Segatella hominis: KUA50_001850
Help
Entry
KUA50_001850 CDS
T09571
Name
(GenBank) autotransporter-associated beta strand repeat-containing protein
Organism
shoi
Segatella hominis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RGL11_C
RGI_lyase
PATR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOZ81736
LinkDB
All DBs
Position
463635..468245
Genome browser
AA seq
1536 aa
AA seq
DB search
MNKKLLATSALALLVSMGANAQRFTDKLDRGLIAVQTTNGVYCSWRIQADEYYDVKYNLY
RNGMKLNSEPLDVSNFTDKSGSSSNTYTVKAVVNGVEQAASKAATVFNSNYKEIKIQYPA
ALKSTYIPNDACCADVDGDGELEILMKFTNQQEGEQLYPKNGPTINGVETKEYTMLACLK
QDGKILWWVNCGPNMGDFQNNEQNIVGYDWDMDGKAEVVMRLEEGSTVHMADGTTYTIGA
DGKNGSTWTNYRQPKAEGSVEWFTHYGKEFLWYCEGATGKPYQCIDFPLKRLEAGETDLK
TAWGDGYGHRSSKYFFGAPYLDGKHPSIFLGRGIYTRHKFIAYDVDPNTHALNVRWKWTN
NQPGSPWYGQGYHNYIIADVDWDGRDEIVWGSMVIDDNGKGLSTTGLGHGDAQHVSDFNP
YIHGQEMFACNEDAPSNNYRDATTSKIYYRKTDTNDDGRCLAGNFYNDIPGAVGHSAHDT
PISTVTNEHVSPNTNGLSMNFRIYWDGDLQEECFNNTEVTKPGQGTIATFTGAYSNNSTK
ATPCFQGDVFGDWREEVIERTADNNIRIYTTTTPTPWRNYSLWYDHQYRNAMVWQPCGYN
QPPHASYFLGELEGITIAPPPLTTRGREEVGSSISKSLDGKHALLSTNGDATVAVADGAA
PAIFIDNAPSWVQGTAASECKVKDTEIKYTYYTHTLTGGAFSGNMRLVKQGDGTLVLPNV
TQTYTGKTDVWAGTLQFDGTMEKSPVWLNRFAELNSNGGNFKGGIKADYGSIIRPGGKDQ
VGTLITSDLQLGFGARVIFDVNGGNVDKLVAGKMSIEKKNWANGPQYSAPVFEFTSAPQP
GTYTLAEVGELTGKLADITVEGLSGEKYSLKYADGKLTIRVSDSRDSESVVWTGANGSIW
DLMESENFASSDNKFVSGDNVTFNDAAVKTDVEINEDLAPGNIVFNNNSKVYTLSGKGAI
EGNGSVTLKGKSAVNIKNTNRYTGGTYIDGGYLRPATLANKDGLEYGSLGAADNTITMSN
QGKLWVNASMTSSHPIVLGENGGQIETYTGTNLIVNGGISKMNKGANRDLYKLGSGTLQL
NCAADFDKLYINAGTVYDFQDAHFNGKTIVLNGSKVVLQASNSIYSNNSDNVNIEVPKGK
SGIWYPDGRCDYTGKLTGEGTIDIYGTWIRCSFKGDWSKFAGTINAKRGTKNAYEPVFDF
NNAYGIPLATLNVDSRFTKDYAFCTNGKSFAIGALTGSGYISNGGNFGSGTNTLTIGGKN
TNFEFKGSINGSHVVKNGTGIWTISSENVLANAKSLKILDGFVKLNKATATTSMTSPTIL
NIQGAGELCGVGYAYGINLLNGGTLRPGTNKPTAQTSNTGVINIQKNLVAYDGSSIYVNR
AKADSLVVNAYTGSKSLGWAYLKVGGNATLNGTIYVTYNANGWTPAEGDYVRVVDCAGTI
SGTPTFDLQALPAGLGWDTSKFLTEGVVYVANATGIREIGFDAGSFQAEVYTLNGFRMTS
LQTSMATLQSDLKSRGLAPGLYIVRTAKGTIKVTLK
NT seq
4611 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaaactactcgcaacatctgctttagcattgttggtaagtatgggagcaaat
gcccagcgctttaccgataagttggatcgtggactcattgcagtgcaaaccacaaatggt
gtgtactgctcttggcgtatccaggccgatgaatactatgatgtaaagtacaatctttac
agaaatggtatgaaattaaattctgaacccctcgatgtttccaactttacagataagtct
