Segatella hominis: KUA50_013690
Help
Entry
KUA50_013690 CDS
T09571
Name
(GenBank) pectate lyase
Organism
shoi
Segatella hominis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CBM77
Pectate_lyase_4
Beta_helix
RGI_lyase
GH85_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOZ81071
LinkDB
All DBs
Position
3372849..3375674
Genome browser
AA seq
941 aa
AA seq
DB search
MKKMVFTLALLLMSLSAAMAQTWTFGAMSEADKALCAADANWVLGTDRYCYTLVLENEAL
VANNSELAYTKGLKFTAGAPADKSEGKAKVRLNYGSSRLELNGNGVSLIIPSLKAGQKVT
VSCKTGSTSTARCLDAANLTSVSGSFGTPTKDQVTNVGTVTADGDVVLKTNGGGMNIYSI
KVETVGGGSTVTPGSTDKITNAVARNSKVNQMYVTTNAGDVKYYNTADLTSVKFEGDKTI
ITPKSGAENDEYDASVQAISFAKKADQGESGDVENPAGVIQITEAKGWQESAYLKWAPFE
GASSYNVYVDDKKIDAQLIRQYASYYRADVLGLKAGTYSVKVVPVNAEGTEITGANTASN
LVVKSYNREGFAHFKYDGVGAYNNDGTLKAGAKVLYITAKTAKTVSTTVDTGKPETITGL
QSIIDAYQKGEDTTPIVFRIIGKVSLSDLDRISSSAEGLQIKGKGAHSEMNMTFEGVGDD
ATVYGFGFLLRNTKSVEFRNFAIMRCLDDAMSLDTDNSHVWIHNMDLFYGKKGGAADQAK
GDGTVDIKGDSQYITVAYNRFWDNGKASMCGMTSESGPNYITYHHNWFDHSDSRMARIRT
MSVHMYNNYYQHNDVYGIGATSGSSVFMESNYFDAVKRPIMSSLQGTDAMGDGTFSGEKG
GLIKAYGNVFANKPDNFSYITYANNNTSFDAYEVSAPSEQVPSSVKTLVGGTSYNNFDTN
SSLMYAYAADKAEDVPAIVEGFYGAGRLNHGDIDFVIPDETVVTNGHQQPWPALASILDA
YTSGVVKVFGESNASGEGGSTEGGSTGGSTGGSEGGSTVTPIEGTVTCSFTVNGKEAVPS
NSAFVLTGEAKNVKKEETVIEGTTYTASLKMESKTEVSFTTSQKMTLYVYYGLSGANTNV
KVDGVKQTGAPTTVVLEAGAHKITKGDTTTIALIKLVPVTE
NT seq
2826 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaatggtatttactttggcactcctcttgatgagcttgagtgcagccatggca
cagacatggacatttggtgcaatgagcgaggctgataaggctttatgtgcagctgatgcc
aattgggtattgggaactgatcgctactgctataccttagttttggagaatgaagctctt
gttgcaaataactcagaattggcttatactaagggcttgaagtttactgctggtgctcct
gctgataaatccgaaggaaaagcaaaagtccgcttgaattatggctcttctcgcttggaa
ttgaatggaaatggtgtttctttgattattccaagtctgaaggctggtcagaaagtaaca
gttagctgcaagactggtagtacttctactgctcgttgtttagatgctgctaacttgact
tcggtttctggttcttttggtactcctacaaaagatcaggttaccaacgttggaactgta
actgctgatggtgatgtcgtgttgaaaaccaatggtggtggtatgaacatttatagcatc
aaggttgagactgtaggtggcggatctaccgttactcctggttctaccgacaaaattacc
aatgccgttgctcgtaacagcaaggtcaatcagatgtatgttaccaccaatgctggtgat
gtgaagtattataatactgccgacttgacaagtgttaagttcgaaggtgacaagactatt
attactcctaagtctggtgcagagaatgatgagtatgatgcttctgttcaagccatcagt
tttgctaagaaggccgatcagggcgaaagtggtgatgttgaaaatcctgcaggtgtgatt
cagattactgaggcaaagggctggcaggagtctgcctacttgaagtgggctccattcgag
ggcgcttcttcttataatgtatatgtagatgacaagaagattgatgctcagttgattcgt
cagtatgcttcttactatcgtgctgatgttctcggtttgaaggctggtacttattctgta
aaggttgttcctgtcaatgctgaaggtacagagattactggtgccaatacagcttctaac
ttggtagtaaagagctacaatcgtgagggctttgctcatttcaagtatgatggtgtaggt
gcttataataatgatggtactttgaaggctggtgctaaggtcctgtatattacagccaag
acggccaagactgtttctacaacagttgatacaggcaagccagagacgattacgggtctt
cagtctattattgatgcttatcaaaagggtgaggatacaactcctatcgtcttccgaatc
atcggtaaggtaagcctttctgacttggacagaatttcaagttctgcagaaggtttgcag
attaaaggtaagggtgctcactctgaaatgaacatgactttcgaaggagtcggtgatgat
gctactgtatatggatttggtttcttgcttcgtaataccaagagtgtagagttccgtaac
tttgctatcatgcgttgcctggatgatgctatgtctcttgatactgataactctcatgta
tggattcacaacatggatctcttctatggcaagaagggtggcgctgctgaccaggccaag
ggtgatggtactgtagatatcaagggtgactcccagtatataactgtagcatacaaccgc
ttctgggataatggtaaggcttctatgtgtggtatgacgagtgaaagtggccctaactat
atcacttatcaccacaactggttcgaccattcagactctcgtatggctcgtattcgtact
atgagtgttcacatgtacaacaactactatcagcacaatgatgtttatggtattggtgca
accagtggttcaagtgtattcatggagtctaattactttgatgcagttaagcgtcctatc
atgagctctttgcagggtactgatgctatgggtgatggtactttctctggtgagaaaggt
ggcttgattaaggcatacggcaatgtatttgccaacaaacctgataacttcagctatatc
acatacgcaaacaataatacaagttttgatgcttacgaggtttctgccccaagtgagcag
gttccttcaagcgtaaagactttggtaggtggtacttcttacaacaacttcgataccaac
tcaagcctcatgtatgcatacgctgcagataaggcagaagatgttcctgctattgtagaa
ggattctatggtgcaggtcgtttgaatcatggcgatattgatttcgttattcctgatgaa
acagtcgtaacaaatggtcaccagcagccatggcctgctttggcaagcattcttgatgct
tatacttctggtgttgttaaggtgttcggtgagagcaatgcttctggcgaaggtggttct
actgaaggtggtagcactggtggctctactggtggttcagaaggtggcagcacagtaact
cctattgagggtactgtaacatgcagctttactgtgaacggaaaagaggctgttccttct
aatagtgcatttgttttgacaggtgaagctaagaatgttaaaaaggaagaaacagttatt
gaaggtacaacttatacagcaagtcttaagatggaaagtaaaacagaagtttctttcacc
acatctcagaagatgactctgtatgtatattatggtctttctggtgcaaacactaatgta
aaggtagatggcgtaaagcagacaggagctcctacaacagttgtgcttgaggctggtgct
cataagattacaaagggtgatacaactacaatcgctctcatcaaacttgtacctgtaaca
gaataa
DBGET
integrated database retrieval system
