagagttttgaaaagtatcaggccgtgttggcgattaagcctgatgagcatgaagccttt
ttcaactggggaatagccctttcagagttagcacagcttaaacaagagccagccttattt
gagcagagtgctgaaaagtatcaggccgcgttgacaattaagcctgacaagcatcaagct
cttaacaactggggaattgccctttcagaattagcaaagctacaacaaaaaacagagtta
tttgaagaggcaaaatctaagttcatacaagcccgctcacttaccaatcaaccgaactat
aacttggcttgcatctactctttactgcatgatgatttcaattgtagagaggaactactc
gcctgctataagacaaaaatattacctgataaaaaccatttgaacactgattcggacttg
gattttgtaaggggtaaagagtggtttaaagaattattagatactctaccgtaa
DBGET
integrated database retrieval system