ggttcatcaagcaacacttataccgtaaaggcagtagtgaatggggtagagcaggcagct
tctaaggctgctactgtattcaactcaaattataaggaaataaaaatccagtatcctgct
gccctgaagtcaacttatatccctaacgatgcctgctgcgccgatgtggatggcgatggc
gagttggagattctgatgaagttcaccaaccagcaggaaggtgaacagctttatcctaag
aatggacctaccatcaatggcgttgagaccaaggaatatactatgctggcctgtctgaag
caggacggtaagattctctggtgggtaaattgtggtcctaacatgggcgacttccaaaac
aacgagcagaatatcgtaggttacgactgggatatggacggtaaggcagaagtcgtaatg
cgtctcgaagaaggctctaccgtccacatggctgatggtaccacttataccattggtgct
gacggcaagaatggttctacatggactaactatcgccagccaaaggctgaaggaagcgta
gaatggtttacccactatggcaaggagttcctctggtattgcgagggtgctacgggtaag
ccataccagtgcatagatttcccattgaagcgtctggaagcaggcgagactgatttgaag
acagcttggggtgatggttatggtcatcgcagcagtaagtacttcttcggtgctccttat
ctggatggcaagcatccaagcatcttcctgggtcgtggtatctatacccgccacaagttt
atcgcatacgatgtggatcctaatactcatgcgctgaatgttcgctggaagtggaccaac
aaccagccgggttctccttggtatggacagggttatcacaactatatcattgccgatgtg
gattgggatggacgtgatgagatagtatggggttctatggttatcgacgataatggcaag
ggactttccactactggtctcggtcatggcgatgctcagcatgtaagtgattttaatcct
tatatccatggtcaggagatgtttgcctgcaacgaggatgctccttccaacaactatcgc
gatgcaactaccagcaagatatattatcgcaagacagataccaatgatgacggtcgctgc
ctggctggtaatttctataatgacattcctggtgccgtaggtcatagtgcgcatgatacg
cctatatctaccgttaccaatgaacatgtatctccgaatacgaatggtctgagcatgaac
ttccgtatctactgggatggcgatttgcaggaggaatgcttcaataatacagaggtaacc
aagcctggacagggcactatagcaaccttcacgggcgcttattccaacaattcaaccaag
gcaactccttgttttcagggcgatgtgttcggcgactggcgtgaggaagttattgagcgt
actgccgataacaatatccgcatctataccactacgactccgactccttggcgcaactac
tctctgtggtacgatcatcagtatcgcaatgcgatggtatggcagccatgcggttacaac
cagcctcctcacgcttcttacttcctcggtgaactggaaggcatcacgatagctcctcca
ccactcaccactaggggtcgtgaagaggtaggttcttctatctctaagtctttggacggc
aagcacgctttgctttctaccaatggcgatgccacggtagctgtggctgatggtgctgct
cctgctatctttatcgacaatgctccttcatgggtgcagggtacggctgccagcgagtgc
aaggtaaaggatactgaaatcaaatatacctactatactcataccctcactggcggtgct
ttctctggcaatatgcgcttagtgaagcagggcgacggtacactcgttcttcctaacgta
acccagacctacactggcaagactgatgtatgggcaggtacgttgcagtttgacggaacg
atggagaagagtccggtatggctgaaccgctttgcggagttgaattccaacggcggtaac
ttcaagggcggtatcaaggccgactatggttctatcatccgtccgggcggtaaggaccag
gtgggtacgcttattacttctgatctccagctcggtttcggtgctcgcgtcatcttcgat
gtgaacggcgggaatgtagataagctcgtggctggcaagatgagtatcgaaaagaagaac
