Segatella hominis: KUA50_008425
Help
Entry
KUA50_008425 CDS
T09571
Name
(GenBank) PL29 family lyase N-terminal domain-containing protein
Organism
shoi
Segatella hominis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4988
Collagen
Prefoldin_2
LapA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOZ80106
LinkDB
All DBs
Position
2018690..2022181
Genome browser
AA seq
1163 aa
AA seq
DB search
MKRKYFSVLLMGALAIASTSMVTSCKDYDDDIQNLQQQIDANKSAIEEISKLIKEGCVIT
SVEKATSGVTVKLNNGDTFTINNGEKGADGTPGTAWTIGADGYWVKDGVKTEYYALGTKG
DKGDKGDKGDKGDKGDKGDKGDTGAAGSTGTGTAGVNGKYYVPNAETGCFDIYQDGEKVE
STNISFIGTGVITAIKDDNAKTLTLFGVKGGEGQNGKVVISMTGDLTSLVFMPKFYLDGI
EMIEYPYLNGTSLKKQNVAGACTNHDGVTVQNLGVDYKDNNKAFVYGPAWAVDYHANPVN
AKLAYANVDGFNVLNPAVLYTRATAAELGVTSPEKNYAGTTLFNIANDGVLTVGLQVAHP
DKLNPAPTKNKVTDTETWNNANTVALKVKNNEGNDIVSDYALLQPTKAKVEGLVWTKDPD
YIRGPKDADGNHIAQTGDEACGVGKGKVHVWDTPKEALQDERHAALELYYENNTEIDLND
YVGIHLTKENIKDYMATSETKTLTPEQAKEWGLTFHFIPVMYKAGDNQTSDSHFLKSLGD
GKFRAQNVDENLKAGLAAEASVGREPLVQVLVTRGETITEDNVVLDGYILLHITKQAKDN
HVVNKWNNQDVVFDQCNDVDVFQTTWEQFNDYMLTQELNMSKEDFDHGYEADIIDGTNKL
NMYAAPLATKGTMTPDNSIGDVFYTKDGTGTTNHTWRWVIPAEQVEKLLHDKASVTLVRY
IRFNAKDQIEAKYPYIYVKMETTITRKQLATNTFGDRIKEYWYKNDMSTRPLTLGNDGII
FDAVNPYDGGDINSITRGIETTMNGNKISSLAGKNYKYFFTPKTIELTAQDGETYVITTS
GNGTNHDKVVCKYDALHTHPYADFANAVKVCAINYGAGAFNNAKLYAVKKGSSATPTEIA
VMDQSNGVISLTKNAVSKKLLNAKGYDEEKTLTDELSAYVSVVASSKTVCNLAEVVEDGS
FIVSWERPINLISKKSNGVIDAKTNGNVINFIDNFKFYDWRGVETNLYKNYKAETELNDA
KRDTYFAKSKMWGENLWFWAYYGINSITVDYSKIETTLNNGSNFVPLSSVSNALELYFLD
ATGKAVRGVQTYNFNLSRYNSEAQNAALQTYMNANKALFGRILYTNNGDVVNNFSLKIPV
TIGYTWGTFNTEIILDVQTSIGH
NT seq
3492 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagaaagtattttagcgtattgcttatgggtgcattagctattgcatctacaagc
atggttacttcttgtaaggactacgatgatgacattcagaatttgcagcagcaaatcgat
gccaacaagtcagctattgaggaaatctcaaagttgattaaggaaggttgcgtcatcaca
agcgtagagaaagctacaagtggtgtaactgtaaagcttaacaacggtgacactttcact
atcaacaatggtgagaagggtgccgatggtacacctggtaccgcttggactatcggtgcc
gatggttattgggtaaaagatggtgttaaaaccgagtactacgcacttggaaccaaaggt
gacaagggagacaaaggtgacaaaggcgacaagggtgacaagggagacaaaggcgacaag
ggtgatactggcgcagcaggctctactggcacaggaactgcaggtgtaaacggcaagtac
tacgtacctaacgcagaaacaggttgcttcgacatctaccaagatggtgaaaaggttgag
tcaacaaacattagcttcattggtactggtgtaatcactgctattaaagatgacaatgct
aagacattgacattgtttggtgttaaaggtggtgaaggtcaaaatggtaaggttgttatc
tcaatgactggtgacttgacaagcttggtattcatgcctaagttctacctcgacggtatt
gagatgattgaatatccatacttgaatggtactagcttgaagaagcagaatgttgcaggt
gcttgcacaaaccatgatggtgtaaccgtacagaaccttggtgttgactacaaggataac
aacaaggctttcgtgtatggtccagcttgggctgttgactatcatgcaaaccctgtaaat
gctaagttggcatatgctaatgttgatggattcaacgttctcaacccagcagttctttac
