Shewanella sp. MR-7: Shewmr7_0478 Help Entry Shewmr7_0478      CDS       T00389                                  Name (GenBank) MSHA biogenesis protein MshQ   KO K12287   MSHA biogenesis protein MshQ Organism shm  Shewanella sp. MR-7 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:shm00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02044 Secretion system [BR:shm02044]     Shewmr7_0478 Secretion system [BR:shm02044]  Type II secretion system   MSHA pilus biogenesis protein    Shewmr7_0478 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  DUF6701 DUF7305 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  ABI41481 UniProt:  Q0HZH4 LinkDB All DBs Position 541212..544979 Genome browser AA seq 1255 aa AA seqDB search MVRCLAFLNLAQLNKAHYMRWVASNLLLLFYFFSLPSAYAAIDCNSVFPGPIQSFSSSGE LYMQSNALVENYNALDVCFKKVKNFHEMNASACGIGKCQITGTPSLARAAPTFVSSSTSA SNVVANWTTPVVELGTTVGYGQRFDSSRWDIGQLTINTGGNVTVSDTYSTYVIKDLTFYN SGTMTLKAGKTYIIDGDLNLNSGILNIVGTGDTKLYIKGNFTIALSSVFNAPTSLDVYVG QKLELQSNAQIQGSYYVADDAVLQNSAVLIGRLSAKNVTLQSSSKVIYDAGTPPLQCFND NFSQSALSNDWVVSRSSGSFTPAIVSGRMRLTEAKSNQSTASTYQRLFPAANNLVEIQFE HYAYGGSGADGIAVVLSDAAITPQPGAFGGPLGYGFKPGINGFAGGWLGVGIDEFGNFSG EGGSINLSGQRRQSVAVRGSGSGTSGYRYLRGTCNNGTTNTSGNCLSPTVDGNNVSPAHR YKITIDSQVSGQSMVKIERNTGSGFVTLIPAFNAIDQQGQAATPSDFLLSLTGSTGGSNN NHEIDNVQICALRSNPIGAQIDHFEFDHTGQGLTCNPETVTIRACANASCSQLFTDPLTA TLLPESTSEGIWIGGNQVSFNNGSTQLQLRRNTPGVVTLGVKGSNPTTKPLSKTLCRIGN GGLSENNCSLTFADSGFVFDVPDKRANRPEQVLVKAVKKSDVTQQCVPSFQSQTKTLNFW SSYHTPSAPISPKAVTINNTAIGTSSASPTTLNLKFDTNGQASISVNYPDAGKLQLDAQY IGSGNEQGLVMTGSDQFVSVPAGLCVKPVDASASCPSADMSCNAYRKAGQNFGMTVQAMA WEDDRDTDFCSGNLPTPNFSDQAMTLTSKVFAPNIASGGHDGALGVASYSHAIQANNLNS ITNQTISEVGVFQIAAQASPNYLGVASSLNIPIGYSANIGRFVPDRFLVGDISVVPACGS FSYMDQLFPMSMSLKALNIGGAVTQNYFPPFSLATAKLVGENNNNGIDLQSRLSALPVNA ASWVQGVATVDGTYRAYLNRVTPNVTTNLYQDGPFELLDIGVQLMDNDPRPNGLFSYVAS PDMNAATTGNCTNCNAKKITSQILRHGRVVMDNTYGPETEILRMPTRAEYWNGTNWVLNG DDSCTIATYSLESQVDNAGLGYNFDPDLTTGQSINRSGATSAFQAGQFDLLWRALTSSGN LYRGQVTAPLNVPSWLEWYWDWNGLSPTSLSDPRASAFFGRYRGHDRIIYWREVN NT seq 3768 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt gtggttagatgtttagcgttcttgaatttagcgcaacttaacaaagctcattacatgcga tgggttgcatctaacttgctgctattattttattttttttcattgccgtctgcttatgcc gcaattgattgtaatagtgtatttccggggccaatacaaagttttagcagtagcggtgag ctttatatgcaaagcaatgcacttgttgaaaattataatgctttggacgtttgctttaaa aaggtaaaaaatttccatgaaatgaatgcaagtgcatgtggtatcgggaaatgccaaatt actggaactccgagtttagcaagagccgcacctacgtttgtcagtagttctacttctgca agcaatgtagtcgcaaactggactactcctgttgtagagcttggtactacagttggttac ggtcagcgattcgacagcagtcgttgggatataggccaattaactatcaataccggaggc aatgttactgtatcagatacctattcaacatacgttataaaagatctgaccttttataat tcaggtacgatgaccttaaaagctggtaaaacttatatcattgatggagatctcaatctt aattcaggcattttaaatatagtaggtacgggtgataccaagctatatatcaaaggtaat tttaccattgcgctgtcatcagtttttaatgcaccaacctccttagacgtatatgttggt caaaaactagagttacaaagcaatgctcagattcaaggtagttattatgtagcggatgat gcggtgttacaaaatagtgcggtattgattggtagactaagcgctaaaaatgtcaccctt caaagtagtagtaaggtcatttatgatgctggcacaccaccgcttcaatgttttaacgat