tgggcgaacggtcctcagtattcagctccagtattcgagtttacatcggctcctcagcct
ggtacctatacactggcagaggtaggcgaactgactggcaagttggctgacatcaccgtg
gaaggcctctctggcgagaaatacagtttaaagtatgctgatggcaagttgactattagg
gtgagcgattcacgcgacagcgagtctgtagtctggactggtgccaacggttctatatgg
gacctgatggagtctgagaacttcgcttcttccgataataaattcgtttcaggtgataac
gtaaccttcaatgatgcagccgttaagactgacgtagagatcaatgaggacctcgctcct
ggcaacatcgtcttcaacaataacagtaaggtatataccttgtctggtaagggcgctatc
gagggcaatggctctgtcactttgaagggtaagagtgcagtcaatatcaagaataccaac
cgatatacgggcggtacctatattgatggcggttatctccgtccagcaacgcttgccaat
aaggatggtctcgaatatggttcgttaggtgcagccgacaataccattaccatgtccaac
caaggtaagttgtgggtaaatgcttccatgacttcttctcatccgattgtattgggcgag
aatggcggtcagatagagacttatactggtacaaacctgattgtgaatggcggtatcagc
aagatgaataagggagccaaccgtgatctctacaagttgggtagtggtacactgcagctc
aactgtgcagccgatttcgacaagctctatatcaatgccggaacagtctatgacttccag
gatgcccatttcaatggcaagacgattgtgctgaatggcagcaaggtggtgctgcaggct
tccaacagtatctacagcaacaactcggataatgtgaatatcgaggtgcctaagggtaag
tcgggaatttggtatcctgatgggcgttgtgactatacaggtaagctgaccggcgaggga
accatcgacatctatggtacttggatccgctgttctttcaagggcgactggagcaagttt
gccggaaccatcaatgcaaagcgcggcaccaagaatgcttacgagccagtatttgatttc
aacaatgcttatggtattccattggcaacgctcaatgtagattcacgtttcaccaaagac
tatgcattctgtaccaacggcaagagttttgctatcggtgccttgacaggttccggctat
atcagtaatggtggaaacttcggttctggtaccaatactttgacgattggtggcaaaaat
acgaactttgagttcaagggttctatcaatggtagccatgtggtgaagaatggtacgggt
atctggaccatctccagtgagaatgtacttgccaatgccaagtcgctgaagattcttgat
ggattcgtgaaactgaacaaggcaactgcgactacatctatgacttctccaaccatcctc
aatattcagggtgccggtgagctttgtggcgtgggttatgcatacggtatcaaccttttg
aatggcggtaccttgcgcccaggaactaataagcctacagctcagaccagcaatacgggc
gttatcaatatccagaagaacctggtagcctacgatggttccagcatttatgtgaacagg
gccaaggctgattctctcgttgtcaatgcatatacaggaagcaagagtctcggctgggca
tatctgaaggtaggtggcaatgctactctgaatggtaccatctatgtcacatacaatgcg
aatggttggactccagctgagggtgactatgtgcgtgttgttgactgtgctggcacaatc
agcggtactcctacatttgacttgcaggcgctccctgctggtttgggttgggatacaagc
aagttccttacagagggagtagtctatgtagccaatgctacaggtatccgtgagattggt
tttgatgctggttcattccaggcagaagtctatacgctcaacggcttccgcatgacaagt
ttgcagacttctatggctaccttgcagagcgacttgaagagtcgtggcttggctcctggc
ttgtacattgtccgtactgctaagggaactatcaaggttaccttgaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
