Shewanella sp. MR-7: Shewmr7_1180 Help Entry Shewmr7_1180      CDS       T00389                                  Name (GenBank) YD repeat protein Organism shm  Shewanella sp. MR-7 SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  SpvB RHS_repeat FG-GAP_3 TcdB_toxin_midN DUF6443 DUF7648 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  ABI42179 UniProt:  Q0HXH6 LinkDB All DBs Position complement(1373948..1381261) Genome browser AA seq 2437 aa AA seqDB search MLPLWTPHRHSSFAAFILLLGLSVGAPSEAALTKPDVEIDPILPSIPLPVAIPSLSGSRF SSSVELRWSIDCSVTAVNIQESINNQSWTTIYTGLGQADNTAAYATFAVGGDVCSGDWSS KRLLQLPNKTLPGYYYRINACKGSLCSAYSPSILVGTPSAPSTPSAPASISTPATNTTGA FSVSWAGVSGATRYELQQRINGGVWVAKYSGTATSYALSGLASGTYQYQARACSTACSAW KLSSNTQVSLPVLGSDWKNLSRVTVADAGGSDIEPAEVVDLNAAAVKGQAGVSGGQASYH IPIDLPPGRNGVQPSISLSYNSQGGNGILGVGWSLNAGSSISRCGATFAQDGFTRAVTFN ASTDRLCLDGQRLIVASGSYGASNAEYRTEMDSFVKVVQHGNINDSNSSFTVYKPDGSRA TYGANANSRFVPSGLSTALSWKVTQESYSNGANTIDYQYDTSVAGEHLLSQILYTGSLGA LGDRNITFYYQPRTDKRKSYLAGGLTTSTRLLSELKVNGAGGQSVHQYQFDYQLSPASGR HLLRALAQCDALGHCTPQTQLTWRDSASTVKADELLIGGQAVFSGELDINKVTPHGDANG DGSTDFPGYDSNAEQDMLGQNGFTHEKACYNDYVSDGWICVAFDADHDGKVDPFKSINNI LHIQLSASGAASYVSTGIPFNPNRFPSPDRLMSATDLNGDGDVDLMVFTVVSGKGYWRAY LNTGNASTPYSANSFQLIHETAIDPKLGSWPARPEVDVTMAGDIDGNGMVDFVVSSLGGS GAANAPVPVLRSFILNNSTPQQWSVQWSSAPTYPFHTGDGFHFFQKLIDINGDELADIIS WRMVNNDRVIGYELNQGRATFAPWVAFAGNLHLKERFHSVVVTAQEPMDVIYPQYFDSMQ TADIDLDGIEEILLPGQRVITGCAYVMFPGGTSGSGIKRTLCGDALYGDLPVNSFNTVPS KPITSSDFDDSIYQYDAIKFVLQVDGRWGLVKQSTPYYGSAHESRLVDTFGDGLVDMLTT YGPRVPGTGQFNETWIQNPGSSMWGTRYGAYLSRNYGSGNGQTTNDYAATDYLQAVTDGL GNRSEWRYRPLSTGEGSADQAKLYTTDHNEVGSGYVHFASSMYVVQSFKQSNGQSGENET QYAYKGAMYNLQGRGFTGFNQIWEKDMQRDKTVHSVFKQKFPEVGLLMSQTVVAPNKNGV KGTVVELKNTWVDNPQHKASLVRSKGVHHNIQTSSLQKSWDLDDGSLMSEIKQTVGTSPT DVDEWGNIKKQTQKVTDYIKGQANTYTSVTETGFVPDVNNWWLNKFNWIKTSHNTAQRNW GDDPVGTMDKAQWQLQTVNTWDSNHKLPTKVTYTGSNSSCNRVEETELNSYGLPRWTKTT GQSSTCSAMTARQTSFTYTKDGTTQVDDGYLPYKVINAKGHITTTEYDMGLGLPTKVIAP NNIVTQTEYDGIGRPVQVKQTGSPTRYLRYLLANEGNNPPQDNDNIPVMMTRTSGAGMPE TEQYFDGQGRLLRTATQGFDGGYQYQDKHYDALGRLTRESTPYGNGTAADYTEFSNFDAL DRPGRRTIPNGRSGGLESLYSYNGLTTDINVEGRLMSRTYGSQGWLYETVDAQNGTNRFA YDSAGRPLVIRDANNSDIKATYNGFGHKTQVIDPNQGTTNFGYNSVGELDKQTDANGVVQ TYVLDVLGRVTSKTTTGGSAPGTATFVWDTPKQGLLTSETENGVARTYAYTTALQLAQTT VTVDGVSRTVKHQYDGFYGRPKALEYPNGLTLKYAYNDYGYLEQTSNAASGYLYRQVTAM DEAGHTTGADLANRVMSESRSYYSEGTMASVAVDGPLGRIHAHYYDGYDDFMNLTSERDG VTGLTKSYRYDTLNRLTEYQFSNTNPTFSATVNYGYDKVGNFLKKTDYSANSSTAYRYGG SACGYKPNAVCQLDKLNGTTVSFQYDNRGNLRVGDGLTMTYNAMDKPLSVSGRGATTSFV YGSDNMRAKQSRTVGSATTTTYYVDKYYEADSDGSWRAYLDDIAVLSYTSQRGHLLQFTL KDRLGSATTLADQNGNIVSQRYFDPFGRTASTGGGHRTDIVNKNTLQSKLQDLDITNKNR