aatttctctcagagtgccttaagtaacgactgggtagtatcccgtagcagtggttcgttt actcctgctattgtcagtggccgtatgcgtttaaccgaggccaaatccaatcaatccact gcctcgacctatcaaagattattccccgcagccaataacttagtcgagatccagttcgaa cactatgcctatggcggtagtggtgccgacggtatcgcggtggtgttatcagatgcggcc atcaccccccagcctggcgcttttggtgggcctttaggttatggctttaaacccggtatc aatggctttgctggtggttggttgggcgtcgggatcgatgagtttggtaacttctccggc gaaggcgggagcataaatctttcgggacaacggcgtcagtcagttgctgttcgcggttct ggttcgggtacatctggttaccgttatctgcgtgggacttgtaataatggcacgaccaat accagtggcaactgtttatcacccacggtcgatggcaacaatgtctcgcctgcgcaccgc tataaaatcactatcgactcgcaggtctcgggtcagtcgatggtgaagattgaacgtaat acaggttcggggtttgtcaccttaatccctgcttttaatgccatagatcaacaaggacaa gcggcgacgccgagtgatttcttgttgtcgcttacaggctcaactggtggctcgaataac aaccatgaaattgataacgttcaaatttgtgccttgaggtctaatccaattggtgcgcaa atcgatcattttgagtttgaccatacggggcagggattaacctgtaatcccgaaaccgtg acgattcgagcctgcgctaacgccagttgtagtcagctttttactgaccctttgacggcg accttgttacccgaatccacctcagaaggcatatggattggcggcaatcaggtgagcttt aacaatggcagcactcagttgcagctaagacgtaacacccctggcgttgtgaccttgggg gtaaaaggttcgaacccgacaaccaaacctttaagtaaaaccctttgccgtatcggtaat ggggggctgagtgaaaacaactgttcacttaccttcgccgacagtggttttgtcttcgat gtgcctgataagcgtgcgaatcgccccgagcaagtgttagtcaaagcggtgaaaaaatcc gatgtgacacagcagtgtgttccaagcttccaaagccagaccaagacattgaatttctgg agcagttatcacactccgagtgcgcctatttcgccaaaagccgtcaccatcaacaatacg gccattggcacttcaagcgcctcgcctactacgctgaatctgaagtttgatactaacgga caggcaagcatttcagtgaattatcccgatgcgggcaaattacaactcgatgcccaatat atcggcagtggcaacgagcaaggcctggtgatgacaggctcggatcaatttgtcagtgtg cctgcggggttgtgcgtcaaacccgtggacgccagcgccagttgtccaagtgcggatatg agctgtaatgcctaccgtaaagcgggacagaatttcggtatgacggtccaagctatggct tgggaagacgaccgcgatacggacttttgctcgggcaacttacctacgcctaactttagt gaccaagccatgacactaaccagtaaagtctttgcgccaaacattgccagcggcggccat gatggcgcattaggcgtggcatcctatagtcatgctatccaagccaataaccttaatagc atcaccaatcagacgattagcgaagtgggggtattccaaatcgcggcgcaggcgagtcct aactaccttggggtggccagcagcttaaatattccgattggctattcagccaatattggc cgctttgtgcccgacagatttttagtgggcgatatttctgtcgtacctgcctgtggcagt tttagctatatggatcaactcttccctatgtcgatgagcctcaaagccttaaatatcggc ggcgcggtgacgcagaactatttcccaccattctccctcgcgaccgccaaattggtgggg gagaacaataataatggtatcgacttacagagtcgcttaagcgctttgcccgtcaatgcg gcgagttgggttcaaggtgtggcgactgtcgatggcacttaccgagcttatttaaaccga gtgaccccgaatgtgacgacgaatttatatcaagatggtcccttcgagctgctcgatatt ggcgtgcagttgatggataacgatcctcgacctaatggactttttagctatgtggcatcg cctgatatgaatgctgcaaccacgggtaattgcacaaactgtaatgccaaaaaaatcacc tcgcagatcctgcgccacggcagggtggtgatggacaatacctatggtccagaaactgaa atcctcaggatgccgacccgagccgaatattggaatgggactaattgggtattaaatggc gatgatagctgcactattgctacctacagccttgagtcgcaggtggataatgcagggctg ggttataactttgatccggatttgaccacagggcagagcattaatcgctccggcgctaca tcagcattccaagcggggcagtttgatttgctgtggcgagcgctcacctcaagtggcaat ttatatcgcggccaagtgaccgcgcctttaaatgtaccgagctggttagaatggtattgg gattggaatgggctctccccaactagcttatccgatccccgcgcgagtgcattttttggt cgttaccgtggccatgacagaatcatctactggcgagaagttaattaa

DBGET integrated database retrieval system