acacgtgcaacagctgctgaacttggtgtaacttctcctgaaaagaattatgcaggtaca
acattgtttaatatcgctaatgatggtgttttgactgtaggtttgcaggttgctcatcct
gataagttgaacccagctccaaccaagaacaaggttactgataccgagacttggaacaat
gctaataccgtcgcattgaaggttaagaacaatgagggcaacgatatcgtttctgattat
gctttactccagccaactaaggctaaggtagagggcttggtatggacgaaagatcctgat
tatatccgtggacctaaggatgcggatggtaatcacattgctcagactggtgatgaggct
tgtggcgtaggtaagggcaaggttcacgtatgggatactccaaaggaggctcttcaagat
gaacgtcatgcagctcttgagttgtactacgagaacaatacagagattgacttgaatgac
tatgtcggtattcacttgacaaaggagaatatcaaggattacatggcaacctcagagaca
aagactttaacacctgagcaggctaaggagtggggcttgactttccactttatccctgta
atgtacaaggctggtgataaccagacatcagattctcacttcttgaaatcacttggagat
ggcaagttccgtgctcagaatgttgatgaaaacttgaaggctggtcttgcagcggaagct
tctgttggtcgtgagccattagtacaggttctcgtaacacgtggtgagactatcacagag
gacaatgttgttctcgatggttacatcttgcttcacattacaaaacaggctaaggacaac
catgttgtaaacaagtggaacaaccaagatgttgtattcgatcagtgtaatgacgttgat
gtattccagacaacatgggagcagttcaacgactatatgttgactcaagaattgaacatg
tctaaggaagactttgaccatggttatgaggctgacattattgatggtaccaataaattg
aatatgtatgctgcaccattggcaacaaagggtacaatgactccagacaattctattggt
gatgtattctatacaaaggatggtacaggtacaaccaaccatacatggcgttgggttatt
cctgctgaacaggttgagaagttgttgcacgacaaagcttctgtgacattagtacgttac
atccgtttcaatgctaaggatcagattgaggctaagtatccttacatctatgtgaagatg
gaaacaactatcactagaaagcagctcgctaccaacacattcggtgatagaatcaaagaa
tactggtacaagaatgatatgtcaacacgtccattgacattgggtaatgatggtatcatc
ttcgatgcagtcaacccatacgatggaggcgatatcaattctattactcgtggtattgaa
acaaccatgaatggaaacaagatttcttcattggcaggcaagaactataagtatttcttc
actcctaagactatcgaattgacagcacaggatggtgagacatatgttattacaacctct
ggtaatggtacaaaccacgataaggtcgtttgcaagtacgacgctctccatacacatcct
tacgcagactttgctaatgctgttaaggtttgcgctatcaactatggcgctggtgcattc
aacaatgctaaattgtatgcagtgaagaagggttcttctgctactcctacagagattgct
gttatggaccagagcaatggtgttatctcacttacaaagaatgctgttagcaagaagctc
ttgaatgccaagggttacgatgaagagaagactcttacagatgagttgagtgcatacgta
agtgttgttgcatcttctaagactgtctgcaaccttgccgaggttgttgaggatggttca
ttcatcgtaagctgggagcgtccaatcaacttgatttctaagaagtctaatggtgttatc
gatgcaaagacaaacggtaatgtcatcaacttcattgacaacttcaagttctacgattgg
cgtggtgtagagacaaacctctacaaaaattacaaggcagaaacagaacttaatgacgct
aagcgtgacacatactttgcaaagagtaagatgtggggtgagaacttgtggttctgggct
tactatggcatcaacagcatcactgttgattacagcaagatcgagactactttgaacaat
ggttctaacttcgttccattgtcaagtgtttcaaatgcacttgagttgtacttcttggat
gcaactggcaaggctgttcgtggtgttcagacttacaacttcaacctttcacgctacaat
tctgaggctcagaacgctgctttgcagacttacatgaatgcaaacaaggctctgttcgga
agaattctctacaccaacaatggtgacgttgtaaacaacttctccttgaagattcctgta
acaattggttacacatggggtacgttcaatacagaaatcatcttggatgtacagacatca
attggtcactaa
DBGET
integrated database retrieval system