RGFTDHEHLNEQQLIHMNGRVYDYNIGRFLSIDPFIQSPGDSQSINPYSYLMNNPMAGTD PTGYCAAATGSHIKDCGDLKVEVKVDGKTVGSTVVKDVNLKNGADVSSAMSKGVAQIGQA IADVGSQKSIAKQQSVNEQSATSGRHKGDFRINEHSLREMIADPGTYGAGLANVAGSLHD DELRDILGDSYGSFRSELENAFNTGWDKAMLAKSIMAPGFMASSAMGFMQALGGYTRSSS IIRQQIQSARTYTRPNGAVYHEVSPTRLIVSENHIGDISKVLQSHNGTLNLFNRNFWQHV LPHRHIYDAAKAPTPKANMRKAFEKAGAEKTTVWQWE NT seq 7314 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgttgcctctgtggacaccgcaccgtcactcatcttttgccgcttttatattgctattg gggttgtctgtgggggcaccgagtgaggcggcgctgacaaaacctgatgttgaaattgac cctatattgccaagtattcctttacctgtagcaataccttctctttccggtagtcgtttt tcgtcaagtgtcgaattacgctggagtattgattgctctgtcactgccgttaatatccaa gaatccatcaataatcagtcttggacaacaatctatactggattaggtcaagcggataat acagctgcctatgctacgtttgctgttgggggggatgtttgcagtggtgattggtcaagc aaacgattattgcaactccctaataagaccctcccaggttattactaccgcatcaatgct tgcaaaggttcattgtgtagcgcttatagcccttctattcttgttggcactccttctgcg ccttctaccccctcggctccagcctctatctcgactcctgcaaccaatacaacaggggcg tttagcgtttcttgggctggcgtcagtggcgctacgcgttatgagttacagcaacgcatt aatggtggcgtatgggttgcgaaatattctggtacggccaccagttatgcattgtcggga ctcgcttcgggcacctatcaatatcaagcgcgggcttgctcaacggcgtgcagtgcctgg aagttatcaagtaatactcaggtcagtttgcccgtgcttggtagtgattggaaaaaccta tcgcgggtgacggttgccgatgcgggcggtagtgatatcgagcccgctgaagttgttgat ttaaatgcagcagcggttaaggggcaagctggcgtctcgggtggccaagcaagttatcac attcctatcgatttaccgccaggacgtaatggtgttcagccttctatatcgcttagctat aactcccaagggggtaatggcattttaggtgtgggttggtcactcaatgctggctcaagc attagtcgctgtggtgcaacctttgcgcaggatggttttacccgtgcggtcacctttaat gcctcaaccgataggttgtgtcttgacgggcagcgtttaattgttgcgagtggcagttat ggggcaagcaatgctgaatatcgcactgagatggattccttcgttaaagtggtacagcac ggcaacattaatgacagtaacagcagttttaccgtctataaacctgatggtagtcgagcc acctatggcgcaaacgccaatagtcgctttgtgccaagcgggttaagcacagcactcagt tggaaggtgacccaggagtcttattccaatggtgctaataccatcgattatcaatacgat acgagcgtggcgggtgagcatcttcttagccagattttatatacaggtagtttgggcgca ttaggtgataggaatatcacattttattatcagcctcggactgacaagcgtaaaagttat ctggccggagggctaacaaccagtactcgtttgttatcagagcttaaggtcaatggtgca ggaggacaatcagttcatcaatatcagtttgattatcaactgagtccggctagcgggcgc cacttattacgagcgctagcgcagtgtgatgcattaggacactgcacaccgcaaactcaa ctgacttggcgcgatagcgcatcgacagttaaggccgatgaactccttattggtgggcaa gcggtattttcaggtgagttggacattaataaagtgaccccgcatggcgatgctaatggt gatggttccaccgatttccctggatatgactcaaatgcagagcaggacatgctgggtcaa aatgggtttactcatgagaaagcttgctataacgattatgtctccgatggttggatttgt gttgcattcgatgcggaccatgacggtaaagtcgacccctttaaatccatcaacaacatc ttacatattcaattatctgcatcaggggcagcttcgtatgtgtcaacgggcatccctttt aatccgaatcgctttccaagccctgataggctaatgagcgcgactgacctcaacggagat ggggatgttgacctgatggtctttactgttgtgagcggtaaaggctattggcgggcttat ttaaatacgggtaacgcatcaacgccttattccgcgaattcctttcaattaatccatgag accgcaatagaccctaaactgggaagttggccagcaagacctgaagttgatgtcactatg gcgggtgatattgatggcaatgggatggtggattttgtggtgtcaagcttgggcggcagt ggtgcggcgaatgcccctgtccccgtgttgcgaagtttcatcttaaataacagcacaccg caacaatggagtgtgcaatggtcaagtgctccaacttatccattccatactggggatggt tttcattttttccaaaagctgattgatattaatggtgatgaattagcggacattatttcc tggcgcatggtaaataatgaccgcgtgattggttatgaacttaatcagggacgcgccacg tttgccccttgggtggcttttgcgggcaatctacatttgaaagagcgtttccattcggtg gtggtcacggcgcaagagcctatggatgtaatttacccgcaatactttgacagcatgcaa acggctgacatcgatttagatggtattgaggagatattacttccaggtcagagggtgatt acaggttgtgcctatgtgatgtttcccggtgggacttcgggcagcggcatcaaaaggaca ctctgtggtgatgcgctctatggggatttgcctgtaaacagttttaatacggttcccagc aaaccgattaccagttcagattttgatgattcgatttatcaatacgatgcaattaaattc gtgttgcaagtcgatggccgctggggcttggtaaagcaatccaccccatattacggctct gcccatgaatcccgcttggtggatacatttggggatggtctggttgatatgctcacaacc tatgggccacgcgtgcctggcacgggacagtttaacgaaacgtggatacaaaacccgggt tcaagcatgtggggcacgcgctatggcgcttacctcagccgtaactatggctctggtaac ggacaaactaccaacgattatgctgctacagattacctgcaagccgttactgacggtcta ggtaatcgtagcgaatggcgttatcgcccactgtcaaccggagaaggcagtgctgaccaa gctaagctttatactacagaccataatgaggttggttccggttatgtccatttcgcctcc agtatgtatgtggtgcagtcctttaagcaaagcaacggacagagtggcgaaaatgaaacc caatatgcctataaaggcgcgatgtacaacctacaaggacgtggctttaccggatttaat caaatctgggaaaaggatatgcagcgggataagacagtgcatagcgtcttcaagcagaag tttcctgaggtgggattgcttatgtcacagacagtggtcgcaccgaacaaaaatggtgtc aagggcactgtggttgagctgaaaaatacctgggtcgataacccgcagcataaggcaagc ctagtgcgcagcaaaggtgtgcaccacaacattcagaccagctcgctgcagaagtcctgg gatctggatgatgggagcctgatgtcagagataaagcagacggtaggaactagccctacc gatgtggatgagtggggcaatattaaaaagcaaactcaaaaagtgactgattacataaag ggtcaggcgaatacctataccagtgtgacggaaacaggttttgtgcccgatgttaataat tggtggctcaataagtttaactggataaagacgagccacaatactgcgcagcgcaactgg ggagatgacccggttggcacgatggataaggcgcagtggcaattgcaaacggtcaatacc tgggatagcaatcataagttacccactaaagtgacttatactggcagtaatagtagttgc aatcgcgtcgaagaaaccgaactaaacagttacggtctgccacggtggaccaaaaccaca ggacaaagcagtacgtgtagtgccatgactgcaaggcaaacgagctttacctacaccaaa gacggcacaactcaggttgacgatggctatctgccttacaaggttatcaatgccaagggg catatcaccacaaccgaatacgatatggggctaggactccccaccaaagtgatagcgccc aacaatatcgtcactcaaacagagtacgatggtatcggtcgtccggtgcaggtcaaacag acaggcagtccaacccgctatttacgctatttactcgccaatgagggtaataatccgccc caggacaacgacaatattcctgtgatgatgacccgcaccagtggtgccggtatgcctgaa acggagcagtattttgacggccaaggtcgtttgctgcgcacggcaacccagggctttgat ggggggtatcagtatcaggataaacattatgatgcgcttgggcgtttaacccgagaatcg acgccctatggtaacggcacggcggcagactataccgagttcagtaattttgatgcgctc gatagacccggcagacgcaccattcctaatgggcgctccggtgggctggagtccctatac tcctataacgggttaaccacggatatcaatgtcgaaggacgcttgatgtcgcgcacctat ggtagtcaaggctggttgtatgaaaccgtggatgcacaaaatggcaccaaccgctttgcc tacgatagtgccggtagaccgttagttatccgcgatgctaacaatagtgatatcaaagca acttacaacggttttggccataaaacccaggtcattgaccctaaccaaggcaccaccaat tttggttacaacagcgtaggcgaattggataagcaaaccgatgccaatggcgtggtacaa acctacgtactcgatgtactggggcgcgttaccagtaaaaccaccacgggcggcagtgcg ccaggtacggcaacttttgtgtgggacacgcccaaacaaggcctactcacttctgaaact gaaaacggcgtcgctcgcacttatgcttacacaactgcactgcaattggcgcaaaccacg gtgaccgttgatggtgtaagtcgtacggttaaacatcaatacgatggcttttatggtcgt cctaaggcactcgaatacccgaacggcttaacactcaaatatgcctataacgattacggt tatctcgagcagaccagcaatgctgcttctggctatctctatcgtcaagtcacagccatg gatgaggcaggccataccactggcgctgaccttgctaaccgggtgatgtctgaatcacgc agttattacagcgaaggcaccatggcaagtgttgcggtggatggcccgcttgggcgtatt catgcgcactactatgatggttatgatgattttatgaatctcaccagtgagcgtgatggg gtgacaggcctaactaagagctaccgttatgacacgcttaatcgcctaaccgagtatcag tttagcaataccaatccgacctttagcgccacggtcaactacggctatgacaaggtgggt aacttccttaaaaagaccgactacagtgccaatagcagcactgcctaccgttatggcggc agcgcctgtggctacaagccaaacgcagtgtgccagctagataaactcaatggcaccaca gtgagttttcaatacgataatcgcggtaatttacgtgtgggtgatggtctcaccatgacc tacaatgccatggataaaccactgagcgtctctggccgtggtgccaccacgagctttgtc tatggcagcgataatatgcgcgccaagcaaagccgcacggtcggcagtgcaacgacaacc acttattatgtcgataagtattatgaagcagacagtgatggtagctggcgtgcctacctt gatgatatcgctgtactcagttatacctctcagcgtggtcatttgttgcaatttactctc aaggaccgcctcggcagtgccaccaccctagccgaccaaaatggcaatattgttagtcaa cgctactttgacccctttggacgaaccgcatcgacgggcggtgggcatcgtactgatata gtgaataaaaatacgctgcaatcaaagttgcaggatttggatatcaccaataagaaccgc cgcggttttaccgatcacgagcatctgaatgaacagcagttaattcatatgaacggccgg gtttatgactacaacataggccggttcctctctatagatcccttcatacaaagtccgggg gatagtcaatcgatcaacccgtacagctatttgatgaacaacccgatggcaggcaccgac ccgacggggtactgtgctgcggcgacagggtcacacatcaaagattgtggcgatctgaag gttgaggtgaaggttgacggtaaaaccgtcggcagtacggtcgttaaagacgtcaatctc aaaaatggtgcggatgtcagtagcgcaatgagcaagggggtcgcacaaattggccaagct atcgctgatgtgggaagccagaagagtatcgctaaacagcaaagcgtaaacgagcaaagt gcaacgagtggaaggcataaaggtgacttccgtataaatgaacactctctacgtgaaatg atcgcggatcctggtacatatggggcgggtctagcaaatgtggcaggctctcttcatgac gatgaactaagggatattctcggtgatagttatggtagcttcaggtctgaattggaaaat gcttttaatactgggtgggataaggccatgttggctaagtcgatcatggctcctggattt atggcttctagtgcaatgggctttatgcaagctctcggtggttacactagaagtagcagt attattcgacaacagatacagtccgcacgaacctataccagaccaaatggtgctgtttac cacgaggtgtctccgacacgattgattgtatctgaaaaccatataggtgatatttcgaag gtacttcaaagccataatggaactcttaatttattcaacaggaatttttggcaacatgtt ttaccgcatcgtcatatttatgatgctgcaaaggcgccaacacctaaagcaaacatgaga aaagcatttgaaaaagctggtgctgaaaaaacaacagtctggcagtgggagtaa

DBGET integrated database retrieval system